MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_022234	GCA	2	6	411731	411736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344598
10002	NC_022234	GGT	2	6	411740	411745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344598
10003	NC_022234	GCC	2	6	411763	411768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344598
10004	NC_022234	GCT	2	6	411798	411803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344598
10005	NC_022234	GGT	2	6	412345	412350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344599
10006	NC_022234	AACG	2	8	412538	412545	50 %	0 %	25 %	25 %	538344599
10007	NC_022234	GGGT	2	8	412568	412575	0 %	25 %	75 %	0 %	538344599
10008	NC_022234	CG	3	6	412621	412626	0 %	0 %	50 %	50 %	538344599
10009	NC_022234	ACA	2	6	412662	412667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538344599
10010	NC_022234	GTG	2	6	412769	412774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344599
10011	NC_022234	AGT	2	6	412888	412893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344599
10012	NC_022234	CCAG	2	8	413066	413073	25 %	0 %	25 %	50 %	538344600
10013	NC_022234	GGT	2	6	413105	413110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344600
10014	NC_022234	CTT	2	6	413159	413164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344600
10015	NC_022234	TGGGC	2	10	413207	413216	0 %	20 %	60 %	20 %	538344600
10016	NC_022234	AGC	2	6	413231	413236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10017	NC_022234	GATC	2	8	413270	413277	25 %	25 %	25 %	25 %	538344600
10018	NC_022234	GGC	2	6	413303	413308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344600
10019	NC_022234	GGT	2	6	413339	413344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344600
10020	NC_022234	GC	3	6	413350	413355	0 %	0 %	50 %	50 %	538344600
10021	NC_022234	AGG	2	6	413356	413361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344600
10022	NC_022234	CG	3	6	413378	413383	0 %	0 %	50 %	50 %	538344600
10023	NC_022234	CGA	3	9	413411	413419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10024	NC_022234	GCA	2	6	413432	413437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10025	NC_022234	CAC	2	6	413496	413501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344600
10026	NC_022234	CGT	2	6	413507	413512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10027	NC_022234	CGAT	2	8	413536	413543	25 %	25 %	25 %	25 %	538344600
10028	NC_022234	CGC	2	6	413702	413707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344600
10029	NC_022234	TCG	2	6	413713	413718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10030	NC_022234	GGC	2	6	413751	413756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344600
10031	NC_022234	CGC	2	6	413765	413770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344600
10032	NC_022234	GCG	2	6	413847	413852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344600
10033	NC_022234	GC	4	8	413898	413905	0 %	0 %	50 %	50 %	538344600
10034	NC_022234	TGT	2	6	413921	413926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344600
10035	NC_022234	CAG	2	6	413949	413954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10036	NC_022234	CGG	2	6	413973	413978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344600
10037	NC_022234	CAC	2	6	414015	414020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344600
10038	NC_022234	CGG	2	6	414068	414073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344600
10039	NC_022234	GCG	2	6	414078	414083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344600
10040	NC_022234	CGG	2	6	414104	414109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344600
10041	NC_022234	CGC	4	12	414142	414153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344600
10042	NC_022234	CTGC	2	8	414157	414164	0 %	25 %	25 %	50 %	538344600
10043	NC_022234	CCG	2	6	414249	414254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344600
10044	NC_022234	CTG	2	6	414261	414266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10045	NC_022234	GCT	2	6	414293	414298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10046	NC_022234	GC	4	8	414399	414406	0 %	0 %	50 %	50 %	538344600
10047	NC_022234	GCA	2	6	414431	414436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344600
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10049	NC_022234	GC	4	8	414461	414468	0 %	0 %	50 %	50 %	538344600
10050	NC_022234	CGA	2	6	414509	414514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10051	NC_022234	GCC	2	6	414520	414525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344600
10052	NC_022234	CCA	2	6	414572	414577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344600
10053	NC_022234	TGC	2	6	414587	414592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344600
10054	NC_022234	GC	3	6	414612	414617	0 %	0 %	50 %	50 %	538344600
10055	NC_022234	CCG	2	6	414692	414697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344600
10056	NC_022234	CGG	2	6	414836	414841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344601
10057	NC_022234	AGG	2	6	414848	414853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344601
10058	NC_022234	CGCC	2	8	414885	414892	0 %	0 %	25 %	75 %	538344601
10059	NC_022234	GGT	2	6	414913	414918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344601
10060	NC_022234	TCC	2	6	414969	414974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344601
10061	NC_022234	CGCGC	3	15	414979	414993	0 %	0 %	40 %	60 %	538344601
10062	NC_022234	TGA	2	6	415027	415032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344601
10063	NC_022234	C	6	6	415050	415055	0 %	0 %	0 %	100 %	538344601
10064	NC_022234	CCG	2	6	415099	415104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344601
10065	NC_022234	CTT	2	6	415247	415252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344601
10066	NC_022234	TGC	2	6	415264	415269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344601
10067	NC_022234	GTGC	2	8	415312	415319	0 %	25 %	50 %	25 %	538344601
10068	NC_022234	GCA	2	6	415342	415347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344601
10069	NC_022234	GCC	4	12	415365	415376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344601
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10071	NC_022234	ACC	2	6	415482	415487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344601
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10073	NC_022234	CGTAGT	2	12	415534	415545	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	538344601
10074	NC_022234	G	6	6	415556	415561	0 %	0 %	100 %	0 %	538344601
10075	NC_022234	CGC	2	6	415618	415623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344602
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10078	NC_022234	CAG	2	6	415760	415765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344602
10079	NC_022234	CTGC	2	8	415783	415790	0 %	25 %	25 %	50 %	538344602
10080	NC_022234	CCACGA	2	12	415807	415818	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538344602
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10082	NC_022234	ACG	2	6	415839	415844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344602
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10084	NC_022234	TGA	2	6	415957	415962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344603
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10086	NC_022234	CGT	2	6	416030	416035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344603
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10088	NC_022234	TTCG	2	8	416087	416094	0 %	50 %	25 %	25 %	538344603
10089	NC_022234	GGC	2	6	416165	416170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344603
10090	NC_022234	CCTT	2	8	416178	416185	0 %	50 %	0 %	50 %	538344603
10091	NC_022234	CGG	2	6	416215	416220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344603
10092	NC_022234	GC	4	8	416253	416260	0 %	0 %	50 %	50 %	538344604
10093	NC_022234	CGG	2	6	416262	416267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344604
10094	NC_022234	GCG	2	6	416337	416342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344604
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10099	NC_022234	GCCG	2	8	416451	416458	0 %	0 %	50 %	50 %	538344604
10100	NC_022234	GTG	2	6	416504	416509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344604
10101	NC_022234	GATC	2	8	416514	416521	25 %	25 %	25 %	25 %	538344604
10102	NC_022234	GCC	3	9	416555	416563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344604
10103	NC_022234	CGA	2	6	416595	416600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344604
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10105	NC_022234	TGGCC	2	10	416631	416640	0 %	20 %	40 %	40 %	538344604
10106	NC_022234	TCG	2	6	416660	416665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344604
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10113	NC_022234	GCTG	2	8	416832	416839	0 %	25 %	50 %	25 %	538344604
10114	NC_022234	GCG	2	6	416840	416845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344604
10115	NC_022234	CAC	2	6	416872	416877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344604
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10117	NC_022234	GCC	2	6	416896	416901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344604
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10119	NC_022234	GAA	2	6	416956	416961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344604
10120	NC_022234	CGA	2	6	416964	416969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344604
10121	NC_022234	CGC	2	6	417013	417018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344604
10122	NC_022234	AGC	2	6	417083	417088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344604
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10124	NC_022234	GCC	2	6	417145	417150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344604
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10126	NC_022234	GCG	2	6	417310	417315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344605
10127	NC_022234	CG	4	8	417314	417321	0 %	0 %	50 %	50 %	538344605
10128	NC_022234	GC	3	6	417412	417417	0 %	0 %	50 %	50 %	538344605
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10136	NC_022234	CGG	2	6	417743	417748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344605
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10138	NC_022234	GAA	2	6	417798	417803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344605
10139	NC_022234	GCCGC	2	10	417847	417856	0 %	0 %	40 %	60 %	538344605
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10149	NC_022234	GC	4	8	418567	418574	0 %	0 %	50 %	50 %	538344606
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10220	NC_022234	C	6	6	421582	421587	0 %	0 %	0 %	100 %	538344608
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10226	NC_022234	AGC	2	6	422857	422862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344609
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10229	NC_022234	GC	3	6	422971	422976	0 %	0 %	50 %	50 %	538344609
10230	NC_022234	GTC	2	6	423058	423063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344609
10231	NC_022234	ACG	2	6	423084	423089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344609
10232	NC_022234	CCAG	2	8	423099	423106	25 %	0 %	25 %	50 %	538344609
10233	NC_022234	GCA	2	6	423159	423164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344609
10234	NC_022234	GCG	2	6	423208	423213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344609
10235	NC_022234	GTC	2	6	423238	423243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344609
10236	NC_022234	CGT	2	6	423385	423390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344609
10237	NC_022234	GC	4	8	423447	423454	0 %	0 %	50 %	50 %	538344609
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10239	NC_022234	GC	3	6	423520	423525	0 %	0 %	50 %	50 %	538344609
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10360	NC_022234	GCGG	2	8	429533	429540	0 %	0 %	75 %	25 %	538344618
10361	NC_022234	CGT	2	6	429547	429552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344618
10362	NC_022234	CTC	2	6	429562	429567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344618
10363	NC_022234	CAC	2	6	429569	429574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344618
10364	NC_022234	GGC	2	6	429596	429601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344618
10365	NC_022234	GCG	2	6	429621	429626	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344618
10366	NC_022234	TCA	2	6	429630	429635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344618
10367	NC_022234	GCG	2	6	429717	429722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344618
10368	NC_022234	GC	4	8	429727	429734	0 %	0 %	50 %	50 %	538344618
10369	NC_022234	GATGCG	2	12	429748	429759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538344618
10370	NC_022234	GCT	2	6	429868	429873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344618
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10372	NC_022234	TGC	2	6	429996	430001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344619
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10376	NC_022234	GGC	2	6	430087	430092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344619
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10379	NC_022234	GCG	2	6	430160	430165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344619
10380	NC_022234	CCGG	2	8	430167	430174	0 %	0 %	50 %	50 %	538344619
10381	NC_022234	TTC	2	6	430253	430258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344619
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10387	NC_022234	GC	3	6	430367	430372	0 %	0 %	50 %	50 %	538344619
10388	NC_022234	CGC	2	6	430381	430386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344619
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10402	NC_022234	CTG	2	6	430841	430846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344619
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10424	NC_022234	CGCC	2	8	431749	431756	0 %	0 %	25 %	75 %	538344620
10425	NC_022234	CGA	2	6	431849	431854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344620
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10427	NC_022234	GC	3	6	431916	431921	0 %	0 %	50 %	50 %	538344620
10428	NC_022234	GCCG	2	8	431928	431935	0 %	0 %	50 %	50 %	538344620
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10432	NC_022234	CGA	2	6	432239	432244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344620
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10439	NC_022234	GCA	2	6	433131	433136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344621
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10464	NC_022234	GAC	2	6	434433	434438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344622
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10467	NC_022234	CTG	2	6	434541	434546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344622
10468	NC_022234	CG	3	6	434548	434553	0 %	0 %	50 %	50 %	538344622
10469	NC_022234	GGC	2	6	434586	434591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344622
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10471	NC_022234	GACAC	2	10	434700	434709	40 %	0 %	20 %	40 %	538344623
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10477	NC_022234	GAA	2	6	434886	434891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538344623
10478	NC_022234	GCG	2	6	434947	434952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344623
10479	NC_022234	CG	4	8	434951	434958	0 %	0 %	50 %	50 %	538344623
10480	NC_022234	GCG	2	6	435011	435016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344623
10481	NC_022234	GTC	2	6	435026	435031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344623
10482	NC_022234	GCT	2	6	435032	435037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344623
10483	NC_022234	CGGC	3	12	435052	435063	0 %	0 %	50 %	50 %	538344623
10484	NC_022234	GGC	2	6	435101	435106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344623
10485	NC_022234	CGT	2	6	435128	435133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344623
10486	NC_022234	GCC	2	6	435134	435139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344623
10487	NC_022234	GC	3	6	435151	435156	0 %	0 %	50 %	50 %	538344623
10488	NC_022234	TCGT	2	8	435166	435173	0 %	50 %	25 %	25 %	538344623
10489	NC_022234	GCT	2	6	435197	435202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344623
10490	NC_022234	GCAGC	2	10	435206	435215	20 %	0 %	40 %	40 %	538344623
10491	NC_022234	CG	3	6	435255	435260	0 %	0 %	50 %	50 %	538344623
10492	NC_022234	CG	3	6	435284	435289	0 %	0 %	50 %	50 %	538344623
10493	NC_022234	CAG	2	6	435291	435296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344623
10494	NC_022234	GGC	2	6	435297	435302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344623
10495	NC_022234	GTC	2	6	435342	435347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344623
10496	NC_022234	TGG	2	6	435349	435354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344623
10497	NC_022234	ATG	2	6	435396	435401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344623
10498	NC_022234	TGA	2	6	435415	435420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344623
10499	NC_022234	GCA	2	6	435500	435505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344623
10500	NC_022234	GCG	2	6	435508	435513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344623

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