MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_022234	GTT	2	6	1258939	1258944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345414
30003	NC_022234	GCA	2	6	1258959	1258964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345414
30004	NC_022234	CCAGCA	2	12	1258980	1258991	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538345414
30005	NC_022234	CAG	2	6	1259073	1259078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30006	NC_022234	CGA	2	6	1259121	1259126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30007	NC_022234	CAG	2	6	1259151	1259156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30008	NC_022234	CGA	2	6	1259159	1259164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30009	NC_022234	GCCC	2	8	1259168	1259175	0 %	0 %	25 %	75 %	538345415
30010	NC_022234	ACC	2	6	1259176	1259181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345415
30011	NC_022234	GCC	2	6	1259184	1259189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345415
30012	NC_022234	GCC	2	6	1259202	1259207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345415
30013	NC_022234	CGA	2	6	1259219	1259224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30014	NC_022234	GGT	3	9	1259262	1259270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345415
30015	NC_022234	CCA	2	6	1259282	1259287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345415
30016	NC_022234	CAG	2	6	1259304	1259309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30017	NC_022234	GCA	2	6	1259333	1259338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30018	NC_022234	CG	3	6	1259339	1259344	0 %	0 %	50 %	50 %	538345415
30019	NC_022234	GC	4	8	1259362	1259369	0 %	0 %	50 %	50 %	538345415
30020	NC_022234	GGC	2	6	1259382	1259387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345415
30021	NC_022234	GAA	2	6	1259424	1259429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345415
30022	NC_022234	CCG	3	9	1259453	1259461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345415
30023	NC_022234	GCA	2	6	1259486	1259491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30024	NC_022234	CGC	2	6	1259522	1259527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345415
30025	NC_022234	GGC	2	6	1259533	1259538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345415
30026	NC_022234	CTG	2	6	1259544	1259549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30027	NC_022234	CAC	2	6	1259571	1259576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345415
30028	NC_022234	TGA	4	12	1259606	1259617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345415
30029	NC_022234	CCGG	2	8	1259638	1259645	0 %	0 %	50 %	50 %	538345415
30030	NC_022234	AGC	2	6	1259665	1259670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345415
30031	NC_022234	CGC	2	6	1259676	1259681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345415
30032	NC_022234	CGC	2	6	1259696	1259701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345415
30033	NC_022234	GGC	2	6	1259742	1259747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345415
30034	NC_022234	ATC	2	6	1259752	1259757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345415
30035	NC_022234	TGA	2	6	1259792	1259797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345415
30036	NC_022234	CGC	2	6	1259798	1259803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345415
30037	NC_022234	GGT	2	6	1259856	1259861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345415
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30039	NC_022234	TGC	2	6	1259930	1259935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345416
30040	NC_022234	GC	4	8	1260016	1260023	0 %	0 %	50 %	50 %	538345416
30041	NC_022234	CGA	2	6	1260066	1260071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345416
30042	NC_022234	GGC	2	6	1260073	1260078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345416
30043	NC_022234	CGG	2	6	1260087	1260092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345416
30044	NC_022234	CGG	2	6	1260119	1260124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345416
30045	NC_022234	TGCGC	2	10	1260150	1260159	0 %	20 %	40 %	40 %	538345416
30046	NC_022234	GCA	2	6	1260180	1260185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345416
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30048	NC_022234	CGCC	2	8	1260218	1260225	0 %	0 %	25 %	75 %	538345416
30049	NC_022234	TGA	2	6	1260300	1260305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345416
30050	NC_022234	GCCAG	2	10	1260333	1260342	20 %	0 %	40 %	40 %	538345416
30051	NC_022234	CAG	2	6	1260379	1260384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345416
30052	NC_022234	GCG	2	6	1260399	1260404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345416
30053	NC_022234	AGG	2	6	1260441	1260446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345416
30054	NC_022234	AGC	2	6	1260503	1260508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345416
30055	NC_022234	TCGCGC	2	12	1260554	1260565	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538345416
30056	NC_022234	GC	3	6	1260600	1260605	0 %	0 %	50 %	50 %	538345416
30057	NC_022234	GC	5	10	1260619	1260628	0 %	0 %	50 %	50 %	538345416
30058	NC_022234	GC	3	6	1260700	1260705	0 %	0 %	50 %	50 %	538345416
30059	NC_022234	GCG	2	6	1260710	1260715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345416
30060	NC_022234	GCA	2	6	1260753	1260758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345416
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30062	NC_022234	GCCG	2	8	1260867	1260874	0 %	0 %	50 %	50 %	538345416
30063	NC_022234	GGCC	2	8	1260936	1260943	0 %	0 %	50 %	50 %	538345416
30064	NC_022234	CGG	2	6	1260948	1260953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345416
30065	NC_022234	GCAG	2	8	1260963	1260970	25 %	0 %	50 %	25 %	538345416
30066	NC_022234	GCC	2	6	1260985	1260990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345416
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30069	NC_022234	GGT	2	6	1261041	1261046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345416
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30071	NC_022234	CGA	2	6	1261203	1261208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345417
30072	NC_022234	TGG	2	6	1261215	1261220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345417
30073	NC_022234	TCGCG	2	10	1261227	1261236	0 %	20 %	40 %	40 %	538345417
30074	NC_022234	GCC	2	6	1261255	1261260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345417
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30084	NC_022234	GC	3	6	1261537	1261542	0 %	0 %	50 %	50 %	538345417
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30088	NC_022234	GCC	2	6	1261723	1261728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345417
30089	NC_022234	CAG	2	6	1261738	1261743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345417
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30099	NC_022234	TTG	2	6	1261997	1262002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345417
30100	NC_022234	CGT	3	9	1262013	1262021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345417
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30104	NC_022234	GGCCG	2	10	1262122	1262131	0 %	0 %	60 %	40 %	538345417
30105	NC_022234	ACC	2	6	1262141	1262146	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345417
30106	NC_022234	CGG	2	6	1262178	1262183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345417
30107	NC_022234	CAGC	2	8	1262184	1262191	25 %	0 %	25 %	50 %	538345417
30108	NC_022234	GCA	2	6	1262193	1262198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345417
30109	NC_022234	GCG	2	6	1262201	1262206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345417
30110	NC_022234	CAG	2	6	1262212	1262217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345417
30111	NC_022234	T	6	6	1262271	1262276	0 %	100 %	0 %	0 %	538345417
30112	NC_022234	GC	3	6	1262312	1262317	0 %	0 %	50 %	50 %	538345418
30113	NC_022234	CGC	2	6	1262325	1262330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345418
30114	NC_022234	GC	3	6	1262349	1262354	0 %	0 %	50 %	50 %	538345418
30115	NC_022234	GC	4	8	1262379	1262386	0 %	0 %	50 %	50 %	538345418
30116	NC_022234	ACGC	2	8	1262432	1262439	25 %	0 %	25 %	50 %	538345418
30117	NC_022234	CGG	2	6	1262443	1262448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345418
30118	NC_022234	CGAGGC	2	12	1262474	1262485	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538345418
30119	NC_022234	GTC	2	6	1262501	1262506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345418
30120	NC_022234	CGCT	2	8	1262535	1262542	0 %	25 %	25 %	50 %	538345418
30121	NC_022234	TC	3	6	1262545	1262550	0 %	50 %	0 %	50 %	538345418
30122	NC_022234	GAGCGC	2	12	1262606	1262617	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538345418
30123	NC_022234	GC	4	8	1262614	1262621	0 %	0 %	50 %	50 %	538345418
30124	NC_022234	GC	3	6	1262707	1262712	0 %	0 %	50 %	50 %	538345418
30125	NC_022234	GC	5	10	1262789	1262798	0 %	0 %	50 %	50 %	538345418
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30131	NC_022234	CGC	2	6	1262926	1262931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345418
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30133	NC_022234	CG	3	6	1263001	1263006	0 %	0 %	50 %	50 %	538345418
30134	NC_022234	CGC	2	6	1263019	1263024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345418
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30143	NC_022234	CGCA	2	8	1263392	1263399	25 %	0 %	25 %	50 %	538345418
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30153	NC_022234	CCG	2	6	1263648	1263653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345418
30154	NC_022234	GC	3	6	1263658	1263663	0 %	0 %	50 %	50 %	538345418
30155	NC_022234	GTA	2	6	1263686	1263691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345418
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30200	NC_022234	GC	3	6	1265196	1265201	0 %	0 %	50 %	50 %	538345419
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30208	NC_022234	GCA	2	6	1265481	1265486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345419
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30216	NC_022234	TCG	2	6	1265834	1265839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345419
30217	NC_022234	AGC	2	6	1265840	1265845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345419
30218	NC_022234	CG	3	6	1265847	1265852	0 %	0 %	50 %	50 %	538345419
30219	NC_022234	GC	3	6	1265886	1265891	0 %	0 %	50 %	50 %	538345419
30220	NC_022234	GCC	2	6	1265899	1265904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345419
30221	NC_022234	GCA	2	6	1265925	1265930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345419
30222	NC_022234	TCG	2	6	1265972	1265977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345419
30223	NC_022234	TTC	2	6	1266001	1266006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345419
30224	NC_022234	GGC	2	6	1266340	1266345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345420
30225	NC_022234	GGC	2	6	1266415	1266420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345420
30226	NC_022234	GC	3	6	1266419	1266424	0 %	0 %	50 %	50 %	538345420
30227	NC_022234	GTG	2	6	1266475	1266480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345420
30228	NC_022234	GCC	3	9	1266578	1266586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345420
30229	NC_022234	GCA	2	6	1266589	1266594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345420
30230	NC_022234	CGT	2	6	1266604	1266609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345420
30231	NC_022234	AGCG	2	8	1266620	1266627	25 %	0 %	50 %	25 %	538345420
30232	NC_022234	GGC	2	6	1266632	1266637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345420
30233	NC_022234	CAT	2	6	1266658	1266663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345420
30234	NC_022234	CGA	2	6	1266664	1266669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345420
30235	NC_022234	GTC	2	6	1266680	1266685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345420
30236	NC_022234	CACG	2	8	1266709	1266716	25 %	0 %	25 %	50 %	538345420
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30238	NC_022234	TGT	2	6	1266797	1266802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345420
30239	NC_022234	GCA	2	6	1266844	1266849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345420
30240	NC_022234	GCG	2	6	1266899	1266904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345420
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30245	NC_022234	CTG	3	9	1267043	1267051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345420
30246	NC_022234	GGC	3	9	1267055	1267063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345420
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30250	NC_022234	GCT	2	6	1267222	1267227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345420
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30272	NC_022234	CGG	2	6	1268043	1268048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345421
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30302	NC_022234	GGC	2	6	1269206	1269211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345423
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30317	NC_022234	ACG	2	6	1269710	1269715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345423
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30321	NC_022234	TCG	3	9	1269836	1269844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345423
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30323	NC_022234	GCCG	2	8	1269869	1269876	0 %	0 %	50 %	50 %	538345423
30324	NC_022234	ATCG	2	8	1269897	1269904	25 %	25 %	25 %	25 %	538345423
30325	NC_022234	GGCC	2	8	1270041	1270048	0 %	0 %	50 %	50 %	538345424
30326	NC_022234	CG	5	10	1270069	1270078	0 %	0 %	50 %	50 %	538345424
30327	NC_022234	AGC	2	6	1270079	1270084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345424
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30329	NC_022234	GGCG	2	8	1270158	1270165	0 %	0 %	75 %	25 %	538345424
30330	NC_022234	GATC	2	8	1270170	1270177	25 %	25 %	25 %	25 %	538345424
30331	NC_022234	GGT	2	6	1270195	1270200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345424
30332	NC_022234	CGC	2	6	1270205	1270210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345424
30333	NC_022234	CGG	2	6	1270215	1270220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345424
30334	NC_022234	GCG	2	6	1270227	1270232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345424
30335	NC_022234	CAGC	2	8	1270248	1270255	25 %	0 %	25 %	50 %	538345424
30336	NC_022234	GA	3	6	1270292	1270297	50 %	0 %	50 %	0 %	538345424
30337	NC_022234	GC	3	6	1270301	1270306	0 %	0 %	50 %	50 %	538345424
30338	NC_022234	GGC	2	6	1270312	1270317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345424
30339	NC_022234	GGCCC	2	10	1270381	1270390	0 %	0 %	40 %	60 %	538345424
30340	NC_022234	CG	3	6	1270413	1270418	0 %	0 %	50 %	50 %	538345424
30341	NC_022234	CTTC	2	8	1270458	1270465	0 %	50 %	0 %	50 %	538345424
30342	NC_022234	ATG	2	6	1270466	1270471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345424
30343	NC_022234	GCG	2	6	1270501	1270506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345424
30344	NC_022234	GCT	2	6	1270556	1270561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345424
30345	NC_022234	ATG	2	6	1270589	1270594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345424
30346	NC_022234	GTC	2	6	1270777	1270782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345425
30347	NC_022234	GGC	2	6	1270862	1270867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345425
30348	NC_022234	CG	3	6	1270957	1270962	0 %	0 %	50 %	50 %	538345425
30349	NC_022234	CAGG	2	8	1270987	1270994	25 %	0 %	50 %	25 %	538345425
30350	NC_022234	GCCG	2	8	1271013	1271020	0 %	0 %	50 %	50 %	538345425
30351	NC_022234	GAT	2	6	1271044	1271049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345425
30352	NC_022234	GC	3	6	1271066	1271071	0 %	0 %	50 %	50 %	538345425
30353	NC_022234	GCA	3	9	1271097	1271105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345425
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30402	NC_022234	GC	3	6	1272733	1272738	0 %	0 %	50 %	50 %	538345427
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30463	NC_022234	GCTG	2	8	1274841	1274848	0 %	25 %	50 %	25 %	538345430
30464	NC_022234	ACC	2	6	1274888	1274893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345430
30465	NC_022234	CAG	2	6	1274998	1275003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345430
30466	NC_022234	CTC	2	6	1275067	1275072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345430
30467	NC_022234	GCG	2	6	1275097	1275102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345430
30468	NC_022234	CAC	2	6	1275104	1275109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345430
30469	NC_022234	CGG	2	6	1275177	1275182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345430
30470	NC_022234	GGC	2	6	1275248	1275253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345431
30471	NC_022234	GCA	2	6	1275270	1275275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345431
30472	NC_022234	CGGC	2	8	1275312	1275319	0 %	0 %	50 %	50 %	538345431
30473	NC_022234	CTC	2	6	1275408	1275413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345431
30474	NC_022234	GCA	2	6	1275428	1275433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345431
30475	NC_022234	GTAGAT	2	12	1275445	1275456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345431
30476	NC_022234	GCC	2	6	1275502	1275507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345431
30477	NC_022234	CG	3	6	1275525	1275530	0 %	0 %	50 %	50 %	538345431
30478	NC_022234	TCA	2	6	1275651	1275656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345431
30479	NC_022234	CGT	2	6	1275663	1275668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345431
30480	NC_022234	GCT	2	6	1275678	1275683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345431
30481	NC_022234	GC	3	6	1275868	1275873	0 %	0 %	50 %	50 %	538345432
30482	NC_022234	GCT	2	6	1275875	1275880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345432
30483	NC_022234	TCC	2	6	1275916	1275921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345432
30484	NC_022234	CAC	2	6	1275951	1275956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345432
30485	NC_022234	TGG	3	9	1275995	1276003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345432
30486	NC_022234	GCA	2	6	1276016	1276021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345432
30487	NC_022234	ATG	2	6	1276042	1276047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345432
30488	NC_022234	GCC	2	6	1276065	1276070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345432
30489	NC_022234	CCAG	2	8	1276076	1276083	25 %	0 %	25 %	50 %	538345432
30490	NC_022234	CAGCG	2	10	1276111	1276120	20 %	0 %	40 %	40 %	538345432
30491	NC_022234	GCG	2	6	1276142	1276147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345432
30492	NC_022234	CAG	3	9	1276176	1276184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345432
30493	NC_022234	GTC	2	6	1276227	1276232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345432
30494	NC_022234	CGA	2	6	1276311	1276316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345432
30495	NC_022234	CGT	2	6	1276325	1276330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345432
30496	NC_022234	CG	3	6	1276424	1276429	0 %	0 %	50 %	50 %	538345432
30497	NC_022234	ATG	2	6	1276501	1276506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345432
30498	NC_022234	GAA	2	6	1276518	1276523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345432
30499	NC_022234	TGA	2	6	1276529	1276534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345432
30500	NC_022234	GTT	2	6	1276575	1276580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345432

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