MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022234	TGC	2	6	682187	682192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344851
16502	NC_022234	GAT	2	6	682210	682215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344851
16503	NC_022234	CGC	3	9	682356	682364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344851
16504	NC_022234	CTGGT	2	10	682451	682460	0 %	40 %	40 %	20 %	538344851
16505	NC_022234	CAC	2	6	682465	682470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344851
16506	NC_022234	CCG	2	6	682515	682520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344851
16507	NC_022234	CGG	2	6	682530	682535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344851
16508	NC_022234	TTG	2	6	682538	682543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344851
16509	NC_022234	GGT	5	15	682546	682560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344851
16510	NC_022234	CCA	2	6	682596	682601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344851
16511	NC_022234	CTT	2	6	682624	682629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344851
16512	NC_022234	AGG	2	6	682631	682636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344851
16513	NC_022234	GGC	2	6	682642	682647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344851
16514	NC_022234	CTT	2	6	682684	682689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344851
16515	NC_022234	GCG	2	6	682697	682702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344851
16516	NC_022234	ACCTTC	2	12	682760	682771	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	538344851
16517	NC_022234	CTG	2	6	682867	682872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344851
16518	NC_022234	GCT	2	6	682925	682930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344851
16519	NC_022234	CTT	2	6	682931	682936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344851
16520	NC_022234	TGC	2	6	684943	684948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344852
16521	NC_022234	CGG	2	6	684951	684956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344852
16522	NC_022234	GAT	3	9	684983	684991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344852
16523	NC_022234	ACC	2	6	685002	685007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344852
16524	NC_022234	ATG	2	6	685062	685067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344852
16525	NC_022234	GAT	2	6	685076	685081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344852
16526	NC_022234	GGTGCC	2	12	685094	685105	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344852
16527	NC_022234	GCC	2	6	685121	685126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344852
16528	NC_022234	ACC	2	6	685131	685136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344852
16529	NC_022234	CAG	2	6	685205	685210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344852
16530	NC_022234	GCC	2	6	685229	685234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344852
16531	NC_022234	CCT	2	6	685294	685299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344852
16532	NC_022234	TGC	2	6	685303	685308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344852
16533	NC_022234	TTG	2	6	685341	685346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344852
16534	NC_022234	GCCACC	2	12	685362	685373	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538344852
16535	NC_022234	AGC	2	6	685518	685523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344852
16536	NC_022234	ATC	2	6	685524	685529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344852
16537	NC_022234	GAA	2	6	685607	685612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344852
16538	NC_022234	CAC	2	6	685661	685666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344852
16539	NC_022234	TCA	2	6	685690	685695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344852
16540	NC_022234	TGA	2	6	685726	685731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344852
16541	NC_022234	GCG	2	6	685816	685821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344852
16542	NC_022234	GAA	2	6	685832	685837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344852
16543	NC_022234	CAG	2	6	685868	685873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344852
16544	NC_022234	GCG	2	6	685926	685931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344852
16545	NC_022234	GTC	2	6	685974	685979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16546	NC_022234	GGC	3	9	685987	685995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344853
16547	NC_022234	AGC	3	9	685996	686004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16548	NC_022234	GGT	2	6	686005	686010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344853
16549	NC_022234	GAT	2	6	686143	686148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344853
16550	NC_022234	CGG	2	6	686166	686171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344853
16551	NC_022234	CG	3	6	686223	686228	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
16552	NC_022234	TCG	2	6	686234	686239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16553	NC_022234	GCA	2	6	686262	686267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16554	NC_022234	TCT	2	6	686286	686291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344853
16555	NC_022234	GCC	2	6	686299	686304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344853
16556	NC_022234	AGC	2	6	686309	686314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16557	NC_022234	GCT	2	6	686352	686357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16558	NC_022234	GGC	2	6	686386	686391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344853
16559	NC_022234	CTT	2	6	686422	686427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344853
16560	NC_022234	CT	3	6	686550	686555	0 %	50 %	0 %	50 %	538344853
16561	NC_022234	CG	4	8	686605	686612	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
16562	NC_022234	GCA	2	6	686670	686675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16563	NC_022234	TCGCG	2	10	686682	686691	0 %	20 %	40 %	40 %	538344853
16564	NC_022234	CGC	2	6	686700	686705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344853
16565	NC_022234	GGC	2	6	686781	686786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344853
16566	NC_022234	CCA	2	6	686787	686792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344853
16567	NC_022234	GAT	2	6	686950	686955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344853
16568	NC_022234	CCT	2	6	686973	686978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344853
16569	NC_022234	GTT	2	6	686980	686985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344853
16570	NC_022234	GCG	2	6	686990	686995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344853
16571	NC_022234	ATG	2	6	687008	687013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344853
16572	NC_022234	CG	3	6	687018	687023	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
16573	NC_022234	CCA	2	6	687051	687056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344853
16574	NC_022234	CTG	2	6	687058	687063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16575	NC_022234	GC	3	6	687118	687123	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
16576	NC_022234	CTCGGC	2	12	687133	687144	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344853
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16578	NC_022234	TCG	2	6	687158	687163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344853
16579	NC_022234	CG	3	6	687183	687188	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
16580	NC_022234	GCG	2	6	687215	687220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344853
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16584	NC_022234	CG	4	8	687280	687287	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
16585	NC_022234	TCA	2	6	687363	687368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344853
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16587	NC_022234	GC	4	8	687447	687454	0 %	0 %	50 %	50 %	538344853
16588	NC_022234	AGTC	2	8	687509	687516	25 %	25 %	25 %	25 %	538344854
16589	NC_022234	GGC	2	6	687582	687587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344854
16590	NC_022234	GGCG	2	8	687669	687676	0 %	0 %	75 %	25 %	538344854
16591	NC_022234	GC	3	6	687719	687724	0 %	0 %	50 %	50 %	538344854
16592	NC_022234	CCG	2	6	687726	687731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344854
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16598	NC_022234	CAC	2	6	687892	687897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344854
16599	NC_022234	GC	3	6	688018	688023	0 %	0 %	50 %	50 %	538344854
16600	NC_022234	GTC	3	9	688030	688038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344854
16601	NC_022234	GCA	2	6	688050	688055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344854
16602	NC_022234	CGAG	2	8	688098	688105	25 %	0 %	50 %	25 %	538344854
16603	NC_022234	CGC	2	6	688146	688151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344854
16604	NC_022234	CCA	2	6	688152	688157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344854
16605	NC_022234	GC	3	6	688164	688169	0 %	0 %	50 %	50 %	538344854
16606	NC_022234	CGG	2	6	688209	688214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344854
16607	NC_022234	GCA	2	6	688251	688256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344854
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16609	NC_022234	GCG	2	6	688293	688298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344854
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16611	NC_022234	GC	3	6	688316	688321	0 %	0 %	50 %	50 %	538344854
16612	NC_022234	CGC	2	6	688335	688340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344854
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16741	NC_022234	GCGCC	2	10	694449	694458	0 %	0 %	40 %	60 %	538344861
16742	NC_022234	GCA	2	6	694500	694505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344861
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16978	NC_022234	GCC	2	6	704588	704593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344870
16979	NC_022234	TCG	2	6	704619	704624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344870
16980	NC_022234	ACC	2	6	704637	704642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344870
16981	NC_022234	GCCG	2	8	704687	704694	0 %	0 %	50 %	50 %	538344870
16982	NC_022234	GCC	2	6	704702	704707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344870
16983	NC_022234	CAC	2	6	704732	704737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344870
16984	NC_022234	CG	3	6	704751	704756	0 %	0 %	50 %	50 %	538344870
16985	NC_022234	CCG	2	6	704764	704769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344870
16986	NC_022234	CGC	2	6	704785	704790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344870
16987	NC_022234	GTCTT	2	10	704844	704853	0 %	60 %	20 %	20 %	538344870
16988	NC_022234	CAG	2	6	705016	705021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344871
16989	NC_022234	CCTT	2	8	705041	705048	0 %	50 %	0 %	50 %	538344871
16990	NC_022234	GGCTG	2	10	705099	705108	0 %	20 %	60 %	20 %	538344871
16991	NC_022234	CGGGCG	2	12	705150	705161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344871
16992	NC_022234	GC	4	8	705174	705181	0 %	0 %	50 %	50 %	538344871
16993	NC_022234	C	6	6	705244	705249	0 %	0 %	0 %	100 %	538344871
16994	NC_022234	GC	3	6	705267	705272	0 %	0 %	50 %	50 %	538344871
16995	NC_022234	CTTCG	2	10	705394	705403	0 %	40 %	20 %	40 %	538344871
16996	NC_022234	GAC	2	6	705445	705450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344871
16997	NC_022234	CGT	2	6	705504	705509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344871
16998	NC_022234	TGC	2	6	705552	705557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344871
16999	NC_022234	AGC	2	6	705563	705568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344871
17000	NC_022234	GCG	2	6	705590	705595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344871

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