MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 66358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
57001	NC_022528	GAA	2	6	3527953	3527958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690719
57002	NC_022528	ATG	2	6	3528289	3528294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690720
57003	NC_022528	TG	3	6	3528370	3528375	0 %	50 %	50 %	0 %	549690720
57004	NC_022528	TGT	2	6	3528435	3528440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690720
57005	NC_022528	ATCG	2	8	3528478	3528485	25 %	25 %	25 %	25 %	549690720
57006	NC_022528	AAT	2	6	3528607	3528612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549690720
57007	NC_022528	TTC	2	6	3528664	3528669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690720
57008	NC_022528	GGA	2	6	3528707	3528712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549690720
57009	NC_022528	CTT	2	6	3528804	3528809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690720
57010	NC_022528	GAC	2	6	3528896	3528901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690720
57011	NC_022528	TGA	2	6	3528906	3528911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690720
57012	NC_022528	T	6	6	3528916	3528921	0 %	100 %	0 %	0 %	549690720
57013	NC_022528	TC	3	6	3529004	3529009	0 %	50 %	0 %	50 %	549690721
57014	NC_022528	TGC	2	6	3529103	3529108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690721
57015	NC_022528	CTTTG	2	10	3529233	3529242	0 %	60 %	20 %	20 %	549690721
57016	NC_022528	CAT	2	6	3529261	3529266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690721
57017	NC_022528	CCAA	2	8	3529385	3529392	50 %	0 %	0 %	50 %	549690721
57018	NC_022528	CAAT	2	8	3529434	3529441	50 %	25 %	0 %	25 %	549690721
57019	NC_022528	TTG	2	6	3529477	3529482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690721
57020	NC_022528	GGT	2	6	3529579	3529584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549690721
57021	NC_022528	T	6	6	3529626	3529631	0 %	100 %	0 %	0 %	549690721
57022	NC_022528	ATC	2	6	3529646	3529651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690721
57023	NC_022528	A	6	6	3529691	3529696	100 %	0 %	0 %	0 %	549690721
57024	NC_022528	TCA	2	6	3529734	3529739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690721
57025	NC_022528	AT	3	6	3529759	3529764	50 %	50 %	0 %	0 %	549690721
57026	NC_022528	GTA	2	6	3529877	3529882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690721
57027	NC_022528	TCTT	2	8	3529974	3529981	0 %	75 %	0 %	25 %	549690721
57028	NC_022528	CAG	2	6	3529987	3529992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690721
57029	NC_022528	TTGAA	2	10	3530023	3530032	40 %	40 %	20 %	0 %	549690721
57030	NC_022528	ATT	2	6	3530048	3530053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549690721
57031	NC_022528	TGA	2	6	3530058	3530063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690721
57032	NC_022528	AGA	2	6	3530117	3530122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690721
57033	NC_022528	GCA	2	6	3530160	3530165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690721
57034	NC_022528	TAG	2	6	3530176	3530181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690721
57035	NC_022528	GCTT	2	8	3530210	3530217	0 %	50 %	25 %	25 %	549690721
57036	NC_022528	ACC	2	6	3530294	3530299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690721
57037	NC_022528	GCC	2	6	3530322	3530327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690721
57038	NC_022528	ACC	2	6	3530489	3530494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690721
57039	NC_022528	TAC	2	6	3530497	3530502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690721
57040	NC_022528	AAC	3	9	3530579	3530587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690721
57041	NC_022528	CGT	2	6	3530597	3530602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690721
57042	NC_022528	ACA	2	6	3530637	3530642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690721
57043	NC_022528	CTG	2	6	3530656	3530661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690721
57044	NC_022528	CTT	2	6	3530662	3530667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690721
57045	NC_022528	AGC	2	6	3530694	3530699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690721
57046	NC_022528	AGA	2	6	3530718	3530723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690721
57047	NC_022528	T	7	7	3530725	3530731	0 %	100 %	0 %	0 %	549690721
57048	NC_022528	GAA	2	6	3531254	3531259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690722
57049	NC_022528	CTGA	2	8	3531272	3531279	25 %	25 %	25 %	25 %	549690722
57050	NC_022528	GC	3	6	3531346	3531351	0 %	0 %	50 %	50 %	549690722
57051	NC_022528	TAC	2	6	3531386	3531391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690722
57052	NC_022528	CAGC	2	8	3531444	3531451	25 %	0 %	25 %	50 %	549690722
57053	NC_022528	GAA	2	6	3531608	3531613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690722
57054	NC_022528	AAC	2	6	3531627	3531632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690722
57055	NC_022528	ATG	2	6	3531639	3531644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690722
57056	NC_022528	CGT	2	6	3531709	3531714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690722
57057	NC_022528	AGA	2	6	3531798	3531803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690722
57058	NC_022528	AG	3	6	3531832	3531837	50 %	0 %	50 %	0 %	549690722
57059	NC_022528	TTG	2	6	3531848	3531853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690722
57060	NC_022528	CAATA	2	10	3531953	3531962	60 %	20 %	0 %	20 %	549690722
57061	NC_022528	GCC	2	6	3531965	3531970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690722
57062	NC_022528	CCG	2	6	3532048	3532053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690722
57063	NC_022528	TCC	2	6	3532111	3532116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549690722
57064	NC_022528	AC	3	6	3532229	3532234	50 %	0 %	0 %	50 %	549690722
57065	NC_022528	AC	3	6	3532274	3532279	50 %	0 %	0 %	50 %	549690722
57066	NC_022528	GAAA	2	8	3532304	3532311	75 %	0 %	25 %	0 %	549690722
57067	NC_022528	CTT	2	6	3532393	3532398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690723
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57070	NC_022528	A	7	7	3532504	3532510	100 %	0 %	0 %	0 %	549690723
57071	NC_022528	AGCA	2	8	3532582	3532589	50 %	0 %	25 %	25 %	549690723
57072	NC_022528	CA	3	6	3532659	3532664	50 %	0 %	0 %	50 %	549690723
57073	NC_022528	TTTTC	2	10	3532692	3532701	0 %	80 %	0 %	20 %	549690723
57074	NC_022528	T	6	6	3532758	3532763	0 %	100 %	0 %	0 %	549690724
57075	NC_022528	CTT	2	6	3532924	3532929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690724
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57077	NC_022528	TCAGC	2	10	3532963	3532972	20 %	20 %	20 %	40 %	549690724
57078	NC_022528	CAA	3	9	3533039	3533047	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690724
57079	NC_022528	GCT	2	6	3533063	3533068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690724
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57081	NC_022528	AGC	2	6	3533160	3533165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690724
57082	NC_022528	TCA	2	6	3533175	3533180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690724
57083	NC_022528	CT	3	6	3533249	3533254	0 %	50 %	0 %	50 %	549690724
57084	NC_022528	TTAGA	2	10	3533272	3533281	40 %	40 %	20 %	0 %	549690724
57085	NC_022528	TTG	2	6	3533348	3533353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690724
57086	NC_022528	AT	3	6	3533663	3533668	50 %	50 %	0 %	0 %	549690725
57087	NC_022528	TGG	2	6	3533711	3533716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549690725
57088	NC_022528	GCA	2	6	3533724	3533729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690725
57089	NC_022528	GA	3	6	3533773	3533778	50 %	0 %	50 %	0 %	549690725
57090	NC_022528	GGC	2	6	3533787	3533792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549690725
57091	NC_022528	CCATC	2	10	3533812	3533821	20 %	20 %	0 %	60 %	549690725
57092	NC_022528	CT	3	6	3533872	3533877	0 %	50 %	0 %	50 %	549690725
57093	NC_022528	AAT	2	6	3533886	3533891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549690725
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57100	NC_022528	TTG	2	6	3534646	3534651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690725
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57102	NC_022528	GAC	2	6	3534761	3534766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690725
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57104	NC_022528	GC	3	6	3534908	3534913	0 %	0 %	50 %	50 %	549690725
57105	NC_022528	CAT	2	6	3534941	3534946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690725
57106	NC_022528	CTTT	2	8	3535103	3535110	0 %	75 %	0 %	25 %	549690726
57107	NC_022528	ACG	2	6	3535150	3535155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690726
57108	NC_022528	AATA	2	8	3535305	3535312	75 %	25 %	0 %	0 %	549690726
57109	NC_022528	CAC	2	6	3535330	3535335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690726
57110	NC_022528	ATGGC	2	10	3535346	3535355	20 %	20 %	40 %	20 %	549690726
57111	NC_022528	TGC	2	6	3535384	3535389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690726
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57113	NC_022528	TTGCC	2	10	3535535	3535544	0 %	40 %	20 %	40 %	549690726
57114	NC_022528	ATC	2	6	3535591	3535596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690726
57115	NC_022528	TCA	2	6	3535607	3535612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690726
57116	NC_022528	CAT	2	6	3535634	3535639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690726
57117	NC_022528	CCCAT	2	10	3535735	3535744	20 %	20 %	0 %	60 %	549690726
57118	NC_022528	A	6	6	3535809	3535814	100 %	0 %	0 %	0 %	549690726
57119	NC_022528	AGCC	2	8	3535978	3535985	25 %	0 %	25 %	50 %	549690726
57120	NC_022528	GCA	2	6	3536008	3536013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690726
57121	NC_022528	CTG	2	6	3536043	3536048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690726
57122	NC_022528	GTC	2	6	3536224	3536229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690726
57123	NC_022528	ATC	2	6	3536269	3536274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690726
57124	NC_022528	TGC	2	6	3536276	3536281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690726
57125	NC_022528	CCT	2	6	3536293	3536298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549690726
57126	NC_022528	CCG	2	6	3536330	3536335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690726
57127	NC_022528	CCA	2	6	3536339	3536344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690726
57128	NC_022528	TTGT	2	8	3536403	3536410	0 %	75 %	25 %	0 %	549690726
57129	NC_022528	AATC	2	8	3536503	3536510	50 %	25 %	0 %	25 %	549690727
57130	NC_022528	GAA	2	6	3536551	3536556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690727
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57132	NC_022528	GCT	2	6	3536673	3536678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690727
57133	NC_022528	ACC	3	9	3536695	3536703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690727
57134	NC_022528	CAA	2	6	3536748	3536753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690727
57135	NC_022528	CTT	2	6	3536814	3536819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690727
57136	NC_022528	CAAT	2	8	3536847	3536854	50 %	25 %	0 %	25 %	549690727
57137	NC_022528	AGGAG	2	10	3536857	3536866	40 %	0 %	60 %	0 %	549690727
57138	NC_022528	CAA	2	6	3536901	3536906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690727
57139	NC_022528	CGCT	2	8	3536930	3536937	0 %	25 %	25 %	50 %	549690727
57140	NC_022528	AAG	2	6	3537080	3537085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690727
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57143	NC_022528	TG	3	6	3537110	3537115	0 %	50 %	50 %	0 %	549690727
57144	NC_022528	GCA	2	6	3537197	3537202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690727
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57146	NC_022528	CT	4	8	3537236	3537243	0 %	50 %	0 %	50 %	549690727
57147	NC_022528	TGA	2	6	3537408	3537413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690728
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57150	NC_022528	CCAT	2	8	3537614	3537621	25 %	25 %	0 %	50 %	549690728
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57170	NC_022528	AAG	2	6	3539071	3539076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690729
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57200	NC_022528	TGC	2	6	3540917	3540922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690730
57201	NC_022528	GCTG	2	8	3540932	3540939	0 %	25 %	50 %	25 %	549690730
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57206	NC_022528	ATTT	2	8	3541418	3541425	25 %	75 %	0 %	0 %	549690731
57207	NC_022528	TAC	2	6	3541509	3541514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690731
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57209	NC_022528	TCT	2	6	3541781	3541786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690731
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57218	NC_022528	ACG	2	6	3542172	3542177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690731
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57220	NC_022528	TGC	2	6	3542411	3542416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690732
57221	NC_022528	TACT	2	8	3542579	3542586	25 %	50 %	0 %	25 %	549690732
57222	NC_022528	A	6	6	3542592	3542597	100 %	0 %	0 %	0 %	549690732
57223	NC_022528	TCG	2	6	3542853	3542858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690732
57224	NC_022528	GCA	2	6	3542877	3542882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690732
57225	NC_022528	CAG	2	6	3543122	3543127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690733
57226	NC_022528	CCA	2	6	3543203	3543208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690733
57227	NC_022528	GAATAT	2	12	3543239	3543250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	549690733
57228	NC_022528	CGA	2	6	3543265	3543270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690733
57229	NC_022528	TGA	2	6	3543376	3543381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690733
57230	NC_022528	GCATT	2	10	3543486	3543495	20 %	40 %	20 %	20 %	549690733
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57232	NC_022528	GCT	2	6	3543522	3543527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690733
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