MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_022234	GCT	2	6	557879	557884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344738
13502	NC_022234	CGAG	2	8	557896	557903	25 %	0 %	50 %	25 %	538344738
13503	NC_022234	TTC	2	6	557947	557952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344738
13504	NC_022234	GCT	2	6	558035	558040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344738
13505	NC_022234	GC	3	6	558111	558116	0 %	0 %	50 %	50 %	538344738
13506	NC_022234	TTC	2	6	558165	558170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344738
13507	NC_022234	GCACGC	2	12	558178	558189	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344738
13508	NC_022234	GCC	2	6	558204	558209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344738
13509	NC_022234	CGG	2	6	558221	558226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344738
13510	NC_022234	TCG	2	6	558258	558263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344738
13511	NC_022234	TGA	2	6	558301	558306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344738
13512	NC_022234	TGG	2	6	558325	558330	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344738
13513	NC_022234	CCA	2	6	558373	558378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344738
13514	NC_022234	TCA	2	6	558388	558393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344738
13515	NC_022234	GCAC	2	8	558490	558497	25 %	0 %	25 %	50 %	538344738
13516	NC_022234	GCT	2	6	558551	558556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344738
13517	NC_022234	CG	3	6	558635	558640	0 %	0 %	50 %	50 %	538344738
13518	NC_022234	TGG	2	6	558790	558795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344738
13519	NC_022234	CG	3	6	558838	558843	0 %	0 %	50 %	50 %	538344738
13520	NC_022234	CAG	2	6	558972	558977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344738
13521	NC_022234	GC	3	6	558981	558986	0 %	0 %	50 %	50 %	538344738
13522	NC_022234	GAA	2	6	559162	559167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344739
13523	NC_022234	GCGTGC	2	12	559194	559205	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344739
13524	NC_022234	CG	3	6	559215	559220	0 %	0 %	50 %	50 %	538344739
13525	NC_022234	GCG	2	6	559296	559301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344739
13526	NC_022234	CG	3	6	559308	559313	0 %	0 %	50 %	50 %	538344739
13527	NC_022234	GCC	2	6	559332	559337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344739
13528	NC_022234	ACA	2	6	559338	559343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344739
13529	NC_022234	CCT	2	6	559344	559349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344739
13530	NC_022234	CAA	2	6	559369	559374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344739
13531	NC_022234	GTG	2	6	559448	559453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344739
13532	NC_022234	CGG	2	6	559471	559476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344739
13533	NC_022234	AGA	2	6	559482	559487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344739
13534	NC_022234	ATC	2	6	559529	559534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344739
13535	NC_022234	GAG	2	6	559637	559642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344739
13536	NC_022234	CGC	2	6	559669	559674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344739
13537	NC_022234	GCGCAC	2	12	559732	559743	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538344739
13538	NC_022234	GCC	2	6	559752	559757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344739
13539	NC_022234	GAT	3	9	559786	559794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344739
13540	NC_022234	CTA	2	6	559801	559806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344739
13541	NC_022234	CAA	2	6	559924	559929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344739
13542	NC_022234	CGA	2	6	559951	559956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344739
13543	NC_022234	CCA	2	6	559998	560003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344739
13544	NC_022234	GCT	2	6	560032	560037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344739
13545	NC_022234	CG	3	6	560070	560075	0 %	0 %	50 %	50 %	538344739
13546	NC_022234	CAT	2	6	560233	560238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344739
13547	NC_022234	GC	4	8	560244	560251	0 %	0 %	50 %	50 %	538344739
13548	NC_022234	CCG	2	6	560270	560275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344739
13549	NC_022234	TGC	2	6	560301	560306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344739
13550	NC_022234	TCA	2	6	560361	560366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344739
13551	NC_022234	CAGGA	2	10	560480	560489	40 %	0 %	40 %	20 %	538344740
13552	NC_022234	TGA	2	6	560512	560517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344740
13553	NC_022234	GCC	2	6	560540	560545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344740
13554	NC_022234	GGCGCG	2	12	560564	560575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344740
13555	NC_022234	CCGG	2	8	560635	560642	0 %	0 %	50 %	50 %	538344740
13556	NC_022234	CGG	2	6	560650	560655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344740
13557	NC_022234	CAG	2	6	560837	560842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344740
13558	NC_022234	CCA	2	6	560992	560997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344740
13559	NC_022234	ACG	2	6	561036	561041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344740
13560	NC_022234	TGT	2	6	561121	561126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344740
13561	NC_022234	CGA	2	6	561143	561148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344740
13562	NC_022234	GC	4	8	561177	561184	0 %	0 %	50 %	50 %	538344740
13563	NC_022234	GAT	2	6	561230	561235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344740
13564	NC_022234	TTG	2	6	561252	561257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344740
13565	NC_022234	GCC	3	9	561293	561301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344740
13566	NC_022234	ACG	2	6	561315	561320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344740
13567	NC_022234	CTG	2	6	561332	561337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344740
13568	NC_022234	GCG	2	6	561644	561649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344741
13569	NC_022234	GGC	2	6	561656	561661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344741
13570	NC_022234	GC	3	6	561663	561668	0 %	0 %	50 %	50 %	538344741
13571	NC_022234	AGC	2	6	561677	561682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344741
13572	NC_022234	CGCGG	2	10	561730	561739	0 %	0 %	60 %	40 %	538344741
13573	NC_022234	GTG	3	9	561742	561750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344741
13574	NC_022234	CG	3	6	561768	561773	0 %	0 %	50 %	50 %	538344741
13575	NC_022234	GCA	2	6	561798	561803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344741
13576	NC_022234	ACC	2	6	561824	561829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344741
13577	NC_022234	ACG	2	6	561845	561850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344741
13578	NC_022234	CGG	2	6	561863	561868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344741
13579	NC_022234	ACC	2	6	561950	561955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344741
13580	NC_022234	AGC	2	6	561962	561967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344741
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13583	NC_022234	CAA	2	6	562092	562097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344741
13584	NC_022234	ATTCG	2	10	562122	562131	20 %	40 %	20 %	20 %	538344741
13585	NC_022234	CGC	2	6	562188	562193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344741
13586	NC_022234	CGA	2	6	562259	562264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344741
13587	NC_022234	CGG	2	6	562275	562280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344741
13588	NC_022234	GC	4	8	562322	562329	0 %	0 %	50 %	50 %	538344741
13589	NC_022234	CGG	2	6	562353	562358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344741
13590	NC_022234	GAC	2	6	562457	562462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344741
13591	NC_022234	CATT	2	8	562995	563002	25 %	50 %	0 %	25 %	538344742
13592	NC_022234	CGA	2	6	563016	563021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344742
13593	NC_022234	GC	4	8	563032	563039	0 %	0 %	50 %	50 %	538344742
13594	NC_022234	GCT	2	6	563049	563054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344742
13595	NC_022234	CAGC	2	8	563160	563167	25 %	0 %	25 %	50 %	538344742
13596	NC_022234	CGC	2	6	563341	563346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344742
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13598	NC_022234	CTC	2	6	563385	563390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344742
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13600	NC_022234	CAT	2	6	563410	563415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344742
13601	NC_022234	GCA	2	6	563423	563428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344742
13602	NC_022234	GAC	2	6	563449	563454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344742
13603	NC_022234	AAC	2	6	563480	563485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344742
13604	NC_022234	GCG	2	6	563490	563495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344742
13605	NC_022234	CTC	2	6	563574	563579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344742
13606	NC_022234	GCG	2	6	563630	563635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344742
13607	NC_022234	GGC	2	6	563637	563642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344742
13608	NC_022234	GCCAC	2	10	563648	563657	20 %	0 %	20 %	60 %	538344742
13609	NC_022234	CAGG	2	8	563695	563702	25 %	0 %	50 %	25 %	538344742
13610	NC_022234	CAC	2	6	563725	563730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344742
13611	NC_022234	CTC	2	6	563740	563745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344742
13612	NC_022234	GGCGG	2	10	563749	563758	0 %	0 %	80 %	20 %	538344742
13613	NC_022234	CCA	2	6	563781	563786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344742
13614	NC_022234	GCCGA	2	10	563855	563864	20 %	0 %	40 %	40 %	538344742
13615	NC_022234	GTC	2	6	563872	563877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344742
13616	NC_022234	TGA	2	6	563904	563909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344742
13617	NC_022234	TCT	2	6	563930	563935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344742
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13619	NC_022234	CCA	2	6	563997	564002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344742
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13621	NC_022234	CCA	2	6	564105	564110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344743
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13623	NC_022234	GC	3	6	564315	564320	0 %	0 %	50 %	50 %	538344743
13624	NC_022234	GCC	2	6	564322	564327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344743
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13722	NC_022234	GCCC	2	8	569384	569391	0 %	0 %	25 %	75 %	538344746
13723	NC_022234	GGGC	2	8	569394	569401	0 %	0 %	75 %	25 %	538344746
13724	NC_022234	GC	5	10	569409	569418	0 %	0 %	50 %	50 %	538344746
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13731	NC_022234	CCG	2	6	569766	569771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344747
13732	NC_022234	GC	3	6	569772	569777	0 %	0 %	50 %	50 %	538344747
13733	NC_022234	GCCTG	2	10	569784	569793	0 %	20 %	40 %	40 %	538344747
13734	NC_022234	GC	3	6	569917	569922	0 %	0 %	50 %	50 %	538344747
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13737	NC_022234	GC	3	6	569972	569977	0 %	0 %	50 %	50 %	538344747
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13842	NC_022234	GCGG	2	8	575293	575300	0 %	0 %	75 %	25 %	538344751
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13978	NC_022234	GGC	3	9	580113	580121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344754
13979	NC_022234	TGCGG	2	10	580149	580158	0 %	20 %	60 %	20 %	538344754
13980	NC_022234	TGG	2	6	580196	580201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344754
13981	NC_022234	GCG	2	6	580217	580222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344754
13982	NC_022234	GCT	2	6	580239	580244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344754
13983	NC_022234	TCA	2	6	580309	580314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344755
13984	NC_022234	GCG	2	6	580315	580320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344755
13985	NC_022234	CCGC	2	8	580345	580352	0 %	0 %	25 %	75 %	538344755
13986	NC_022234	GC	3	6	580359	580364	0 %	0 %	50 %	50 %	538344755
13987	NC_022234	GGA	2	6	580409	580414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344755
13988	NC_022234	CGG	2	6	580439	580444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344755
13989	NC_022234	CG	3	6	580477	580482	0 %	0 %	50 %	50 %	538344755
13990	NC_022234	CG	4	8	580511	580518	0 %	0 %	50 %	50 %	538344755
13991	NC_022234	CAA	2	6	580544	580549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344755
13992	NC_022234	CGC	2	6	580550	580555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344755
13993	NC_022234	TGG	2	6	580609	580614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344755
13994	NC_022234	GCG	2	6	580678	580683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344755
13995	NC_022234	ATC	2	6	580689	580694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344755
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13997	NC_022234	GCC	2	6	580788	580793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344755
13998	NC_022234	GC	4	8	580801	580808	0 %	0 %	50 %	50 %	538344755
13999	NC_022234	CGC	2	6	580906	580911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344755
14000	NC_022234	GGC	2	6	580915	580920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344755

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