MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022247	CCT	2	6	620010	620015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392804
16502	NC_022247	CGT	2	6	620031	620036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392804
16503	NC_022247	TGA	2	6	620037	620042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392804
16504	NC_022247	GGCG	2	8	620049	620056	0 %	0 %	75 %	25 %	538392804
16505	NC_022247	TG	3	6	620181	620186	0 %	50 %	50 %	0 %	538392804
16506	NC_022247	CGA	2	6	620321	620326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392805
16507	NC_022247	CGC	2	6	620342	620347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392805
16508	NC_022247	GAT	2	6	620414	620419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392805
16509	NC_022247	TGA	2	6	620485	620490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392805
16510	NC_022247	CGC	2	6	620566	620571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392805
16511	NC_022247	GCA	2	6	620581	620586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392805
16512	NC_022247	CGA	2	6	620669	620674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392805
16513	NC_022247	CCTGAT	2	12	620681	620692	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538392805
16514	NC_022247	CGG	2	6	620714	620719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392805
16515	NC_022247	CG	3	6	620759	620764	0 %	0 %	50 %	50 %	538392805
16516	NC_022247	CGG	2	6	620810	620815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392805
16517	NC_022247	ACA	2	6	620827	620832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392805
16518	NC_022247	CG	4	8	620834	620841	0 %	0 %	50 %	50 %	538392805
16519	NC_022247	CCG	2	6	620848	620853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392805
16520	NC_022247	CGG	2	6	620905	620910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392805
16521	NC_022247	AGC	2	6	620929	620934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392805
16522	NC_022247	ATA	2	6	620954	620959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538392805
16523	NC_022247	CGGT	2	8	621017	621024	0 %	25 %	50 %	25 %	538392806
16524	NC_022247	GTCC	2	8	621081	621088	0 %	25 %	25 %	50 %	538392806
16525	NC_022247	TCGTGC	2	12	621116	621127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392806
16526	NC_022247	GGCGC	2	10	621132	621141	0 %	0 %	60 %	40 %	538392806
16527	NC_022247	CGC	2	6	621147	621152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392806
16528	NC_022247	GCC	3	9	621172	621180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392806
16529	NC_022247	TGC	2	6	621234	621239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392806
16530	NC_022247	AAT	2	6	621410	621415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538392807
16531	NC_022247	TCC	2	6	621426	621431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392807
16532	NC_022247	GCC	2	6	621441	621446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392807
16533	NC_022247	CGC	2	6	621479	621484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392807
16534	NC_022247	GCCCG	2	10	621491	621500	0 %	0 %	40 %	60 %	538392807
16535	NC_022247	GCT	2	6	621503	621508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16536	NC_022247	CGA	2	6	621530	621535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16537	NC_022247	GGC	2	6	621582	621587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392807
16538	NC_022247	GCG	2	6	621599	621604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392807
16539	NC_022247	GCG	3	9	621644	621652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392807
16540	NC_022247	ACG	2	6	621763	621768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16541	NC_022247	TGC	2	6	621769	621774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16542	NC_022247	TTCC	2	8	621785	621792	0 %	50 %	0 %	50 %	538392807
16543	NC_022247	GCGAGG	2	12	621796	621807	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	538392807
16544	NC_022247	GAT	2	6	621815	621820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392807
16545	NC_022247	ACA	2	6	621832	621837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392807
16546	NC_022247	CG	4	8	621857	621864	0 %	0 %	50 %	50 %	538392807
16547	NC_022247	GAG	2	6	621870	621875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392807
16548	NC_022247	GCT	2	6	621878	621883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16549	NC_022247	GTG	2	6	621909	621914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392807
16550	NC_022247	GGCT	2	8	621918	621925	0 %	25 %	50 %	25 %	538392807
16551	NC_022247	CGC	2	6	621935	621940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392807
16552	NC_022247	CCG	2	6	621958	621963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392807
16553	NC_022247	CGA	2	6	621977	621982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16554	NC_022247	GCG	2	6	622027	622032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392807
16555	NC_022247	GTGGC	2	10	622086	622095	0 %	20 %	60 %	20 %	538392807
16556	NC_022247	GC	3	6	622094	622099	0 %	0 %	50 %	50 %	538392807
16557	NC_022247	GC	4	8	622106	622113	0 %	0 %	50 %	50 %	538392807
16558	NC_022247	GCT	2	6	622118	622123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16559	NC_022247	GGC	2	6	622130	622135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392807
16560	NC_022247	TGG	2	6	622150	622155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392807
16561	NC_022247	GCC	2	6	622160	622165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392807
16562	NC_022247	GCCC	2	8	622168	622175	0 %	0 %	25 %	75 %	538392807
16563	NC_022247	CTG	2	6	622179	622184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16564	NC_022247	GCA	2	6	622208	622213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16565	NC_022247	GAC	2	6	622218	622223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16566	NC_022247	GCG	2	6	622264	622269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392807
16567	NC_022247	ACG	2	6	622288	622293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392807
16568	NC_022247	GC	3	6	622306	622311	0 %	0 %	50 %	50 %	538392807
16569	NC_022247	GCC	2	6	622419	622424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392807
16570	NC_022247	GT	3	6	622499	622504	0 %	50 %	50 %	0 %	538392808
16571	NC_022247	A	7	7	622519	622525	100 %	0 %	0 %	0 %	538392808
16572	NC_022247	CGCGC	2	10	622531	622540	0 %	0 %	40 %	60 %	538392808
16573	NC_022247	CCA	2	6	622602	622607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392808
16574	NC_022247	TCGACT	2	12	622620	622631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538392808
16575	NC_022247	CAA	2	6	622675	622680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392808
16576	NC_022247	GC	3	6	622700	622705	0 %	0 %	50 %	50 %	538392808
16577	NC_022247	GTG	2	6	622748	622753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392808
16578	NC_022247	ATCGAG	2	12	622802	622813	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538392808
16579	NC_022247	CTA	2	6	622861	622866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392808
16580	NC_022247	GCT	2	6	622903	622908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16581	NC_022247	GCAGC	2	10	622921	622930	20 %	0 %	40 %	40 %	538392808
16582	NC_022247	GC	3	6	622946	622951	0 %	0 %	50 %	50 %	538392808
16583	NC_022247	GTG	2	6	622952	622957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392808
16584	NC_022247	AGC	2	6	622968	622973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16585	NC_022247	CGC	2	6	622978	622983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392808
16586	NC_022247	CTG	2	6	623018	623023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16587	NC_022247	GAA	2	6	623080	623085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392808
16588	NC_022247	AGC	2	6	623121	623126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16589	NC_022247	GAC	2	6	623159	623164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16590	NC_022247	TCG	2	6	623199	623204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16591	NC_022247	AGACCG	2	12	623226	623237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16592	NC_022247	AGCCCG	2	12	623244	623255	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392808
16593	NC_022247	ATC	2	6	623291	623296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392808
16594	NC_022247	GCT	2	6	623308	623313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16595	NC_022247	GCAGC	2	10	623314	623323	20 %	0 %	40 %	40 %	538392808
16596	NC_022247	CGG	2	6	623341	623346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392808
16597	NC_022247	GGC	2	6	623350	623355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392808
16598	NC_022247	CGGC	2	8	623358	623365	0 %	0 %	50 %	50 %	538392808
16599	NC_022247	AGG	2	6	623385	623390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392808
16600	NC_022247	CGC	2	6	623452	623457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392808
16601	NC_022247	AGC	4	12	623462	623473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392808
16602	NC_022247	CGCA	2	8	623476	623483	25 %	0 %	25 %	50 %	538392808
16603	NC_022247	GCC	2	6	623501	623506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392808
16604	NC_022247	CG	3	6	623519	623524	0 %	0 %	50 %	50 %	538392808
16605	NC_022247	GAA	2	6	623550	623555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392809
16606	NC_022247	CGC	2	6	623592	623597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392809
16607	NC_022247	CTA	2	6	623628	623633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392809
16608	NC_022247	GGC	2	6	623672	623677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392809
16609	NC_022247	GC	4	8	623691	623698	0 %	0 %	50 %	50 %	538392809
16610	NC_022247	GCG	2	6	623711	623716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392809
16611	NC_022247	TTC	2	6	623722	623727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392809
16612	NC_022247	GCA	2	6	623739	623744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392809
16613	NC_022247	GCT	2	6	623766	623771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392809
16614	NC_022247	GCT	2	6	623802	623807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392809
16615	NC_022247	CCG	2	6	623819	623824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392809
16616	NC_022247	GCT	2	6	623829	623834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392809
16617	NC_022247	GCG	2	6	623839	623844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392809
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16619	NC_022247	TCGACC	2	12	623918	623929	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538392809
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16741	NC_022247	CGAGGT	2	12	629705	629716	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538392813
16742	NC_022247	CCA	2	6	629770	629775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392813
16743	NC_022247	CG	3	6	629798	629803	0 %	0 %	50 %	50 %	538392813
16744	NC_022247	CGC	2	6	629806	629811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392813
16745	NC_022247	GGC	2	6	629822	629827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392813
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16769	NC_022247	TGC	3	9	631203	631211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392814
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16855	NC_022247	GCA	2	6	634015	634020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392815
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16857	NC_022247	GGC	2	6	634065	634070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392815
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16980	NC_022247	CGC	2	6	638200	638205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392816
16981	NC_022247	TGA	2	6	638209	638214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392816
16982	NC_022247	CGA	2	6	638245	638250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392816
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16984	NC_022247	CCG	2	6	638338	638343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392816
16985	NC_022247	CGT	2	6	638377	638382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392816
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