MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022234	CG	3	6	658710	658715	0 %	0 %	50 %	50 %	538344821
16002	NC_022234	CCT	2	6	658762	658767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344822
16003	NC_022234	GA	3	6	658785	658790	50 %	0 %	50 %	0 %	538344822
16004	NC_022234	TTC	2	6	658791	658796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344822
16005	NC_022234	GGT	2	6	658802	658807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344822
16006	NC_022234	TC	3	6	658853	658858	0 %	50 %	0 %	50 %	538344822
16007	NC_022234	GGC	2	6	658860	658865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344822
16008	NC_022234	CTG	3	9	658893	658901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344822
16009	NC_022234	GGCG	2	8	658928	658935	0 %	0 %	75 %	25 %	538344822
16010	NC_022234	AGG	2	6	658981	658986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344822
16011	NC_022234	CTG	3	9	658998	659006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344822
16012	NC_022234	CGT	2	6	659086	659091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344822
16013	NC_022234	CGGC	2	8	659170	659177	0 %	0 %	50 %	50 %	538344822
16014	NC_022234	GCT	2	6	659180	659185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344822
16015	NC_022234	GTC	2	6	659202	659207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344822
16016	NC_022234	CTCGC	2	10	659316	659325	0 %	20 %	20 %	60 %	538344822
16017	NC_022234	TGC	3	9	659338	659346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344822
16018	NC_022234	TGG	2	6	659347	659352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344822
16019	NC_022234	CGTGTT	2	12	659396	659407	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	538344822
16020	NC_022234	CTG	2	6	659427	659432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344822
16021	NC_022234	TGA	2	6	659440	659445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344822
16022	NC_022234	TGC	2	6	659446	659451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344822
16023	NC_022234	TTC	2	6	659460	659465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344822
16024	NC_022234	GC	3	6	659522	659527	0 %	0 %	50 %	50 %	538344822
16025	NC_022234	CG	3	6	659586	659591	0 %	0 %	50 %	50 %	538344823
16026	NC_022234	GCG	2	6	659597	659602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344823
16027	NC_022234	GGT	2	6	659604	659609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344823
16028	NC_022234	GTG	2	6	659635	659640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344823
16029	NC_022234	GGT	2	6	659646	659651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344823
16030	NC_022234	GCG	2	6	659672	659677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344823
16031	NC_022234	CCT	2	6	659691	659696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344823
16032	NC_022234	CCA	2	6	659717	659722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344823
16033	NC_022234	CTG	2	6	659731	659736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344823
16034	NC_022234	CTG	2	6	659764	659769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344823
16035	NC_022234	GCC	2	6	659815	659820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344823
16036	NC_022234	GCGGCC	2	12	659821	659832	0 %	0 %	50 %	50 %	538344823
16037	NC_022234	GCG	2	6	659861	659866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344823
16038	NC_022234	GGC	2	6	659868	659873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344823
16039	NC_022234	TCT	2	6	659933	659938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344823
16040	NC_022234	TCA	2	6	659951	659956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344823
16041	NC_022234	GCT	3	9	659982	659990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344823
16042	NC_022234	GTG	3	9	660007	660015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344823
16043	NC_022234	TCG	2	6	660023	660028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344823
16044	NC_022234	GCC	2	6	660061	660066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344823
16045	NC_022234	CCG	2	6	660074	660079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344823
16046	NC_022234	AGC	3	9	660176	660184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344823
16047	NC_022234	CGC	3	9	660250	660258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344823
16048	NC_022234	GACC	2	8	660366	660373	25 %	0 %	25 %	50 %	538344823
16049	NC_022234	CG	3	6	660377	660382	0 %	0 %	50 %	50 %	538344823
16050	NC_022234	CG	4	8	660387	660394	0 %	0 %	50 %	50 %	538344823
16051	NC_022234	GCGAGG	2	12	660395	660406	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	538344823
16052	NC_022234	GCG	2	6	660676	660681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344824
16053	NC_022234	GCA	2	6	660701	660706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344824
16054	NC_022234	CGC	2	6	660759	660764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344824
16055	NC_022234	CAC	2	6	660788	660793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344824
16056	NC_022234	GCG	2	6	660845	660850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344824
16057	NC_022234	TCG	2	6	660873	660878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344824
16058	NC_022234	TCG	2	6	660982	660987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344824
16059	NC_022234	GCA	2	6	661070	661075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344824
16060	NC_022234	CGGC	2	8	661081	661088	0 %	0 %	50 %	50 %	538344824
16061	NC_022234	CGG	2	6	661163	661168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344824
16062	NC_022234	CGA	2	6	661172	661177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344824
16063	NC_022234	AGA	2	6	661265	661270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344824
16064	NC_022234	GC	5	10	661292	661301	0 %	0 %	50 %	50 %	538344824
16065	NC_022234	CA	3	6	661315	661320	50 %	0 %	0 %	50 %	538344824
16066	NC_022234	GCG	2	6	661322	661327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344824
16067	NC_022234	GCA	2	6	661334	661339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344824
16068	NC_022234	CGG	2	6	661347	661352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344824
16069	NC_022234	ACG	2	6	661354	661359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344824
16070	NC_022234	AGGC	2	8	661508	661515	25 %	0 %	50 %	25 %	538344824
16071	NC_022234	CGGCGT	2	12	661858	661869	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344825
16072	NC_022234	CCA	2	6	661921	661926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344825
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16074	NC_022234	GC	3	6	661975	661980	0 %	0 %	50 %	50 %	538344825
16075	NC_022234	GCG	2	6	661993	661998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344825
16076	NC_022234	TCG	2	6	662008	662013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344825
16077	NC_022234	CTG	2	6	662019	662024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344825
16078	NC_022234	GCACG	2	10	662047	662056	20 %	0 %	40 %	40 %	538344825
16079	NC_022234	CTGG	2	8	662090	662097	0 %	25 %	50 %	25 %	538344825
16080	NC_022234	TGG	2	6	662130	662135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344825
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16084	NC_022234	GCA	2	6	662219	662224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344825
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16086	NC_022234	TCG	2	6	662524	662529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344825
16087	NC_022234	GCA	2	6	662567	662572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344825
16088	NC_022234	CTG	2	6	662589	662594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344825
16089	NC_022234	GTC	2	6	662636	662641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344825
16090	NC_022234	GCC	2	6	662674	662679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344825
16091	NC_022234	GC	3	6	662688	662693	0 %	0 %	50 %	50 %	538344825
16092	NC_022234	GCA	2	6	662720	662725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344825
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16095	NC_022234	GC	3	6	663184	663189	0 %	0 %	50 %	50 %	538344826
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16097	NC_022234	GC	3	6	663242	663247	0 %	0 %	50 %	50 %	538344826
16098	NC_022234	GC	3	6	663254	663259	0 %	0 %	50 %	50 %	538344826
16099	NC_022234	TCGT	2	8	663289	663296	0 %	50 %	25 %	25 %	538344826
16100	NC_022234	CG	3	6	663317	663322	0 %	0 %	50 %	50 %	538344827
16101	NC_022234	CTG	2	6	663337	663342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344827
16102	NC_022234	GTT	2	6	663531	663536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344827
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16104	NC_022234	ACGA	2	8	663811	663818	50 %	0 %	25 %	25 %	538344828
16105	NC_022234	CCG	2	6	663842	663847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344828
16106	NC_022234	GCAG	2	8	663868	663875	25 %	0 %	50 %	25 %	538344828
16107	NC_022234	GCG	2	6	663881	663886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344828
16108	NC_022234	TTCAC	2	10	664047	664056	20 %	40 %	0 %	40 %	538344829
16109	NC_022234	CGC	2	6	664112	664117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344829
16110	NC_022234	TCAT	2	8	664135	664142	25 %	50 %	0 %	25 %	538344829
16111	NC_022234	GCAAC	2	10	664183	664192	40 %	0 %	20 %	40 %	538344829
16112	NC_022234	AAAG	2	8	664288	664295	75 %	0 %	25 %	0 %	538344829
16113	NC_022234	CGA	2	6	664391	664396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344830
16114	NC_022234	TCG	2	6	664446	664451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344830
16115	NC_022234	GTC	2	6	664524	664529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344830
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16117	NC_022234	TAA	2	6	664556	664561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538344830
16118	NC_022234	GCG	2	6	664647	664652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344831
16119	NC_022234	CAG	3	9	664685	664693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344831
16120	NC_022234	GC	3	6	664740	664745	0 %	0 %	50 %	50 %	538344831
16121	NC_022234	GC	3	6	664770	664775	0 %	0 %	50 %	50 %	538344831
16122	NC_022234	CGC	2	6	664804	664809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344831
16123	NC_022234	GGC	2	6	664832	664837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344831
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16133	NC_022234	GCC	2	6	665180	665185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344832
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16240	NC_022234	CG	3	6	671579	671584	0 %	0 %	50 %	50 %	538344839
16241	NC_022234	GCGG	2	8	671635	671642	0 %	0 %	75 %	25 %	538344839
16242	NC_022234	TCGGCG	2	12	671679	671690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344839
16243	NC_022234	TCG	2	6	671694	671699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344839
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16247	NC_022234	CTG	2	6	671783	671788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344839
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16249	NC_022234	CG	4	8	671881	671888	0 %	0 %	50 %	50 %	538344839
16250	NC_022234	CGGCA	2	10	671897	671906	20 %	0 %	40 %	40 %	538344839
16251	NC_022234	CTGG	2	8	671914	671921	0 %	25 %	50 %	25 %	538344839
16252	NC_022234	CG	3	6	671946	671951	0 %	0 %	50 %	50 %	538344839
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16345	NC_022234	GCC	2	6	676000	676005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344843
16346	NC_022234	CGC	2	6	676036	676041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344843
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16350	NC_022234	CCAGCG	2	12	676221	676232	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344843
16351	NC_022234	GGC	2	6	676261	676266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344843
16352	NC_022234	AGT	2	6	676269	676274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344843
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16355	NC_022234	CCA	2	6	676344	676349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344843
16356	NC_022234	TGCT	2	8	676364	676371	0 %	50 %	25 %	25 %	538344843
16357	NC_022234	GCA	2	6	676401	676406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344843
16358	NC_022234	TCT	2	6	676431	676436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344843
16359	NC_022234	CG	3	6	676449	676454	0 %	0 %	50 %	50 %	538344843
16360	NC_022234	GTT	2	6	676465	676470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344843
16361	NC_022234	CCT	2	6	676497	676502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344843
16362	NC_022234	GC	3	6	676521	676526	0 %	0 %	50 %	50 %	538344843
16363	NC_022234	CG	3	6	676575	676580	0 %	0 %	50 %	50 %	538344843
16364	NC_022234	C	6	6	676593	676598	0 %	0 %	0 %	100 %	538344843
16365	NC_022234	TTG	2	6	676613	676618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344843
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16371	NC_022234	AGGCC	2	10	676833	676842	20 %	0 %	40 %	40 %	538344844
16372	NC_022234	GCA	2	6	676872	676877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344844
16373	NC_022234	CCG	2	6	676907	676912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344844
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16397	NC_022234	CAG	2	6	677850	677855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344845
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16451	NC_022234	GTA	2	6	680305	680310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344849
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16458	NC_022234	CG	4	8	680571	680578	0 %	0 %	50 %	50 %	538344849
16459	NC_022234	TGCCGC	2	12	680604	680615	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344849
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16465	NC_022234	CGC	2	6	680906	680911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344850
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16469	NC_022234	ATG	2	6	681028	681033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344850
16470	NC_022234	ATG	2	6	681046	681051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344850
16471	NC_022234	CCG	2	6	681086	681091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344850
16472	NC_022234	TCG	2	6	681140	681145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344850
16473	NC_022234	CTC	2	6	681147	681152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344850
16474	NC_022234	ATC	2	6	681232	681237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344850
16475	NC_022234	CGG	2	6	681280	681285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344850
16476	NC_022234	GTC	2	6	681288	681293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344850
16477	NC_022234	CCT	2	6	681347	681352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344850
16478	NC_022234	TCG	2	6	681373	681378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344850
16479	NC_022234	AGCC	2	8	681388	681395	25 %	0 %	25 %	50 %	538344850
16480	NC_022234	GGT	2	6	681402	681407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344850
16481	NC_022234	CTT	2	6	681488	681493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344850
16482	NC_022234	CTC	2	6	681543	681548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344850
16483	NC_022234	CCA	2	6	681563	681568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344850
16484	NC_022234	ACC	2	6	681622	681627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344850
16485	NC_022234	GCTG	2	8	681677	681684	0 %	25 %	50 %	25 %	538344850
16486	NC_022234	GACGT	2	10	681688	681697	20 %	20 %	40 %	20 %	538344850
16487	NC_022234	GCC	2	6	681698	681703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344850
16488	NC_022234	CCAC	2	8	681725	681732	25 %	0 %	0 %	75 %	538344850
16489	NC_022234	CGA	2	6	681746	681751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344850
16490	NC_022234	GCA	2	6	681780	681785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344850
16491	NC_022234	GGTC	2	8	681842	681849	0 %	25 %	50 %	25 %	538344850
16492	NC_022234	ACG	2	6	681856	681861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344850
16493	NC_022234	CGC	2	6	681864	681869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344850
16494	NC_022234	AGT	2	6	681872	681877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344850
16495	NC_022234	GCT	2	6	681911	681916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344850
16496	NC_022234	AGA	2	6	682047	682052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344851
16497	NC_022234	ACC	2	6	682064	682069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344851
16498	NC_022234	TGC	2	6	682161	682166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344851
16499	NC_022234	GAT	2	6	682171	682176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344851
16500	NC_022234	TTC	2	6	682181	682186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344851

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