MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022234	GGCC	2	8	535311	535318	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
13002	NC_022234	TCGGCC	2	12	535392	535403	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344714
13003	NC_022234	GCCG	2	8	535411	535418	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
13004	NC_022234	CG	3	6	535423	535428	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
13005	NC_022234	CGC	2	6	535465	535470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
13006	NC_022234	ACG	2	6	535501	535506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344714
13007	NC_022234	TGG	2	6	535516	535521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344714
13008	NC_022234	TGC	2	6	535534	535539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
13009	NC_022234	CGA	2	6	535613	535618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344714
13010	NC_022234	CG	3	6	535637	535642	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
13011	NC_022234	GGC	2	6	535650	535655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
13012	NC_022234	GCG	2	6	535690	535695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
13013	NC_022234	CG	3	6	535697	535702	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
13014	NC_022234	GGT	2	6	535706	535711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344714
13015	NC_022234	TGCGCG	2	12	535723	535734	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344714
13016	NC_022234	CGC	2	6	535760	535765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
13017	NC_022234	GCC	2	6	535800	535805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
13018	NC_022234	GCG	2	6	535830	535835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
13019	NC_022234	TGC	2	6	535935	535940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344715
13020	NC_022234	ACCG	2	8	536002	536009	25 %	0 %	25 %	50 %	538344715
13021	NC_022234	CGC	2	6	536011	536016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
13022	NC_022234	CGG	2	6	536038	536043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344715
13023	NC_022234	CATT	2	8	536046	536053	25 %	50 %	0 %	25 %	538344715
13024	NC_022234	ACG	2	6	536060	536065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344715
13025	NC_022234	GGC	2	6	536100	536105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344715
13026	NC_022234	GCC	2	6	536144	536149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
13027	NC_022234	GCC	2	6	536192	536197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
13028	NC_022234	CGGC	2	8	536273	536280	0 %	0 %	50 %	50 %	538344715
13029	NC_022234	GCC	2	6	536281	536286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
13030	NC_022234	GGA	2	6	536293	536298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344715
13031	NC_022234	CGG	2	6	536319	536324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344715
13032	NC_022234	GC	3	6	536329	536334	0 %	0 %	50 %	50 %	538344715
13033	NC_022234	CGC	2	6	536374	536379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
13034	NC_022234	GTC	2	6	536401	536406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344715
13035	NC_022234	CGT	2	6	536488	536493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344715
13036	NC_022234	CAG	2	6	536497	536502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344715
13037	NC_022234	GAC	2	6	536600	536605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344715
13038	NC_022234	CGC	2	6	536634	536639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
13039	NC_022234	GC	3	6	536668	536673	0 %	0 %	50 %	50 %	538344715
13040	NC_022234	CCA	2	6	536685	536690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344715
13041	NC_022234	CGG	2	6	536694	536699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344715
13042	NC_022234	CGG	2	6	536709	536714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344715
13043	NC_022234	GCC	2	6	536746	536751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344715
13044	NC_022234	TCT	2	6	536754	536759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344715
13045	NC_022234	CGA	2	6	536853	536858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344715
13046	NC_022234	TCG	2	6	536904	536909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344715
13047	NC_022234	TGTT	2	8	536940	536947	0 %	75 %	25 %	0 %	538344715
13048	NC_022234	CTT	2	6	537201	537206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344716
13049	NC_022234	GAA	2	6	537213	537218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344716
13050	NC_022234	GTT	2	6	537330	537335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344716
13051	NC_022234	CCA	2	6	537434	537439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344716
13052	NC_022234	CGG	2	6	537575	537580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344716
13053	NC_022234	CTTC	2	8	537584	537591	0 %	50 %	0 %	50 %	538344716
13054	NC_022234	GAT	2	6	537605	537610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344716
13055	NC_022234	CGG	2	6	537614	537619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344716
13056	NC_022234	ATC	2	6	537736	537741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344716
13057	NC_022234	CAT	2	6	537780	537785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344716
13058	NC_022234	GT	3	6	537791	537796	0 %	50 %	50 %	0 %	538344716
13059	NC_022234	CAA	2	6	537890	537895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344716
13060	NC_022234	GAG	2	6	537921	537926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344716
13061	NC_022234	GCG	2	6	538016	538021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344717
13062	NC_022234	AGGCA	2	10	538104	538113	40 %	0 %	40 %	20 %	538344717
13063	NC_022234	A	7	7	538134	538140	100 %	0 %	0 %	0 %	538344717
13064	NC_022234	GCCG	2	8	538172	538179	0 %	0 %	50 %	50 %	538344717
13065	NC_022234	ACC	2	6	538201	538206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344717
13066	NC_022234	GC	3	6	538269	538274	0 %	0 %	50 %	50 %	538344717
13067	NC_022234	GCC	2	6	538291	538296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344717
13068	NC_022234	CAG	2	6	538416	538421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344717
13069	NC_022234	GGC	2	6	538422	538427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344717
13070	NC_022234	TTC	2	6	538482	538487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344717
13071	NC_022234	CGG	2	6	538556	538561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344717
13072	NC_022234	CGT	3	9	538628	538636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344717
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13074	NC_022234	GCT	2	6	538780	538785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344717
13075	NC_022234	CGT	2	6	538883	538888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344718
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13077	NC_022234	CGC	3	9	538950	538958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344718
13078	NC_022234	TGCC	2	8	538999	539006	0 %	25 %	25 %	50 %	538344718
13079	NC_022234	GAA	2	6	539089	539094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344719
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13081	NC_022234	TCATT	2	10	539152	539161	20 %	60 %	0 %	20 %	538344719
13082	NC_022234	GCG	2	6	539182	539187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344719
13083	NC_022234	GGCG	2	8	539194	539201	0 %	0 %	75 %	25 %	538344719
13084	NC_022234	GCGA	2	8	539315	539322	25 %	0 %	50 %	25 %	538344719
13085	NC_022234	GCGCC	2	10	539334	539343	0 %	0 %	40 %	60 %	538344719
13086	NC_022234	GAA	2	6	539552	539557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344720
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13088	NC_022234	CTGC	2	8	539690	539697	0 %	25 %	25 %	50 %	538344720
13089	NC_022234	GGC	2	6	539753	539758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344720
13090	NC_022234	GTT	2	6	539767	539772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344720
13091	NC_022234	GAT	2	6	539798	539803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344720
13092	NC_022234	AGCG	2	8	539831	539838	25 %	0 %	50 %	25 %	538344720
13093	NC_022234	GCG	2	6	539855	539860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344720
13094	NC_022234	CTT	2	6	539906	539911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344720
13095	NC_022234	CTGG	2	8	539970	539977	0 %	25 %	50 %	25 %	538344721
13096	NC_022234	G	6	6	540026	540031	0 %	0 %	100 %	0 %	538344721
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13100	NC_022234	GCG	2	6	540153	540158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344721
13101	NC_022234	CCT	2	6	540183	540188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344721
13102	NC_022234	CCGGT	2	10	540204	540213	0 %	20 %	40 %	40 %	538344721
13103	NC_022234	CAG	2	6	540217	540222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344721
13104	NC_022234	TGT	2	6	540273	540278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344721
13105	NC_022234	GTT	2	6	540286	540291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344721
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13107	NC_022234	TCG	2	6	540416	540421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344721
13108	NC_022234	GCG	2	6	540426	540431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344721
13109	NC_022234	TTG	2	6	540520	540525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344722
13110	NC_022234	GAT	2	6	540555	540560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344722
13111	NC_022234	GGAT	2	8	540591	540598	25 %	25 %	50 %	0 %	538344722
13112	NC_022234	GTGGCA	2	12	540600	540611	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344722
13113	NC_022234	CGT	2	6	540626	540631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344722
13114	NC_022234	CAACG	2	10	540642	540651	40 %	0 %	20 %	40 %	538344722
13115	NC_022234	CGC	2	6	540659	540664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
13116	NC_022234	GCCGC	2	10	540727	540736	0 %	0 %	40 %	60 %	538344722
13117	NC_022234	TCG	2	6	540787	540792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344722
13118	NC_022234	CG	3	6	540806	540811	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13119	NC_022234	CGT	2	6	540824	540829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344722
13120	NC_022234	GGC	2	6	540865	540870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
13121	NC_022234	CGCAG	2	10	540881	540890	20 %	0 %	40 %	40 %	538344722
13122	NC_022234	GCC	2	6	540895	540900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
13123	NC_022234	CG	3	6	540909	540914	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13124	NC_022234	CG	3	6	540940	540945	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13125	NC_022234	TCG	2	6	541003	541008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344722
13126	NC_022234	CCT	2	6	541031	541036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344722
13127	NC_022234	CGCAT	2	10	541044	541053	20 %	20 %	20 %	40 %	538344722
13128	NC_022234	GC	4	8	541055	541062	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13129	NC_022234	CGC	2	6	541100	541105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
13130	NC_022234	CAT	2	6	541122	541127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344722
13131	NC_022234	CGT	2	6	541214	541219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344722
13132	NC_022234	GC	3	6	541226	541231	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13133	NC_022234	GGT	2	6	541244	541249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344722
13134	NC_022234	CAGC	2	8	541284	541291	25 %	0 %	25 %	50 %	538344722
13135	NC_022234	CGT	2	6	541362	541367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344722
13136	NC_022234	GCG	2	6	541406	541411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
13137	NC_022234	CTC	2	6	541461	541466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344722
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13139	NC_022234	GAT	2	6	541518	541523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344722
13140	NC_022234	CCGTCG	2	12	541561	541572	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344722
13141	NC_022234	CGG	2	6	541592	541597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
13142	NC_022234	GC	3	6	541601	541606	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13143	NC_022234	CG	3	6	541609	541614	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13144	NC_022234	GCTC	2	8	541615	541622	0 %	25 %	25 %	50 %	538344722
13145	NC_022234	TTGA	2	8	541634	541641	25 %	50 %	25 %	0 %	538344722
13146	NC_022234	GCG	2	6	541646	541651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
13147	NC_022234	GGC	2	6	541657	541662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
13148	NC_022234	TCC	2	6	541693	541698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344722
13149	NC_022234	CG	3	6	541707	541712	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13150	NC_022234	GGCC	2	8	541766	541773	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13151	NC_022234	CA	3	6	541850	541855	50 %	0 %	0 %	50 %	538344722
13152	NC_022234	CCG	2	6	541856	541861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
13153	NC_022234	GC	3	6	541874	541879	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13154	NC_022234	CCG	2	6	541912	541917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
13155	NC_022234	GC	3	6	541932	541937	0 %	0 %	50 %	50 %	538344722
13156	NC_022234	GCGCT	2	10	541951	541960	0 %	20 %	40 %	40 %	538344722
13157	NC_022234	CGC	2	6	541999	542004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344722
13158	NC_022234	CGG	2	6	542022	542027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344722
13159	NC_022234	GCC	3	9	542053	542061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344723
13160	NC_022234	GGA	2	6	542149	542154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344723
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13164	NC_022234	GCGA	2	8	542338	542345	25 %	0 %	50 %	25 %	538344723
13165	NC_022234	TGA	2	6	542384	542389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344723
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13169	NC_022234	CGAAGG	2	12	542528	542539	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538344723
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13171	NC_022234	TCGA	2	8	542557	542564	25 %	25 %	25 %	25 %	538344723
13172	NC_022234	GAA	2	6	542607	542612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344723
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13178	NC_022234	CAG	3	9	542730	542738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344723
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13180	NC_022234	GAACGC	2	12	542844	542855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344723
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13202	NC_022234	ATC	3	9	543718	543726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344724
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13218	NC_022234	A	6	6	544366	544371	100 %	0 %	0 %	0 %	538344725
13219	NC_022234	GCGA	2	8	544532	544539	25 %	0 %	50 %	25 %	538344725
13220	NC_022234	CAG	2	6	544669	544674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344725
13221	NC_022234	GC	3	6	544711	544716	0 %	0 %	50 %	50 %	538344725
13222	NC_022234	GGC	2	6	544750	544755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344725
13223	NC_022234	GCC	2	6	544811	544816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344725
13224	NC_022234	GTCG	2	8	544831	544838	0 %	25 %	50 %	25 %	538344725
13225	NC_022234	GAT	2	6	544849	544854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344725
13226	NC_022234	GCA	2	6	544956	544961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344725
13227	NC_022234	CG	3	6	545008	545013	0 %	0 %	50 %	50 %	538344725
13228	NC_022234	AGC	2	6	545127	545132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
13229	NC_022234	CAG	2	6	545159	545164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
13230	NC_022234	CTG	2	6	545183	545188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344726
13231	NC_022234	CG	3	6	545205	545210	0 %	0 %	50 %	50 %	538344726
13232	NC_022234	CGC	2	6	545316	545321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344726
13233	NC_022234	GAA	2	6	545327	545332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344726
13234	NC_022234	CGG	2	6	545371	545376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344726
13235	NC_022234	CGTGC	2	10	545388	545397	0 %	20 %	40 %	40 %	538344726
13236	NC_022234	GGGC	2	8	545420	545427	0 %	0 %	75 %	25 %	538344726
13237	NC_022234	CAG	2	6	545462	545467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
13238	NC_022234	AGC	2	6	545499	545504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
13239	NC_022234	CAGC	2	8	545552	545559	25 %	0 %	25 %	50 %	538344726
13240	NC_022234	CGC	2	6	545575	545580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344726
13241	NC_022234	CGA	2	6	545593	545598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
13242	NC_022234	GATC	2	8	545614	545621	25 %	25 %	25 %	25 %	538344726
13243	NC_022234	GCA	2	6	545641	545646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
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13245	NC_022234	CG	3	6	545734	545739	0 %	0 %	50 %	50 %	538344726
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13262	NC_022234	CAG	2	6	546311	546316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344726
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13267	NC_022234	GC	3	6	546513	546518	0 %	0 %	50 %	50 %	538344726
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13342	NC_022234	GTCG	2	8	550658	550665	0 %	25 %	50 %	25 %	538344730
13343	NC_022234	TCCAGT	2	12	550704	550715	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538344730
13344	NC_022234	CGG	2	6	550774	550779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344730
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13346	NC_022234	GCGAG	2	10	550834	550843	20 %	0 %	60 %	20 %	538344730
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13352	NC_022234	TGC	2	6	551043	551048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344730
13353	NC_022234	GCG	2	6	551142	551147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344730
13354	NC_022234	GCC	2	6	551185	551190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344730
13355	NC_022234	C	6	6	551214	551219	0 %	0 %	0 %	100 %	538344730
13356	NC_022234	CGC	2	6	551254	551259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344730
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13358	NC_022234	CCAC	2	8	551326	551333	25 %	0 %	0 %	75 %	538344730
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13478	NC_022234	GCA	2	6	556344	556349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344734
13479	NC_022234	CAG	2	6	556356	556361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344734
13480	NC_022234	CAG	2	6	556366	556371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344734
13481	NC_022234	AAGACG	2	12	556373	556384	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	538344734
13482	NC_022234	GC	3	6	556662	556667	0 %	0 %	50 %	50 %	538344735
13483	NC_022234	GAA	3	9	556691	556699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344735
13484	NC_022234	GC	3	6	556717	556722	0 %	0 %	50 %	50 %	538344735
13485	NC_022234	GGT	2	6	556745	556750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344735
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13497	NC_022234	GCC	2	6	557809	557814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344738
13498	NC_022234	CG	3	6	557824	557829	0 %	0 %	50 %	50 %	538344738
13499	NC_022234	GCC	2	6	557857	557862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344738
13500	NC_022234	GC	3	6	557863	557868	0 %	0 %	50 %	50 %	538344738

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