MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 34971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022543	ACT	2	6	850001	850006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719043
13502	NC_022543	AAG	2	6	850010	850015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719043
13503	NC_022543	CTG	2	6	850025	850030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719043
13504	NC_022543	CAA	2	6	850051	850056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719043
13505	NC_022543	TGAA	2	8	850086	850093	50 %	25 %	25 %	0 %	549719044
13506	NC_022543	GGC	2	6	850109	850114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719044
13507	NC_022543	CGA	2	6	850150	850155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13508	NC_022543	CGTG	2	8	850177	850184	0 %	25 %	50 %	25 %	549719044
13509	NC_022543	TCA	2	6	850305	850310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719044
13510	NC_022543	GCA	2	6	850337	850342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13511	NC_022543	GTTC	2	8	850349	850356	0 %	50 %	25 %	25 %	549719044
13512	NC_022543	ATC	2	6	850490	850495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719044
13513	NC_022543	GCC	2	6	850550	850555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719044
13514	NC_022543	CTGT	2	8	850574	850581	0 %	50 %	25 %	25 %	549719044
13515	NC_022543	TGTT	2	8	850656	850663	0 %	75 %	25 %	0 %	549719044
13516	NC_022543	GTG	2	6	850688	850693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719044
13517	NC_022543	TGA	2	6	850713	850718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719044
13518	NC_022543	ACG	2	6	850794	850799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13519	NC_022543	GT	3	6	850815	850820	0 %	50 %	50 %	0 %	549719044
13520	NC_022543	AGA	2	6	850870	850875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719044
13521	NC_022543	GAA	2	6	850877	850882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719044
13522	NC_022543	TGA	2	6	850944	850949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719044
13523	NC_022543	ATG	2	6	851000	851005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719044
13524	NC_022543	CAGAA	2	10	851013	851022	60 %	0 %	20 %	20 %	549719044
13525	NC_022543	CAATC	2	10	851068	851077	40 %	20 %	0 %	40 %	549719044
13526	NC_022543	AAG	2	6	851105	851110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719044
13527	NC_022543	CAAC	2	8	851203	851210	50 %	0 %	0 %	50 %	549719044
13528	NC_022543	GTC	2	6	851320	851325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13529	NC_022543	ATGA	2	8	851369	851376	50 %	25 %	25 %	0 %	549719044
13530	NC_022543	ATG	2	6	851390	851395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719044
13531	NC_022543	TTG	3	9	851541	851549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719044
13532	NC_022543	TGGC	2	8	851639	851646	0 %	25 %	50 %	25 %	549719044
13533	NC_022543	AGA	2	6	851647	851652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719044
13534	NC_022543	TAA	2	6	851761	851766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549719044
13535	NC_022543	AGA	2	6	851773	851778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719044
13536	NC_022543	GAT	2	6	851779	851784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719044
13537	NC_022543	CAG	2	6	851810	851815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13538	NC_022543	TTC	2	6	851864	851869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719044
13539	NC_022543	GCTGA	2	10	851900	851909	20 %	20 %	40 %	20 %	549719044
13540	NC_022543	GT	3	6	851946	851951	0 %	50 %	50 %	0 %	549719044
13541	NC_022543	TTG	2	6	851973	851978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719044
13542	NC_022543	GGT	2	6	852001	852006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719044
13543	NC_022543	GGC	2	6	852067	852072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719044
13544	NC_022543	AAG	2	6	852114	852119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719044
13545	NC_022543	AGA	2	6	852274	852279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719044
13546	NC_022543	AGC	2	6	852317	852322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13547	NC_022543	GAA	2	6	852422	852427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719044
13548	NC_022543	ATG	2	6	852449	852454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719044
13549	NC_022543	GGT	2	6	852533	852538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719044
13550	NC_022543	CGA	2	6	852619	852624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13551	NC_022543	CTTG	2	8	852643	852650	0 %	50 %	25 %	25 %	549719044
13552	NC_022543	GTC	2	6	852707	852712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13553	NC_022543	ATG	2	6	852878	852883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719044
13554	NC_022543	AG	3	6	852905	852910	50 %	0 %	50 %	0 %	549719044
13555	NC_022543	CAG	2	6	852968	852973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719044
13556	NC_022543	CAA	2	6	853022	853027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719044
13557	NC_022543	CAA	2	6	853030	853035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549719044
13558	NC_022543	GC	3	6	853440	853445	0 %	0 %	50 %	50 %	549719045
13559	NC_022543	CGC	2	6	853525	853530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719045
13560	NC_022543	AT	3	6	853566	853571	50 %	50 %	0 %	0 %	549719045
13561	NC_022543	GAA	2	6	853610	853615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719045
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13563	NC_022543	TGG	2	6	853722	853727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719045
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13565	NC_022543	GA	3	6	853772	853777	50 %	0 %	50 %	0 %	549719045
13566	NC_022543	GTGG	2	8	853868	853875	0 %	25 %	75 %	0 %	549719045
13567	NC_022543	GAT	2	6	853892	853897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719045
13568	NC_022543	AG	3	6	853943	853948	50 %	0 %	50 %	0 %	549719045
13569	NC_022543	TCT	2	6	854089	854094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719045
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13571	NC_022543	GCA	2	6	854333	854338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719045
13572	NC_022543	GCA	2	6	854370	854375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719045
13573	NC_022543	CGCT	2	8	854466	854473	0 %	25 %	25 %	50 %	549719045
13574	NC_022543	GCA	2	6	854524	854529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719045
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13585	NC_022543	TGA	2	6	855102	855107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719047
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13587	NC_022543	GAAA	2	8	855162	855169	75 %	0 %	25 %	0 %	549719047
13588	NC_022543	ATG	2	6	855184	855189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719047
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13590	NC_022543	TGA	2	6	855306	855311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719047
13591	NC_022543	GATT	2	8	855505	855512	25 %	50 %	25 %	0 %	549719048
13592	NC_022543	GCA	2	6	855547	855552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719048
13593	NC_022543	TGA	2	6	855563	855568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719048
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13597	NC_022543	CCAT	2	8	855591	855598	25 %	25 %	0 %	50 %	549719048
13598	NC_022543	TTC	2	6	855619	855624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719048
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13600	NC_022543	GTTT	2	8	855706	855713	0 %	75 %	25 %	0 %	549719048
13601	NC_022543	GTG	2	6	855714	855719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549719048
13602	NC_022543	TA	3	6	855760	855765	50 %	50 %	0 %	0 %	549719048
13603	NC_022543	GAA	2	6	855853	855858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549719048
13604	NC_022543	GCG	2	6	855887	855892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719048
13605	NC_022543	TGT	2	6	855907	855912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719048
13606	NC_022543	GATA	2	8	855963	855970	50 %	25 %	25 %	0 %	549719048
13607	NC_022543	TCA	2	6	856058	856063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719048
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13609	NC_022543	GGC	2	6	856084	856089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549719048
13610	NC_022543	GAT	2	6	856108	856113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719048
13611	NC_022543	CGC	2	6	856197	856202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549719048
13612	NC_022543	TTC	2	6	856319	856324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719048
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13614	NC_022543	TGA	2	6	856488	856493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549719048
13615	NC_022543	GA	3	6	856634	856639	50 %	0 %	50 %	0 %	549719049
13616	NC_022543	CT	3	6	856718	856723	0 %	50 %	0 %	50 %	549719049
13617	NC_022543	TTG	2	6	856838	856843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719049
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13619	NC_022543	CTT	2	6	856872	856877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549719049
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13982	NC_022543	ACAAAG	2	12	884191	884202	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	549719076
13983	NC_022543	CGA	2	6	884204	884209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549719076
13984	NC_022543	A	6	6	884256	884261	100 %	0 %	0 %	0 %	549719076
13985	NC_022543	A	6	6	884283	884288	100 %	0 %	0 %	0 %	549719076
13986	NC_022543	TAA	2	6	884309	884314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549719076
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13990	NC_022543	GTT	2	6	884731	884736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549719077
13991	NC_022543	TAC	2	6	884740	884745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549719077
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