MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 34971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_022543	AAC	2	6	1329664	1329669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719479
21003	NC_022543	CTG	2	6	1329701	1329706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719479
21004	NC_022543	CGA	2	6	1329735	1329740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719479
21005	NC_022543	ACCG	2	8	1329838	1329845	25 %	0 %	25 %	50 %	549719479
21006	NC_022543	TACT	2	8	1329885	1329892	25 %	50 %	0 %	25 %	549719479
21007	NC_022543	CGTT	2	8	1329898	1329905	0 %	50 %	25 %	25 %	549719479
21008	NC_022543	CAT	2	6	1329978	1329983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719479
21009	NC_022543	AACA	2	8	1330015	1330022	75 %	0 %	0 %	25 %	549719479
21010	NC_022543	GA	3	6	1330065	1330070	50 %	0 %	50 %	0 %	549719479
21011	NC_022543	AAG	2	6	1330144	1330149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719479
21012	NC_022543	GTG	2	6	1330292	1330297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719479
21013	NC_022543	ACA	2	6	1330319	1330324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719479
21014	NC_022543	CAG	2	6	1330439	1330444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719479
21015	NC_022543	TGG	2	6	1330448	1330453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719479
21016	NC_022543	CG	3	6	1330471	1330476	0 %	0 %	50 %	50 %	549719479
21017	NC_022543	A	6	6	1330484	1330489	100 %	0 %	0 %	0 %	549719479
21018	NC_022543	AATG	2	8	1330572	1330579	50 %	25 %	25 %	0 %	549719479
21019	NC_022543	AAC	3	9	1330597	1330605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719479
21020	NC_022543	AAG	2	6	1330748	1330753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719479
21021	NC_022543	CGA	2	6	1330774	1330779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719479
21022	NC_022543	GCGAA	2	10	1330814	1330823	40 %	0 %	40 %	20 %	549719479
21023	NC_022543	GAA	2	6	1330885	1330890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719479
21024	NC_022543	GAC	2	6	1330996	1331001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719479
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21026	NC_022543	GTT	2	6	1331034	1331039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719479
21027	NC_022543	ACG	2	6	1331090	1331095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719479
21028	NC_022543	ACC	2	6	1331099	1331104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719479
21029	NC_022543	AAGG	2	8	1331161	1331168	50 %	0 %	50 %	0 %	549719479
21030	NC_022543	ATC	2	6	1331236	1331241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719479
21031	NC_022543	CAC	2	6	1331258	1331263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719479
21032	NC_022543	TCG	2	6	1331343	1331348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719479
21033	NC_022543	GAA	2	6	1331434	1331439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719479
21034	NC_022543	CCGC	2	8	1331499	1331506	0 %	0 %	25 %	75 %	549719479
21035	NC_022543	TCA	2	6	1331549	1331554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719479
21036	NC_022543	CAGA	2	8	1331593	1331600	50 %	0 %	25 %	25 %	549719479
21037	NC_022543	A	7	7	1331713	1331719	100 %	0 %	0 %	0 %	549719480
21038	NC_022543	CTG	2	6	1331731	1331736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719480
21039	NC_022543	TCGG	2	8	1331737	1331744	0 %	25 %	50 %	25 %	549719480
21040	NC_022543	GTG	2	6	1331756	1331761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719480
21041	NC_022543	GAC	2	6	1331851	1331856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719480
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21044	NC_022543	CAAA	2	8	1331957	1331964	75 %	0 %	0 %	25 %	549719480
21045	NC_022543	CTTG	2	8	1331968	1331975	0 %	50 %	25 %	25 %	549719480
21046	NC_022543	GAAT	2	8	1332132	1332139	50 %	25 %	25 %	0 %	549719480
21047	NC_022543	TC	3	6	1332154	1332159	0 %	50 %	0 %	50 %	549719480
21048	NC_022543	AGC	2	6	1332241	1332246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719481
21049	NC_022543	CGG	2	6	1332277	1332282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719481
21050	NC_022543	TCT	2	6	1332283	1332288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719481
21051	NC_022543	GGA	2	6	1332331	1332336	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549719481
21052	NC_022543	GATA	2	8	1332514	1332521	50 %	25 %	25 %	0 %	549719481
21053	NC_022543	CTCG	2	8	1332592	1332599	0 %	25 %	25 %	50 %	549719481
21054	NC_022543	A	6	6	1332693	1332698	100 %	0 %	0 %	0 %	549719481
21055	NC_022543	TG	3	6	1332701	1332706	0 %	50 %	50 %	0 %	549719481
21056	NC_022543	TGCCA	2	10	1332825	1332834	20 %	20 %	20 %	40 %	549719482
21057	NC_022543	ATC	2	6	1332835	1332840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719482
21058	NC_022543	CT	4	8	1332886	1332893	0 %	50 %	0 %	50 %	549719482
21059	NC_022543	CTT	2	6	1333051	1333056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719483
21060	NC_022543	GTTT	2	8	1333089	1333096	0 %	75 %	25 %	0 %	549719483
21061	NC_022543	GCT	2	6	1333162	1333167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719483
21062	NC_022543	AGC	2	6	1333185	1333190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719483
21063	NC_022543	CCA	2	6	1333208	1333213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719483
21064	NC_022543	ACC	2	6	1333361	1333366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719483
21065	NC_022543	CAC	2	6	1333378	1333383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719483
21066	NC_022543	GTC	2	6	1333412	1333417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719483
21067	NC_022543	GATC	2	8	1333459	1333466	25 %	25 %	25 %	25 %	549719483
21068	NC_022543	ACC	2	6	1333472	1333477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719483
21069	NC_022543	GTTT	2	8	1333504	1333511	0 %	75 %	25 %	0 %	549719483
21070	NC_022543	CT	3	6	1333523	1333528	0 %	50 %	0 %	50 %	549719483
21071	NC_022543	GAAG	2	8	1333531	1333538	50 %	0 %	50 %	0 %	549719483
21072	NC_022543	GTA	2	6	1333631	1333636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719483
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21083	NC_022543	GCGTT	2	10	1334125	1334134	0 %	40 %	40 %	20 %	549719483
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21088	NC_022543	CTTT	2	8	1334424	1334431	0 %	75 %	0 %	25 %	549719483
21089	NC_022543	T	6	6	1334434	1334439	0 %	100 %	0 %	0 %	549719483
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21091	NC_022543	CAT	2	6	1334524	1334529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719483
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21100	NC_022543	CT	3	6	1334796	1334801	0 %	50 %	0 %	50 %	549719483
21101	NC_022543	AAG	2	6	1334826	1334831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719483
21102	NC_022543	TCT	2	6	1334949	1334954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719484
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21107	NC_022543	CGC	2	6	1335080	1335085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719484
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21110	NC_022543	GTT	2	6	1335328	1335333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719485
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21112	NC_022543	CCG	2	6	1335369	1335374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719485
21113	NC_022543	TTCAT	2	10	1335414	1335423	20 %	60 %	0 %	20 %	549719485
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21117	NC_022543	T	6	6	1336135	1336140	0 %	100 %	0 %	0 %	549719485
21118	NC_022543	CA	3	6	1336273	1336278	50 %	0 %	0 %	50 %	549719485
21119	NC_022543	GAC	2	6	1336336	1336341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719485
21120	NC_022543	CAA	2	6	1336366	1336371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719485
21121	NC_022543	TCG	2	6	1336389	1336394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719485
21122	NC_022543	GGC	2	6	1336415	1336420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719485
21123	NC_022543	GCA	2	6	1336443	1336448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719485
21124	NC_022543	CTG	2	6	1336459	1336464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719485
21125	NC_022543	T	6	6	1336470	1336475	0 %	100 %	0 %	0 %	549719485
21126	NC_022543	CCA	2	6	1336482	1336487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719485
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21132	NC_022543	T	7	7	1337001	1337007	0 %	100 %	0 %	0 %	549719486
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21153	NC_022543	T	6	6	1338730	1338735	0 %	100 %	0 %	0 %	549719487
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21206	NC_022543	ACC	2	6	1342445	1342450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719494
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21211	NC_022543	CCCAG	2	10	1342719	1342728	20 %	0 %	20 %	60 %	549719494
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21224	NC_022543	GGT	2	6	1344121	1344126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719496
21225	NC_022543	CAGTA	2	10	1344152	1344161	40 %	20 %	20 %	20 %	549719496
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21228	NC_022543	GTTT	2	8	1344285	1344292	0 %	75 %	25 %	0 %	549719496
21229	NC_022543	GCT	2	6	1344347	1344352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719496
21230	NC_022543	TTTAC	2	10	1344411	1344420	20 %	60 %	0 %	20 %	549719497
21231	NC_022543	AAG	2	6	1344473	1344478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719497
21232	NC_022543	TTC	2	6	1344637	1344642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719497
21233	NC_022543	TGC	2	6	1344666	1344671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719497
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21235	NC_022543	GCT	2	6	1344725	1344730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719497
21236	NC_022543	GCC	2	6	1344765	1344770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719498
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21340	NC_022543	AG	3	6	1351640	1351645	50 %	0 %	50 %	0 %	549719502
21341	NC_022543	ACC	2	6	1351777	1351782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549719502
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21343	NC_022543	GAC	2	6	1351831	1351836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719502
21344	NC_022543	TCCA	2	8	1351846	1351853	25 %	25 %	0 %	50 %	549719502
21345	NC_022543	GGCTC	2	10	1351884	1351893	0 %	20 %	40 %	40 %	549719502
21346	NC_022543	TCA	2	6	1351989	1351994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719502
21347	NC_022543	ACA	2	6	1352034	1352039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719502
21348	NC_022543	TG	3	6	1352069	1352074	0 %	50 %	50 %	0 %	549719502
21349	NC_022543	TTCT	2	8	1352078	1352085	0 %	75 %	0 %	25 %	549719502
21350	NC_022543	AAGT	2	8	1352098	1352105	50 %	25 %	25 %	0 %	549719502
21351	NC_022543	TTG	2	6	1352215	1352220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719502
21352	NC_022543	TTCTG	2	10	1352300	1352309	0 %	60 %	20 %	20 %	549719502
21353	NC_022543	AGT	2	6	1352319	1352324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719502
21354	NC_022543	ACG	2	6	1352382	1352387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719502
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21443	NC_022543	A	6	6	1357597	1357602	100 %	0 %	0 %	0 %	549719508
21444	NC_022543	CATTCG	2	12	1357640	1357651	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549719508
21445	NC_022543	CAT	2	6	1357671	1357676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719508
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21452	NC_022543	ATC	2	6	1358209	1358214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719508
21453	NC_022543	ATG	3	9	1358237	1358245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719508
21454	NC_022543	TGGT	2	8	1358271	1358278	0 %	50 %	50 %	0 %	549719508
21455	NC_022543	TCAA	2	8	1358462	1358469	50 %	25 %	0 %	25 %	549719509
21456	NC_022543	TTG	2	6	1358518	1358523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719509
21457	NC_022543	GAA	2	6	1358541	1358546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719509
21458	NC_022543	CTTC	2	8	1358563	1358570	0 %	50 %	0 %	50 %	549719509
21459	NC_022543	CACT	2	8	1358571	1358578	25 %	25 %	0 %	50 %	549719509
21460	NC_022543	CTTT	2	8	1358667	1358674	0 %	75 %	0 %	25 %	549719509
21461	NC_022543	CCG	2	6	1358812	1358817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719509
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21464	NC_022543	GCA	2	6	1358857	1358862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719509
21465	NC_022543	CAA	2	6	1358933	1358938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719509
21466	NC_022543	GCT	2	6	1359045	1359050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719509
21467	NC_022543	CT	3	6	1359049	1359054	0 %	50 %	0 %	50 %	549719509
21468	NC_022543	CAT	2	6	1359680	1359685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719510
21469	NC_022543	AGC	2	6	1359699	1359704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719510
21470	NC_022543	ACTG	2	8	1359710	1359717	25 %	25 %	25 %	25 %	549719510
21471	NC_022543	AGA	2	6	1359734	1359739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719510
21472	NC_022543	ATC	2	6	1359768	1359773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719510
21473	NC_022543	CAA	2	6	1359833	1359838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719510
21474	NC_022543	GGC	2	6	1359912	1359917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719510
21475	NC_022543	CTT	2	6	1359928	1359933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719510
21476	NC_022543	GCG	2	6	1359952	1359957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719510
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21478	NC_022543	TG	3	6	1360088	1360093	0 %	50 %	50 %	0 %	549719510
21479	NC_022543	TGG	2	6	1360112	1360117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719510
21480	NC_022543	TCA	2	6	1360137	1360142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719510
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21483	NC_022543	GCA	2	6	1360215	1360220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719510
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21485	NC_022543	GCT	2	6	1360251	1360256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719510
21486	NC_022543	CTG	2	6	1360315	1360320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719510
21487	NC_022543	CTT	2	6	1360448	1360453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719510
21488	NC_022543	ACA	2	6	1360546	1360551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719510
21489	NC_022543	TACG	2	8	1360686	1360693	25 %	25 %	25 %	25 %	549719510
21490	NC_022543	GGT	2	6	1360713	1360718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719510
21491	NC_022543	TAC	2	6	1360803	1360808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719510
21492	NC_022543	CTGG	2	8	1360909	1360916	0 %	25 %	50 %	25 %	549719511
21493	NC_022543	CAGCT	2	10	1361022	1361031	20 %	20 %	20 %	40 %	549719511
21494	NC_022543	GTA	2	6	1361083	1361088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719511
21495	NC_022543	AGA	2	6	1361098	1361103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719511
21496	NC_022543	CTT	2	6	1361131	1361136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719511
21497	NC_022543	GATAC	2	10	1361266	1361275	40 %	20 %	20 %	20 %	549719511
21498	NC_022543	GGT	2	6	1361281	1361286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719511
21499	NC_022543	GAC	2	6	1361373	1361378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719511
21500	NC_022543	GAA	2	6	1361398	1361403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719511

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