MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022247	CG	4	8	39090	39097	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1002	NC_022247	CG	3	6	39115	39120	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1003	NC_022247	GCT	2	6	39138	39143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1004	NC_022247	CGA	2	6	39159	39164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1005	NC_022247	GC	3	6	39166	39171	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1006	NC_022247	CG	4	8	39180	39187	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1007	NC_022247	TGC	2	6	39224	39229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1008	NC_022247	GC	4	8	39269	39276	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1009	NC_022247	CGA	2	6	39282	39287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1010	NC_022247	CGAA	2	8	39305	39312	50 %	0 %	25 %	25 %	538392268
1011	NC_022247	CGG	2	6	39363	39368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392268
1012	NC_022247	CGA	2	6	39414	39419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1013	NC_022247	AGCGC	2	10	39441	39450	20 %	0 %	40 %	40 %	538392268
1014	NC_022247	GGGCCT	2	12	39507	39518	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392268
1015	NC_022247	GC	3	6	39529	39534	0 %	0 %	50 %	50 %	538392268
1016	NC_022247	CTG	2	6	39544	39549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392268
1017	NC_022247	CGG	3	9	39623	39631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392268
1018	NC_022247	GCC	3	9	39717	39725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1019	NC_022247	GGC	2	6	39773	39778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1020	NC_022247	CGA	2	6	39818	39823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1021	NC_022247	GTC	2	6	39825	39830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1022	NC_022247	CCTT	2	8	39832	39839	0 %	50 %	0 %	50 %	538392269
1023	NC_022247	GTT	2	6	39873	39878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392269
1024	NC_022247	CCAT	2	8	39881	39888	25 %	25 %	0 %	50 %	538392269
1025	NC_022247	GCC	2	6	39897	39902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1026	NC_022247	GGC	2	6	39915	39920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1027	NC_022247	CG	3	6	39959	39964	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1028	NC_022247	GCC	2	6	39966	39971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1029	NC_022247	GAT	2	6	39984	39989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392269
1030	NC_022247	AGGCC	2	10	39998	40007	20 %	0 %	40 %	40 %	538392269
1031	NC_022247	GCT	2	6	40019	40024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1032	NC_022247	CAC	2	6	40026	40031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392269
1033	NC_022247	CGT	2	6	40067	40072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1034	NC_022247	GCC	3	9	40110	40118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1035	NC_022247	GC	3	6	40135	40140	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1036	NC_022247	CAG	3	9	40149	40157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1037	NC_022247	TGC	2	6	40175	40180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1038	NC_022247	GTC	2	6	40188	40193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392269
1039	NC_022247	TTG	2	6	40201	40206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392269
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1041	NC_022247	GC	3	6	40293	40298	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1042	NC_022247	GGC	2	6	40299	40304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1043	NC_022247	TTC	2	6	40332	40337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392269
1044	NC_022247	GC	3	6	40348	40353	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1045	NC_022247	CGA	2	6	40367	40372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392269
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1047	NC_022247	GCC	2	6	40443	40448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
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1049	NC_022247	GCC	2	6	40509	40514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392269
1050	NC_022247	GCCCTG	2	12	40593	40604	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392269
1051	NC_022247	TGA	2	6	40628	40633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392269
1052	NC_022247	CGG	2	6	40640	40645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1053	NC_022247	GC	3	6	40648	40653	0 %	0 %	50 %	50 %	538392269
1054	NC_022247	GTA	2	6	40659	40664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392269
1055	NC_022247	GGC	2	6	40668	40673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1056	NC_022247	GCGA	2	8	40697	40704	25 %	0 %	50 %	25 %	538392269
1057	NC_022247	GCG	2	6	40715	40720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392269
1058	NC_022247	AG	4	8	40772	40779	50 %	0 %	50 %	0 %	538392269
1059	NC_022247	GCG	2	6	40882	40887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392270
1060	NC_022247	GCC	4	12	41009	41020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392270
1061	NC_022247	CGA	2	6	41089	41094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
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1063	NC_022247	GCT	2	6	41131	41136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392270
1064	NC_022247	GCA	2	6	41140	41145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
1065	NC_022247	GCA	2	6	41149	41154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
1066	NC_022247	CGC	2	6	41203	41208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392270
1067	NC_022247	CAGGC	2	10	41217	41226	20 %	0 %	40 %	40 %	538392270
1068	NC_022247	GCG	2	6	41256	41261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392270
1069	NC_022247	CCG	2	6	41317	41322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392270
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1071	NC_022247	CG	3	6	41371	41376	0 %	0 %	50 %	50 %	538392270
1072	NC_022247	GCCC	2	8	41440	41447	0 %	0 %	25 %	75 %	538392270
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1075	NC_022247	CG	4	8	41494	41501	0 %	0 %	50 %	50 %	538392270
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1079	NC_022247	GC	3	6	41669	41674	0 %	0 %	50 %	50 %	538392270
1080	NC_022247	TCGCC	2	10	41680	41689	0 %	20 %	20 %	60 %	538392270
1081	NC_022247	CGA	2	6	41722	41727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
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1083	NC_022247	GCACGC	2	12	41815	41826	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392270
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1088	NC_022247	GAC	2	6	41975	41980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
1089	NC_022247	CGA	2	6	42004	42009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
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1092	NC_022247	GCCG	2	8	42110	42117	0 %	0 %	50 %	50 %	538392270
1093	NC_022247	TGA	2	6	42202	42207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392270
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1095	NC_022247	GCG	2	6	42289	42294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392270
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1098	NC_022247	GCA	2	6	42343	42348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
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1102	NC_022247	CGC	2	6	42448	42453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392270
1103	NC_022247	CAC	2	6	42464	42469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392270
1104	NC_022247	TGC	2	6	42480	42485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392270
1105	NC_022247	ACG	2	6	42486	42491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392270
1106	NC_022247	CTT	2	6	42551	42556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392270
1107	NC_022247	GCG	2	6	42643	42648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392270
1108	NC_022247	GCT	2	6	42656	42661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392270
1109	NC_022247	GCC	2	6	42683	42688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392270
1110	NC_022247	CGTT	2	8	42702	42709	0 %	50 %	25 %	25 %	538392270
1111	NC_022247	GTT	2	6	42713	42718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392270
1112	NC_022247	GCT	3	9	42719	42727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392270
1113	NC_022247	TCC	2	6	42797	42802	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392271
1114	NC_022247	TCT	2	6	42870	42875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392271
1115	NC_022247	GGC	2	6	42901	42906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392271
1116	NC_022247	AGC	2	6	42932	42937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392271
1117	NC_022247	TCG	2	6	42950	42955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392271
1118	NC_022247	GCG	2	6	43001	43006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392271
1119	NC_022247	CGCGG	2	10	43044	43053	0 %	0 %	60 %	40 %	538392271
1120	NC_022247	CAG	2	6	43054	43059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392271
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1122	NC_022247	CG	4	8	43200	43207	0 %	0 %	50 %	50 %	538392271
1123	NC_022247	GAA	2	6	43239	43244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392271
1124	NC_022247	GC	3	6	43325	43330	0 %	0 %	50 %	50 %	538392271
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1126	NC_022247	CG	3	6	43354	43359	0 %	0 %	50 %	50 %	538392271
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1252	NC_022247	A	6	6	49319	49324	100 %	0 %	0 %	0 %	538392278
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1259	NC_022247	CGC	2	6	49540	49545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392279
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1344	NC_022247	GCGT	2	8	52396	52403	0 %	25 %	50 %	25 %	538392282
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1368	NC_022247	CGC	2	6	53496	53501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392283
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1372	NC_022247	GAA	2	6	53674	53679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392283
1373	NC_022247	GCC	2	6	53681	53686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392283
1374	NC_022247	TCGA	2	8	53698	53705	25 %	25 %	25 %	25 %	538392283
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