MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022234	GAA	2	6	167460	167465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344365
4002	NC_022234	TGC	2	6	167495	167500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344365
4003	NC_022234	CG	4	8	167549	167556	0 %	0 %	50 %	50 %	538344365
4004	NC_022234	GCG	2	6	167606	167611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344365
4005	NC_022234	GCT	2	6	167627	167632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344365
4006	NC_022234	CG	3	6	167681	167686	0 %	0 %	50 %	50 %	538344365
4007	NC_022234	CGCA	2	8	167697	167704	25 %	0 %	25 %	50 %	538344365
4008	NC_022234	CGGT	2	8	167707	167714	0 %	25 %	50 %	25 %	538344365
4009	NC_022234	CGG	2	6	167753	167758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344365
4010	NC_022234	GGCG	2	8	167762	167769	0 %	0 %	75 %	25 %	538344365
4011	NC_022234	TGG	2	6	167780	167785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344365
4012	NC_022234	ACG	2	6	167845	167850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4013	NC_022234	TCA	2	6	167899	167904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344366
4014	NC_022234	GGGCC	2	10	167906	167915	0 %	0 %	60 %	40 %	538344366
4015	NC_022234	AGGCCG	2	12	167958	167969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344366
4016	NC_022234	CGG	2	6	167972	167977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344366
4017	NC_022234	CAGGCC	2	12	167984	167995	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344366
4018	NC_022234	ATCACC	2	12	168003	168014	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	538344366
4019	NC_022234	GGAT	2	8	168030	168037	25 %	25 %	50 %	0 %	538344366
4020	NC_022234	GCT	2	6	168043	168048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4021	NC_022234	CAG	2	6	168062	168067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4022	NC_022234	GAT	2	6	168077	168082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344366
4023	NC_022234	GC	3	6	168091	168096	0 %	0 %	50 %	50 %	538344366
4024	NC_022234	CAG	2	6	168137	168142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4025	NC_022234	CTG	2	6	168164	168169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4026	NC_022234	GCC	2	6	168246	168251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344366
4027	NC_022234	TGC	2	6	168265	168270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4028	NC_022234	GC	5	10	168309	168318	0 %	0 %	50 %	50 %	538344366
4029	NC_022234	ACC	2	6	168345	168350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344366
4030	NC_022234	CCA	2	6	168427	168432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344366
4031	NC_022234	GC	3	6	168448	168453	0 %	0 %	50 %	50 %	538344366
4032	NC_022234	AGC	2	6	168459	168464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4033	NC_022234	GCG	2	6	168472	168477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344366
4034	NC_022234	TCG	2	6	168495	168500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4035	NC_022234	CGA	2	6	168517	168522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4036	NC_022234	GC	3	6	168532	168537	0 %	0 %	50 %	50 %	538344366
4037	NC_022234	CCAGCG	2	12	168538	168549	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344366
4038	NC_022234	GGCC	2	8	168571	168578	0 %	0 %	50 %	50 %	538344366
4039	NC_022234	ATG	2	6	168618	168623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344366
4040	NC_022234	CCG	2	6	168661	168666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344366
4041	NC_022234	AGC	2	6	168675	168680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4042	NC_022234	TTCG	2	8	168689	168696	0 %	50 %	25 %	25 %	538344366
4043	NC_022234	GAA	2	6	168782	168787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344366
4044	NC_022234	GGTGAT	2	12	168797	168808	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	538344366
4045	NC_022234	CAGCCC	2	12	168809	168820	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538344366
4046	NC_022234	GCA	3	9	168844	168852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4047	NC_022234	GGA	2	6	168866	168871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344366
4048	NC_022234	CAG	2	6	168890	168895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4049	NC_022234	GAA	2	6	168908	168913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344366
4050	NC_022234	CAG	2	6	168923	168928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4051	NC_022234	CTG	2	6	168956	168961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4052	NC_022234	GA	3	6	168993	168998	50 %	0 %	50 %	0 %	538344366
4053	NC_022234	GCCG	2	8	169067	169074	0 %	0 %	50 %	50 %	538344366
4054	NC_022234	CAG	3	9	169076	169084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4055	NC_022234	TGC	2	6	169101	169106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4056	NC_022234	TCA	2	6	169138	169143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344366
4057	NC_022234	GCA	2	6	169144	169149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4058	NC_022234	CAC	2	6	169172	169177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344366
4059	NC_022234	GCG	2	6	169178	169183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344366
4060	NC_022234	CAC	2	6	169238	169243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344366
4061	NC_022234	GGT	2	6	169280	169285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344366
4062	NC_022234	CCA	2	6	169300	169305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344366
4063	NC_022234	GCA	2	6	169306	169311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4064	NC_022234	CGA	2	6	169316	169321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4065	NC_022234	GAG	2	6	169322	169327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344366
4066	NC_022234	CGC	2	6	169334	169339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344366
4067	NC_022234	GAT	2	6	169349	169354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344366
4068	NC_022234	GCA	2	6	169396	169401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4069	NC_022234	GCTG	2	8	169429	169436	0 %	25 %	50 %	25 %	538344366
4070	NC_022234	CG	3	6	169437	169442	0 %	0 %	50 %	50 %	538344366
4071	NC_022234	GGC	2	6	169451	169456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344366
4072	NC_022234	GAA	2	6	169460	169465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344366
4073	NC_022234	ATC	2	6	169476	169481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344366
4074	NC_022234	CG	3	6	169488	169493	0 %	0 %	50 %	50 %	538344366
4075	NC_022234	GA	3	6	169545	169550	50 %	0 %	50 %	0 %	538344366
4076	NC_022234	GACCAC	2	12	169553	169564	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538344366
4077	NC_022234	ACG	2	6	169578	169583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344366
4078	NC_022234	CCCG	2	8	169625	169632	0 %	0 %	25 %	75 %	538344366
4079	NC_022234	GCG	2	6	169665	169670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344366
4080	NC_022234	CGC	2	6	169695	169700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344367
4081	NC_022234	GCG	2	6	169718	169723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344367
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4083	NC_022234	GAA	2	6	169812	169817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344367
4084	NC_022234	CTC	2	6	169839	169844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344367
4085	NC_022234	TCGC	2	8	169864	169871	0 %	25 %	25 %	50 %	538344367
4086	NC_022234	GC	3	6	169876	169881	0 %	0 %	50 %	50 %	538344367
4087	NC_022234	TGC	2	6	169882	169887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344367
4088	NC_022234	CAC	3	9	169965	169973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344367
4089	NC_022234	CAG	2	6	170002	170007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344367
4090	NC_022234	CGT	2	6	170051	170056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344367
4091	NC_022234	GCC	2	6	170086	170091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344367
4092	NC_022234	GCA	2	6	170168	170173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344367
4093	NC_022234	GC	4	8	170235	170242	0 %	0 %	50 %	50 %	538344367
4094	NC_022234	AGC	2	6	170270	170275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344367
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4096	NC_022234	CCGG	2	8	170311	170318	0 %	0 %	50 %	50 %	538344367
4097	NC_022234	TGG	2	6	170396	170401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344367
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4100	NC_022234	GTT	2	6	170484	170489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344367
4101	NC_022234	AGT	2	6	170495	170500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344367
4102	NC_022234	GCC	2	6	170524	170529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344367
4103	NC_022234	CAC	2	6	170554	170559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344367
4104	NC_022234	GCG	2	6	170569	170574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344367
4105	NC_022234	GTC	2	6	170577	170582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344367
4106	NC_022234	GAG	3	9	170593	170601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344367
4107	NC_022234	AGCGC	2	10	170603	170612	20 %	0 %	40 %	40 %	538344367
4108	NC_022234	GC	3	6	170624	170629	0 %	0 %	50 %	50 %	538344367
4109	NC_022234	GGC	2	6	170655	170660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344367
4110	NC_022234	CGG	2	6	170692	170697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344367
4111	NC_022234	GC	3	6	170875	170880	0 %	0 %	50 %	50 %	538344368
4112	NC_022234	CGC	2	6	170900	170905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344368
4113	NC_022234	GCGT	2	8	170908	170915	0 %	25 %	50 %	25 %	538344368
4114	NC_022234	CGG	2	6	170924	170929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344368
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4117	NC_022234	TTC	2	6	170964	170969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344368
4118	NC_022234	TGA	2	6	170999	171004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344368
4119	NC_022234	GCC	2	6	171024	171029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344368
4120	NC_022234	GGCG	2	8	171057	171064	0 %	0 %	75 %	25 %	538344368
4121	NC_022234	CG	3	6	171105	171110	0 %	0 %	50 %	50 %	538344368
4122	NC_022234	CAG	2	6	171120	171125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344368
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4241	NC_022234	GCT	2	6	176857	176862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344374
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4243	NC_022234	GC	3	6	177197	177202	0 %	0 %	50 %	50 %	538344374
4244	NC_022234	GGGC	2	8	177205	177212	0 %	0 %	75 %	25 %	538344374
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4252	NC_022234	GGCCAT	2	12	177363	177374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538344375
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4273	NC_022234	CTG	2	6	178036	178041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344375
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4353	NC_022234	CTG	2	6	180881	180886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344378
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4360	NC_022234	TGC	2	6	181032	181037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344378
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4362	NC_022234	TGC	2	6	181077	181082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344378
4363	NC_022234	GC	3	6	181094	181099	0 %	0 %	50 %	50 %	538344378
4364	NC_022234	CGG	2	6	181117	181122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344378
4365	NC_022234	CTGC	2	8	181123	181130	0 %	25 %	25 %	50 %	538344378
4366	NC_022234	GGC	2	6	181147	181152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344378
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4369	NC_022234	CGA	2	6	181237	181242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344378
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4373	NC_022234	GCC	2	6	181317	181322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344378
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4481	NC_022234	GC	3	6	184809	184814	0 %	0 %	50 %	50 %	538344382
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4484	NC_022234	CAG	2	6	184844	184849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344382
4485	NC_022234	CG	3	6	184870	184875	0 %	0 %	50 %	50 %	538344382
4486	NC_022234	TCG	2	6	184881	184886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344382
4487	NC_022234	CGGAAA	2	12	184926	184937	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	538344382
4488	NC_022234	CCG	2	6	185016	185021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344382
4489	NC_022234	CCA	2	6	185029	185034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344382
4490	NC_022234	GCC	2	6	185058	185063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344382
4491	NC_022234	TGG	2	6	185101	185106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344382
4492	NC_022234	TGG	3	9	185164	185172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344382
4493	NC_022234	CGT	2	6	185173	185178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344382
4494	NC_022234	GGT	2	6	185207	185212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344382
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4499	NC_022234	CG	4	8	185853	185860	0 %	0 %	50 %	50 %	538344383
4500	NC_022234	GTG	2	6	185868	185873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344383

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