MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_022234	GCG	2	6	1209500	1209505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345365
29002	NC_022234	CGGCG	2	10	1209562	1209571	0 %	0 %	60 %	40 %	538345365
29003	NC_022234	GGT	2	6	1209604	1209609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345365
29004	NC_022234	GCG	2	6	1209634	1209639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345365
29005	NC_022234	GCG	2	6	1209643	1209648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345365
29006	NC_022234	AAC	2	6	1209650	1209655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345365
29007	NC_022234	AG	4	8	1209726	1209733	50 %	0 %	50 %	0 %	538345365
29008	NC_022234	GGC	2	6	1209737	1209742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345365
29009	NC_022234	CTT	2	6	1209764	1209769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345365
29010	NC_022234	GC	3	6	1209944	1209949	0 %	0 %	50 %	50 %	538345366
29011	NC_022234	GCG	2	6	1209971	1209976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345366
29012	NC_022234	CGCGC	2	10	1209988	1209997	0 %	0 %	40 %	60 %	538345366
29013	NC_022234	GAC	2	6	1210042	1210047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345366
29014	NC_022234	GGC	2	6	1210110	1210115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345366
29015	NC_022234	CCG	2	6	1210164	1210169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345366
29016	NC_022234	TCG	2	6	1210190	1210195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345366
29017	NC_022234	GCG	2	6	1210201	1210206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345366
29018	NC_022234	GCA	2	6	1210224	1210229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345366
29019	NC_022234	TGC	2	6	1210266	1210271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345366
29020	NC_022234	GCCG	2	8	1210272	1210279	0 %	0 %	50 %	50 %	538345366
29021	NC_022234	ACC	2	6	1210301	1210306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345366
29022	NC_022234	TCG	2	6	1210319	1210324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345366
29023	NC_022234	CGC	2	6	1210389	1210394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345366
29024	NC_022234	CTC	2	6	1210405	1210410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345366
29025	NC_022234	GC	3	6	1210421	1210426	0 %	0 %	50 %	50 %	538345366
29026	NC_022234	CAC	2	6	1210489	1210494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345366
29027	NC_022234	GGC	2	6	1210530	1210535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345366
29028	NC_022234	CCT	2	6	1210584	1210589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345366
29029	NC_022234	GC	4	8	1210593	1210600	0 %	0 %	50 %	50 %	538345366
29030	NC_022234	CG	3	6	1210609	1210614	0 %	0 %	50 %	50 %	538345366
29031	NC_022234	GCCCC	2	10	1210645	1210654	0 %	0 %	20 %	80 %	538345366
29032	NC_022234	AGC	2	6	1210691	1210696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345366
29033	NC_022234	CCA	2	6	1210979	1210984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345367
29034	NC_022234	GCC	2	6	1211080	1211085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345367
29035	NC_022234	CGG	2	6	1211091	1211096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345367
29036	NC_022234	AGG	2	6	1211174	1211179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345367
29037	NC_022234	GCT	2	6	1211183	1211188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345367
29038	NC_022234	CGC	2	6	1211214	1211219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345367
29039	NC_022234	CGATG	2	10	1211268	1211277	20 %	20 %	40 %	20 %	538345367
29040	NC_022234	GC	3	6	1211278	1211283	0 %	0 %	50 %	50 %	538345367
29041	NC_022234	CTGC	2	8	1211293	1211300	0 %	25 %	25 %	50 %	538345367
29042	NC_022234	GCT	2	6	1211307	1211312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345367
29043	NC_022234	CGG	2	6	1211313	1211318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345367
29044	NC_022234	GC	3	6	1211371	1211376	0 %	0 %	50 %	50 %	538345367
29045	NC_022234	GAC	2	6	1211458	1211463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345367
29046	NC_022234	CG	3	6	1211484	1211489	0 %	0 %	50 %	50 %	538345367
29047	NC_022234	GGGC	2	8	1211500	1211507	0 %	0 %	75 %	25 %	538345367
29048	NC_022234	GCA	2	6	1211543	1211548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345367
29049	NC_022234	AGC	2	6	1211600	1211605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345367
29050	NC_022234	CAT	2	6	1211670	1211675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345367
29051	NC_022234	CGC	2	6	1211696	1211701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345367
29052	NC_022234	CG	4	8	1211718	1211725	0 %	0 %	50 %	50 %	538345367
29053	NC_022234	TCT	2	6	1211741	1211746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345367
29054	NC_022234	CGG	2	6	1211766	1211771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345367
29055	NC_022234	TGC	2	6	1211774	1211779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345367
29056	NC_022234	GGC	2	6	1211793	1211798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345367
29057	NC_022234	GCC	2	6	1211809	1211814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345367
29058	NC_022234	GGC	2	6	1211830	1211835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345367
29059	NC_022234	GCC	2	6	1211866	1211871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345367
29060	NC_022234	AGC	2	6	1211897	1211902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345367
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29062	NC_022234	TGG	2	6	1211948	1211953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345367
29063	NC_022234	CG	4	8	1212049	1212056	0 %	0 %	50 %	50 %	538345367
29064	NC_022234	GAGCAT	2	12	1212113	1212124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538345367
29065	NC_022234	CCTG	2	8	1212164	1212171	0 %	25 %	25 %	50 %	538345368
29066	NC_022234	GCA	2	6	1212215	1212220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345368
29067	NC_022234	CGC	2	6	1212293	1212298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345368
29068	NC_022234	ACG	2	6	1212304	1212309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345368
29069	NC_022234	CTT	2	6	1212321	1212326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345368
29070	NC_022234	CGC	2	6	1212367	1212372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345368
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29077	NC_022234	CCCG	2	8	1212563	1212570	0 %	0 %	25 %	75 %	538345369
29078	NC_022234	GC	3	6	1212591	1212596	0 %	0 %	50 %	50 %	538345369
29079	NC_022234	GCCGGC	2	12	1212654	1212665	0 %	0 %	50 %	50 %	538345369
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29085	NC_022234	CGGC	2	8	1212922	1212929	0 %	0 %	50 %	50 %	538345369
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29099	NC_022234	TGA	2	6	1213786	1213791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345370
29100	NC_022234	TCG	2	6	1214163	1214168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345371
29101	NC_022234	AGC	2	6	1214208	1214213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345371
29102	NC_022234	TCGG	2	8	1214223	1214230	0 %	25 %	50 %	25 %	538345371
29103	NC_022234	ACCA	2	8	1214244	1214251	50 %	0 %	0 %	50 %	538345371
29104	NC_022234	GTC	2	6	1214379	1214384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345371
29105	NC_022234	GTG	2	6	1214656	1214661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345372
29106	NC_022234	CAG	3	9	1214668	1214676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345372
29107	NC_022234	GCA	2	6	1214697	1214702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345372
29108	NC_022234	CGG	2	6	1214703	1214708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345372
29109	NC_022234	AGC	2	6	1214720	1214725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345372
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29111	NC_022234	CG	3	6	1214749	1214754	0 %	0 %	50 %	50 %	538345372
29112	NC_022234	ATC	2	6	1214795	1214800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345372
29113	NC_022234	CAG	2	6	1214824	1214829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345372
29114	NC_022234	GCG	2	6	1214851	1214856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345372
29115	NC_022234	GC	3	6	1215003	1215008	0 %	0 %	50 %	50 %	538345372
29116	NC_022234	CG	3	6	1215020	1215025	0 %	0 %	50 %	50 %	538345372
29117	NC_022234	CGC	2	6	1215032	1215037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345372
29118	NC_022234	GCT	2	6	1215084	1215089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345372
29119	NC_022234	CAAG	2	8	1215147	1215154	50 %	0 %	25 %	25 %	538345372
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29209	NC_022234	ATCGC	2	10	1222957	1222966	20 %	20 %	20 %	40 %	538345380
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29218	NC_022234	CGT	2	6	1223422	1223427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345381
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29222	NC_022234	GGT	2	6	1223622	1223627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345381
29223	NC_022234	CGG	2	6	1223667	1223672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345381
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29226	NC_022234	CCCA	2	8	1223731	1223738	25 %	0 %	0 %	75 %	538345381
29227	NC_022234	GAG	2	6	1223751	1223756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345381
29228	NC_022234	CGT	2	6	1223790	1223795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345381
29229	NC_022234	GCA	2	6	1223886	1223891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345381
29230	NC_022234	CAG	2	6	1223932	1223937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345381
29231	NC_022234	CG	4	8	1224154	1224161	0 %	0 %	50 %	50 %	538345382
29232	NC_022234	AGC	3	9	1224197	1224205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345382
29233	NC_022234	TC	3	6	1224243	1224248	0 %	50 %	0 %	50 %	538345382
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29348	NC_022234	GTG	2	6	1230208	1230213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345387
29349	NC_022234	GCA	2	6	1230217	1230222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345387
29350	NC_022234	G	7	7	1230244	1230250	0 %	0 %	100 %	0 %	538345387
29351	NC_022234	CGG	2	6	1230265	1230270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345387
29352	NC_022234	CGG	2	6	1230283	1230288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345387
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29371	NC_022234	GC	4	8	1231051	1231058	0 %	0 %	50 %	50 %	538345387
29372	NC_022234	CT	3	6	1231107	1231112	0 %	50 %	0 %	50 %	538345387
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29379	NC_022234	CG	3	6	1231546	1231551	0 %	0 %	50 %	50 %	538345388
29380	NC_022234	CGA	2	6	1231595	1231600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345388
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29461	NC_022234	GCC	2	6	1235395	1235400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345394
29462	NC_022234	GGC	2	6	1235464	1235469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345394
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29464	NC_022234	CAG	2	6	1235511	1235516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345394
29465	NC_022234	CGG	2	6	1235544	1235549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345394
29466	NC_022234	CTGG	2	8	1235568	1235575	0 %	25 %	50 %	25 %	538345394
29467	NC_022234	GGCC	2	8	1235577	1235584	0 %	0 %	50 %	50 %	538345394
29468	NC_022234	CGA	2	6	1235592	1235597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345394
29469	NC_022234	GCC	2	6	1235606	1235611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345394
29470	NC_022234	GCG	2	6	1235636	1235641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345394
29471	NC_022234	CGG	2	6	1235646	1235651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345394
29472	NC_022234	ACG	2	6	1235759	1235764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345394
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29491	NC_022234	ACC	2	6	1236575	1236580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345395
29492	NC_022234	GCT	2	6	1236600	1236605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345395
29493	NC_022234	GCGGT	2	10	1236648	1236657	0 %	20 %	60 %	20 %	538345395
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29495	NC_022234	GGC	2	6	1236669	1236674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345395
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29500	NC_022234	CTG	2	6	1236973	1236978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345395

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