MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022247	GCT	2	6	130654	130659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392361
3502	NC_022247	GC	4	8	130690	130697	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3503	NC_022247	CCA	2	6	130729	130734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392361
3504	NC_022247	CATG	2	8	130746	130753	25 %	25 %	25 %	25 %	538392361
3505	NC_022247	CG	3	6	130783	130788	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3506	NC_022247	TCGA	2	8	130932	130939	25 %	25 %	25 %	25 %	538392361
3507	NC_022247	GC	3	6	131000	131005	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3508	NC_022247	GC	3	6	131007	131012	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3509	NC_022247	CGGC	2	8	131026	131033	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3510	NC_022247	GCT	2	6	131042	131047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392361
3511	NC_022247	CTT	2	6	131066	131071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392361
3512	NC_022247	GCC	2	6	131077	131082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392361
3513	NC_022247	GAC	2	6	131091	131096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392361
3514	NC_022247	CGCC	2	8	131102	131109	0 %	0 %	25 %	75 %	538392361
3515	NC_022247	CG	3	6	131164	131169	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3516	NC_022247	CGG	2	6	131179	131184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392361
3517	NC_022247	CTG	2	6	131217	131222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392361
3518	NC_022247	GCG	2	6	131273	131278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392361
3519	NC_022247	GCG	2	6	131290	131295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392361
3520	NC_022247	CG	3	6	131304	131309	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3521	NC_022247	GGC	2	6	131316	131321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392361
3522	NC_022247	CCGCG	2	10	131327	131336	0 %	0 %	40 %	60 %	538392361
3523	NC_022247	TTC	2	6	131406	131411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392361
3524	NC_022247	GC	3	6	131429	131434	0 %	0 %	50 %	50 %	538392361
3525	NC_022247	GGT	2	6	131517	131522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392362
3526	NC_022247	CG	3	6	131538	131543	0 %	0 %	50 %	50 %	538392362
3527	NC_022247	CTG	2	6	131545	131550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392362
3528	NC_022247	TCG	2	6	131552	131557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392362
3529	NC_022247	GCG	2	6	131612	131617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392362
3530	NC_022247	AGC	2	6	131618	131623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392362
3531	NC_022247	ACG	2	6	131660	131665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392362
3532	NC_022247	CG	3	6	131667	131672	0 %	0 %	50 %	50 %	538392362
3533	NC_022247	GCA	2	6	131714	131719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392362
3534	NC_022247	GCG	2	6	131720	131725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392362
3535	NC_022247	CCGCG	2	10	131734	131743	0 %	0 %	40 %	60 %	538392362
3536	NC_022247	GC	3	6	131764	131769	0 %	0 %	50 %	50 %	538392362
3537	NC_022247	GCT	2	6	131802	131807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392362
3538	NC_022247	GCGCG	2	10	131840	131849	0 %	0 %	60 %	40 %	538392362
3539	NC_022247	CGC	2	6	131924	131929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392362
3540	NC_022247	CAC	2	6	131950	131955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392362
3541	NC_022247	TGC	2	6	131975	131980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392362
3542	NC_022247	TGC	2	6	131984	131989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392362
3543	NC_022247	GCG	2	6	132000	132005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392362
3544	NC_022247	GTG	2	6	132244	132249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392363
3545	NC_022247	CAG	3	9	132256	132264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392363
3546	NC_022247	GCA	2	6	132285	132290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392363
3547	NC_022247	CGG	2	6	132291	132296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392363
3548	NC_022247	AGC	2	6	132308	132313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392363
3549	NC_022247	TGG	2	6	132324	132329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392363
3550	NC_022247	CG	3	6	132337	132342	0 %	0 %	50 %	50 %	538392363
3551	NC_022247	ATC	2	6	132383	132388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392363
3552	NC_022247	CAG	2	6	132412	132417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392363
3553	NC_022247	GCG	2	6	132439	132444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392363
3554	NC_022247	GC	3	6	132591	132596	0 %	0 %	50 %	50 %	538392363
3555	NC_022247	CG	3	6	132608	132613	0 %	0 %	50 %	50 %	538392363
3556	NC_022247	CGC	2	6	132620	132625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392363
3557	NC_022247	GCT	2	6	132672	132677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392363
3558	NC_022247	CAAG	2	8	132735	132742	50 %	0 %	25 %	25 %	538392363
3559	NC_022247	TTC	2	6	132749	132754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392363
3560	NC_022247	GCG	2	6	132793	132798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392363
3561	NC_022247	CGC	2	6	132828	132833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392363
3562	NC_022247	CAC	2	6	132835	132840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392363
3563	NC_022247	CG	3	6	132875	132880	0 %	0 %	50 %	50 %	538392363
3564	NC_022247	GCA	2	6	132933	132938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392363
3565	NC_022247	CGCA	2	8	132939	132946	25 %	0 %	25 %	50 %	538392363
3566	NC_022247	AGA	2	6	132963	132968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392363
3567	NC_022247	AGT	2	6	132987	132992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392363
3568	NC_022247	GC	3	6	133014	133019	0 %	0 %	50 %	50 %	538392363
3569	NC_022247	TCG	2	6	133073	133078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392363
3570	NC_022247	CAA	2	6	133111	133116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392363
3571	NC_022247	CGC	2	6	133129	133134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392363
3572	NC_022247	GCTC	2	8	133140	133147	0 %	25 %	25 %	50 %	538392363
3573	NC_022247	ACGAC	2	10	133196	133205	40 %	0 %	20 %	40 %	538392363
3574	NC_022247	CCG	2	6	133209	133214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392363
3575	NC_022247	TGC	2	6	133247	133252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392363
3576	NC_022247	CACAA	2	10	133269	133278	60 %	0 %	0 %	40 %	538392363
3577	NC_022247	ACGC	2	8	133318	133325	25 %	0 %	25 %	50 %	538392363
3578	NC_022247	CG	3	6	133353	133358	0 %	0 %	50 %	50 %	538392363
3579	NC_022247	CCG	2	6	133359	133364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392363
3580	NC_022247	CG	4	8	133363	133370	0 %	0 %	50 %	50 %	538392363
3581	NC_022247	CTTG	2	8	133392	133399	0 %	50 %	25 %	25 %	538392363
3582	NC_022247	CAC	2	6	133410	133415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392363
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3585	NC_022247	ACG	2	6	133454	133459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392363
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3587	NC_022247	CG	3	6	133653	133658	0 %	0 %	50 %	50 %	538392364
3588	NC_022247	CGCC	2	8	133671	133678	0 %	0 %	25 %	75 %	538392364
3589	NC_022247	CAC	2	6	133679	133684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392364
3590	NC_022247	TCA	2	6	133687	133692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392364
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3592	NC_022247	TCG	2	6	133797	133802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392364
3593	NC_022247	CCG	2	6	133822	133827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392364
3594	NC_022247	CG	3	6	133849	133854	0 %	0 %	50 %	50 %	538392364
3595	NC_022247	TCG	2	6	133863	133868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392364
3596	NC_022247	CGA	2	6	133924	133929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392364
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3598	NC_022247	GCG	2	6	134015	134020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392364
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3600	NC_022247	CGC	2	6	134029	134034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392364
3601	NC_022247	GC	3	6	134033	134038	0 %	0 %	50 %	50 %	538392364
3602	NC_022247	GC	3	6	134044	134049	0 %	0 %	50 %	50 %	538392364
3603	NC_022247	CGC	2	6	134264	134269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392364
3604	NC_022247	TGA	2	6	134275	134280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392364
3605	NC_022247	TTG	3	9	134319	134327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392364
3606	NC_022247	GTC	2	6	134375	134380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392364
3607	NC_022247	GCA	2	6	134395	134400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392364
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3609	NC_022247	GAA	2	6	134585	134590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392364
3610	NC_022247	GC	3	6	134592	134597	0 %	0 %	50 %	50 %	538392364
3611	NC_022247	GTC	2	6	134612	134617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392364
3612	NC_022247	CGA	2	6	134659	134664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392364
3613	NC_022247	GC	3	6	134686	134691	0 %	0 %	50 %	50 %	538392364
3614	NC_022247	CCG	2	6	134695	134700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392364
3615	NC_022247	GCCG	2	8	134711	134718	0 %	0 %	50 %	50 %	538392364
3616	NC_022247	TCA	2	6	134764	134769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392364
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3618	NC_022247	GCG	3	9	134843	134851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392364
3619	NC_022247	CTG	2	6	134861	134866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392364
3620	NC_022247	GCC	2	6	134876	134881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392364
3621	NC_022247	CAGC	2	8	134891	134898	25 %	0 %	25 %	50 %	538392364
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3623	NC_022247	TGC	2	6	134953	134958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392364
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3865	NC_022247	GCAT	2	8	143642	143649	25 %	25 %	25 %	25 %	538392373
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3990	NC_022247	CGA	2	6	148194	148199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392378
3991	NC_022247	GC	3	6	148209	148214	0 %	0 %	50 %	50 %	538392378
3992	NC_022247	GC	3	6	148241	148246	0 %	0 %	50 %	50 %	538392378
3993	NC_022247	GTCATC	2	12	148247	148258	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538392378
3994	NC_022247	CG	3	6	148269	148274	0 %	0 %	50 %	50 %	538392378
3995	NC_022247	TCG	2	6	148334	148339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392378
3996	NC_022247	CG	3	6	148359	148364	0 %	0 %	50 %	50 %	538392378
3997	NC_022247	AGC	2	6	148365	148370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392378
3998	NC_022247	GC	3	6	148369	148374	0 %	0 %	50 %	50 %	538392378
3999	NC_022247	CCA	2	6	148380	148385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392378
4000	NC_022247	CGA	2	6	148425	148430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392378

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