MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_022247	GCG	2	6	260798	260803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392477
7003	NC_022247	CG	4	8	260859	260866	0 %	0 %	50 %	50 %	538392477
7004	NC_022247	TCA	2	6	260903	260908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392477
7005	NC_022247	AAG	2	6	260992	260997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392477
7006	NC_022247	CG	3	6	261008	261013	0 %	0 %	50 %	50 %	538392477
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7009	NC_022247	CGG	2	6	261103	261108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392477
7010	NC_022247	GCT	2	6	261120	261125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392477
7011	NC_022247	GGA	2	6	261163	261168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392477
7012	NC_022247	TGC	2	6	261178	261183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392478
7013	NC_022247	GC	3	6	261182	261187	0 %	0 %	50 %	50 %	538392478
7014	NC_022247	ATC	2	6	261261	261266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392478
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7017	NC_022247	GCC	2	6	261444	261449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392478
7018	NC_022247	CGACG	2	10	261497	261506	20 %	0 %	40 %	40 %	538392478
7019	NC_022247	GAA	2	6	261515	261520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392478
7020	NC_022247	GCC	2	6	261552	261557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392478
7021	NC_022247	GC	3	6	261619	261624	0 %	0 %	50 %	50 %	538392478
7022	NC_022247	ACC	2	6	261639	261644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392478
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7024	NC_022247	TGG	2	6	261735	261740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392478
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7027	NC_022247	CGA	2	6	261809	261814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392478
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7029	NC_022247	CGA	2	6	261917	261922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392478
7030	NC_022247	GC	5	10	261929	261938	0 %	0 %	50 %	50 %	538392478
7031	NC_022247	GCT	2	6	261962	261967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392478
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7034	NC_022247	CCA	2	6	262157	262162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392478
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7036	NC_022247	GCT	2	6	262208	262213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392478
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7039	NC_022247	CTG	2	6	262254	262259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392478
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7045	NC_022247	CGC	3	9	262447	262455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392478
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7053	NC_022247	GC	3	6	262698	262703	0 %	0 %	50 %	50 %	538392478
7054	NC_022247	GGT	2	6	262718	262723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392478
7055	NC_022247	CGAC	2	8	262864	262871	25 %	0 %	25 %	50 %	538392478
7056	NC_022247	TGC	2	6	262900	262905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392478
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7069	NC_022247	CGCTCG	2	12	263419	263430	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538392478
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7105	NC_022247	GGCG	3	12	264404	264415	0 %	0 %	75 %	25 %	538392478
7106	NC_022247	CGC	2	6	264458	264463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392478
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7119	NC_022247	GC	3	6	265028	265033	0 %	0 %	50 %	50 %	538392479
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7121	NC_022247	CGG	2	6	265077	265082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392479
7122	NC_022247	GGC	2	6	265087	265092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392479
7123	NC_022247	GCC	2	6	265120	265125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392479
7124	NC_022247	GCG	2	6	265126	265131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392479
7125	NC_022247	GCG	2	6	265144	265149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392479
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7141	NC_022247	TGCGCG	2	12	265647	265658	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538392479
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7143	NC_022247	TTC	2	6	265778	265783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392479
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7149	NC_022247	GCAC	2	8	265983	265990	25 %	0 %	25 %	50 %	538392479
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7152	NC_022247	GAAT	2	8	266033	266040	50 %	25 %	25 %	0 %	538392479
7153	NC_022247	CGC	2	6	266307	266312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392480
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7156	NC_022247	CG	3	6	266394	266399	0 %	0 %	50 %	50 %	538392480
7157	NC_022247	TGG	2	6	266411	266416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392480
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7161	NC_022247	GGC	3	9	266737	266745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392480
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7233	NC_022247	CGG	2	6	268937	268942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392481
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7238	NC_022247	GCG	2	6	269044	269049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392481
7239	NC_022247	CGC	2	6	269056	269061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392481
7240	NC_022247	GTCGCT	2	12	269066	269077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392481
7241	NC_022247	ACA	2	6	269092	269097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392481
7242	NC_022247	GCA	2	6	270165	270170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392482
7243	NC_022247	ACG	3	9	270239	270247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392482
7244	NC_022247	GTC	2	6	270271	270276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392482
7245	NC_022247	CGC	2	6	270291	270296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392482
7246	NC_022247	GGT	2	6	270329	270334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392482
7247	NC_022247	GC	4	8	270338	270345	0 %	0 %	50 %	50 %	538392482
7248	NC_022247	GCGG	2	8	270356	270363	0 %	0 %	75 %	25 %	538392482
7249	NC_022247	GGT	2	6	270377	270382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392482
7250	NC_022247	CGG	2	6	270387	270392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392482
7251	NC_022247	TCGCG	2	10	270410	270419	0 %	20 %	40 %	40 %	538392482
7252	NC_022247	ACC	2	6	270461	270466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392482
7253	NC_022247	GAT	2	6	270577	270582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392482
7254	NC_022247	GCT	2	6	270607	270612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392482
7255	NC_022247	GGC	2	6	270718	270723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392483
7256	NC_022247	GCT	2	6	270729	270734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392483
7257	NC_022247	TGC	2	6	270740	270745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392483
7258	NC_022247	GCA	2	6	270765	270770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392483
7259	NC_022247	TCG	2	6	270773	270778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392483
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7261	NC_022247	GC	3	6	270887	270892	0 %	0 %	50 %	50 %	538392483
7262	NC_022247	CATGAA	2	12	270913	270924	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	538392483
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7265	NC_022247	CGG	2	6	270963	270968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392483
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7268	NC_022247	GC	4	8	271046	271053	0 %	0 %	50 %	50 %	538392483
7269	NC_022247	GC	3	6	271279	271284	0 %	0 %	50 %	50 %	538392483
7270	NC_022247	GAT	2	6	271306	271311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392483
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7273	NC_022247	CGGC	2	8	271434	271441	0 %	0 %	50 %	50 %	538392483
7274	NC_022247	CACG	2	8	271470	271477	25 %	0 %	25 %	50 %	538392483
7275	NC_022247	GTC	2	6	271540	271545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392483
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7278	NC_022247	TGG	2	6	271638	271643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392483
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7280	NC_022247	TGG	2	6	271700	271705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392483
7281	NC_022247	CAG	2	6	271735	271740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392483
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7308	NC_022247	TCC	2	6	273260	273265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392486
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7310	NC_022247	GCTTG	2	10	273319	273328	0 %	40 %	40 %	20 %	538392486
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7314	NC_022247	TGCG	2	8	273637	273644	0 %	25 %	50 %	25 %	538392487
7315	NC_022247	GCA	2	6	273800	273805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392487
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7317	NC_022247	CGT	2	6	273916	273921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392487
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7319	NC_022247	TGAG	2	8	273964	273971	25 %	25 %	50 %	0 %	538392487
7320	NC_022247	GCC	2	6	273985	273990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392487
7321	NC_022247	TCG	2	6	273997	274002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392487
7322	NC_022247	CGGCG	2	10	274005	274014	0 %	0 %	60 %	40 %	538392487
7323	NC_022247	GGCTC	2	10	274028	274037	0 %	20 %	40 %	40 %	538392487
7324	NC_022247	CCA	2	6	274059	274064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392487
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7330	NC_022247	TC	3	6	274451	274456	0 %	50 %	0 %	50 %	538392487
7331	NC_022247	AGA	2	6	274482	274487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392487
7332	NC_022247	ATCA	2	8	274497	274504	50 %	25 %	0 %	25 %	538392487
7333	NC_022247	TCAT	2	8	274648	274655	25 %	50 %	0 %	25 %	538392488
7334	NC_022247	GCC	2	6	274664	274669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392488
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7338	NC_022247	GAGCCA	2	12	274794	274805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392488
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7340	NC_022247	GCC	2	6	274862	274867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392488
7341	NC_022247	TGC	2	6	274996	275001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392489
7342	NC_022247	CTGC	2	8	275024	275031	0 %	25 %	25 %	50 %	538392489
7343	NC_022247	CCG	2	6	275046	275051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392489
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7347	NC_022247	GGCA	2	8	275231	275238	25 %	0 %	50 %	25 %	538392489
7348	NC_022247	GGCG	2	8	275272	275279	0 %	0 %	75 %	25 %	538392489
7349	NC_022247	CAA	2	6	275285	275290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392489
7350	NC_022247	GTC	2	6	275297	275302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392489
7351	NC_022247	TTC	2	6	275321	275326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392489
7352	NC_022247	GTG	2	6	275450	275455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392489
7353	NC_022247	AGGC	2	8	275532	275539	25 %	0 %	50 %	25 %	538392489
7354	NC_022247	CTG	2	6	275576	275581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392489
7355	NC_022247	CTG	2	6	275600	275605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392489
7356	NC_022247	CAATG	2	10	275681	275690	40 %	20 %	20 %	20 %	538392489
7357	NC_022247	CG	3	6	275699	275704	0 %	0 %	50 %	50 %	538392489
7358	NC_022247	GCG	2	6	275745	275750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392489
7359	NC_022247	CG	3	6	275755	275760	0 %	0 %	50 %	50 %	538392489
7360	NC_022247	TGC	2	6	275781	275786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392489
7361	NC_022247	CGC	2	6	275807	275812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392489
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7363	NC_022247	CCAG	2	8	275857	275864	25 %	0 %	25 %	50 %	538392489
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7486	NC_022247	CGC	2	6	281330	281335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392494
7487	NC_022247	TTG	2	6	281354	281359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538392494
7488	NC_022247	CGC	2	6	281381	281386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392494
7489	NC_022247	GCTGGT	2	12	281395	281406	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538392494
7490	NC_022247	CA	3	6	281428	281433	50 %	0 %	0 %	50 %	538392494
7491	NC_022247	GAT	2	6	281442	281447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392494
7492	NC_022247	CG	3	6	281564	281569	0 %	0 %	50 %	50 %	538392494
7493	NC_022247	GC	3	6	281630	281635	0 %	0 %	50 %	50 %	538392494
7494	NC_022247	CGG	2	6	281654	281659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392494
7495	NC_022247	CTC	2	6	281673	281678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538392494
7496	NC_022247	AGC	2	6	281680	281685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392494
7497	NC_022247	CGC	2	6	281809	281814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392495
7498	NC_022247	TCA	2	6	281866	281871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392495
7499	NC_022247	ACCG	2	8	281885	281892	25 %	0 %	25 %	50 %	538392495
7500	NC_022247	TCG	2	6	281904	281909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392495

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