MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
27001	NC_022234	GGC	2	6	1128785	1128790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345291
27002	NC_022234	GCC	2	6	1128822	1128827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345291
27003	NC_022234	GC	4	8	1128842	1128849	0 %	0 %	50 %	50 %	538345291
27004	NC_022234	TGC	2	6	1128883	1128888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345291
27005	NC_022234	CG	4	8	1128889	1128896	0 %	0 %	50 %	50 %	538345291
27006	NC_022234	GAG	2	6	1129015	1129020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345292
27007	NC_022234	GCC	3	9	1129093	1129101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345292
27008	NC_022234	ACATCG	2	12	1129136	1129147	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	538345292
27009	NC_022234	CCG	2	6	1129167	1129172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345292
27010	NC_022234	AGC	2	6	1129202	1129207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345292
27011	NC_022234	GCC	2	6	1129213	1129218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345292
27012	NC_022234	GCC	2	6	1129355	1129360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345292
27013	NC_022234	CGCA	2	8	1129396	1129403	25 %	0 %	25 %	50 %	538345292
27014	NC_022234	CGA	2	6	1129455	1129460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345292
27015	NC_022234	GCC	2	6	1129466	1129471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345292
27016	NC_022234	CG	3	6	1129499	1129504	0 %	0 %	50 %	50 %	538345292
27017	NC_022234	GAA	2	6	1129587	1129592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345292
27018	NC_022234	GC	3	6	1129630	1129635	0 %	0 %	50 %	50 %	538345292
27019	NC_022234	GCA	2	6	1129676	1129681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345292
27020	NC_022234	CCA	2	6	1129775	1129780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345292
27021	NC_022234	GGCC	2	8	1129818	1129825	0 %	0 %	50 %	50 %	538345292
27022	NC_022234	CGC	2	6	1129848	1129853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345292
27023	NC_022234	GAT	2	6	1129854	1129859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345292
27024	NC_022234	AGG	2	6	1129877	1129882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345292
27025	NC_022234	ATGGA	2	10	1129909	1129918	40 %	20 %	40 %	0 %	538345292
27026	NC_022234	TGC	2	6	1129933	1129938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345292
27027	NC_022234	CCAGG	2	10	1129962	1129971	20 %	0 %	40 %	40 %	538345292
27028	NC_022234	CTG	2	6	1129975	1129980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345292
27029	NC_022234	GCC	2	6	1130011	1130016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345292
27030	NC_022234	CTG	2	6	1130041	1130046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345292
27031	NC_022234	CGATG	2	10	1130154	1130163	20 %	20 %	40 %	20 %	538345292
27032	NC_022234	GCT	2	6	1130187	1130192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345292
27033	NC_022234	CGA	3	9	1130196	1130204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345292
27034	NC_022234	GCG	2	6	1130246	1130251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345292
27035	NC_022234	GGC	2	6	1130280	1130285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345292
27036	NC_022234	GACAT	2	10	1130354	1130363	40 %	20 %	20 %	20 %	538345293
27037	NC_022234	GCC	3	9	1130381	1130389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345293
27038	NC_022234	GCC	2	6	1130413	1130418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345293
27039	NC_022234	GCTGGC	2	12	1130424	1130435	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538345293
27040	NC_022234	CGC	2	6	1130442	1130447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345293
27041	NC_022234	GGC	2	6	1130451	1130456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345293
27042	NC_022234	AGC	2	6	1130465	1130470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27043	NC_022234	GTG	2	6	1130482	1130487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345293
27044	NC_022234	CGG	4	12	1130499	1130510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345293
27045	NC_022234	GTC	2	6	1130569	1130574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27046	NC_022234	CGCCGG	2	12	1130583	1130594	0 %	0 %	50 %	50 %	538345293
27047	NC_022234	GCC	2	6	1130605	1130610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345293
27048	NC_022234	AGGCC	2	10	1130624	1130633	20 %	0 %	40 %	40 %	538345293
27049	NC_022234	CTG	2	6	1130650	1130655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27050	NC_022234	CGCC	2	8	1130681	1130688	0 %	0 %	25 %	75 %	538345293
27051	NC_022234	CGA	2	6	1130721	1130726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27052	NC_022234	GC	3	6	1130800	1130805	0 %	0 %	50 %	50 %	538345293
27053	NC_022234	GCT	2	6	1130808	1130813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27054	NC_022234	GCC	2	6	1130818	1130823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345293
27055	NC_022234	CACCGG	2	12	1130850	1130861	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538345293
27056	NC_022234	TGC	2	6	1130915	1130920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27057	NC_022234	G	6	6	1130964	1130969	0 %	0 %	100 %	0 %	538345293
27058	NC_022234	CTT	2	6	1130982	1130987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345293
27059	NC_022234	GCT	2	6	1131036	1131041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27060	NC_022234	TGG	2	6	1131137	1131142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345293
27061	NC_022234	CGCC	2	8	1131143	1131150	0 %	0 %	25 %	75 %	538345293
27062	NC_022234	CGC	2	6	1131155	1131160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345293
27063	NC_022234	GGT	2	6	1131165	1131170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345293
27064	NC_022234	GCT	2	6	1131174	1131179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27065	NC_022234	ACC	2	6	1131185	1131190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345293
27066	NC_022234	CGC	2	6	1131240	1131245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345293
27067	NC_022234	TCG	2	6	1131284	1131289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27068	NC_022234	GAC	2	6	1131292	1131297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345293
27069	NC_022234	GGC	2	6	1131312	1131317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345293
27070	NC_022234	TGA	2	6	1131332	1131337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345293
27071	NC_022234	CAG	2	6	1131471	1131476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345294
27072	NC_022234	ACG	2	6	1131481	1131486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345294
27073	NC_022234	GCC	2	6	1131559	1131564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345294
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27076	NC_022234	TGC	2	6	1131685	1131690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345294
27077	NC_022234	CG	3	6	1131705	1131710	0 %	0 %	50 %	50 %	538345294
27078	NC_022234	CGG	2	6	1131725	1131730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345294
27079	NC_022234	CG	3	6	1131782	1131787	0 %	0 %	50 %	50 %	538345294
27080	NC_022234	AACGA	2	10	1131918	1131927	60 %	0 %	20 %	20 %	538345294
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27082	NC_022234	GCCC	2	8	1132007	1132014	0 %	0 %	25 %	75 %	538345294
27083	NC_022234	GC	3	6	1132022	1132027	0 %	0 %	50 %	50 %	538345294
27084	NC_022234	CGG	2	6	1132046	1132051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345294
27085	NC_022234	CGC	2	6	1132058	1132063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345294
27086	NC_022234	CTG	2	6	1132110	1132115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345294
27087	NC_022234	GCG	2	6	1132143	1132148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345294
27088	NC_022234	GC	3	6	1132177	1132182	0 %	0 %	50 %	50 %	538345294
27089	NC_022234	GC	3	6	1132189	1132194	0 %	0 %	50 %	50 %	538345294
27090	NC_022234	CCGGC	2	10	1132204	1132213	0 %	0 %	40 %	60 %	538345294
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27092	NC_022234	CGGC	2	8	1132296	1132303	0 %	0 %	50 %	50 %	538345295
27093	NC_022234	TGG	2	6	1132314	1132319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345295
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27097	NC_022234	GGGC	2	8	1132461	1132468	0 %	0 %	75 %	25 %	538345295
27098	NC_022234	GCCCG	2	10	1132505	1132514	0 %	0 %	40 %	60 %	538345295
27099	NC_022234	GC	3	6	1132557	1132562	0 %	0 %	50 %	50 %	538345295
27100	NC_022234	AGC	2	6	1132652	1132657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345295
27101	NC_022234	ACCGGC	2	12	1132727	1132738	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538345295
27102	NC_022234	GGCGC	2	10	1132739	1132748	0 %	0 %	60 %	40 %	538345295
27103	NC_022234	AGC	2	6	1132770	1132775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345295
27104	NC_022234	CGG	2	6	1132840	1132845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345295
27105	NC_022234	CTT	2	6	1132858	1132863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345295
27106	NC_022234	CGC	2	6	1132875	1132880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345295
27107	NC_022234	CGG	2	6	1132897	1132902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345295
27108	NC_022234	GCT	2	6	1132912	1132917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345295
27109	NC_022234	AGC	2	6	1132925	1132930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345295
27110	NC_022234	CCGCG	2	10	1132931	1132940	0 %	0 %	40 %	60 %	538345295
27111	NC_022234	CGT	2	6	1132987	1132992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345295
27112	NC_022234	TGGCC	2	10	1133008	1133017	0 %	20 %	40 %	40 %	538345295
27113	NC_022234	GCCG	2	8	1133020	1133027	0 %	0 %	50 %	50 %	538345295
27114	NC_022234	AGG	2	6	1133037	1133042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345295
27115	NC_022234	GCT	2	6	1133092	1133097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345295
27116	NC_022234	GC	3	6	1133188	1133193	0 %	0 %	50 %	50 %	538345295
27117	NC_022234	GCG	2	6	1133202	1133207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345295
27118	NC_022234	CCG	2	6	1133243	1133248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345296
27119	NC_022234	CCG	2	6	1133294	1133299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345296
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27121	NC_022234	TGCGC	2	10	1133379	1133388	0 %	20 %	40 %	40 %	538345296
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27123	NC_022234	GCTG	2	8	1133426	1133433	0 %	25 %	50 %	25 %	538345296
27124	NC_022234	CCGAT	2	10	1133450	1133459	20 %	20 %	20 %	40 %	538345296
27125	NC_022234	CTG	2	6	1133509	1133514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345296
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27222	NC_022234	ACC	2	6	1136765	1136770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345298
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27224	NC_022234	CAT	2	6	1136785	1136790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345298
27225	NC_022234	ATG	2	6	1136861	1136866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345298
27226	NC_022234	GCC	2	6	1136879	1136884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345298
27227	NC_022234	TGGCA	2	10	1136891	1136900	20 %	20 %	40 %	20 %	538345298
27228	NC_022234	CGC	2	6	1136920	1136925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345298
27229	NC_022234	CGG	2	6	1136978	1136983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345298
27230	NC_022234	GAGC	2	8	1137037	1137044	25 %	0 %	50 %	25 %	538345298
27231	NC_022234	GC	3	6	1137061	1137066	0 %	0 %	50 %	50 %	538345298
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27466	NC_022234	CG	5	10	1145880	1145889	0 %	0 %	50 %	50 %	538345305
27467	NC_022234	CGG	2	6	1145895	1145900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345305
27468	NC_022234	CCATCG	2	12	1145945	1145956	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538345305
27469	NC_022234	CAGC	2	8	1146077	1146084	25 %	0 %	25 %	50 %	538345305
27470	NC_022234	CGC	2	6	1146102	1146107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345305
27471	NC_022234	CAC	2	6	1146111	1146116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345305
27472	NC_022234	CGC	2	6	1146137	1146142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345305
27473	NC_022234	GCC	2	6	1146168	1146173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345305
27474	NC_022234	GC	4	8	1146210	1146217	0 %	0 %	50 %	50 %	538345305
27475	NC_022234	GC	3	6	1146231	1146236	0 %	0 %	50 %	50 %	538345305
27476	NC_022234	GAAGCG	2	12	1146300	1146311	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538345305
27477	NC_022234	TCAGG	2	10	1146317	1146326	20 %	20 %	40 %	20 %	538345305
27478	NC_022234	TCG	2	6	1146343	1146348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345305
27479	NC_022234	CCA	2	6	1146359	1146364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345305
27480	NC_022234	CGAG	2	8	1146374	1146381	25 %	0 %	50 %	25 %	538345305
27481	NC_022234	CG	3	6	1146422	1146427	0 %	0 %	50 %	50 %	538345305
27482	NC_022234	GCT	2	6	1146464	1146469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345305
27483	NC_022234	GAG	2	6	1146519	1146524	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345305
27484	NC_022234	TCC	2	6	1146556	1146561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345305
27485	NC_022234	GCA	2	6	1146575	1146580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345305
27486	NC_022234	GCA	2	6	1146584	1146589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345305
27487	NC_022234	GCA	2	6	1146596	1146601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345305
27488	NC_022234	CGGC	2	8	1146602	1146609	0 %	0 %	50 %	50 %	538345305
27489	NC_022234	CAG	2	6	1146648	1146653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345305
27490	NC_022234	GGCA	2	8	1146694	1146701	25 %	0 %	50 %	25 %	538345305
27491	NC_022234	GC	3	6	1146994	1146999	0 %	0 %	50 %	50 %	538345306
27492	NC_022234	CG	5	10	1147012	1147021	0 %	0 %	50 %	50 %	538345306
27493	NC_022234	TGC	3	9	1147077	1147085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345306
27494	NC_022234	GAA	2	6	1147094	1147099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345306
27495	NC_022234	CAG	2	6	1147157	1147162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345306
27496	NC_022234	CGC	2	6	1147178	1147183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345306
27497	NC_022234	CGA	2	6	1147189	1147194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345306
27498	NC_022234	GTC	2	6	1147205	1147210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345306
27499	NC_022234	CTG	2	6	1147247	1147252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345306
27500	NC_022234	GTG	2	6	1147256	1147261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345306

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