MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio nigripulchritudo str. SFn1 chromosome

Total Repeats: 66358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_022528	AGAC	2	8	3328713	3328720	50 %	0 %	25 %	25 %	549690529
54002	NC_022528	GAT	2	6	3328833	3328838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690529
54003	NC_022528	TCA	2	6	3328901	3328906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690529
54004	NC_022528	TAA	2	6	3328991	3328996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549690529
54005	NC_022528	CCA	2	6	3329198	3329203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690529
54006	NC_022528	ATTG	2	8	3329207	3329214	25 %	50 %	25 %	0 %	549690529
54007	NC_022528	AC	4	8	3329257	3329264	50 %	0 %	0 %	50 %	549690529
54008	NC_022528	GTC	2	6	3329274	3329279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690529
54009	NC_022528	TCA	2	6	3329299	3329304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690529
54010	NC_022528	TTG	2	6	3329337	3329342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690529
54011	NC_022528	CTA	2	6	3329396	3329401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690529
54012	NC_022528	GCTT	2	8	3329423	3329430	0 %	50 %	25 %	25 %	549690529
54013	NC_022528	TTA	2	6	3329473	3329478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549690529
54014	NC_022528	GT	3	6	3329489	3329494	0 %	50 %	50 %	0 %	549690529
54015	NC_022528	TCA	3	9	3329513	3329521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690529
54016	NC_022528	GCTG	2	8	3329879	3329886	0 %	25 %	50 %	25 %	549690530
54017	NC_022528	GGC	2	6	3329913	3329918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549690530
54018	NC_022528	ATTAA	2	10	3329955	3329964	60 %	40 %	0 %	0 %	549690530
54019	NC_022528	ATC	2	6	3329967	3329972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690530
54020	NC_022528	GCA	2	6	3330054	3330059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690530
54021	NC_022528	AAG	2	6	3330070	3330075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690530
54022	NC_022528	AGAA	2	8	3330079	3330086	75 %	0 %	25 %	0 %	549690530
54023	NC_022528	CTT	2	6	3330263	3330268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690530
54024	NC_022528	GAC	2	6	3330282	3330287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690530
54025	NC_022528	ACT	2	6	3330340	3330345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690530
54026	NC_022528	CAT	2	6	3330356	3330361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690530
54027	NC_022528	GAA	2	6	3330468	3330473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690530
54028	NC_022528	CCG	2	6	3330502	3330507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690530
54029	NC_022528	GCTG	2	8	3330878	3330885	0 %	25 %	50 %	25 %	549690530
54030	NC_022528	GATGT	2	10	3330972	3330981	20 %	40 %	40 %	0 %	549690530
54031	NC_022528	TAT	2	6	3331451	3331456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549690530
54032	NC_022528	TCA	2	6	3331501	3331506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690530
54033	NC_022528	CAA	2	6	3331514	3331519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690530
54034	NC_022528	CAA	2	6	3331535	3331540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690530
54035	NC_022528	GTCA	2	8	3331623	3331630	25 %	25 %	25 %	25 %	549690530
54036	NC_022528	ACA	2	6	3331660	3331665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690530
54037	NC_022528	TTA	2	6	3331747	3331752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549690530
54038	NC_022528	GAC	2	6	3331791	3331796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690530
54039	NC_022528	TAA	2	6	3331904	3331909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549690531
54040	NC_022528	AGA	2	6	3331935	3331940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690531
54041	NC_022528	TCA	2	6	3332022	3332027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690531
54042	NC_022528	CTG	2	6	3332056	3332061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690531
54043	NC_022528	TCT	2	6	3332184	3332189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690531
54044	NC_022528	CTG	2	6	3332278	3332283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690531
54045	NC_022528	AAG	2	6	3332303	3332308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690531
54046	NC_022528	TGC	2	6	3332324	3332329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690531
54047	NC_022528	GAA	2	6	3332341	3332346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690531
54048	NC_022528	CA	4	8	3332427	3332434	50 %	0 %	0 %	50 %	549690531
54049	NC_022528	TCAGCC	2	12	3332435	3332446	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549690531
54050	NC_022528	CTTT	2	8	3332561	3332568	0 %	75 %	0 %	25 %	549690532
54051	NC_022528	CT	3	6	3332576	3332581	0 %	50 %	0 %	50 %	549690532
54052	NC_022528	CTG	2	6	3332693	3332698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690532
54053	NC_022528	GAA	2	6	3332711	3332716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690532
54054	NC_022528	ACC	2	6	3332765	3332770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690532
54055	NC_022528	AGT	2	6	3332782	3332787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690532
54056	NC_022528	AAAG	2	8	3332792	3332799	75 %	0 %	25 %	0 %	549690532
54057	NC_022528	TCAC	2	8	3332844	3332851	25 %	25 %	0 %	50 %	549690532
54058	NC_022528	ATT	2	6	3332910	3332915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549690532
54059	NC_022528	AG	3	6	3332987	3332992	50 %	0 %	50 %	0 %	549690532
54060	NC_022528	CGCT	2	8	3333007	3333014	0 %	25 %	25 %	50 %	549690533
54061	NC_022528	ATC	2	6	3333042	3333047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690533
54062	NC_022528	CTG	2	6	3333054	3333059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690533
54063	NC_022528	GCC	2	6	3333060	3333065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690533
54064	NC_022528	TGA	2	6	3333092	3333097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690533
54065	NC_022528	AAG	2	6	3333188	3333193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690533
54066	NC_022528	TTGG	2	8	3333237	3333244	0 %	50 %	50 %	0 %	549690533
54067	NC_022528	ATG	2	6	3333255	3333260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690533
54068	NC_022528	CGCT	2	8	3333280	3333287	0 %	25 %	25 %	50 %	549690533
54069	NC_022528	GTT	2	6	3333407	3333412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690533
54070	NC_022528	TGC	2	6	3333415	3333420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690533
54071	NC_022528	CTT	2	6	3333544	3333549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690533
54072	NC_022528	TCCC	2	8	3333555	3333562	0 %	25 %	0 %	75 %	549690533
54073	NC_022528	TCTGG	2	10	3333614	3333623	0 %	40 %	40 %	20 %	549690533
54074	NC_022528	CTGC	2	8	3333637	3333644	0 %	25 %	25 %	50 %	549690533
54075	NC_022528	GGC	2	6	3333671	3333676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549690533
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54077	NC_022528	ATG	2	6	3333816	3333821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690533
54078	NC_022528	A	6	6	3333827	3333832	100 %	0 %	0 %	0 %	549690533
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54080	NC_022528	ATGCC	2	10	3334142	3334151	20 %	20 %	20 %	40 %	549690534
54081	NC_022528	GTTG	2	8	3334241	3334248	0 %	50 %	50 %	0 %	549690534
54082	NC_022528	CA	3	6	3334300	3334305	50 %	0 %	0 %	50 %	549690534
54083	NC_022528	CTT	2	6	3334377	3334382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690534
54084	NC_022528	TTTG	2	8	3334416	3334423	0 %	75 %	25 %	0 %	549690534
54085	NC_022528	CAA	2	6	3334474	3334479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690534
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54088	NC_022528	CAA	2	6	3334649	3334654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690535
54089	NC_022528	CAA	2	6	3334680	3334685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690535
54090	NC_022528	TGCC	2	8	3334711	3334718	0 %	25 %	25 %	50 %	549690535
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54106	NC_022528	T	6	6	3335587	3335592	0 %	100 %	0 %	0 %	549690535
54107	NC_022528	AAAG	2	8	3335642	3335649	75 %	0 %	25 %	0 %	549690535
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54116	NC_022528	TGC	2	6	3336175	3336180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690536
54117	NC_022528	TGA	2	6	3336207	3336212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690536
54118	NC_022528	TCT	2	6	3336275	3336280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690536
54119	NC_022528	CCA	2	6	3336388	3336393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690537
54120	NC_022528	CAA	2	6	3336406	3336411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690537
54121	NC_022528	CCA	2	6	3336464	3336469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549690537
54122	NC_022528	TAC	2	6	3336502	3336507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690537
54123	NC_022528	TC	3	6	3336559	3336564	0 %	50 %	0 %	50 %	549690537
54124	NC_022528	CAT	2	6	3336566	3336571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690537
54125	NC_022528	CT	3	6	3336616	3336621	0 %	50 %	0 %	50 %	549690537
54126	NC_022528	TCG	2	6	3336748	3336753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690537
54127	NC_022528	CTG	2	6	3336832	3336837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690537
54128	NC_022528	CTCAT	2	10	3336846	3336855	20 %	40 %	0 %	40 %	549690537
54129	NC_022528	CAAG	2	8	3336860	3336867	50 %	0 %	25 %	25 %	549690537
54130	NC_022528	TAC	2	6	3336958	3336963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690537
54131	NC_022528	TTC	2	6	3337114	3337119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690538
54132	NC_022528	CTAT	2	8	3337140	3337147	25 %	50 %	0 %	25 %	549690538
54133	NC_022528	CTT	2	6	3337153	3337158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690538
54134	NC_022528	CGC	2	6	3337320	3337325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549690538
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54136	NC_022528	GA	3	6	3337356	3337361	50 %	0 %	50 %	0 %	549690538
54137	NC_022528	ACG	2	6	3337428	3337433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690538
54138	NC_022528	ACA	2	6	3337708	3337713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690539
54139	NC_022528	AGC	2	6	3337798	3337803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690539
54140	NC_022528	TCGAA	2	10	3337902	3337911	40 %	20 %	20 %	20 %	549690539
54141	NC_022528	TCA	2	6	3337951	3337956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690539
54142	NC_022528	A	7	7	3338069	3338075	100 %	0 %	0 %	0 %	549690539
54143	NC_022528	TG	3	6	3338087	3338092	0 %	50 %	50 %	0 %	549690539
54144	NC_022528	GCT	2	6	3338152	3338157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690539
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54147	NC_022528	TC	3	6	3338433	3338438	0 %	50 %	0 %	50 %	549690539
54148	NC_022528	CTCGAT	2	12	3338555	3338566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549690539
54149	NC_022528	ACG	2	6	3338571	3338576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690539
54150	NC_022528	TAC	2	6	3338579	3338584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549690539
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54152	NC_022528	CAA	2	6	3338767	3338772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690539
54153	NC_022528	AC	3	6	3338850	3338855	50 %	0 %	0 %	50 %	549690539
54154	NC_022528	TCAGCA	2	12	3338871	3338882	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549690539
54155	NC_022528	CTGT	2	8	3338920	3338927	0 %	50 %	25 %	25 %	549690539
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54174	NC_022528	TC	3	6	3339799	3339804	0 %	50 %	0 %	50 %	549690540
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54185	NC_022528	GAA	2	6	3340918	3340923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549690542
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54187	NC_022528	GAT	2	6	3341007	3341012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690542
54188	NC_022528	TGG	2	6	3341049	3341054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549690542
54189	NC_022528	TTC	2	6	3341094	3341099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690542
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54191	NC_022528	TGG	2	6	3341234	3341239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549690542
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54193	NC_022528	TCCA	2	8	3341436	3341443	25 %	25 %	0 %	50 %	549690543
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54195	NC_022528	ATG	2	6	3341596	3341601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690543
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54199	NC_022528	CA	3	6	3341761	3341766	50 %	0 %	0 %	50 %	549690543
54200	NC_022528	CAA	2	6	3341775	3341780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690543
54201	NC_022528	TCG	2	6	3341893	3341898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690543
54202	NC_022528	TTG	2	6	3341947	3341952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549690543
54203	NC_022528	TCG	2	6	3342007	3342012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690543
54204	NC_022528	CT	3	6	3342017	3342022	0 %	50 %	0 %	50 %	549690543
54205	NC_022528	TGG	2	6	3342035	3342040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549690543
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54213	NC_022528	ATG	2	6	3342481	3342486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690543
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54217	NC_022528	CAG	2	6	3342749	3342754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690544
54218	NC_022528	CTT	2	6	3342758	3342763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549690544
54219	NC_022528	CAA	2	6	3342782	3342787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690544
54220	NC_022528	AGC	2	6	3342864	3342869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690544
54221	NC_022528	GAC	2	6	3342938	3342943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690544
54222	NC_022528	ACG	2	6	3342988	3342993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690544
54223	NC_022528	CTTTTG	2	12	3343004	3343015	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549690544
54224	NC_022528	AGT	2	6	3343020	3343025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549690544
54225	NC_022528	AG	3	6	3343048	3343053	50 %	0 %	50 %	0 %	549690544
54226	NC_022528	CTG	2	6	3343087	3343092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549690544
54227	NC_022528	GTTGA	2	10	3343098	3343107	20 %	40 %	40 %	0 %	549690544
54228	NC_022528	TGG	2	6	3343178	3343183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549690545
54229	NC_022528	AGAC	2	8	3343208	3343215	50 %	0 %	25 %	25 %	549690545
54230	NC_022528	GGATC	2	10	3343390	3343399	20 %	20 %	40 %	20 %	549690545
54231	NC_022528	CTTCT	2	10	3343409	3343418	0 %	60 %	0 %	40 %	549690545
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54233	NC_022528	ACG	2	6	3343490	3343495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690545
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54345	NC_022528	CG	3	6	3348677	3348682	0 %	0 %	50 %	50 %	549690554
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54462	NC_022528	CAG	2	6	3354879	3354884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690569
54463	NC_022528	AGC	2	6	3354967	3354972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549690569
54464	NC_022528	CAA	2	6	3355086	3355091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549690569
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