MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022247	CCA	2	6	381823	381828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392584
10002	NC_022247	GTC	2	6	381836	381841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392584
10003	NC_022247	CGG	2	6	381874	381879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392584
10004	NC_022247	TCT	3	9	381919	381927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392584
10005	NC_022247	CTGG	2	8	381941	381948	0 %	25 %	50 %	25 %	538392584
10006	NC_022247	CTT	2	6	381953	381958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392584
10007	NC_022247	CGC	2	6	382138	382143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
10008	NC_022247	GTGG	2	8	382169	382176	0 %	25 %	75 %	0 %	538392585
10009	NC_022247	GCT	2	6	382180	382185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392585
10010	NC_022247	CAC	2	6	382199	382204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392585
10011	NC_022247	CCGA	2	8	382207	382214	25 %	0 %	25 %	50 %	538392585
10012	NC_022247	GC	3	6	382232	382237	0 %	0 %	50 %	50 %	538392585
10013	NC_022247	GCC	2	6	382253	382258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
10014	NC_022247	GGC	2	6	382287	382292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392585
10015	NC_022247	TCA	2	6	382362	382367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392585
10016	NC_022247	GCA	2	6	382372	382377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392585
10017	NC_022247	CGC	2	6	382401	382406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
10018	NC_022247	GC	3	6	382463	382468	0 %	0 %	50 %	50 %	538392585
10019	NC_022247	CCA	2	6	382473	382478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392585
10020	NC_022247	TCGCCG	2	12	382496	382507	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392585
10021	NC_022247	CGGCA	2	10	382523	382532	20 %	0 %	40 %	40 %	538392585
10022	NC_022247	CGC	2	6	382573	382578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
10023	NC_022247	AGC	2	6	382635	382640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392585
10024	NC_022247	GCC	2	6	382657	382662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
10025	NC_022247	CGGC	2	8	382665	382672	0 %	0 %	50 %	50 %	538392585
10026	NC_022247	GCC	2	6	382675	382680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
10027	NC_022247	GCC	2	6	382684	382689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392585
10028	NC_022247	CGGCC	2	10	382843	382852	0 %	0 %	40 %	60 %	538392585
10029	NC_022247	CG	3	6	382889	382894	0 %	0 %	50 %	50 %	538392585
10030	NC_022247	CG	3	6	382921	382926	0 %	0 %	50 %	50 %	538392585
10031	NC_022247	GAA	2	6	382947	382952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392585
10032	NC_022247	CTT	3	9	382991	382999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392586
10033	NC_022247	CTG	2	6	383029	383034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392586
10034	NC_022247	GCC	2	6	383038	383043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392586
10035	NC_022247	TCG	2	6	383051	383056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392586
10036	NC_022247	CGG	2	6	383203	383208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392586
10037	NC_022247	GCT	2	6	383259	383264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392586
10038	NC_022247	TCA	2	6	383291	383296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392586
10039	NC_022247	GGCCCT	2	12	383402	383413	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392586
10040	NC_022247	TGCGC	2	10	383426	383435	0 %	20 %	40 %	40 %	538392586
10041	NC_022247	CG	3	6	383438	383443	0 %	0 %	50 %	50 %	538392586
10042	NC_022247	CGT	2	6	383454	383459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392586
10043	NC_022247	TGC	2	6	383489	383494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392586
10044	NC_022247	ACG	2	6	383495	383500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392586
10045	NC_022247	GGC	2	6	383508	383513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392586
10046	NC_022247	TGG	2	6	383534	383539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392586
10047	NC_022247	GCA	2	6	383543	383548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392586
10048	NC_022247	CGG	2	6	383549	383554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392586
10049	NC_022247	CGG	2	6	383564	383569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392586
10050	NC_022247	CG	3	6	383594	383599	0 %	0 %	50 %	50 %	538392586
10051	NC_022247	GCG	2	6	383647	383652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392586
10052	NC_022247	GGT	2	6	383658	383663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392586
10053	NC_022247	GCGCG	2	10	383667	383676	0 %	0 %	60 %	40 %	538392586
10054	NC_022247	TTC	2	6	383684	383689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392586
10055	NC_022247	GCT	2	6	383697	383702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392586
10056	NC_022247	TGGG	2	8	383884	383891	0 %	25 %	75 %	0 %	538392587
10057	NC_022247	GGC	2	6	383894	383899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392587
10058	NC_022247	CG	3	6	384009	384014	0 %	0 %	50 %	50 %	538392587
10059	NC_022247	TCG	2	6	384028	384033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392587
10060	NC_022247	CGA	2	6	384128	384133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392587
10061	NC_022247	GTCT	2	8	384135	384142	0 %	50 %	25 %	25 %	538392587
10062	NC_022247	GAC	2	6	384165	384170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392587
10063	NC_022247	TGG	2	6	384209	384214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392587
10064	NC_022247	GCC	2	6	384247	384252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392587
10065	NC_022247	TCG	2	6	384310	384315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392587
10066	NC_022247	TCG	2	6	384331	384336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392587
10067	NC_022247	CAC	2	6	384412	384417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392587
10068	NC_022247	T	8	8	384445	384452	0 %	100 %	0 %	0 %	538392588
10069	NC_022247	GC	3	6	384503	384508	0 %	0 %	50 %	50 %	538392588
10070	NC_022247	GTTCGA	2	12	384514	384525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538392588
10071	NC_022247	CG	3	6	384580	384585	0 %	0 %	50 %	50 %	538392588
10072	NC_022247	CAC	2	6	384750	384755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392588
10073	NC_022247	CG	3	6	384778	384783	0 %	0 %	50 %	50 %	538392588
10074	NC_022247	ATG	2	6	384785	384790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392588
10075	NC_022247	GAT	2	6	384815	384820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392588
10076	NC_022247	GCT	2	6	384947	384952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392589
10077	NC_022247	CG	3	6	384980	384985	0 %	0 %	50 %	50 %	538392589
10078	NC_022247	CGGC	2	8	384993	385000	0 %	0 %	50 %	50 %	538392589
10079	NC_022247	GTA	2	6	385018	385023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392589
10080	NC_022247	CCG	2	6	385032	385037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392589
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10082	NC_022247	CGG	2	6	385096	385101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392589
10083	NC_022247	GCA	2	6	385263	385268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392589
10084	NC_022247	CAG	2	6	385346	385351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392589
10085	NC_022247	GCG	2	6	385362	385367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392589
10086	NC_022247	CAG	2	6	385437	385442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392589
10087	NC_022247	CGG	2	6	385443	385448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392589
10088	NC_022247	CTT	2	6	385479	385484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392590
10089	NC_022247	CAG	2	6	385491	385496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392590
10090	NC_022247	CAC	2	6	385512	385517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392590
10091	NC_022247	GGC	2	6	385521	385526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392590
10092	NC_022247	CTG	2	6	385554	385559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392590
10093	NC_022247	TGAAGC	2	12	385616	385627	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538392590
10094	NC_022247	CGA	3	9	385655	385663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392590
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10097	NC_022247	CCAC	2	8	385765	385772	25 %	0 %	0 %	75 %	538392591
10098	NC_022247	CCG	2	6	385789	385794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392591
10099	NC_022247	CGC	2	6	385822	385827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392591
10100	NC_022247	GCG	2	6	385853	385858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392591
10101	NC_022247	CGC	2	6	385891	385896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392591
10102	NC_022247	GGT	2	6	385898	385903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392591
10103	NC_022247	GC	3	6	385920	385925	0 %	0 %	50 %	50 %	538392591
10104	NC_022247	GCT	3	9	385943	385951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392591
10105	NC_022247	AGT	2	6	385963	385968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392591
10106	NC_022247	TCG	2	6	385977	385982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392591
10107	NC_022247	TTC	2	6	386039	386044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392591
10108	NC_022247	GCA	2	6	386095	386100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392591
10109	NC_022247	AGCCG	2	10	386164	386173	20 %	0 %	40 %	40 %	538392591
10110	NC_022247	GGC	2	6	386258	386263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392591
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10112	NC_022247	CG	3	6	386310	386315	0 %	0 %	50 %	50 %	538392591
10113	NC_022247	GC	3	6	386329	386334	0 %	0 %	50 %	50 %	538392591
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10117	NC_022247	GTG	2	6	386443	386448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392592
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10119	NC_022247	CGG	2	6	386486	386491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392592
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10479	NC_022247	CAGC	2	8	399329	399336	25 %	0 %	25 %	50 %	538392604
10480	NC_022247	GGC	2	6	399337	399342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392604
10481	NC_022247	GGC	2	6	399394	399399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392604
10482	NC_022247	CTG	2	6	399454	399459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392604
10483	NC_022247	GCA	2	6	399500	399505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392604
10484	NC_022247	TTC	2	6	399529	399534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392604
10485	NC_022247	GCC	2	6	399581	399586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392604
10486	NC_022247	TGC	3	9	399590	399598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392604
10487	NC_022247	TG	3	6	399602	399607	0 %	50 %	50 %	0 %	538392604
10488	NC_022247	CTG	2	6	399631	399636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392604
10489	NC_022247	GC	3	6	399637	399642	0 %	0 %	50 %	50 %	538392604
10490	NC_022247	CGG	2	6	399714	399719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392604
10491	NC_022247	GC	3	6	399746	399751	0 %	0 %	50 %	50 %	538392604
10492	NC_022247	CG	3	6	399812	399817	0 %	0 %	50 %	50 %	538392604
10493	NC_022247	ACG	2	6	399836	399841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392604
10494	NC_022247	CG	3	6	399958	399963	0 %	0 %	50 %	50 %	538392604
10495	NC_022247	GGT	2	6	400023	400028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392604
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10497	NC_022247	GGC	3	9	400047	400055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392604
10498	NC_022247	CGACG	2	10	400080	400089	20 %	0 %	40 %	40 %	538392604
10499	NC_022247	GGC	2	6	400094	400099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392604
10500	NC_022247	CGG	2	6	400124	400129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392604

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