MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022234	GGT	2	6	514384	514389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12502	NC_022234	CCG	2	6	514419	514424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12503	NC_022234	GTC	2	6	514427	514432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12504	NC_022234	GGAGCC	2	12	514435	514446	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538344698
12505	NC_022234	TTG	2	6	514568	514573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
12506	NC_022234	CTG	2	6	514606	514611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12507	NC_022234	TGG	2	6	514614	514619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12508	NC_022234	GCTG	2	8	514626	514633	0 %	25 %	50 %	25 %	538344698
12509	NC_022234	GTG	2	6	514736	514741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12510	NC_022234	GCC	2	6	514762	514767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12511	NC_022234	CCG	2	6	514791	514796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12512	NC_022234	GTG	2	6	514802	514807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12513	NC_022234	GTT	2	6	514837	514842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
12514	NC_022234	GTCC	2	8	514873	514880	0 %	25 %	25 %	50 %	538344698
12515	NC_022234	GTT	2	6	514939	514944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
12516	NC_022234	TGG	2	6	514968	514973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12517	NC_022234	TCG	2	6	515010	515015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12518	NC_022234	CTG	2	6	515020	515025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12519	NC_022234	TGG	2	6	515028	515033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12520	NC_022234	CCGG	2	8	515080	515087	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12521	NC_022234	CGC	2	6	515119	515124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12522	NC_022234	GTG	2	6	515150	515155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12523	NC_022234	GCC	2	6	515176	515181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12524	NC_022234	CGT	2	6	515206	515211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12525	NC_022234	GTC	2	6	515213	515218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12526	NC_022234	CAATG	2	10	515233	515242	40 %	20 %	20 %	20 %	538344698
12527	NC_022234	GTT	2	6	515251	515256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
12528	NC_022234	GTT	2	6	515353	515358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
12529	NC_022234	GTT	2	6	515374	515379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
12530	NC_022234	TGGT	2	8	515438	515445	0 %	50 %	50 %	0 %	538344698
12531	NC_022234	GTCG	2	8	515473	515480	0 %	25 %	50 %	25 %	538344698
12532	NC_022234	CGC	2	6	515500	515505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12533	NC_022234	CGT	2	6	515563	515568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12534	NC_022234	CGC	2	6	515589	515594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12535	NC_022234	CCG	2	6	515619	515624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12536	NC_022234	GTC	2	6	515627	515632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12537	NC_022234	CGT	2	6	515655	515660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12538	NC_022234	GTT	2	6	515665	515670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344698
12539	NC_022234	CCG	2	6	515676	515681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12540	NC_022234	GC	3	6	515712	515717	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12541	NC_022234	TGC	2	6	515724	515729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12542	NC_022234	GCC	4	12	515821	515832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12543	NC_022234	CG	3	6	515986	515991	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12544	NC_022234	CCG	2	6	515993	515998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12545	NC_022234	CGC	2	6	516054	516059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12546	NC_022234	CGG	2	6	516096	516101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344698
12547	NC_022234	GCC	2	6	516109	516114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12548	NC_022234	GC	3	6	516140	516145	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12549	NC_022234	CCG	2	6	516318	516323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12550	NC_022234	CGTG	2	8	516346	516353	0 %	25 %	50 %	25 %	538344698
12551	NC_022234	CGATGG	2	12	516399	516410	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344698
12552	NC_022234	CGGC	2	8	516416	516423	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12553	NC_022234	CGT	2	6	516532	516537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12554	NC_022234	GTC	2	6	516586	516591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12555	NC_022234	TGCC	2	8	516606	516613	0 %	25 %	25 %	50 %	538344698
12556	NC_022234	GCC	2	6	516617	516622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12557	NC_022234	C	6	6	516725	516730	0 %	0 %	0 %	100 %	538344698
12558	NC_022234	GC	3	6	516744	516749	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12559	NC_022234	CGG	2	6	516765	516770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344698
12560	NC_022234	CGT	2	6	516930	516935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12561	NC_022234	GCG	2	6	517001	517006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344698
12562	NC_022234	GTG	2	6	517112	517117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12563	NC_022234	CTG	2	6	517179	517184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12564	NC_022234	GC	3	6	517230	517235	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12565	NC_022234	CGATGG	2	12	517254	517265	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344698
12566	NC_022234	GC	3	6	517320	517325	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12567	NC_022234	TGC	2	6	517338	517343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12568	NC_022234	GC	4	8	517342	517349	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12569	NC_022234	CTG	2	6	517371	517376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344698
12570	NC_022234	CGC	2	6	517446	517451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344698
12571	NC_022234	GGT	2	6	517453	517458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
12572	NC_022234	GAG	2	6	517505	517510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344698
12573	NC_022234	GCCGT	2	10	517529	517538	0 %	20 %	40 %	40 %	538344698
12574	NC_022234	CGCCTG	2	12	517573	517584	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538344698
12575	NC_022234	GCCG	2	8	517612	517619	0 %	0 %	50 %	50 %	538344698
12576	NC_022234	GGT	2	6	517666	517671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344698
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12578	NC_022234	ACG	2	6	518203	518208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344699
12579	NC_022234	GAG	2	6	518287	518292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344699
12580	NC_022234	GCT	2	6	518346	518351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344699
12581	NC_022234	AGG	2	6	518375	518380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344699
12582	NC_022234	CGA	2	6	518386	518391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344699
12583	NC_022234	CGGG	2	8	518397	518404	0 %	0 %	75 %	25 %	538344699
12584	NC_022234	TGC	3	9	518415	518423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344699
12585	NC_022234	GCC	2	6	518432	518437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344699
12586	NC_022234	GCA	2	6	518515	518520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344700
12587	NC_022234	CAC	2	6	518579	518584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344700
12588	NC_022234	TTCG	2	8	518654	518661	0 %	50 %	25 %	25 %	538344700
12589	NC_022234	GCT	2	6	518695	518700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344700
12590	NC_022234	CGAA	2	8	518739	518746	50 %	0 %	25 %	25 %	538344700
12591	NC_022234	TGG	2	6	518770	518775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344700
12592	NC_022234	CCA	2	6	518818	518823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344700
12593	NC_022234	GCC	2	6	518840	518845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344700
12594	NC_022234	TCG	2	6	518857	518862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344700
12595	NC_022234	GCG	2	6	518910	518915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344700
12596	NC_022234	AGA	2	6	519232	519237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344701
12597	NC_022234	CGA	2	6	519254	519259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344701
12598	NC_022234	GCC	2	6	519276	519281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344701
12599	NC_022234	GCC	2	6	519321	519326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344701
12600	NC_022234	GC	3	6	519342	519347	0 %	0 %	50 %	50 %	538344701
12601	NC_022234	ACT	2	6	519358	519363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344701
12602	NC_022234	ACGCG	2	10	519472	519481	20 %	0 %	40 %	40 %	538344701
12603	NC_022234	GAA	2	6	519513	519518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344701
12604	NC_022234	GCA	2	6	519537	519542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344701
12605	NC_022234	ACG	2	6	519565	519570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344701
12606	NC_022234	ATG	2	6	519613	519618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344701
12607	NC_022234	AGC	2	6	519652	519657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344701
12608	NC_022234	TCG	2	6	519660	519665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344701
12609	NC_022234	CTT	2	6	519747	519752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344701
12610	NC_022234	ACG	2	6	519763	519768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344701
12611	NC_022234	CCA	2	6	519815	519820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344701
12612	NC_022234	GCGA	2	8	519834	519841	25 %	0 %	50 %	25 %	538344701
12613	NC_022234	GC	3	6	519852	519857	0 %	0 %	50 %	50 %	538344701
12614	NC_022234	CCA	2	6	519878	519883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344701
12615	NC_022234	GC	3	6	519885	519890	0 %	0 %	50 %	50 %	538344701
12616	NC_022234	GATGGG	2	12	519902	519913	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	538344701
12617	NC_022234	GGC	2	6	519926	519931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344701
12618	NC_022234	TGCG	2	8	519958	519965	0 %	25 %	50 %	25 %	538344701
12619	NC_022234	ATC	2	6	519997	520002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344701
12620	NC_022234	GAA	2	6	520041	520046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344701
12621	NC_022234	CGC	2	6	520175	520180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344701
12622	NC_022234	CAGG	2	8	520250	520257	25 %	0 %	50 %	25 %	538344701
12623	NC_022234	GTG	2	6	520293	520298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344701
12624	NC_022234	TGCC	2	8	520299	520306	0 %	25 %	25 %	50 %	538344701
12625	NC_022234	CGG	2	6	520354	520359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344701
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12630	NC_022234	TGT	2	6	520511	520516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344701
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12632	NC_022234	GCC	2	6	520603	520608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344701
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12639	NC_022234	GCCG	2	8	520853	520860	0 %	0 %	50 %	50 %	538344701
12640	NC_022234	CTG	2	6	520874	520879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344701
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12642	NC_022234	GCG	2	6	521028	521033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344701
12643	NC_022234	CA	3	6	521128	521133	50 %	0 %	0 %	50 %	538344701
12644	NC_022234	GGGC	2	8	521155	521162	0 %	0 %	75 %	25 %	538344701
12645	NC_022234	CGC	2	6	521207	521212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344701
12646	NC_022234	TGG	2	6	521245	521250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344701
12647	NC_022234	GCA	2	6	521261	521266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344701
12648	NC_022234	AG	3	6	521320	521325	50 %	0 %	50 %	0 %	538344701
12649	NC_022234	AAC	2	6	521326	521331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344701
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12651	NC_022234	GGCGA	2	10	521425	521434	20 %	0 %	60 %	20 %	538344701
12652	NC_022234	GAC	2	6	521540	521545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344702
12653	NC_022234	GCT	2	6	521651	521656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344702
12654	NC_022234	CAA	2	6	521723	521728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344702
12655	NC_022234	CATC	2	8	521765	521772	25 %	25 %	0 %	50 %	538344702
12656	NC_022234	GGC	2	6	521810	521815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344702
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12672	NC_022234	ATC	2	6	522419	522424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344703
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12676	NC_022234	CCTG	2	8	522514	522521	0 %	25 %	25 %	50 %	538344703
12677	NC_022234	GGCA	2	8	522530	522537	25 %	0 %	50 %	25 %	538344703
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12714	NC_022234	AGATCG	2	12	523794	523805	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538344703
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12723	NC_022234	CGA	2	6	524215	524220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344704
12724	NC_022234	CG	3	6	524232	524237	0 %	0 %	50 %	50 %	538344704
12725	NC_022234	GC	3	6	524259	524264	0 %	0 %	50 %	50 %	538344704
12726	NC_022234	CGT	2	6	524283	524288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344704
12727	NC_022234	CAC	2	6	524323	524328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344704
12728	NC_022234	AGGC	2	8	524366	524373	25 %	0 %	50 %	25 %	538344704
12729	NC_022234	GCT	2	6	524432	524437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344704
12730	NC_022234	CTG	2	6	524631	524636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344704
12731	NC_022234	GC	3	6	524699	524704	0 %	0 %	50 %	50 %	538344704
12732	NC_022234	GCC	2	6	524710	524715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344704
12733	NC_022234	GTC	3	9	524716	524724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344704
12734	NC_022234	TTC	2	6	524743	524748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344704
12735	NC_022234	GCCA	2	8	524828	524835	25 %	0 %	25 %	50 %	538344704
12736	NC_022234	AGA	2	6	524898	524903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344704
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12976	NC_022234	GGCG	2	8	534356	534363	0 %	0 %	75 %	25 %	538344714
12977	NC_022234	GCG	2	6	534370	534375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
12978	NC_022234	AGG	2	6	534457	534462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344714
12979	NC_022234	CG	3	6	534490	534495	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
12980	NC_022234	GGC	2	6	534507	534512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
12981	NC_022234	CGA	2	6	534563	534568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344714
12982	NC_022234	GCC	2	6	534573	534578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
12983	NC_022234	TGC	2	6	534613	534618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
12984	NC_022234	AAG	2	6	534627	534632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344714
12985	NC_022234	GCG	2	6	534649	534654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714
12986	NC_022234	GGCG	2	8	534737	534744	0 %	0 %	75 %	25 %	538344714
12987	NC_022234	GGCC	2	8	534749	534756	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
12988	NC_022234	GC	4	8	534781	534788	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
12989	NC_022234	CG	3	6	534913	534918	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
12990	NC_022234	CG	3	6	534936	534941	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
12991	NC_022234	CG	3	6	534984	534989	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
12992	NC_022234	TGC	2	6	535000	535005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
12993	NC_022234	GC	3	6	535015	535020	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
12994	NC_022234	CGC	2	6	535027	535032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
12995	NC_022234	GCT	2	6	535034	535039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
12996	NC_022234	CGGC	2	8	535060	535067	0 %	0 %	50 %	50 %	538344714
12997	NC_022234	CTG	2	6	535068	535073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344714
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12999	NC_022234	GCC	2	6	535212	535217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344714
13000	NC_022234	CGG	2	6	535277	535282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344714

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