MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_022247	CAG	2	6	490834	490839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13003	NC_022247	CGC	2	6	490876	490881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13004	NC_022247	CAC	2	6	490906	490911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392686
13005	NC_022247	GCC	3	9	490915	490923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13006	NC_022247	GCC	2	6	490927	490932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13007	NC_022247	TGA	2	6	490968	490973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392686
13008	NC_022247	ACG	2	6	490994	490999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13009	NC_022247	GCA	2	6	491028	491033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13010	NC_022247	AGC	2	6	491039	491044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13011	NC_022247	GGT	2	6	491071	491076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392686
13012	NC_022247	TCG	2	6	491081	491086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13013	NC_022247	CGC	2	6	491154	491159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13014	NC_022247	GTG	2	6	491168	491173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392686
13015	NC_022247	CAC	2	6	491407	491412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392686
13016	NC_022247	GCCC	2	8	491439	491446	0 %	0 %	25 %	75 %	538392686
13017	NC_022247	TGAAGC	2	12	491454	491465	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538392686
13018	NC_022247	CG	4	8	491487	491494	0 %	0 %	50 %	50 %	538392686
13019	NC_022247	TGC	2	6	491556	491561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13020	NC_022247	GCG	2	6	491562	491567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392686
13021	NC_022247	TGA	2	6	491595	491600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392686
13022	NC_022247	CGGC	2	8	491640	491647	0 %	0 %	50 %	50 %	538392686
13023	NC_022247	GC	3	6	491655	491660	0 %	0 %	50 %	50 %	538392686
13024	NC_022247	GC	3	6	491671	491676	0 %	0 %	50 %	50 %	538392686
13025	NC_022247	CGG	2	6	491679	491684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392686
13026	NC_022247	GCCCGA	2	12	491716	491727	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392686
13027	NC_022247	GTT	2	6	491785	491790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392686
13028	NC_022247	GGTC	2	8	491823	491830	0 %	25 %	50 %	25 %	538392686
13029	NC_022247	GCG	2	6	491858	491863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392686
13030	NC_022247	CGC	2	6	491864	491869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13031	NC_022247	CGG	2	6	491884	491889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392686
13032	NC_022247	CTT	2	6	491926	491931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392686
13033	NC_022247	GCG	2	6	491953	491958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392686
13034	NC_022247	TCT	2	6	491973	491978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392686
13035	NC_022247	GCC	2	6	492020	492025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13036	NC_022247	CGCC	2	8	492056	492063	0 %	0 %	25 %	75 %	538392686
13037	NC_022247	CGG	2	6	492102	492107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392686
13038	NC_022247	TCG	2	6	492122	492127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13039	NC_022247	TCG	2	6	492224	492229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392686
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13041	NC_022247	TGCGC	2	10	492282	492291	0 %	20 %	40 %	40 %	538392686
13042	NC_022247	CGC	2	6	492294	492299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13043	NC_022247	CGT	2	6	492348	492353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392686
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13046	NC_022247	CGC	2	6	492501	492506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13047	NC_022247	GCCGA	2	10	492516	492525	20 %	0 %	40 %	40 %	538392686
13048	NC_022247	CCA	2	6	492531	492536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392686
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13050	NC_022247	GCC	2	6	492571	492576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
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13052	NC_022247	GCGCC	2	10	492652	492661	0 %	0 %	40 %	60 %	538392686
13053	NC_022247	GAT	2	6	492670	492675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392686
13054	NC_022247	CTT	2	6	492691	492696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392686
13055	NC_022247	CTT	2	6	492703	492708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392686
13056	NC_022247	GCC	2	6	492758	492763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392686
13057	NC_022247	GCA	3	9	492771	492779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13058	NC_022247	CTG	2	6	492781	492786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13059	NC_022247	CGTCGA	2	12	492816	492827	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392686
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13061	NC_022247	GCG	2	6	492877	492882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392686
13062	NC_022247	GA	4	8	492914	492921	50 %	0 %	50 %	0 %	538392686
13063	NC_022247	CCA	2	6	492930	492935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392686
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13065	NC_022247	AGT	2	6	493041	493046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392686
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13067	NC_022247	GCT	2	6	493176	493181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392686
13068	NC_022247	GC	5	10	493192	493201	0 %	0 %	50 %	50 %	538392686
13069	NC_022247	CAC	2	6	493213	493218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392686
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13072	NC_022247	CG	3	6	493353	493358	0 %	0 %	50 %	50 %	538392686
13073	NC_022247	ATC	2	6	493373	493378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392686
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13084	NC_022247	GC	3	6	493871	493876	0 %	0 %	50 %	50 %	538392686
13085	NC_022247	CAA	2	6	494097	494102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392687
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13091	NC_022247	ACC	2	6	494374	494379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392687
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13114	NC_022247	GCCT	2	8	495137	495144	0 %	25 %	25 %	50 %	538392688
13115	NC_022247	GC	4	8	495173	495180	0 %	0 %	50 %	50 %	538392688
13116	NC_022247	GACG	2	8	495186	495193	25 %	0 %	50 %	25 %	538392688
13117	NC_022247	CGC	2	6	495272	495277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392688
13118	NC_022247	GC	3	6	495308	495313	0 %	0 %	50 %	50 %	538392688
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13120	NC_022247	GC	3	6	495353	495358	0 %	0 %	50 %	50 %	538392688
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13239	NC_022247	GAA	2	6	500850	500855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392694
13240	NC_022247	GAC	4	12	500863	500874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392694
13241	NC_022247	TCG	2	6	500887	500892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392694
13242	NC_022247	ATCGAG	2	12	500938	500949	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538392694
13243	NC_022247	GGCC	2	8	501012	501019	0 %	0 %	50 %	50 %	538392694
13244	NC_022247	ATGCG	2	10	501080	501089	20 %	20 %	40 %	20 %	538392694
13245	NC_022247	CG	4	8	501123	501130	0 %	0 %	50 %	50 %	538392694
13246	NC_022247	GGCA	2	8	501151	501158	25 %	0 %	50 %	25 %	538392694
13247	NC_022247	GAA	3	9	501312	501320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392694
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13250	NC_022247	GAA	2	6	501564	501569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392694
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13252	NC_022247	GCT	2	6	501606	501611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392694
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13354	NC_022247	ACC	2	6	505615	505620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392700
13355	NC_022247	CGG	2	6	505644	505649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392700
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13474	NC_022247	CTG	2	6	509941	509946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392703
13475	NC_022247	CCG	2	6	509947	509952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392703
13476	NC_022247	GCA	2	6	509958	509963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392703
13477	NC_022247	CTG	2	6	509983	509988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392703
13478	NC_022247	GC	3	6	510035	510040	0 %	0 %	50 %	50 %	538392703
13479	NC_022247	GCTGTC	2	12	510042	510053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392703
13480	NC_022247	GTG	2	6	510067	510072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392703
13481	NC_022247	GGT	2	6	510081	510086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392703
13482	NC_022247	GGCG	2	8	510087	510094	0 %	0 %	75 %	25 %	538392703
13483	NC_022247	TTC	2	6	510118	510123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392703
13484	NC_022247	CTG	2	6	510184	510189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392703
13485	NC_022247	TCG	2	6	510203	510208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392703
13486	NC_022247	GTG	2	6	510256	510261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392703
13487	NC_022247	CG	3	6	510286	510291	0 %	0 %	50 %	50 %	538392703
13488	NC_022247	CG	3	6	510311	510316	0 %	0 %	50 %	50 %	538392703
13489	NC_022247	CGG	2	6	510326	510331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392703
13490	NC_022247	CG	3	6	510332	510337	0 %	0 %	50 %	50 %	538392703
13491	NC_022247	TGC	2	6	510377	510382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392703
13492	NC_022247	CTCG	2	8	510414	510421	0 %	25 %	25 %	50 %	538392703
13493	NC_022247	CCTCGG	2	12	510462	510473	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392703
13494	NC_022247	GCC	2	6	510480	510485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392703
13495	NC_022247	GC	3	6	510517	510522	0 %	0 %	50 %	50 %	538392703
13496	NC_022247	TGC	2	6	510530	510535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392703
13497	NC_022247	GC	3	6	510534	510539	0 %	0 %	50 %	50 %	538392703
13498	NC_022247	TGG	2	6	510541	510546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392703
13499	NC_022247	TCT	2	6	510772	510777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392704
13500	NC_022247	GCG	2	6	510816	510821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392704

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