MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022234	CAT	2	6	63980	63985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344251
1502	NC_022234	CCA	2	6	63988	63993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344251
1503	NC_022234	GCCG	2	8	64039	64046	0 %	0 %	50 %	50 %	538344251
1504	NC_022234	GATC	2	8	64180	64187	25 %	25 %	25 %	25 %	538344251
1505	NC_022234	CAG	2	6	64208	64213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344251
1506	NC_022234	CGATGA	2	12	64219	64230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538344251
1507	NC_022234	GAGC	2	8	64422	64429	25 %	0 %	50 %	25 %	538344252
1508	NC_022234	CCT	2	6	64535	64540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344252
1509	NC_022234	GCG	2	6	64542	64547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344252
1510	NC_022234	CCT	2	6	64571	64576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344252
1511	NC_022234	GCA	2	6	64577	64582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344252
1512	NC_022234	TCG	2	6	64609	64614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344252
1513	NC_022234	AGC	2	6	64615	64620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344252
1514	NC_022234	GC	5	10	64643	64652	0 %	0 %	50 %	50 %	538344252
1515	NC_022234	CG	5	10	64692	64701	0 %	0 %	50 %	50 %	538344252
1516	NC_022234	GC	3	6	64730	64735	0 %	0 %	50 %	50 %	538344252
1517	NC_022234	GCT	2	6	64751	64756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344252
1518	NC_022234	AGC	2	6	64909	64914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344252
1519	NC_022234	CGC	2	6	64919	64924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344252
1520	NC_022234	CAG	2	6	64989	64994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344252
1521	NC_022234	GCG	2	6	65014	65019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344252
1522	NC_022234	ACC	2	6	65068	65073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344252
1523	NC_022234	CCT	2	6	65098	65103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344253
1524	NC_022234	CGGGCT	2	12	65104	65115	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344253
1525	NC_022234	TCG	2	6	65166	65171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1526	NC_022234	GGC	2	6	65173	65178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344253
1527	NC_022234	CGA	2	6	65185	65190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1528	NC_022234	ACG	2	6	65208	65213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1529	NC_022234	CGA	2	6	65254	65259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1530	NC_022234	CGC	2	6	65313	65318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344253
1531	NC_022234	GCCG	2	8	65333	65340	0 %	0 %	50 %	50 %	538344253
1532	NC_022234	CAG	2	6	65357	65362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1533	NC_022234	GC	3	6	65380	65385	0 %	0 %	50 %	50 %	538344253
1534	NC_022234	CAG	2	6	65396	65401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1535	NC_022234	CTT	2	6	65402	65407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344253
1536	NC_022234	AGC	2	6	65454	65459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1537	NC_022234	AGC	2	6	65469	65474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1538	NC_022234	CGC	3	9	65513	65521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344253
1539	NC_022234	GTG	2	6	65549	65554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344253
1540	NC_022234	GGC	2	6	65561	65566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344253
1541	NC_022234	CGC	2	6	65636	65641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344253
1542	NC_022234	CGGC	2	8	65676	65683	0 %	0 %	50 %	50 %	538344253
1543	NC_022234	AGC	2	6	65733	65738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1544	NC_022234	CGA	2	6	65773	65778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1545	NC_022234	GCA	2	6	65812	65817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1546	NC_022234	CAG	2	6	65858	65863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1547	NC_022234	TGC	2	6	65873	65878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344253
1548	NC_022234	CAG	2	6	65929	65934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344254
1549	NC_022234	CAG	2	6	65941	65946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344254
1550	NC_022234	CGC	2	6	66034	66039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344254
1551	NC_022234	CGA	2	6	66057	66062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344254
1552	NC_022234	GCCG	2	8	66067	66074	0 %	0 %	50 %	50 %	538344254
1553	NC_022234	TGC	2	6	66075	66080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344254
1554	NC_022234	CGC	2	6	66084	66089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344254
1555	NC_022234	ATC	2	6	66092	66097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344254
1556	NC_022234	CAG	2	6	66109	66114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344254
1557	NC_022234	GCC	2	6	66178	66183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344254
1558	NC_022234	GAGC	2	8	66226	66233	25 %	0 %	50 %	25 %	538344254
1559	NC_022234	GCC	2	6	66254	66259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344254
1560	NC_022234	CTC	2	6	66268	66273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344254
1561	NC_022234	GC	3	6	66288	66293	0 %	0 %	50 %	50 %	538344254
1562	NC_022234	CGG	2	6	66317	66322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344254
1563	NC_022234	CAG	2	6	66325	66330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344254
1564	NC_022234	GGCC	2	8	66386	66393	0 %	0 %	50 %	50 %	538344254
1565	NC_022234	AGT	2	6	66510	66515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344254
1566	NC_022234	TTG	2	6	66527	66532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344254
1567	NC_022234	CGC	2	6	66565	66570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344254
1568	NC_022234	GGC	2	6	66583	66588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344254
1569	NC_022234	GCG	2	6	66597	66602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344254
1570	NC_022234	TCA	2	6	66672	66677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344254
1571	NC_022234	CAG	2	6	66806	66811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1572	NC_022234	CAG	3	9	66815	66823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1573	NC_022234	AGGA	2	8	66828	66835	50 %	0 %	50 %	0 %	538344255
1574	NC_022234	GGC	2	6	66836	66841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344255
1575	NC_022234	CGG	2	6	66910	66915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344255
1576	NC_022234	AGC	2	6	66933	66938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1577	NC_022234	CCCA	2	8	66971	66978	25 %	0 %	0 %	75 %	538344255
1578	NC_022234	GCA	2	6	67000	67005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1579	NC_022234	GC	3	6	67030	67035	0 %	0 %	50 %	50 %	538344255
1580	NC_022234	CGACAG	2	12	67040	67051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1581	NC_022234	TGC	2	6	67054	67059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1582	NC_022234	C	6	6	67059	67064	0 %	0 %	0 %	100 %	538344255
1583	NC_022234	CCA	2	6	67072	67077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344255
1584	NC_022234	GCG	2	6	67143	67148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344255
1585	NC_022234	TTG	2	6	67149	67154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344255
1586	NC_022234	GC	4	8	67159	67166	0 %	0 %	50 %	50 %	538344255
1587	NC_022234	CAG	3	9	67193	67201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1588	NC_022234	CACCAG	2	12	67205	67216	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538344255
1589	NC_022234	CAC	2	6	67220	67225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344255
1590	NC_022234	CGT	2	6	67226	67231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1591	NC_022234	GCG	2	6	67282	67287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344255
1592	NC_022234	CG	3	6	67397	67402	0 %	0 %	50 %	50 %	538344255
1593	NC_022234	CAG	2	6	67403	67408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1594	NC_022234	GAC	2	6	67454	67459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1595	NC_022234	CAG	2	6	67469	67474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344255
1596	NC_022234	GCG	2	6	67486	67491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344255
1597	NC_022234	CCG	2	6	67615	67620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344255
1598	NC_022234	GAA	2	6	67624	67629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344255
1599	NC_022234	TGA	2	6	67764	67769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344256
1600	NC_022234	GGC	3	9	67822	67830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344256
1601	NC_022234	TCA	2	6	67866	67871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344256
1602	NC_022234	CGT	2	6	67878	67883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344256
1603	NC_022234	CCTT	2	8	67913	67920	0 %	50 %	0 %	50 %	538344256
1604	NC_022234	TCG	2	6	67926	67931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344256
1605	NC_022234	GCG	2	6	68013	68018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344256
1606	NC_022234	AGG	2	6	68039	68044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344256
1607	NC_022234	CCT	2	6	68106	68111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344256
1608	NC_022234	TGC	2	6	68145	68150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344256
1609	NC_022234	GAC	2	6	68212	68217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344256
1610	NC_022234	GCC	2	6	68221	68226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344256
1611	NC_022234	GTT	2	6	68278	68283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344256
1612	NC_022234	AGG	2	6	68376	68381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344256
1613	NC_022234	TGC	3	9	68406	68414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344256
1614	NC_022234	TGTTGA	2	12	68415	68426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	538344256
1615	NC_022234	CCTT	2	8	68438	68445	0 %	50 %	0 %	50 %	538344256
1616	NC_022234	GAG	2	6	68480	68485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344256
1617	NC_022234	CAC	2	6	68497	68502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344256
1618	NC_022234	CGT	2	6	68548	68553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344256
1619	NC_022234	GCC	2	6	68560	68565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344256
1620	NC_022234	CGA	2	6	68574	68579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344256
1621	NC_022234	CGC	2	6	68604	68609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344256
1622	NC_022234	ATG	2	6	68639	68644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344256
1623	NC_022234	TGG	2	6	68667	68672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344256
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1750	NC_022234	GAC	2	6	73925	73930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344262
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1754	NC_022234	CGC	2	6	74035	74040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344262
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1997	NC_022234	GATG	2	8	84999	85006	25 %	25 %	50 %	0 %	538344278
1998	NC_022234	GCC	3	9	85018	85026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344278
1999	NC_022234	AGC	3	9	85099	85107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344278
2000	NC_022234	GAT	2	6	85129	85134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344278

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