MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_022234	GGCCGA	2	12	1296727	1296738	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538345453
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31004	NC_022234	GCC	2	6	1296923	1296928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345453
31005	NC_022234	GT	3	6	1296967	1296972	0 %	50 %	50 %	0 %	538345453
31006	NC_022234	TGT	2	6	1296997	1297002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345453
31007	NC_022234	GCC	2	6	1297059	1297064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345453
31008	NC_022234	GGC	2	6	1297134	1297139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345453
31009	NC_022234	GGCGC	2	10	1297249	1297258	0 %	0 %	60 %	40 %	538345453
31010	NC_022234	CAG	2	6	1297268	1297273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345453
31011	NC_022234	TGC	2	6	1297284	1297289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345453
31012	NC_022234	GCG	2	6	1297346	1297351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345453
31013	NC_022234	GCC	2	6	1297362	1297367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345453
31014	NC_022234	TTGC	2	8	1297416	1297423	0 %	50 %	25 %	25 %	538345453
31015	NC_022234	ACCG	2	8	1297493	1297500	25 %	0 %	25 %	50 %	538345453
31016	NC_022234	GGC	2	6	1297504	1297509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345453
31017	NC_022234	CTT	2	6	1297511	1297516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345453
31018	NC_022234	GTC	2	6	1297529	1297534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345453
31019	NC_022234	GAT	2	6	1297535	1297540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345453
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31021	NC_022234	GCC	2	6	1297547	1297552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345453
31022	NC_022234	GCA	2	6	1297597	1297602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345453
31023	NC_022234	CG	3	6	1297656	1297661	0 %	0 %	50 %	50 %	538345453
31024	NC_022234	CG	3	6	1297683	1297688	0 %	0 %	50 %	50 %	538345453
31025	NC_022234	GCA	2	6	1297818	1297823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345453
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31030	NC_022234	GAC	2	6	1298091	1298096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345454
31031	NC_022234	GCG	2	6	1298124	1298129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345454
31032	NC_022234	GTT	2	6	1298296	1298301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345454
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31035	NC_022234	CCCG	2	8	1298355	1298362	0 %	0 %	25 %	75 %	538345454
31036	NC_022234	CTG	2	6	1298389	1298394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345454
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31039	NC_022234	GTTGC	2	10	1298442	1298451	0 %	40 %	40 %	20 %	538345455
31040	NC_022234	CGC	2	6	1298477	1298482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345455
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31042	NC_022234	GGC	2	6	1298522	1298527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345455
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31047	NC_022234	CAG	2	6	1298689	1298694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345455
31048	NC_022234	CCCG	2	8	1298732	1298739	0 %	0 %	25 %	75 %	538345455
31049	NC_022234	GCCC	2	8	1298770	1298777	0 %	0 %	25 %	75 %	538345455
31050	NC_022234	TCCG	2	8	1298845	1298852	0 %	25 %	25 %	50 %	538345455
31051	NC_022234	GGT	2	6	1298919	1298924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345455
31052	NC_022234	CGA	2	6	1298928	1298933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345455
31053	NC_022234	ACCC	2	8	1298936	1298943	25 %	0 %	0 %	75 %	538345455
31054	NC_022234	CGA	2	6	1298946	1298951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345455
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31058	NC_022234	GATC	2	8	1299258	1299265	25 %	25 %	25 %	25 %	538345455
31059	NC_022234	GTCG	2	8	1299281	1299288	0 %	25 %	50 %	25 %	538345455
31060	NC_022234	GCC	2	6	1299344	1299349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345455
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31062	NC_022234	GCCA	2	8	1299386	1299393	25 %	0 %	25 %	50 %	538345455
31063	NC_022234	CGG	2	6	1299402	1299407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345455
31064	NC_022234	TGA	2	6	1299408	1299413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345455
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31091	NC_022234	GCC	3	9	1300708	1300716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345456
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31100	NC_022234	AC	3	6	1301178	1301183	50 %	0 %	0 %	50 %	538345456
31101	NC_022234	TTG	2	6	1301192	1301197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345456
31102	NC_022234	GGT	2	6	1301248	1301253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345456
31103	NC_022234	ACGG	2	8	1301297	1301304	25 %	0 %	50 %	25 %	538345456
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31106	NC_022234	TCG	2	6	1301445	1301450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345456
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31111	NC_022234	AGC	2	6	1301686	1301691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345457
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31114	NC_022234	GCGAT	2	10	1301821	1301830	20 %	20 %	40 %	20 %	538345457
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31116	NC_022234	CACT	2	8	1301933	1301940	25 %	25 %	0 %	50 %	538345457
31117	NC_022234	CGA	2	6	1301954	1301959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345457
31118	NC_022234	ACC	2	6	1301971	1301976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345457
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31123	NC_022234	GCGCA	2	10	1302689	1302698	20 %	0 %	40 %	40 %	538345458
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31130	NC_022234	CGT	2	6	1302999	1303004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345459
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31133	NC_022234	GTG	2	6	1303124	1303129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345459
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31138	NC_022234	TGC	3	9	1304152	1304160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345460
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31152	NC_022234	CGA	2	6	1304527	1304532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345460
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31212	NC_022234	GGCC	2	8	1307314	1307321	0 %	0 %	50 %	50 %	538345464
31213	NC_022234	TGT	2	6	1307341	1307346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345464
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31219	NC_022234	GGA	2	6	1307545	1307550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345464
31220	NC_022234	CGT	2	6	1307579	1307584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345464
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31229	NC_022234	GCC	2	6	1307969	1307974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345465
31230	NC_022234	CG	3	6	1308051	1308056	0 %	0 %	50 %	50 %	538345465
31231	NC_022234	TGG	2	6	1308099	1308104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345465
31232	NC_022234	ACG	2	6	1308111	1308116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345465
31233	NC_022234	TGAC	2	8	1308427	1308434	25 %	25 %	25 %	25 %	538345466
31234	NC_022234	GCT	2	6	1308584	1308589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345466
31235	NC_022234	GAC	3	9	1308675	1308683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345466
31236	NC_022234	CTG	2	6	1308814	1308819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345467
31237	NC_022234	GCC	2	6	1308822	1308827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345467
31238	NC_022234	AGCG	2	8	1308829	1308836	25 %	0 %	50 %	25 %	538345467
31239	NC_022234	TCC	2	6	1308864	1308869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345467
31240	NC_022234	GCTGGC	2	12	1308954	1308965	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538345467
31241	NC_022234	ACG	2	6	1309060	1309065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345467
31242	NC_022234	TGG	2	6	1309091	1309096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345467
31243	NC_022234	GGGC	2	8	1309115	1309122	0 %	0 %	75 %	25 %	538345467
31244	NC_022234	GACC	2	8	1309156	1309163	25 %	0 %	25 %	50 %	538345467
31245	NC_022234	CCCAT	2	10	1309171	1309180	20 %	20 %	0 %	60 %	538345467
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31248	NC_022234	GCC	2	6	1309249	1309254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345467
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31251	NC_022234	CGGCT	2	10	1309360	1309369	0 %	20 %	40 %	40 %	538345467
31252	NC_022234	TGC	2	6	1309460	1309465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345467
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31256	NC_022234	GTT	2	6	1309692	1309697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345467
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31262	NC_022234	CG	3	6	1309908	1309913	0 %	0 %	50 %	50 %	538345467
31263	NC_022234	CAC	2	6	1310061	1310066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345468
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31313	NC_022234	CGA	2	6	1312108	1312113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345470
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31328	NC_022234	TCGA	2	8	1312740	1312747	25 %	25 %	25 %	25 %	538345472
31329	NC_022234	CAGGC	2	10	1312790	1312799	20 %	0 %	40 %	40 %	538345472
31330	NC_022234	GC	3	6	1312798	1312803	0 %	0 %	50 %	50 %	538345472
31331	NC_022234	CTG	2	6	1312852	1312857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345472
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31333	NC_022234	GCG	2	6	1313056	1313061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345472
31334	NC_022234	CAG	2	6	1313116	1313121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345472
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31338	NC_022234	CTCG	2	8	1313592	1313599	0 %	25 %	25 %	50 %	538345473
31339	NC_022234	GCT	2	6	1313604	1313609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345473
31340	NC_022234	CGG	2	6	1313635	1313640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345473
31341	NC_022234	CAA	2	6	1313672	1313677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345473
31342	NC_022234	CG	3	6	1313767	1313772	0 %	0 %	50 %	50 %	538345473
31343	NC_022234	CGA	2	6	1313815	1313820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345473
31344	NC_022234	CGA	2	6	1313875	1313880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345473
31345	NC_022234	CTG	2	6	1313952	1313957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345473
31346	NC_022234	GCT	2	6	1314005	1314010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345473
31347	NC_022234	GCAA	2	8	1314031	1314038	50 %	0 %	25 %	25 %	538345473
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31349	NC_022234	GGC	2	6	1314264	1314269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345474
31350	NC_022234	GCGCG	2	10	1314328	1314337	0 %	0 %	60 %	40 %	538345474
31351	NC_022234	GGA	2	6	1314342	1314347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345474
31352	NC_022234	CG	4	8	1314360	1314367	0 %	0 %	50 %	50 %	538345474
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31452	NC_022234	GC	3	6	1319358	1319363	0 %	0 %	50 %	50 %	538345481
31453	NC_022234	AGC	2	6	1319376	1319381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345481
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31458	NC_022234	CTT	2	6	1320116	1320121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345482
31459	NC_022234	GGCGC	2	10	1320131	1320140	0 %	0 %	60 %	40 %	538345482
31460	NC_022234	GC	3	6	1320158	1320163	0 %	0 %	50 %	50 %	538345482
31461	NC_022234	GCT	2	6	1320218	1320223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345482
31462	NC_022234	CTG	2	6	1320231	1320236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345482
31463	NC_022234	TCG	2	6	1320250	1320255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345482
31464	NC_022234	GCT	2	6	1320272	1320277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345482
31465	NC_022234	CCGCTA	2	12	1320350	1320361	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538345482
31466	NC_022234	GGC	2	6	1320363	1320368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345482
31467	NC_022234	GCT	2	6	1320398	1320403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345482
31468	NC_022234	CATT	2	8	1320437	1320444	25 %	50 %	0 %	25 %	538345482
31469	NC_022234	GGT	2	6	1320467	1320472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345482
31470	NC_022234	CG	3	6	1322695	1322700	0 %	0 %	50 %	50 %	538345483
31471	NC_022234	CCG	2	6	1322728	1322733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345483
31472	NC_022234	GGGCAT	2	12	1322743	1322754	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538345483
31473	NC_022234	CCG	2	6	1322757	1322762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345483
31474	NC_022234	GGC	2	6	1322797	1322802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345483
31475	NC_022234	GCG	2	6	1323134	1323139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345484
31476	NC_022234	CCT	2	6	1323141	1323146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345484
31477	NC_022234	TGG	3	9	1323210	1323218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345484
31478	NC_022234	TGG	2	6	1323222	1323227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345484
31479	NC_022234	CAC	2	6	1323256	1323261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345484
31480	NC_022234	GTC	2	6	1323480	1323485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345485
31481	NC_022234	CGA	2	6	1323532	1323537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345485
31482	NC_022234	AGC	2	6	1323567	1323572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345485
31483	NC_022234	C	6	6	1323610	1323615	0 %	0 %	0 %	100 %	538345485
31484	NC_022234	CGC	2	6	1323642	1323647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345485
31485	NC_022234	CCT	2	6	1323658	1323663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345485
31486	NC_022234	TGC	2	6	1323664	1323669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345485
31487	NC_022234	ACG	2	6	1323675	1323680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345485
31488	NC_022234	GAT	2	6	1323704	1323709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345485
31489	NC_022234	CG	3	6	1323716	1323721	0 %	0 %	50 %	50 %	538345485
31490	NC_022234	CA	3	6	1323745	1323750	50 %	0 %	0 %	50 %	538345485
31491	NC_022234	TGCT	2	8	1323753	1323760	0 %	50 %	25 %	25 %	538345485
31492	NC_022234	GCA	2	6	1323802	1323807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345485
31493	NC_022234	ACG	2	6	1323849	1323854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345485
31494	NC_022234	TTGC	2	8	1324133	1324140	0 %	50 %	25 %	25 %	538345486
31495	NC_022234	CTG	2	6	1324143	1324148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345486
31496	NC_022234	TGC	2	6	1324159	1324164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345486
31497	NC_022234	AGC	2	6	1324189	1324194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345486
31498	NC_022234	CAG	2	6	1324202	1324207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345486
31499	NC_022234	CAC	2	6	1324262	1324267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345486
31500	NC_022234	TGCC	2	8	1324298	1324305	0 %	25 %	25 %	50 %	538345486

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