MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
145001	NC_022247	CTG	2	6	5651846	5651851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145002	NC_022247	TGG	2	6	5651875	5651880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397528
145003	NC_022247	GGC	2	6	5651903	5651908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397528
145004	NC_022247	CTGC	2	8	5651943	5651950	0 %	25 %	25 %	50 %	538397528
145005	NC_022247	CAAGC	2	10	5651955	5651964	40 %	0 %	20 %	40 %	538397528
145006	NC_022247	TGT	2	6	5651971	5651976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397528
145007	NC_022247	CAATG	2	10	5652060	5652069	40 %	20 %	20 %	20 %	538397528
145008	NC_022247	AAC	2	6	5652198	5652203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
145009	NC_022247	TGGGC	2	10	5652241	5652250	0 %	20 %	60 %	20 %	538397528
145010	NC_022247	CAG	2	6	5652257	5652262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145011	NC_022247	TCG	2	6	5652312	5652317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145012	NC_022247	CCG	2	6	5652355	5652360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397528
145013	NC_022247	TAC	2	6	5652390	5652395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397528
145014	NC_022247	CTCGA	2	10	5652447	5652456	20 %	20 %	20 %	40 %	538397528
145015	NC_022247	ACT	2	6	5652511	5652516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397528
145016	NC_022247	A	6	6	5652547	5652552	100 %	0 %	0 %	0 %	538397528
145017	NC_022247	ACA	2	6	5652562	5652567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
145018	NC_022247	CTC	2	6	5652702	5652707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538397528
145019	NC_022247	GACG	2	8	5652710	5652717	25 %	0 %	50 %	25 %	538397528
145020	NC_022247	GCA	2	6	5652770	5652775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145021	NC_022247	GAC	2	6	5652804	5652809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145022	NC_022247	GA	3	6	5652857	5652862	50 %	0 %	50 %	0 %	538397528
145023	NC_022247	CCA	2	6	5652907	5652912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397528
145024	NC_022247	CAA	2	6	5652935	5652940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
145025	NC_022247	CAC	2	6	5652965	5652970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397528
145026	NC_022247	AACCCG	2	12	5653001	5653012	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538397528
145027	NC_022247	ACCG	2	8	5653130	5653137	25 %	0 %	25 %	50 %	538397528
145028	NC_022247	CAG	3	9	5653169	5653177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145029	NC_022247	TGA	2	6	5653223	5653228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397528
145030	NC_022247	ACG	2	6	5653299	5653304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145031	NC_022247	TAC	2	6	5653395	5653400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397528
145032	NC_022247	AGC	2	6	5653446	5653451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145033	NC_022247	GCA	2	6	5653456	5653461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145034	NC_022247	GCA	2	6	5653474	5653479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145035	NC_022247	GCA	2	6	5653517	5653522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145036	NC_022247	CCA	2	6	5653684	5653689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397528
145037	NC_022247	CGA	2	6	5653694	5653699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145038	NC_022247	TAC	2	6	5653734	5653739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397528
145039	NC_022247	CGT	2	6	5653781	5653786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145040	NC_022247	GCA	2	6	5653796	5653801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145041	NC_022247	TGG	2	6	5653846	5653851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397528
145042	NC_022247	ACA	2	6	5653858	5653863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
145043	NC_022247	GCT	2	6	5653995	5654000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145044	NC_022247	CAA	2	6	5654144	5654149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
145045	NC_022247	CAA	2	6	5654159	5654164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
145046	NC_022247	GCG	2	6	5654191	5654196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397528
145047	NC_022247	CAA	2	6	5654231	5654236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
145048	NC_022247	CGC	2	6	5654243	5654248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397528
145049	NC_022247	CAT	2	6	5654282	5654287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397528
145050	NC_022247	ACGCCG	2	12	5654329	5654340	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538397528
145051	NC_022247	CG	3	6	5654371	5654376	0 %	0 %	50 %	50 %	538397528
145052	NC_022247	GTG	2	6	5654382	5654387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538397528
145053	NC_022247	ACG	2	6	5654401	5654406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145054	NC_022247	TGC	2	6	5654410	5654415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145055	NC_022247	GCC	2	6	5654427	5654432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538397528
145056	NC_022247	GCGG	2	8	5654442	5654449	0 %	0 %	75 %	25 %	538397528
145057	NC_022247	TTG	3	9	5654596	5654604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397528
145058	NC_022247	GCG	2	6	5654617	5654622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397528
145059	NC_022247	CTA	2	6	5654630	5654635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397528
145060	NC_022247	GCG	2	6	5654734	5654739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538397528
145061	NC_022247	ACA	3	9	5654773	5654781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
145062	NC_022247	CTG	3	9	5654835	5654843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145063	NC_022247	CCA	2	6	5654851	5654856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397528
145064	NC_022247	GCA	3	9	5654863	5654871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397528
145065	NC_022247	ACA	2	6	5654923	5654928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397528
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145072	NC_022247	GC	3	6	5655215	5655220	0 %	0 %	50 %	50 %	538397528
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145086	NC_022247	CTCC	2	8	5656221	5656228	0 %	25 %	0 %	75 %	538397529
145087	NC_022247	GCCGT	2	10	5656294	5656303	0 %	20 %	40 %	40 %	538397529
145088	NC_022247	ACGC	2	8	5656349	5656356	25 %	0 %	25 %	50 %	538397529
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145091	NC_022247	ATGCT	2	10	5656575	5656584	20 %	40 %	20 %	20 %	538397530
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145096	NC_022247	TTCA	2	8	5657097	5657104	25 %	50 %	0 %	25 %	538397531
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145098	NC_022247	CAA	2	6	5657411	5657416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538397531
145099	NC_022247	CAG	2	6	5657512	5657517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397531
145100	NC_022247	TGT	2	6	5657530	5657535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538397531
145101	NC_022247	GTA	2	6	5657561	5657566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397531
145102	NC_022247	CAC	2	6	5657666	5657671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397531
145103	NC_022247	CCTC	2	8	5657676	5657683	0 %	25 %	0 %	75 %	538397531
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145108	NC_022247	ACT	2	6	5657982	5657987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538397531
145109	NC_022247	TGA	2	6	5658019	5658024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397531
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145111	NC_022247	AGGAA	2	10	5658243	5658252	60 %	0 %	40 %	0 %	538397531
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145113	NC_022247	CGGT	2	8	5658271	5658278	0 %	25 %	50 %	25 %	538397532
145114	NC_022247	GCA	2	6	5658319	5658324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397532
145115	NC_022247	GAA	2	6	5658338	5658343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397532
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145126	NC_022247	TCGT	2	8	5658866	5658873	0 %	50 %	25 %	25 %	538397532
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145133	NC_022247	GCTC	2	8	5659079	5659086	0 %	25 %	25 %	50 %	538397533
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145210	NC_022247	GTTG	2	8	5663164	5663171	0 %	50 %	50 %	0 %	538397536
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145215	NC_022247	ATG	2	6	5663590	5663595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397537
145216	NC_022247	GATC	2	8	5663598	5663605	25 %	25 %	25 %	25 %	538397537
145217	NC_022247	CGA	2	6	5663615	5663620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397537
145218	NC_022247	ACC	2	6	5663831	5663836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397537
145219	NC_022247	CCA	2	6	5663934	5663939	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538397537
145220	NC_022247	AGC	2	6	5664001	5664006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538397537
145221	NC_022247	TAG	2	6	5664010	5664015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397537
145222	NC_022247	AC	3	6	5664200	5664205	50 %	0 %	0 %	50 %	538397538
145223	NC_022247	ATG	2	6	5664216	5664221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538397538
145224	NC_022247	A	7	7	5664233	5664239	100 %	0 %	0 %	0 %	538397538
145225	NC_022247	TCCA	2	8	5664506	5664513	25 %	25 %	0 %	50 %	538397538
145226	NC_022247	AGA	2	6	5664528	5664533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538397538
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145339	NC_022247	GCCA	2	8	5671120	5671127	25 %	0 %	25 %	50 %	538397543
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