MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022234	GGCG	2	8	641379	641386	0 %	0 %	75 %	25 %	538344808
15502	NC_022234	GC	3	6	641479	641484	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15503	NC_022234	TGCG	2	8	641537	641544	0 %	25 %	50 %	25 %	538344808
15504	NC_022234	GC	4	8	641554	641561	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15505	NC_022234	CGG	2	6	641576	641581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15506	NC_022234	CG	3	6	641589	641594	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15507	NC_022234	GCC	2	6	641650	641655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15508	NC_022234	CGG	2	6	641669	641674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15509	NC_022234	CGT	3	9	641748	641756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15510	NC_022234	CCG	2	6	641762	641767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15511	NC_022234	CG	3	6	641770	641775	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15512	NC_022234	GCG	2	6	641786	641791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15513	NC_022234	CAT	2	6	641868	641873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344808
15514	NC_022234	CTG	2	6	641877	641882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15515	NC_022234	TTC	2	6	641914	641919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344808
15516	NC_022234	GCCGAG	2	12	641958	641969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344808
15517	NC_022234	CGC	2	6	641985	641990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15518	NC_022234	GC	3	6	642024	642029	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15519	NC_022234	CG	3	6	642039	642044	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15520	NC_022234	CGG	2	6	642068	642073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15521	NC_022234	GCC	2	6	642088	642093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15522	NC_022234	GGC	2	6	642096	642101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15523	NC_022234	CG	3	6	642108	642113	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15524	NC_022234	TGG	2	6	642125	642130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344808
15525	NC_022234	CG	3	6	642131	642136	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15526	NC_022234	CAC	2	6	642147	642152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344808
15527	NC_022234	GA	3	6	642169	642174	50 %	0 %	50 %	0 %	538344808
15528	NC_022234	GC	3	6	642195	642200	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15529	NC_022234	CGTG	2	8	642233	642240	0 %	25 %	50 %	25 %	538344808
15530	NC_022234	CGC	2	6	642285	642290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15531	NC_022234	GC	3	6	642302	642307	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15532	NC_022234	CAGC	2	8	642311	642318	25 %	0 %	25 %	50 %	538344808
15533	NC_022234	GCCA	2	8	642369	642376	25 %	0 %	25 %	50 %	538344808
15534	NC_022234	ACC	2	6	642394	642399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344808
15535	NC_022234	GC	3	6	642447	642452	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15536	NC_022234	CGAG	2	8	642488	642495	25 %	0 %	50 %	25 %	538344808
15537	NC_022234	TGT	2	6	642545	642550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344808
15538	NC_022234	TCG	2	6	642592	642597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15539	NC_022234	TGA	2	6	642653	642658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344808
15540	NC_022234	GCC	2	6	642660	642665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15541	NC_022234	GTC	2	6	642666	642671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15542	NC_022234	GAC	2	6	642687	642692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15543	NC_022234	GCA	2	6	642695	642700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15544	NC_022234	CG	4	8	642707	642714	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15545	NC_022234	CGC	2	6	642719	642724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15546	NC_022234	CCA	2	6	642731	642736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344808
15547	NC_022234	CGGC	2	8	642824	642831	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15548	NC_022234	CGAG	2	8	642842	642849	25 %	0 %	50 %	25 %	538344808
15549	NC_022234	TGCG	2	8	642895	642902	0 %	25 %	50 %	25 %	538344808
15550	NC_022234	GCC	3	9	642921	642929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15551	NC_022234	ATG	2	6	642952	642957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344808
15552	NC_022234	GC	3	6	643003	643008	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15553	NC_022234	GTC	2	6	643011	643016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15554	NC_022234	GCTG	2	8	643019	643026	0 %	25 %	50 %	25 %	538344808
15555	NC_022234	CTG	3	9	643053	643061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15556	NC_022234	CGG	2	6	643085	643090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15557	NC_022234	GCC	2	6	643126	643131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15558	NC_022234	CTT	2	6	643137	643142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344808
15559	NC_022234	CGG	2	6	643211	643216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15560	NC_022234	CG	3	6	643223	643228	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15561	NC_022234	CGGCGT	2	12	643232	643243	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344808
15562	NC_022234	TTG	2	6	643249	643254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344808
15563	NC_022234	GCG	2	6	643279	643284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15564	NC_022234	TCG	2	6	643303	643308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15565	NC_022234	CTG	2	6	643314	643319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15566	NC_022234	GC	3	6	643343	643348	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15567	NC_022234	CG	3	6	643353	643358	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15568	NC_022234	GC	3	6	643380	643385	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15569	NC_022234	GTTC	2	8	643430	643437	0 %	50 %	25 %	25 %	538344808
15570	NC_022234	CG	3	6	643451	643456	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15571	NC_022234	CGT	2	6	643463	643468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
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15573	NC_022234	CGT	2	6	643508	643513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15574	NC_022234	CG	3	6	643532	643537	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15575	NC_022234	TCT	2	6	643571	643576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344808
15576	NC_022234	GCGCG	2	10	643578	643587	0 %	0 %	60 %	40 %	538344808
15577	NC_022234	GTC	2	6	643590	643595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15578	NC_022234	GC	3	6	643646	643651	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15579	NC_022234	GCG	3	9	643658	643666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
15580	NC_022234	GC	3	6	643716	643721	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15581	NC_022234	GCC	2	6	643731	643736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
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15587	NC_022234	GTC	2	6	643914	643919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
15588	NC_022234	CG	3	6	643931	643936	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15589	NC_022234	CGC	2	6	643967	643972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15590	NC_022234	GGTCG	2	10	643986	643995	0 %	20 %	60 %	20 %	538344808
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15593	NC_022234	GC	3	6	644091	644096	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15594	NC_022234	TCG	2	6	644176	644181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
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15602	NC_022234	CG	3	6	644357	644362	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15603	NC_022234	GCC	2	6	644388	644393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
15604	NC_022234	CGCA	2	8	644430	644437	25 %	0 %	25 %	50 %	538344808
15605	NC_022234	GCGCG	2	10	644474	644483	0 %	0 %	60 %	40 %	538344808
15606	NC_022234	CTG	2	6	644484	644489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
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15608	NC_022234	CG	3	6	644571	644576	0 %	0 %	50 %	50 %	538344808
15609	NC_022234	GCC	2	6	644622	644627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
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15611	NC_022234	CGTGGT	2	12	644655	644666	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538344808
15612	NC_022234	GGC	2	6	644685	644690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344808
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15619	NC_022234	GTC	2	6	644994	644999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344808
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15621	NC_022234	CGC	2	6	645077	645082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344808
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15623	NC_022234	GGT	2	6	645207	645212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344808
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15741	NC_022234	GCA	2	6	649486	649491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344811
15742	NC_022234	ATC	2	6	649517	649522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344811
15743	NC_022234	GCG	2	6	649589	649594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
15744	NC_022234	TGC	2	6	649596	649601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
15745	NC_022234	TGGGCT	2	12	649602	649613	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	538344811
15746	NC_022234	GCG	2	6	649627	649632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
15747	NC_022234	GAA	2	6	649636	649641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344811
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15749	NC_022234	GCCGC	2	10	649712	649721	0 %	0 %	40 %	60 %	538344811
15750	NC_022234	GCG	3	9	649749	649757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344811
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15754	NC_022234	GGT	2	6	650011	650016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344811
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15759	NC_022234	CG	3	6	650190	650195	0 %	0 %	50 %	50 %	538344811
15760	NC_022234	TGC	2	6	650223	650228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
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15762	NC_022234	CTG	2	6	650420	650425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
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15764	NC_022234	CTG	3	9	650468	650476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
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15768	NC_022234	GCT	2	6	650611	650616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344811
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15771	NC_022234	CTC	2	6	650785	650790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344812
15772	NC_022234	GGT	2	6	650811	650816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344812
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15801	NC_022234	CTG	2	6	652206	652211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344813
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15806	NC_022234	CGC	2	6	652390	652395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344813
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15840	NC_022234	GCGCA	2	10	653314	653323	20 %	0 %	40 %	40 %	538344814
15841	NC_022234	GAGGTG	2	12	653369	653380	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	538344814
15842	NC_022234	GGGC	2	8	653392	653399	0 %	0 %	75 %	25 %	538344814
15843	NC_022234	GCA	2	6	653449	653454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344814
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15845	NC_022234	GCC	2	6	653574	653579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344814
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15849	NC_022234	TGCG	2	8	653721	653728	0 %	25 %	50 %	25 %	538344814
15850	NC_022234	TGC	2	6	653751	653756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344814
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15855	NC_022234	GC	3	6	653923	653928	0 %	0 %	50 %	50 %	538344814
15856	NC_022234	CAG	2	6	654108	654113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344815
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15861	NC_022234	GCCG	2	8	654383	654390	0 %	0 %	50 %	50 %	538344816
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15977	NC_022234	CGA	2	6	657856	657861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344820
15978	NC_022234	CGAT	2	8	657954	657961	25 %	25 %	25 %	25 %	538344820
15979	NC_022234	TGG	2	6	657993	657998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344820
15980	NC_022234	GCG	3	9	658019	658027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344820
15981	NC_022234	CTG	2	6	658040	658045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344820
15982	NC_022234	GCT	2	6	658066	658071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344820
15983	NC_022234	CGA	2	6	658114	658119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344820
15984	NC_022234	GCC	2	6	658162	658167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344820
15985	NC_022234	GCG	2	6	658244	658249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344821
15986	NC_022234	GCT	2	6	658260	658265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344821
15987	NC_022234	AGA	2	6	658286	658291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344821
15988	NC_022234	GTC	2	6	658306	658311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344821
15989	NC_022234	GC	3	6	658312	658317	0 %	0 %	50 %	50 %	538344821
15990	NC_022234	GCA	2	6	658353	658358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344821
15991	NC_022234	GCA	4	12	658371	658382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344821
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15993	NC_022234	ACGC	2	8	658554	658561	25 %	0 %	25 %	50 %	538344821
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15996	NC_022234	GC	3	6	658584	658589	0 %	0 %	50 %	50 %	538344821
15997	NC_022234	GCA	2	6	658614	658619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344821
15998	NC_022234	GCA	2	6	658623	658628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344821
15999	NC_022234	GC	4	8	658629	658636	0 %	0 %	50 %	50 %	538344821
16000	NC_022234	ACG	2	6	658670	658675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344821

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