MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 34971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022543	CAAT	2	8	352945	352952	50 %	25 %	0 %	25 %	549718576
5502	NC_022543	GTT	2	6	352956	352961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718576
5503	NC_022543	GTT	2	6	352979	352984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718576
5504	NC_022543	GCA	2	6	353102	353107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718577
5505	NC_022543	TAGT	2	8	353124	353131	25 %	50 %	25 %	0 %	549718577
5506	NC_022543	TTA	2	6	353153	353158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718577
5507	NC_022543	CAA	2	6	353166	353171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718577
5508	NC_022543	TAA	2	6	353183	353188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718577
5509	NC_022543	TCT	2	6	353231	353236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718577
5510	NC_022543	CTT	2	6	353238	353243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718577
5511	NC_022543	TCA	2	6	353261	353266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718577
5512	NC_022543	ATT	2	6	353291	353296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718577
5513	NC_022543	TA	4	8	353313	353320	50 %	50 %	0 %	0 %	549718577
5514	NC_022543	TAA	2	6	353355	353360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718577
5515	NC_022543	T	8	8	353390	353397	0 %	100 %	0 %	0 %	549718577
5516	NC_022543	CTG	2	6	353512	353517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718578
5517	NC_022543	TTC	2	6	353531	353536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718578
5518	NC_022543	AT	3	6	353639	353644	50 %	50 %	0 %	0 %	549718578
5519	NC_022543	TCA	2	6	353658	353663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718578
5520	NC_022543	AGCTA	2	10	353696	353705	40 %	20 %	20 %	20 %	549718578
5521	NC_022543	TA	3	6	353744	353749	50 %	50 %	0 %	0 %	549718578
5522	NC_022543	GAGC	2	8	353837	353844	25 %	0 %	50 %	25 %	549718578
5523	NC_022543	CAA	2	6	353886	353891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718579
5524	NC_022543	GCT	2	6	353938	353943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718579
5525	NC_022543	TCT	3	9	353948	353956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718579
5526	NC_022543	TAAA	2	8	353961	353968	75 %	25 %	0 %	0 %	549718579
5527	NC_022543	T	6	6	354065	354070	0 %	100 %	0 %	0 %	549718579
5528	NC_022543	GTA	2	6	354085	354090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718579
5529	NC_022543	GAA	2	6	354094	354099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718579
5530	NC_022543	T	8	8	354100	354107	0 %	100 %	0 %	0 %	549718579
5531	NC_022543	TGA	2	6	354120	354125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718579
5532	NC_022543	AGGA	2	8	354127	354134	50 %	0 %	50 %	0 %	549718579
5533	NC_022543	A	6	6	354193	354198	100 %	0 %	0 %	0 %	549718579
5534	NC_022543	CAC	2	6	354210	354215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718579
5535	NC_022543	A	6	6	354223	354228	100 %	0 %	0 %	0 %	549718579
5536	NC_022543	TTC	2	6	354234	354239	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718579
5537	NC_022543	ATG	2	6	354326	354331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718579
5538	NC_022543	TCT	2	6	354353	354358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718579
5539	NC_022543	GAAC	2	8	354361	354368	50 %	0 %	25 %	25 %	549718579
5540	NC_022543	TAG	2	6	354672	354677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718580
5541	NC_022543	TTA	2	6	354721	354726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718580
5542	NC_022543	A	6	6	354736	354741	100 %	0 %	0 %	0 %	549718580
5543	NC_022543	TCA	4	12	354742	354753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718580
5544	NC_022543	CAT	2	6	354755	354760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718580
5545	NC_022543	AT	3	6	354767	354772	50 %	50 %	0 %	0 %	549718580
5546	NC_022543	TTTC	2	8	354777	354784	0 %	75 %	0 %	25 %	549718580
5547	NC_022543	TA	3	6	354860	354865	50 %	50 %	0 %	0 %	549718580
5548	NC_022543	GAA	2	6	354870	354875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718580
5549	NC_022543	GGA	2	6	354887	354892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718580
5550	NC_022543	CTT	3	9	354977	354985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718580
5551	NC_022543	TCA	2	6	355024	355029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718580
5552	NC_022543	TA	3	6	355077	355082	50 %	50 %	0 %	0 %	549718580
5553	NC_022543	ATC	2	6	355083	355088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718580
5554	NC_022543	T	6	6	355096	355101	0 %	100 %	0 %	0 %	549718580
5555	NC_022543	ACC	2	6	355216	355221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718581
5556	NC_022543	ATC	3	9	355225	355233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718581
5557	NC_022543	TTTTC	2	10	355250	355259	0 %	80 %	0 %	20 %	549718581
5558	NC_022543	ATT	2	6	355310	355315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718581
5559	NC_022543	A	6	6	355318	355323	100 %	0 %	0 %	0 %	549718581
5560	NC_022543	TGA	2	6	355402	355407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718581
5561	NC_022543	CTTC	2	8	355496	355503	0 %	50 %	0 %	50 %	549718581
5562	NC_022543	GAC	2	6	355519	355524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718581
5563	NC_022543	CAT	2	6	355530	355535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718581
5564	NC_022543	ATG	2	6	355538	355543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718581
5565	NC_022543	CT	3	6	355594	355599	0 %	50 %	0 %	50 %	549718581
5566	NC_022543	TAA	2	6	355630	355635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718581
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5569	NC_022543	TAT	2	6	355739	355744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718582
5570	NC_022543	TA	3	6	355755	355760	50 %	50 %	0 %	0 %	549718582
5571	NC_022543	AT	3	6	355897	355902	50 %	50 %	0 %	0 %	549718582
5572	NC_022543	CCAC	2	8	356036	356043	25 %	0 %	0 %	75 %	549718582
5573	NC_022543	ACC	2	6	356079	356084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718582
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5575	NC_022543	GTA	2	6	356133	356138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718582
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5581	NC_022543	CTG	3	9	356484	356492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718582
5582	NC_022543	GT	3	6	356530	356535	0 %	50 %	50 %	0 %	549718582
5583	NC_022543	TTGG	2	8	356607	356614	0 %	50 %	50 %	0 %	549718582
5584	NC_022543	TTAA	2	8	356626	356633	50 %	50 %	0 %	0 %	549718582
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5586	NC_022543	T	6	6	356745	356750	0 %	100 %	0 %	0 %	549718582
5587	NC_022543	TG	3	6	356779	356784	0 %	50 %	50 %	0 %	549718582
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5593	NC_022543	GCT	2	6	357092	357097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718582
5594	NC_022543	TTG	2	6	357181	357186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718582
5595	NC_022543	GCC	2	6	357210	357215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718582
5596	NC_022543	TTG	2	6	357225	357230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718582
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5599	NC_022543	ACCCA	2	10	357374	357383	40 %	0 %	0 %	60 %	549718582
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5602	NC_022543	TTGGG	2	10	357529	357538	0 %	40 %	60 %	0 %	549718582
5603	NC_022543	GGC	2	6	357558	357563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718582
5604	NC_022543	CGTC	2	8	357586	357593	0 %	25 %	25 %	50 %	549718582
5605	NC_022543	GTA	2	6	357706	357711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718582
5606	NC_022543	GA	3	6	357767	357772	50 %	0 %	50 %	0 %	549718582
5607	NC_022543	GTA	2	6	357885	357890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718582
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5609	NC_022543	TTGT	2	8	357939	357946	0 %	75 %	25 %	0 %	549718582
5610	NC_022543	GTA	2	6	357948	357953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718582
5611	NC_022543	TGT	2	6	357971	357976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718582
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5614	NC_022543	GTATTC	2	12	358263	358274	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549718582
5615	NC_022543	TCGGT	2	10	358333	358342	0 %	40 %	40 %	20 %	549718582
5616	NC_022543	ATG	2	6	358366	358371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718582
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5618	NC_022543	GATGT	2	10	358426	358435	20 %	40 %	40 %	0 %	549718582
5619	NC_022543	GTC	2	6	358440	358445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718582
5620	NC_022543	ACC	2	6	358473	358478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718582
5621	NC_022543	TCG	2	6	358510	358515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718582
5622	NC_022543	TCA	2	6	358570	358575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718582
5623	NC_022543	CGGA	2	8	358612	358619	25 %	0 %	50 %	25 %	549718582
5624	NC_022543	GTT	2	6	358670	358675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718582
5625	NC_022543	TCT	2	6	358678	358683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718582
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5644	NC_022543	T	6	6	359929	359934	0 %	100 %	0 %	0 %	549718582
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5743	NC_022543	TCG	2	6	365824	365829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718587
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5987	NC_022543	CGA	2	6	380488	380493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718598
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5991	NC_022543	ACC	2	6	380633	380638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718598
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