MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_022234	GCA	2	6	951179	951184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345114
23002	NC_022234	CGG	2	6	951251	951256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345114
23003	NC_022234	CCAG	2	8	951302	951309	25 %	0 %	25 %	50 %	538345114
23004	NC_022234	CGC	2	6	951338	951343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345114
23005	NC_022234	ACG	2	6	951445	951450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345114
23006	NC_022234	TGT	2	6	951452	951457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345114
23007	NC_022234	CGC	2	6	951474	951479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345114
23008	NC_022234	CGCA	2	8	951627	951634	25 %	0 %	25 %	50 %	538345115
23009	NC_022234	GCG	2	6	951668	951673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345115
23010	NC_022234	CGC	2	6	951759	951764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345115
23011	NC_022234	AC	3	6	951858	951863	50 %	0 %	0 %	50 %	538345115
23012	NC_022234	CAA	2	6	952052	952057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345115
23013	NC_022234	CGA	2	6	952058	952063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345115
23014	NC_022234	CCG	2	6	952090	952095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345115
23015	NC_022234	GA	3	6	952116	952121	50 %	0 %	50 %	0 %	538345115
23016	NC_022234	GAA	2	6	952919	952924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345117
23017	NC_022234	GCA	2	6	952945	952950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345117
23018	NC_022234	AGA	2	6	953044	953049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345117
23019	NC_022234	GGA	2	6	953063	953068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538345117
23020	NC_022234	GGC	2	6	953075	953080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345117
23021	NC_022234	ACG	2	6	953101	953106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345117
23022	NC_022234	CG	3	6	953215	953220	0 %	0 %	50 %	50 %	538345117
23023	NC_022234	CCGA	2	8	953277	953284	25 %	0 %	25 %	50 %	538345117
23024	NC_022234	CGGA	2	8	953295	953302	25 %	0 %	50 %	25 %	538345117
23025	NC_022234	GGCTC	2	10	953331	953340	0 %	20 %	40 %	40 %	538345117
23026	NC_022234	CGG	2	6	953348	953353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345117
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23028	NC_022234	CACG	2	8	953462	953469	25 %	0 %	25 %	50 %	538345117
23029	NC_022234	ACA	2	6	953548	953553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538345117
23030	NC_022234	CTG	2	6	953589	953594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345117
23031	NC_022234	GC	3	6	953631	953636	0 %	0 %	50 %	50 %	538345117
23032	NC_022234	GTC	2	6	953643	953648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345117
23033	NC_022234	CCTT	2	8	953674	953681	0 %	50 %	0 %	50 %	538345117
23034	NC_022234	ACG	2	6	953692	953697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345117
23035	NC_022234	GCTT	2	8	953987	953994	0 %	50 %	25 %	25 %	538345118
23036	NC_022234	GAC	2	6	954059	954064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345118
23037	NC_022234	GAC	2	6	954123	954128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345118
23038	NC_022234	GCC	2	6	954186	954191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345118
23039	NC_022234	GAA	2	6	954314	954319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345118
23040	NC_022234	CGA	2	6	954362	954367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345118
23041	NC_022234	GC	3	6	954397	954402	0 %	0 %	50 %	50 %	538345118
23042	NC_022234	TCCA	2	8	954483	954490	25 %	25 %	0 %	50 %	538345118
23043	NC_022234	GC	3	6	954527	954532	0 %	0 %	50 %	50 %	538345118
23044	NC_022234	CTG	2	6	954552	954557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345118
23045	NC_022234	GC	3	6	954627	954632	0 %	0 %	50 %	50 %	538345119
23046	NC_022234	GC	4	8	954674	954681	0 %	0 %	50 %	50 %	538345119
23047	NC_022234	ACT	2	6	954717	954722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345119
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23049	NC_022234	ATC	2	6	954749	954754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345119
23050	NC_022234	TGGC	2	8	954787	954794	0 %	25 %	50 %	25 %	538345119
23051	NC_022234	GCAA	2	8	955067	955074	50 %	0 %	25 %	25 %	538345119
23052	NC_022234	CGC	2	6	955111	955116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345119
23053	NC_022234	CGG	2	6	955177	955182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345119
23054	NC_022234	TGC	2	6	955206	955211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345119
23055	NC_022234	GAC	2	6	955298	955303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345119
23056	NC_022234	CCG	2	6	955326	955331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345119
23057	NC_022234	CGG	2	6	955332	955337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345119
23058	NC_022234	ACG	2	6	955479	955484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345119
23059	NC_022234	GC	4	8	955487	955494	0 %	0 %	50 %	50 %	538345119
23060	NC_022234	CTA	2	6	955618	955623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345119
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23062	NC_022234	TTGA	2	8	955680	955687	25 %	50 %	25 %	0 %	538345119
23063	NC_022234	ATG	2	6	955805	955810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538345120
23064	NC_022234	GGC	2	6	955894	955899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345120
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23069	NC_022234	CTCG	2	8	956035	956042	0 %	25 %	25 %	50 %	538345120
23070	NC_022234	GCG	2	6	956090	956095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345120
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23074	NC_022234	GTC	2	6	956352	956357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345121
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23081	NC_022234	GTG	2	6	956641	956646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345121
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23085	NC_022234	GGC	2	6	956946	956951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345121
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23088	NC_022234	CCG	2	6	957085	957090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345121
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23092	NC_022234	GCG	2	6	957399	957404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345122
23093	NC_022234	CGA	3	9	957406	957414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345122
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23102	NC_022234	GCC	2	6	958163	958168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345122
23103	NC_022234	CGG	2	6	958189	958194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345122
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23105	NC_022234	TCCTTG	2	12	958320	958331	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	538345122
23106	NC_022234	GCAA	2	8	958335	958342	50 %	0 %	25 %	25 %	538345122
23107	NC_022234	GCA	2	6	958389	958394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345122
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23110	NC_022234	GCA	2	6	958518	958523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345122
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23112	NC_022234	CG	3	6	958900	958905	0 %	0 %	50 %	50 %	538345123
23113	NC_022234	TCC	2	6	958936	958941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345123
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23117	NC_022234	TCC	2	6	959281	959286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345123
23118	NC_022234	CCT	2	6	959420	959425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345123
23119	NC_022234	GAC	2	6	959511	959516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345123
23120	NC_022234	GC	3	6	959520	959525	0 %	0 %	50 %	50 %	538345123
23121	NC_022234	GCCCG	2	10	959567	959576	0 %	0 %	40 %	60 %	538345123
23122	NC_022234	CTCGA	2	10	959587	959596	20 %	20 %	20 %	40 %	538345123
23123	NC_022234	AAG	2	6	960051	960056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538345124
23124	NC_022234	GTC	2	6	960069	960074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
23125	NC_022234	GGT	2	6	960089	960094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345124
23126	NC_022234	GCA	2	6	960103	960108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345124
23127	NC_022234	GCC	3	9	960144	960152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345124
23128	NC_022234	GGC	2	6	960220	960225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345124
23129	NC_022234	TCG	2	6	960241	960246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
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23132	NC_022234	GCT	2	6	960440	960445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
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23136	NC_022234	CAGCT	2	10	960555	960564	20 %	20 %	20 %	40 %	538345124
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23143	NC_022234	GC	3	6	960912	960917	0 %	0 %	50 %	50 %	538345124
23144	NC_022234	TGG	2	6	960955	960960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345124
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23148	NC_022234	TGC	2	6	961054	961059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345124
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23150	NC_022234	CCG	2	6	961183	961188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345124
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23155	NC_022234	GCG	2	6	961464	961469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345125
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23161	NC_022234	GCC	2	6	961790	961795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345125
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23167	NC_022234	CGCC	2	8	962070	962077	0 %	0 %	25 %	75 %	538345125
23168	NC_022234	GAGCC	2	10	962201	962210	20 %	0 %	40 %	40 %	538345125
23169	NC_022234	GCT	2	6	962248	962253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345125
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23198	NC_022234	CTA	2	6	963493	963498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345125
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23229	NC_022234	TTC	2	6	964924	964929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538345127
23230	NC_022234	GCC	2	6	964937	964942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345127
23231	NC_022234	GCA	2	6	964963	964968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345127
23232	NC_022234	GTC	2	6	965141	965146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345127
23233	NC_022234	AGC	2	6	965184	965189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345127
23234	NC_022234	TGTC	2	8	965190	965197	0 %	50 %	25 %	25 %	538345127
23235	NC_022234	GCA	2	6	965203	965208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345127
23236	NC_022234	CTGC	2	8	965249	965256	0 %	25 %	25 %	50 %	538345127
23237	NC_022234	GCA	2	6	965351	965356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345127
23238	NC_022234	CG	3	6	965383	965388	0 %	0 %	50 %	50 %	538345127
23239	NC_022234	GCA	2	6	965405	965410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345127
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23241	NC_022234	CTG	2	6	965498	965503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345127
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23357	NC_022234	CAT	2	6	972880	972885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538345136
23358	NC_022234	GGT	2	6	972997	973002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345136
23359	NC_022234	ACGCG	2	10	973043	973052	20 %	0 %	40 %	40 %	538345136
23360	NC_022234	ACC	2	6	973081	973086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345136
23361	NC_022234	GCCC	2	8	973098	973105	0 %	0 %	25 %	75 %	538345136
23362	NC_022234	GC	4	8	973118	973125	0 %	0 %	50 %	50 %	538345136
23363	NC_022234	CAC	2	6	973128	973133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345136
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23365	NC_022234	CGA	2	6	973186	973191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345136
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23385	NC_022234	CCG	2	6	974788	974793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345139
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23389	NC_022234	TCC	2	6	974950	974955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345139
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23475	NC_022234	GCG	2	6	979080	979085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345140
23476	NC_022234	GCT	2	6	979141	979146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345140
23477	NC_022234	CG	3	6	979149	979154	0 %	0 %	50 %	50 %	538345140
23478	NC_022234	CGA	2	6	979158	979163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345140
23479	NC_022234	CG	3	6	979173	979178	0 %	0 %	50 %	50 %	538345140
23480	NC_022234	CGG	2	6	979242	979247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345140
23481	NC_022234	CGC	2	6	979300	979305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538345140
23482	NC_022234	CG	3	6	979322	979327	0 %	0 %	50 %	50 %	538345140
23483	NC_022234	CTG	2	6	979330	979335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345140
23484	NC_022234	TGT	2	6	979434	979439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538345140
23485	NC_022234	CAC	2	6	979471	979476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345140
23486	NC_022234	CGGATG	2	12	979487	979498	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538345140
23487	NC_022234	GCT	2	6	979537	979542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345140
23488	NC_022234	TGC	2	6	979581	979586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538345140
23489	NC_022234	CTC	2	6	979609	979614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538345140
23490	NC_022234	GCG	2	6	979618	979623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345140
23491	NC_022234	GGC	2	6	979678	979683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538345140
23492	NC_022234	TGG	2	6	979713	979718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345140
23493	NC_022234	CCGC	2	8	979719	979726	0 %	0 %	25 %	75 %	538345140
23494	NC_022234	GTG	2	6	979835	979840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538345140
23495	NC_022234	CCTT	2	8	979904	979911	0 %	50 %	0 %	50 %	538345140
23496	NC_022234	CGA	2	6	979923	979928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345140
23497	NC_022234	CGGC	2	8	979952	979959	0 %	0 %	50 %	50 %	538345140
23498	NC_022234	CCA	2	6	979965	979970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538345140
23499	NC_022234	GGCC	2	8	979998	980005	0 %	0 %	50 %	50 %	538345140
23500	NC_022234	CGA	2	6	980013	980018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538345140

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