MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_022234	CAC	2	6	1042172	1042177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345202
25003	NC_022234	GCA	2	6	1042213	1042218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345202
25004	NC_022234	GCA	2	6	1042282	1042287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345202
25005	NC_022234	GAA	2	6	1042292	1042297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345202
25006	NC_022234	T	6	6	1042309	1042314	0 %	100 %	0 %	0 %	538345202
25007	NC_022234	AGC	2	6	1042386	1042391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345202
25008	NC_022234	CG	3	6	1042396	1042401	0 %	0 %	50 %	50 %	538345202
25009	NC_022234	GCAG	2	8	1042579	1042586	25 %	0 %	50 %	25 %	538345203
25010	NC_022234	GCTG	2	8	1042606	1042613	0 %	25 %	50 %	25 %	538345203
25011	NC_022234	CG	3	6	1042716	1042721	0 %	0 %	50 %	50 %	538345203
25012	NC_022234	GT	3	6	1042764	1042769	0 %	50 %	50 %	0 %	538345203
25013	NC_022234	GCC	2	6	1042818	1042823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345203
25014	NC_022234	GCA	2	6	1042852	1042857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345203
25015	NC_022234	GCC	2	6	1042923	1042928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345203
25016	NC_022234	GCC	2	6	1042932	1042937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345203
25017	NC_022234	CAC	2	6	1042946	1042951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345203
25018	NC_022234	CATCG	2	10	1043003	1043012	20 %	20 %	20 %	40 %	538345203
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25020	NC_022234	TCG	2	6	1043058	1043063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345203
25021	NC_022234	TGA	2	6	1043140	1043145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345203
25022	NC_022234	TTC	2	6	1043160	1043165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345203
25023	NC_022234	GCG	2	6	1043183	1043188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345203
25024	NC_022234	GCT	2	6	1043191	1043196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345203
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25027	NC_022234	GA	3	6	1043348	1043353	50 %	0 %	50 %	0 %	538345203
25028	NC_022234	TGC	2	6	1043439	1043444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345204
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25032	NC_022234	GTC	2	6	1043653	1043658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345204
25033	NC_022234	GTT	2	6	1043674	1043679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345204
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25038	NC_022234	GCA	2	6	1043960	1043965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345204
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25040	NC_022234	TGG	3	9	1043994	1044002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345204
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25050	NC_022234	GC	3	6	1044399	1044404	0 %	0 %	50 %	50 %	538345204
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25055	NC_022234	CGA	2	6	1044726	1044731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345204
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25072	NC_022234	TGA	2	6	1046130	1046135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345205
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25074	NC_022234	GC	3	6	1046208	1046213	0 %	0 %	50 %	50 %	538345205
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25103	NC_022234	GA	3	6	1047291	1047296	50 %	0 %	50 %	0 %	538345207
25104	NC_022234	GCCAG	2	10	1047356	1047365	20 %	0 %	40 %	40 %	538345207
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25115	NC_022234	CGC	2	6	1047774	1047779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345208
25116	NC_022234	GC	3	6	1047778	1047783	0 %	0 %	50 %	50 %	538345208
25117	NC_022234	GC	3	6	1047825	1047830	0 %	0 %	50 %	50 %	538345208
25118	NC_022234	GTC	2	6	1047868	1047873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345208
25119	NC_022234	GAAGC	2	10	1047966	1047975	40 %	0 %	40 %	20 %	538345208
25120	NC_022234	GCG	2	6	1048023	1048028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345208
25121	NC_022234	GCG	2	6	1048043	1048048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345208
25122	NC_022234	CAC	2	6	1048051	1048056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345208
25123	NC_022234	ACAGGT	2	12	1048059	1048070	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538345208
25124	NC_022234	TCCA	2	8	1048100	1048107	25 %	25 %	0 %	50 %	538345208
25125	NC_022234	CGA	2	6	1048206	1048211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345208
25126	NC_022234	GGC	2	6	1048215	1048220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345208
25127	NC_022234	CGG	2	6	1048270	1048275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345208
25128	NC_022234	CGT	2	6	1048330	1048335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345208
25129	NC_022234	GCG	2	6	1048336	1048341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345208
25130	NC_022234	GAT	2	6	1048420	1048425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345208
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25132	NC_022234	GTT	2	6	1048474	1048479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345208
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25134	NC_022234	GAC	2	6	1048512	1048517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345208
25135	NC_022234	CG	3	6	1048547	1048552	0 %	0 %	50 %	50 %	538345208
25136	NC_022234	CGC	2	6	1048595	1048600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345208
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25138	NC_022234	CG	3	6	1048612	1048617	0 %	0 %	50 %	50 %	538345208
25139	NC_022234	CAT	2	6	1048624	1048629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345208
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25143	NC_022234	TCG	2	6	1048747	1048752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345209
25144	NC_022234	CGC	2	6	1048761	1048766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345209
25145	NC_022234	CGCA	2	8	1048805	1048812	25 %	0 %	25 %	50 %	538345209
25146	NC_022234	GCC	2	6	1048819	1048824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345209
25147	NC_022234	AGGG	2	8	1048867	1048874	25 %	0 %	75 %	0 %	538345209
25148	NC_022234	GCA	2	6	1048940	1048945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345209
25149	NC_022234	CTG	2	6	1048947	1048952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345209
25150	NC_022234	AGC	2	6	1048993	1048998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345209
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25152	NC_022234	TGC	2	6	1049065	1049070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345209
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25174	NC_022234	GC	3	6	1050338	1050343	0 %	0 %	50 %	50 %	538345210
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25202	NC_022234	GCG	2	6	1051389	1051394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345211
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25204	NC_022234	CGC	2	6	1051594	1051599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345212
25205	NC_022234	GCT	2	6	1051611	1051616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345212
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25208	NC_022234	TG	4	8	1051729	1051736	0 %	50 %	50 %	0 %	538345212
25209	NC_022234	TGC	2	6	1051779	1051784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345212
25210	NC_022234	GCGTCC	2	12	1051820	1051831	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538345213
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25212	NC_022234	CTG	2	6	1052040	1052045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345213
25213	NC_022234	CAC	2	6	1052206	1052211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345214
25214	NC_022234	CGA	2	6	1052232	1052237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345214
25215	NC_022234	GC	3	6	1052239	1052244	0 %	0 %	50 %	50 %	538345214
25216	NC_022234	CAG	2	6	1052341	1052346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345214
25217	NC_022234	TCG	2	6	1052375	1052380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345214
25218	NC_022234	CGC	2	6	1052386	1052391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345214
25219	NC_022234	GCA	2	6	1052400	1052405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345214
25220	NC_022234	GCT	2	6	1052450	1052455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345214
25221	NC_022234	TGCG	2	8	1052561	1052568	0 %	25 %	50 %	25 %	538345214
25222	NC_022234	GCC	2	6	1052687	1052692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345215
25223	NC_022234	GC	3	6	1052742	1052747	0 %	0 %	50 %	50 %	538345215
25224	NC_022234	CTG	2	6	1052748	1052753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345215
25225	NC_022234	GTG	2	6	1052772	1052777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345215
25226	NC_022234	CAG	2	6	1052778	1052783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345215
25227	NC_022234	GCA	2	6	1052786	1052791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345215
25228	NC_022234	GGTG	2	8	1052837	1052844	0 %	25 %	75 %	0 %	538345215
25229	NC_022234	CGCCCA	2	12	1052858	1052869	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538345215
25230	NC_022234	CGG	2	6	1052876	1052881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345215
25231	NC_022234	GCC	2	6	1052889	1052894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345215
25232	NC_022234	CGC	2	6	1052930	1052935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345215
25233	NC_022234	GCG	2	6	1052978	1052983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345215
25234	NC_022234	CGC	2	6	1053018	1053023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345215
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25236	NC_022234	GCA	2	6	1053065	1053070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345215
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25252	NC_022234	TCTGC	2	10	1054142	1054151	0 %	40 %	20 %	40 %	538345216
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25262	NC_022234	CTC	2	6	1054629	1054634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345216
25263	NC_022234	CGC	2	6	1054645	1054650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345216
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25267	NC_022234	TCC	2	6	1055106	1055111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345217
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25299	NC_022234	CAC	2	6	1056208	1056213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345218
25300	NC_022234	ACC	2	6	1056234	1056239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345218
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25311	NC_022234	GAG	2	6	1056702	1056707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345219
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25318	NC_022234	CCCCA	2	10	1057038	1057047	20 %	0 %	0 %	80 %	538345219
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25324	NC_022234	GAG	2	6	1057325	1057330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345220
25325	NC_022234	ATCG	2	8	1057360	1057367	25 %	25 %	25 %	25 %	538345220
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25328	NC_022234	GGC	3	9	1057414	1057422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345220
25329	NC_022234	CAA	2	6	1057459	1057464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345220
25330	NC_022234	GCGG	2	8	1057481	1057488	0 %	0 %	75 %	25 %	538345220
25331	NC_022234	CGC	2	6	1057663	1057668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345220
25332	NC_022234	CG	3	6	1057695	1057700	0 %	0 %	50 %	50 %	538345220
25333	NC_022234	CGC	2	6	1057717	1057722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345220
25334	NC_022234	CGT	2	6	1057744	1057749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345220
25335	NC_022234	AGC	2	6	1057794	1057799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345220
25336	NC_022234	GC	3	6	1057798	1057803	0 %	0 %	50 %	50 %	538345220
25337	NC_022234	CGG	2	6	1057804	1057809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345220
25338	NC_022234	CTG	2	6	1057823	1057828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345220
25339	NC_022234	GCGA	2	8	1057904	1057911	25 %	0 %	50 %	25 %	538345220
25340	NC_022234	TCA	2	6	1057923	1057928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345220
25341	NC_022234	TCG	2	6	1057944	1057949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345220
25342	NC_022234	GGC	2	6	1057952	1057957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345220
25343	NC_022234	CG	3	6	1057963	1057968	0 %	0 %	50 %	50 %	538345220
25344	NC_022234	CAC	2	6	1058021	1058026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345221
25345	NC_022234	CGG	2	6	1058034	1058039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345221
25346	NC_022234	CGC	2	6	1058044	1058049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345221
25347	NC_022234	GCT	3	9	1058050	1058058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345221
25348	NC_022234	CGC	2	6	1058062	1058067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345221
25349	NC_022234	GCAC	2	8	1058068	1058075	25 %	0 %	25 %	50 %	538345221
25350	NC_022234	GAC	2	6	1058083	1058088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345221
25351	NC_022234	TCG	2	6	1058094	1058099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345221
25352	NC_022234	CGGG	2	8	1058112	1058119	0 %	0 %	75 %	25 %	538345221
25353	NC_022234	CG	3	6	1058134	1058139	0 %	0 %	50 %	50 %	538345221
25354	NC_022234	TCA	2	6	1058181	1058186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345221
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25359	NC_022234	GTC	2	6	1058357	1058362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345221
25360	NC_022234	AAC	2	6	1058363	1058368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345221
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25368	NC_022234	GCT	2	6	1058530	1058535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345221
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25370	NC_022234	GCT	2	6	1058620	1058625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345221
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25375	NC_022234	CAA	2	6	1058800	1058805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345221
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25381	NC_022234	GCT	2	6	1059072	1059077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345222
25382	NC_022234	CTC	2	6	1059088	1059093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345222
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25452	NC_022234	GCC	2	6	1061621	1061626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345225
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25461	NC_022234	CAT	2	6	1061816	1061821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345225
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25463	NC_022234	ACG	2	6	1061904	1061909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345225
25464	NC_022234	GCA	2	6	1062150	1062155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345226
25465	NC_022234	CTG	2	6	1062223	1062228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345226
25466	NC_022234	GCC	2	6	1062280	1062285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345226
25467	NC_022234	GAT	2	6	1062286	1062291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345226
25468	NC_022234	CAG	4	12	1062310	1062321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345226
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25470	NC_022234	GC	3	6	1062363	1062368	0 %	0 %	50 %	50 %	538345226
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25475	NC_022234	CGC	2	6	1062526	1062531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345226
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25482	NC_022234	GCA	2	6	1062777	1062782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345226
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25490	NC_022234	GC	3	6	1063243	1063248	0 %	0 %	50 %	50 %	538345227
25491	NC_022234	CCA	2	6	1063258	1063263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345227
25492	NC_022234	CTG	3	9	1063265	1063273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345227
25493	NC_022234	CCCG	2	8	1063274	1063281	0 %	0 %	25 %	75 %	538345227
25494	NC_022234	CG	3	6	1063361	1063366	0 %	0 %	50 %	50 %	538345227
25495	NC_022234	GCG	2	6	1063369	1063374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345227
25496	NC_022234	CAG	2	6	1063385	1063390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345227
25497	NC_022234	GCCGC	2	10	1063448	1063457	0 %	0 %	40 %	60 %	538345227
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25499	NC_022234	TCGCC	2	10	1063486	1063495	0 %	20 %	20 %	60 %	538345227
25500	NC_022234	CG	3	6	1063513	1063518	0 %	0 %	50 %	50 %	538345227

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