MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 66358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_022528	GAA	2	6	3357950	3357955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690574
54502	NC_022528	GAC	2	6	3357964	3357969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690574
54503	NC_022528	GT	3	6	3358014	3358019	0 %	50 %	50 %	0 %	549690574
54504	NC_022528	TTGA	2	8	3358023	3358030	25 %	50 %	25 %	0 %	549690574
54505	NC_022528	TCA	2	6	3358065	3358070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690574
54506	NC_022528	GTA	2	6	3358158	3358163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690574
54507	NC_022528	CGT	2	6	3358195	3358200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690574
54508	NC_022528	TAC	2	6	3358238	3358243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690574
54509	NC_022528	GTA	2	6	3358282	3358287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690574
54510	NC_022528	GCTCTG	2	12	3358309	3358320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690574
54511	NC_022528	CAA	2	6	3358351	3358356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690574
54512	NC_022528	TCA	2	6	3358422	3358427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690574
54513	NC_022528	AGAA	2	8	3358445	3358452	75 %	0 %	25 %	0 %	549690574
54514	NC_022528	CTA	2	6	3358471	3358476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690574
54515	NC_022528	TCA	3	9	3358491	3358499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690574
54516	NC_022528	GAT	2	6	3358526	3358531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690574
54517	NC_022528	TAG	2	6	3358556	3358561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690574
54518	NC_022528	ACC	2	6	3358616	3358621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690574
54519	NC_022528	GCA	2	6	3358632	3358637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690574
54520	NC_022528	CACGCT	2	12	3358744	3358755	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549690574
54521	NC_022528	CCG	2	6	3358797	3358802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690574
54522	NC_022528	AGT	2	6	3358817	3358822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690574
54523	NC_022528	GCA	2	6	3358830	3358835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690574
54524	NC_022528	GTT	2	6	3358842	3358847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690574
54525	NC_022528	AAG	2	6	3359116	3359121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690575
54526	NC_022528	GAT	2	6	3359231	3359236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690575
54527	NC_022528	CGA	2	6	3359241	3359246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690575
54528	NC_022528	TCT	2	6	3359280	3359285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690575
54529	NC_022528	TCA	2	6	3359305	3359310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690575
54530	NC_022528	AC	3	6	3359461	3359466	50 %	0 %	0 %	50 %	549690575
54531	NC_022528	GTT	2	6	3359468	3359473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690575
54532	NC_022528	CAC	2	6	3359527	3359532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690575
54533	NC_022528	TCA	2	6	3359541	3359546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690575
54534	NC_022528	ACAAAA	2	12	3359547	3359558	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	549690575
54535	NC_022528	CAG	2	6	3359572	3359577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690575
54536	NC_022528	ACC	2	6	3359615	3359620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690575
54537	NC_022528	CGAA	2	8	3359628	3359635	50 %	0 %	25 %	25 %	549690575
54538	NC_022528	CAC	2	6	3359656	3359661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690575
54539	NC_022528	CAA	2	6	3359734	3359739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690575
54540	NC_022528	CGG	2	6	3359824	3359829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549690575
54541	NC_022528	T	6	6	3359854	3359859	0 %	100 %	0 %	0 %	549690575
54542	NC_022528	TGT	2	6	3359966	3359971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690575
54543	NC_022528	CTG	2	6	3359989	3359994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690575
54544	NC_022528	CG	3	6	3360008	3360013	0 %	0 %	50 %	50 %	549690575
54545	NC_022528	TTC	2	6	3360026	3360031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690575
54546	NC_022528	CAGAG	2	10	3360185	3360194	40 %	0 %	40 %	20 %	549690575
54547	NC_022528	GTC	2	6	3360206	3360211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690575
54548	NC_022528	GTC	2	6	3360239	3360244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690575
54549	NC_022528	GTT	2	6	3360362	3360367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690575
54550	NC_022528	GTACGA	2	12	3360372	3360383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	549690575
54551	NC_022528	CTT	2	6	3360418	3360423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690575
54552	NC_022528	CAA	2	6	3360469	3360474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690575
54553	NC_022528	ATTGG	2	10	3360628	3360637	20 %	40 %	40 %	0 %	549690575
54554	NC_022528	ATG	2	6	3360879	3360884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690575
54555	NC_022528	GAT	2	6	3360892	3360897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690575
54556	NC_022528	AGT	3	9	3360929	3360937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690575
54557	NC_022528	GTGATT	2	12	3360948	3360959	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549690575
54558	NC_022528	GCTCCT	2	12	3360964	3360975	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549690575
54559	NC_022528	TCCA	2	8	3360978	3360985	25 %	25 %	0 %	50 %	549690575
54560	NC_022528	GCA	2	6	3360996	3361001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690575
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54562	NC_022528	CAG	2	6	3361318	3361323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690576
54563	NC_022528	AGC	2	6	3361331	3361336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690576
54564	NC_022528	CAC	2	6	3361348	3361353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690576
54565	NC_022528	CAAC	3	12	3361369	3361380	50 %	0 %	0 %	50 %	549690576
54566	NC_022528	ACC	2	6	3361439	3361444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690576
54567	NC_022528	CTT	2	6	3361492	3361497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690576
54568	NC_022528	CGA	2	6	3361671	3361676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690576
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54571	NC_022528	T	6	6	3362048	3362053	0 %	100 %	0 %	0 %	549690577
54572	NC_022528	GTA	2	6	3362058	3362063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690577
54573	NC_022528	TACA	2	8	3362077	3362084	50 %	25 %	0 %	25 %	549690577
54574	NC_022528	AAC	2	6	3362129	3362134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690577
54575	NC_022528	TTG	2	6	3362421	3362426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690578
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54579	NC_022528	TGA	2	6	3362669	3362674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690578
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54581	NC_022528	CA	4	8	3362812	3362819	50 %	0 %	0 %	50 %	549690579
54582	NC_022528	AGA	2	6	3362885	3362890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690579
54583	NC_022528	AATA	2	8	3362930	3362937	75 %	25 %	0 %	0 %	549690579
54584	NC_022528	GC	3	6	3363016	3363021	0 %	0 %	50 %	50 %	549690579
54585	NC_022528	AGTT	2	8	3363035	3363042	25 %	50 %	25 %	0 %	549690579
54586	NC_022528	CAC	2	6	3363055	3363060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690580
54587	NC_022528	TGC	2	6	3363131	3363136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690580
54588	NC_022528	TCAC	2	8	3363164	3363171	25 %	25 %	0 %	50 %	549690580
54589	NC_022528	GCT	2	6	3363188	3363193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690580
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54591	NC_022528	AC	3	6	3363321	3363326	50 %	0 %	0 %	50 %	549690580
54592	NC_022528	GT	3	6	3363333	3363338	0 %	50 %	50 %	0 %	549690580
54593	NC_022528	GT	3	6	3363490	3363495	0 %	50 %	50 %	0 %	549690581
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54596	NC_022528	TTC	2	6	3363624	3363629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690581
54597	NC_022528	GTTC	2	8	3363634	3363641	0 %	50 %	25 %	25 %	549690581
54598	NC_022528	CCA	2	6	3363653	3363658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690581
54599	NC_022528	GAT	2	6	3363688	3363693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690581
54600	NC_022528	CTT	2	6	3363698	3363703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690581
54601	NC_022528	GA	3	6	3363740	3363745	50 %	0 %	50 %	0 %	549690581
54602	NC_022528	GTTGAT	2	12	3363759	3363770	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549690581
54603	NC_022528	AAG	2	6	3363774	3363779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690581
54604	NC_022528	TCA	2	6	3363827	3363832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690581
54605	NC_022528	AGTAA	2	10	3363852	3363861	60 %	20 %	20 %	0 %	549690581
54606	NC_022528	GAC	2	6	3363941	3363946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690581
54607	NC_022528	GA	3	6	3363996	3364001	50 %	0 %	50 %	0 %	549690581
54608	NC_022528	GAT	2	6	3364074	3364079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690581
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54611	NC_022528	CGC	2	6	3364367	3364372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690582
54612	NC_022528	AGC	2	6	3364384	3364389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690582
54613	NC_022528	GT	3	6	3364430	3364435	0 %	50 %	50 %	0 %	549690582
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