MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio campbellii ATCC BAA-1116 chromosome I

Total Repeats: 59490

< Previous12...6263646566676869707172...118119Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33004	NC_022269	GC	3	6	2106444	2106449	0 %	0 %	50 %	50 %	541867963
33005	NC_022269	A	7	7	2106463	2106469	100 %	0 %	0 %	0 %	541867963
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33009	NC_022269	ACA	2	6	2106851	2106856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867963
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33018	NC_022269	GAT	2	6	2107314	2107319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867963
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33021	NC_022269	TGA	2	6	2107388	2107393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867963
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33029	NC_022269	CTGAA	2	10	2107645	2107654	40 %	20 %	20 %	20 %	541867963
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33032	NC_022269	GAA	2	6	2107743	2107748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541867963
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33050	NC_022269	CTG	2	6	2108947	2108952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867965
33051	NC_022269	TCTG	2	8	2108966	2108973	0 %	50 %	25 %	25 %	541867965
33052	NC_022269	TCT	2	6	2109032	2109037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541867965
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33054	NC_022269	TAC	2	6	2109143	2109148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867965
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33084	NC_022269	TGA	2	6	2110406	2110411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867965
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33087	NC_022269	AAGC	2	8	2110521	2110528	50 %	0 %	25 %	25 %	541867965
33088	NC_022269	ACA	2	6	2110549	2110554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867965
33089	NC_022269	TGA	2	6	2110618	2110623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867965
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33099	NC_022269	CCAA	2	8	2111425	2111432	50 %	0 %	0 %	50 %	541869744
33100	NC_022269	ATT	2	6	2111468	2111473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541869744
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33106	NC_022269	TGA	2	6	2111874	2111879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541869744
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33113	NC_022269	GAC	2	6	2112181	2112186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541869744
33114	NC_022269	AGCA	2	8	2112199	2112206	50 %	0 %	25 %	25 %	541869744
33115	NC_022269	ACT	2	6	2112216	2112221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869744
33116	NC_022269	TCA	2	6	2112237	2112242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869744
33117	NC_022269	ATT	2	6	2112317	2112322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541869744
33118	NC_022269	A	7	7	2112388	2112394	100 %	0 %	0 %	0 %	541869744
33119	NC_022269	ACCT	2	8	2112485	2112492	25 %	25 %	0 %	50 %	541869744
33120	NC_022269	TGG	2	6	2112535	2112540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541869744
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33122	NC_022269	GAA	2	6	2112634	2112639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541869744
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33124	NC_022269	ATC	2	6	2112700	2112705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869744
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33126	NC_022269	GGC	2	6	2112757	2112762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541869744
33127	NC_022269	GC	3	6	2112767	2112772	0 %	0 %	50 %	50 %	541869744
33128	NC_022269	TCG	2	6	2112785	2112790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541869744
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33144	NC_022269	ATC	2	6	2113723	2113728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867966
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33201	NC_022269	AGCA	2	8	2116874	2116881	50 %	0 %	25 %	25 %	541867968
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33203	NC_022269	ACGAT	2	10	2116938	2116947	40 %	20 %	20 %	20 %	541867968
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33216	NC_022269	GCA	2	6	2117535	2117540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867969
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33218	NC_022269	A	6	6	2117583	2117588	100 %	0 %	0 %	0 %	541867969
33219	NC_022269	CGT	2	6	2117607	2117612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867969
33220	NC_022269	GTG	2	6	2117649	2117654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	541867969
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33223	NC_022269	T	6	6	2117685	2117690	0 %	100 %	0 %	0 %	541867969
33224	NC_022269	GAA	2	6	2117729	2117734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541867969
33225	NC_022269	GATT	2	8	2117789	2117796	25 %	50 %	25 %	0 %	541867969
33226	NC_022269	CG	3	6	2117808	2117813	0 %	0 %	50 %	50 %	541867969
33227	NC_022269	A	7	7	2117819	2117825	100 %	0 %	0 %	0 %	541867969
33228	NC_022269	GAA	2	6	2117904	2117909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	541867969
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33230	NC_022269	TCT	3	9	2118123	2118131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541867970
33231	NC_022269	CTA	2	6	2118159	2118164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867970
33232	NC_022269	TTCT	2	8	2118235	2118242	0 %	75 %	0 %	25 %	541867970
33233	NC_022269	AAC	2	6	2118407	2118412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867970
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33236	NC_022269	CTCTT	2	10	2118542	2118551	0 %	60 %	0 %	40 %	541867970
33237	NC_022269	CGA	2	6	2118576	2118581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867970
33238	NC_022269	CTT	2	6	2118610	2118615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541867970
33239	NC_022269	CAC	2	6	2118673	2118678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541867970
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33241	NC_022269	GCG	2	6	2118726	2118731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541867970
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33243	NC_022269	TCT	2	6	2118788	2118793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541867970
33244	NC_022269	GC	3	6	2118822	2118827	0 %	0 %	50 %	50 %	541867970
33245	NC_022269	CAAG	2	8	2118852	2118859	50 %	0 %	25 %	25 %	541867970
33246	NC_022269	ATCA	2	8	2118874	2118881	50 %	25 %	0 %	25 %	541867970
33247	NC_022269	ACCA	2	8	2118953	2118960	50 %	0 %	0 %	50 %	541867970
33248	NC_022269	AGTTTC	2	12	2118967	2118978	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	541867970
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33252	NC_022269	CTT	2	6	2119108	2119113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541867970
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33254	NC_022269	TTTC	2	8	2119203	2119210	0 %	75 %	0 %	25 %	541867970
33255	NC_022269	ATC	2	6	2119217	2119222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867970
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33258	NC_022269	ATC	2	6	2119447	2119452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867970
33259	NC_022269	GAT	2	6	2119482	2119487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867970
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33262	NC_022269	AAT	2	6	2119567	2119572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541867970
33263	NC_022269	CTG	2	6	2119619	2119624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867970
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33266	NC_022269	GTA	2	6	2119720	2119725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867970
33267	NC_022269	CT	3	6	2119730	2119735	0 %	50 %	0 %	50 %	541867970
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33271	NC_022269	TCA	2	6	2119866	2119871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867970
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33292	NC_022269	TCA	2	6	2121286	2121291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541869746
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33300	NC_022269	TGA	2	6	2121653	2121658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541869746
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33328	NC_022269	ATA	2	6	2123395	2123400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	541867972
33329	NC_022269	GCTT	2	8	2123403	2123410	0 %	50 %	25 %	25 %	541867972
33330	NC_022269	GC	3	6	2123429	2123434	0 %	0 %	50 %	50 %	541867972
33331	NC_022269	CAG	2	6	2123554	2123559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867972
33332	NC_022269	ACTT	2	8	2123590	2123597	25 %	50 %	0 %	25 %	541867972
33333	NC_022269	CCA	2	6	2123632	2123637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541867972
33334	NC_022269	AGCCA	2	10	2123653	2123662	40 %	0 %	20 %	40 %	541867972
33335	NC_022269	CTG	2	6	2123801	2123806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	541867972
33336	NC_022269	TC	3	6	2123902	2123907	0 %	50 %	0 %	50 %	541867972
33337	NC_022269	CTTAT	2	10	2123911	2123920	20 %	60 %	0 %	20 %	541867972
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33340	NC_022269	CCA	3	9	2124200	2124208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	541867973
33341	NC_022269	GGC	2	6	2124210	2124215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	541867973
33342	NC_022269	CT	3	6	2124248	2124253	0 %	50 %	0 %	50 %	541867973
33343	NC_022269	CAA	2	6	2124254	2124259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	541867973
33344	NC_022269	GC	3	6	2124300	2124305	0 %	0 %	50 %	50 %	541867973
33345	NC_022269	ATT	2	6	2124313	2124318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	541867973
33346	NC_022269	AGC	2	6	2124333	2124338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867973
33347	NC_022269	CTT	2	6	2124379	2124384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	541867973
33348	NC_022269	CAT	2	6	2124431	2124436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867973
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33353	NC_022269	GTA	2	6	2124603	2124608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	541867973
33354	NC_022269	TAC	2	6	2124630	2124635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867973
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33464	NC_022269	CAG	2	6	2131202	2131207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	541867981
33465	NC_022269	CAT	2	6	2131274	2131279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	541867981
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