MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 34971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022543	TCA	2	6	79	84	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718282
2	NC_022543	AC	3	6	108	113	50 %	0 %	0 %	50 %	549718282
3	NC_022543	AG	3	6	153	158	50 %	0 %	50 %	0 %	549718282
4	NC_022543	CAC	2	6	219	224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718282
5	NC_022543	TCT	2	6	226	231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718282
6	NC_022543	CAA	2	6	395	400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718282
7	NC_022543	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718282
8	NC_022543	TGG	2	6	578	583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718282
9	NC_022543	CTT	2	6	608	613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718282
10	NC_022543	CCA	2	6	644	649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718282
11	NC_022543	TTC	2	6	660	665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718282
12	NC_022543	CAC	2	6	702	707	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718282
13	NC_022543	CTTCC	2	10	726	735	0 %	40 %	0 %	60 %	549718282
14	NC_022543	ACG	2	6	774	779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718282
15	NC_022543	AGC	2	6	820	825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718282
16	NC_022543	GAA	2	6	861	866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718282
17	NC_022543	GAA	2	6	899	904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718282
18	NC_022543	CGG	2	6	909	914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718282
19	NC_022543	GAA	2	6	921	926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718282
20	NC_022543	CG	3	6	932	937	0 %	0 %	50 %	50 %	549718282
21	NC_022543	AGC	2	6	940	945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718282
22	NC_022543	GGTTT	2	10	983	992	0 %	60 %	40 %	0 %	549718282
23	NC_022543	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718282
24	NC_022543	CATC	2	8	1104	1111	25 %	25 %	0 %	50 %	549718282
25	NC_022543	TCTT	2	8	1195	1202	0 %	75 %	0 %	25 %	549718282
26	NC_022543	GCG	2	6	1235	1240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718282
27	NC_022543	TGA	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718282
28	NC_022543	T	6	6	1357	1362	0 %	100 %	0 %	0 %	549718282
29	NC_022543	GAT	2	6	1363	1368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718282
30	NC_022543	G	6	6	1437	1442	0 %	0 %	100 %	0 %	549718282
31	NC_022543	AAT	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718282
32	NC_022543	ACA	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718282
33	NC_022543	TTCA	2	8	1539	1546	25 %	50 %	0 %	25 %	549718282
34	NC_022543	TGCT	2	8	1606	1613	0 %	50 %	25 %	25 %	549718282
35	NC_022543	TCA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718282
36	NC_022543	TGG	2	6	1631	1636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718282
37	NC_022543	GCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718282
38	NC_022543	CCAG	2	8	1693	1700	25 %	0 %	25 %	50 %	549718282
39	NC_022543	CTT	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718282
40	NC_022543	CCG	2	6	1748	1753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718282
41	NC_022543	GCT	2	6	1763	1768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718282
42	NC_022543	TGC	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718282
43	NC_022543	GGT	2	6	1815	1820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718282
44	NC_022543	ATCC	2	8	1829	1836	25 %	25 %	0 %	50 %	549718282
45	NC_022543	CTA	2	6	1840	1845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718282
46	NC_022543	AGT	2	6	1870	1875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718282
47	NC_022543	CAA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718282
48	NC_022543	CAA	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718282
49	NC_022543	TAA	2	6	3450	3455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549718283
50	NC_022543	A	6	6	3465	3470	100 %	0 %	0 %	0 %	549718283
51	NC_022543	AGTTG	2	10	3484	3493	20 %	40 %	40 %	0 %	549718283
52	NC_022543	CAA	2	6	3506	3511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718283
53	NC_022543	AGA	2	6	3541	3546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718283
54	NC_022543	TCC	2	6	3565	3570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549718283
55	NC_022543	CGT	2	6	3611	3616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718283
56	NC_022543	AAG	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718283
57	NC_022543	ACA	2	6	3768	3773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718283
58	NC_022543	ATC	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718283
59	NC_022543	GCC	2	6	3842	3847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549718283
60	NC_022543	TCTG	2	8	3882	3889	0 %	50 %	25 %	25 %	549718283
61	NC_022543	TTGACC	2	12	3891	3902	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549718283
62	NC_022543	TCAGTG	2	12	3939	3950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549718283
63	NC_022543	ACA	2	6	3957	3962	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718283
64	NC_022543	CTG	2	6	3969	3974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718283
65	NC_022543	CAA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718283
66	NC_022543	TCGT	2	8	4152	4159	0 %	50 %	25 %	25 %	549718283
67	NC_022543	GAAA	2	8	4165	4172	75 %	0 %	25 %	0 %	549718283
68	NC_022543	TGA	2	6	4209	4214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718283
69	NC_022543	GACTG	2	10	4299	4308	20 %	20 %	40 %	20 %	549718283
70	NC_022543	A	6	6	4424	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	549718283
71	NC_022543	TGA	2	6	4476	4481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718283
72	NC_022543	CGA	2	6	4485	4490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718283
73	NC_022543	CTT	2	6	4583	4588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718283
74	NC_022543	AGA	2	6	4608	4613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718283
75	NC_022543	GT	3	6	4632	4637	0 %	50 %	50 %	0 %	549718283
76	NC_022543	GTC	2	6	4651	4656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718283
77	NC_022543	CAA	2	6	4726	4731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718284
78	NC_022543	AAG	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718284
79	NC_022543	GGCAG	2	10	4804	4813	20 %	0 %	60 %	20 %	549718284
80	NC_022543	GAA	2	6	4946	4951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718284
81	NC_022543	CAG	2	6	4958	4963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718284
82	NC_022543	GTC	2	6	4977	4982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718284
83	NC_022543	GAA	2	6	5047	5052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718284
84	NC_022543	TCTG	2	8	5104	5111	0 %	50 %	25 %	25 %	549718284
85	NC_022543	CA	3	6	5124	5129	50 %	0 %	0 %	50 %	549718284
86	NC_022543	GCT	2	6	5261	5266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718284
87	NC_022543	TTC	2	6	5345	5350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718284
88	NC_022543	GCA	2	6	5365	5370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718284
89	NC_022543	CTG	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718284
90	NC_022543	A	6	6	5384	5389	100 %	0 %	0 %	0 %	549718284
91	NC_022543	AAG	2	6	5454	5459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718284
92	NC_022543	AGC	2	6	5466	5471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718284
93	NC_022543	GAA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718284
94	NC_022543	A	6	6	5504	5509	100 %	0 %	0 %	0 %	549718284
95	NC_022543	TTA	2	6	5535	5540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718284
96	NC_022543	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718284
97	NC_022543	GAC	2	6	5600	5605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718284
98	NC_022543	TGG	2	6	5855	5860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718285
99	NC_022543	GAG	2	6	5863	5868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549718285
100	NC_022543	ATC	2	6	5969	5974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718285
101	NC_022543	TGGT	2	8	6074	6081	0 %	50 %	50 %	0 %	549718285
102	NC_022543	AGTG	2	8	6133	6140	25 %	25 %	50 %	0 %	549718285
103	NC_022543	AAGAT	2	10	6179	6188	60 %	20 %	20 %	0 %	549718285
104	NC_022543	A	6	6	6218	6223	100 %	0 %	0 %	0 %	549718285
105	NC_022543	GAA	2	6	6287	6292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718285
106	NC_022543	GAC	2	6	6293	6298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718285
107	NC_022543	TGA	2	6	6305	6310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718285
108	NC_022543	CGAGGG	2	12	6319	6330	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	549718285
109	NC_022543	GTC	2	6	6391	6396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718285
110	NC_022543	CAA	2	6	6407	6412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718285
111	NC_022543	GCTTGG	2	12	6450	6461	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549718285
112	NC_022543	ACC	2	6	6620	6625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718285
113	NC_022543	CTGG	2	8	6716	6723	0 %	25 %	50 %	25 %	549718285
114	NC_022543	TCAA	2	8	6737	6744	50 %	25 %	0 %	25 %	549718285
115	NC_022543	AGA	2	6	6759	6764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718285
116	NC_022543	CTT	2	6	6795	6800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718285
117	NC_022543	AGA	2	6	6816	6821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718285
118	NC_022543	TTG	2	6	6913	6918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718285
119	NC_022543	ATGGC	2	10	6991	7000	20 %	20 %	40 %	20 %	549718285
120	NC_022543	TTGG	2	8	7012	7019	0 %	50 %	50 %	0 %	549718285
121	NC_022543	TCT	2	6	7051	7056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549718285
122	NC_022543	CGT	2	6	7087	7092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718285
123	NC_022543	GAT	2	6	7141	7146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718285
124	NC_022543	AAAG	2	8	7202	7209	75 %	0 %	25 %	0 %	549718285
125	NC_022543	GGGT	2	8	7211	7218	0 %	25 %	75 %	0 %	549718285
126	NC_022543	GAA	2	6	7240	7245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718285
127	NC_022543	AGTGA	2	10	7255	7264	40 %	20 %	40 %	0 %	549718285
128	NC_022543	CCA	2	6	7274	7279	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718285
129	NC_022543	TGC	2	6	7301	7306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718285
130	NC_022543	GTG	2	6	7367	7372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718285
131	NC_022543	CTTT	2	8	7519	7526	0 %	75 %	0 %	25 %	549718285
132	NC_022543	ATG	2	6	7630	7635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718285
133	NC_022543	TTG	2	6	7673	7678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718285
134	NC_022543	AT	3	6	7755	7760	50 %	50 %	0 %	0 %	549718285
135	NC_022543	AGA	2	6	8246	8251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718286
136	NC_022543	TGAT	2	8	8326	8333	25 %	50 %	25 %	0 %	549718286
137	NC_022543	CCT	2	6	8335	8340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549718286
138	NC_022543	TCTTT	2	10	8384	8393	0 %	80 %	0 %	20 %	549718286
139	NC_022543	GT	3	6	8479	8484	0 %	50 %	50 %	0 %	549718286
140	NC_022543	ACG	2	6	8608	8613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718287
141	NC_022543	A	6	6	8628	8633	100 %	0 %	0 %	0 %	549718287
142	NC_022543	TGT	2	6	8654	8659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718287
143	NC_022543	GAA	2	6	8777	8782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718287
144	NC_022543	CTG	2	6	8797	8802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718287
145	NC_022543	TGGT	2	8	8814	8821	0 %	50 %	50 %	0 %	549718287
146	NC_022543	ATT	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718287
147	NC_022543	TTG	2	6	8999	9004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549718288
148	NC_022543	GCG	2	6	9056	9061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718288
149	NC_022543	CA	4	8	9115	9122	50 %	0 %	0 %	50 %	549718288
150	NC_022543	ATGAAA	2	12	9234	9245	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	549718288
151	NC_022543	AC	3	6	9303	9308	50 %	0 %	0 %	50 %	549718288
152	NC_022543	ATT	2	6	9455	9460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549718288
153	NC_022543	AGA	3	9	9589	9597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718288
154	NC_022543	GA	3	6	9666	9671	50 %	0 %	50 %	0 %	549718288
155	NC_022543	CAT	2	6	9684	9689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718288
156	NC_022543	AACA	2	8	9699	9706	75 %	0 %	0 %	25 %	549718288
157	NC_022543	CCACAA	2	12	9725	9736	50 %	0 %	0 %	50 %	549718288
158	NC_022543	GCA	3	9	9788	9796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718288
159	NC_022543	TCGACA	2	12	9840	9851	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549718288
160	NC_022543	TGG	2	6	9873	9878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718288
161	NC_022543	TCA	2	6	9888	9893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718288
162	NC_022543	TCTG	2	8	10069	10076	0 %	50 %	25 %	25 %	549718288
163	NC_022543	GTC	2	6	10077	10082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718288
164	NC_022543	ACG	2	6	10216	10221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718288
165	NC_022543	G	6	6	10273	10278	0 %	0 %	100 %	0 %	549718288
166	NC_022543	GAT	2	6	10301	10306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718288
167	NC_022543	A	6	6	10337	10342	100 %	0 %	0 %	0 %	549718288
168	NC_022543	GAA	2	6	10382	10387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718288
169	NC_022543	AGA	2	6	10441	10446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718288
170	NC_022543	GCG	2	6	10467	10472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549718288
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173	NC_022543	TGGC	2	8	10611	10618	0 %	25 %	50 %	25 %	549718288
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175	NC_022543	CAT	2	6	10645	10650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549718288
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252	NC_022543	ACA	2	6	14687	14692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718291
253	NC_022543	AGCA	2	8	14709	14716	50 %	0 %	25 %	25 %	549718291
254	NC_022543	GCCAA	2	10	14757	14766	40 %	0 %	20 %	40 %	549718291
255	NC_022543	TGAG	2	8	14789	14796	25 %	25 %	50 %	0 %	549718291
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260	NC_022543	AGC	2	6	15027	15032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549718292
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262	NC_022543	CAA	2	6	15056	15061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549718292
263	NC_022543	ACC	2	6	15066	15071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718292
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289	NC_022543	TGA	2	6	16349	16354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549718294
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387	NC_022543	CAC	2	6	22100	22105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549718298
388	NC_022543	AAG	2	6	22128	22133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718298
389	NC_022543	AG	3	6	22160	22165	50 %	0 %	50 %	0 %	549718298
390	NC_022543	AAG	2	6	22170	22175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718298
391	NC_022543	GGT	2	6	22196	22201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549718298
392	NC_022543	AAG	2	6	22311	22316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718298
393	NC_022543	A	6	6	22376	22381	100 %	0 %	0 %	0 %	549718298
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432	NC_022543	GAA	2	6	25281	25286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718302
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497	NC_022543	CT	3	6	29302	29307	0 %	50 %	0 %	50 %	549718304
498	NC_022543	GAA	2	6	29371	29376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549718304
499	NC_022543	CACC	2	8	29420	29427	25 %	0 %	0 %	75 %	549718304
500	NC_022543	TCG	3	9	29437	29445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549718304

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