MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 2

Total Repeats: 32115

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022234	CGC	2	6	250950	250955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344436
6002	NC_022234	GC	3	6	250964	250969	0 %	0 %	50 %	50 %	538344436
6003	NC_022234	GCC	2	6	250982	250987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344436
6004	NC_022234	CAG	2	6	251027	251032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6005	NC_022234	GGC	3	9	251050	251058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344436
6006	NC_022234	GC	3	6	251057	251062	0 %	0 %	50 %	50 %	538344436
6007	NC_022234	AGC	2	6	251067	251072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6008	NC_022234	TCT	2	6	251077	251082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344436
6009	NC_022234	CTGC	2	8	251128	251135	0 %	25 %	25 %	50 %	538344436
6010	NC_022234	CG	3	6	251166	251171	0 %	0 %	50 %	50 %	538344436
6011	NC_022234	CAC	3	9	251204	251212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344436
6012	NC_022234	CGT	2	6	251332	251337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6013	NC_022234	GTC	2	6	251339	251344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6014	NC_022234	CGA	2	6	251347	251352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6015	NC_022234	AGC	2	6	251382	251387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6016	NC_022234	GC	3	6	251396	251401	0 %	0 %	50 %	50 %	538344436
6017	NC_022234	GCG	2	6	251422	251427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344436
6018	NC_022234	GAC	2	6	251444	251449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6019	NC_022234	CGC	2	6	251465	251470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344436
6020	NC_022234	CGC	2	6	251479	251484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344436
6021	NC_022234	GC	3	6	251483	251488	0 %	0 %	50 %	50 %	538344436
6022	NC_022234	CTT	2	6	251500	251505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344436
6023	NC_022234	GCA	2	6	251545	251550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6024	NC_022234	CGG	2	6	251561	251566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344436
6025	NC_022234	CCAC	2	8	251581	251588	25 %	0 %	0 %	75 %	538344436
6026	NC_022234	AGC	2	6	251607	251612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6027	NC_022234	GCGA	2	8	251628	251635	25 %	0 %	50 %	25 %	538344436
6028	NC_022234	CGC	2	6	251683	251688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344436
6029	NC_022234	AGGT	2	8	251700	251707	25 %	25 %	50 %	0 %	538344436
6030	NC_022234	GCA	2	6	251722	251727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6031	NC_022234	GTC	2	6	251769	251774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344436
6032	NC_022234	GGCGC	2	10	251780	251789	0 %	0 %	60 %	40 %	538344436
6033	NC_022234	GC	3	6	251798	251803	0 %	0 %	50 %	50 %	538344436
6034	NC_022234	GGC	2	6	251864	251869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344436
6035	NC_022234	GCG	2	6	251918	251923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344436
6036	NC_022234	ACC	2	6	251955	251960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344436
6037	NC_022234	GCG	2	6	251977	251982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344436
6038	NC_022234	CG	3	6	252031	252036	0 %	0 %	50 %	50 %	538344436
6039	NC_022234	TGCG	2	8	252061	252068	0 %	25 %	50 %	25 %	538344436
6040	NC_022234	GC	3	6	252343	252348	0 %	0 %	50 %	50 %	538344437
6041	NC_022234	TTG	2	6	252357	252362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538344437
6042	NC_022234	GCA	2	6	252388	252393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344437
6043	NC_022234	GC	3	6	252398	252403	0 %	0 %	50 %	50 %	538344437
6044	NC_022234	GC	4	8	252407	252414	0 %	0 %	50 %	50 %	538344437
6045	NC_022234	GC	3	6	252426	252431	0 %	0 %	50 %	50 %	538344437
6046	NC_022234	GTC	3	9	252444	252452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344437
6047	NC_022234	GCGG	2	8	252476	252483	0 %	0 %	75 %	25 %	538344437
6048	NC_022234	CCA	2	6	252515	252520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344437
6049	NC_022234	GCC	2	6	252533	252538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344437
6050	NC_022234	GCC	2	6	252567	252572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344437
6051	NC_022234	TCG	2	6	252613	252618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344437
6052	NC_022234	GGC	2	6	252629	252634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344437
6053	NC_022234	GCC	2	6	252640	252645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344437
6054	NC_022234	TGG	2	6	252649	252654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344437
6055	NC_022234	GGC	2	6	252761	252766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344437
6056	NC_022234	GCG	2	6	252789	252794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344437
6057	NC_022234	TGC	2	6	252811	252816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344437
6058	NC_022234	CAG	2	6	252968	252973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344437
6059	NC_022234	GCAT	2	8	253001	253008	25 %	25 %	25 %	25 %	538344437
6060	NC_022234	GCTGCG	2	12	253010	253021	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538344437
6061	NC_022234	GGC	2	6	253042	253047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344438
6062	NC_022234	GCG	2	6	253082	253087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344438
6063	NC_022234	GCC	2	6	253103	253108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344438
6064	NC_022234	AGG	2	6	253140	253145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538344438
6065	NC_022234	GCA	2	6	253170	253175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344438
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6068	NC_022234	TCG	2	6	253311	253316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344438
6069	NC_022234	CCG	2	6	253322	253327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344438
6070	NC_022234	CGG	3	9	253405	253413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344438
6071	NC_022234	GCG	2	6	253434	253439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344438
6072	NC_022234	CTT	2	6	253444	253449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538344438
6073	NC_022234	GCC	2	6	253453	253458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344438
6074	NC_022234	TGG	2	6	253512	253517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344438
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6079	NC_022234	CCAC	2	8	253694	253701	25 %	0 %	0 %	75 %	538344439
6080	NC_022234	TCA	2	6	253724	253729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344439
6081	NC_022234	GTG	2	6	253740	253745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344439
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6084	NC_022234	TCC	2	6	253855	253860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344439
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6087	NC_022234	GCC	2	6	253944	253949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344439
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6089	NC_022234	GTA	2	6	254187	254192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344440
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6091	NC_022234	GCC	2	6	254225	254230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344440
6092	NC_022234	CAT	2	6	254247	254252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344440
6093	NC_022234	GTC	2	6	254253	254258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344440
6094	NC_022234	GCA	2	6	254273	254278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344440
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6098	NC_022234	TGG	2	6	254413	254418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344440
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6100	NC_022234	GCG	2	6	254464	254469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344440
6101	NC_022234	GCA	2	6	254507	254512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344440
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6103	NC_022234	CG	3	6	254636	254641	0 %	0 %	50 %	50 %	538344440
6104	NC_022234	GCAG	2	8	254647	254654	25 %	0 %	50 %	25 %	538344440
6105	NC_022234	ACCG	2	8	254688	254695	25 %	0 %	25 %	50 %	538344440
6106	NC_022234	C	7	7	254710	254716	0 %	0 %	0 %	100 %	538344440
6107	NC_022234	GCA	2	6	254762	254767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344440
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6109	NC_022234	GTA	2	6	254787	254792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344440
6110	NC_022234	CGTC	2	8	254801	254808	0 %	25 %	25 %	50 %	538344440
6111	NC_022234	CGC	2	6	254824	254829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344440
6112	NC_022234	GCG	3	9	254914	254922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344440
6113	NC_022234	GC	4	8	254937	254944	0 %	0 %	50 %	50 %	538344440
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6117	NC_022234	GC	3	6	255282	255287	0 %	0 %	50 %	50 %	538344441
6118	NC_022234	GC	3	6	255301	255306	0 %	0 %	50 %	50 %	538344441
6119	NC_022234	GC	3	6	255312	255317	0 %	0 %	50 %	50 %	538344441
6120	NC_022234	GCA	2	6	255325	255330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344441
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6122	NC_022234	CGG	2	6	255364	255369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344441
6123	NC_022234	CCA	2	6	255453	255458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344441
6124	NC_022234	GCT	2	6	255466	255471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344441
6125	NC_022234	ACG	2	6	255486	255491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344441
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6133	NC_022234	ATG	2	6	255764	255769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344441
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6138	NC_022234	GCT	2	6	256018	256023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344441
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6142	NC_022234	GCG	2	6	256295	256300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344442
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6144	NC_022234	CTG	2	6	256380	256385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344442
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6150	NC_022234	CGC	2	6	256495	256500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344442
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6152	NC_022234	ACC	2	6	256523	256528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344442
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6155	NC_022234	GCG	2	6	256619	256624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344442
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6161	NC_022234	CCGCG	2	10	256743	256752	0 %	0 %	40 %	60 %	538344442
6162	NC_022234	CG	3	6	256780	256785	0 %	0 %	50 %	50 %	538344442
6163	NC_022234	CG	3	6	256789	256794	0 %	0 %	50 %	50 %	538344442
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6187	NC_022234	TCG	2	6	257746	257751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344443
6188	NC_022234	CCACA	2	10	257753	257762	40 %	0 %	0 %	60 %	538344443
6189	NC_022234	GC	4	8	257825	257832	0 %	0 %	50 %	50 %	538344443
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6197	NC_022234	CCGCG	2	10	258197	258206	0 %	0 %	40 %	60 %	538344443
6198	NC_022234	TCG	2	6	258210	258215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344443
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6200	NC_022234	GGC	2	6	258333	258338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344443
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6210	NC_022234	CAT	2	6	258867	258872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344444
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6213	NC_022234	GGCG	2	8	259005	259012	0 %	0 %	75 %	25 %	538344444
6214	NC_022234	GT	3	6	259019	259024	0 %	50 %	50 %	0 %	538344444
6215	NC_022234	GCT	2	6	259038	259043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344444
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6221	NC_022234	TGC	2	6	259265	259270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344444
6222	NC_022234	TGC	2	6	259284	259289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344444
6223	NC_022234	CGT	2	6	259308	259313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344444
6224	NC_022234	CGC	2	6	259319	259324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344444
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6229	NC_022234	GC	3	6	259420	259425	0 %	0 %	50 %	50 %	538344444
6230	NC_022234	CAC	2	6	259428	259433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344444
6231	NC_022234	GGC	2	6	259434	259439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344444
6232	NC_022234	TGG	2	6	259469	259474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344444
6233	NC_022234	CGGC	2	8	259476	259483	0 %	0 %	50 %	50 %	538344444
6234	NC_022234	CG	3	6	259488	259493	0 %	0 %	50 %	50 %	538344444
6235	NC_022234	TGCG	2	8	259526	259533	0 %	25 %	50 %	25 %	538344444
6236	NC_022234	ACG	2	6	259554	259559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344444
6237	NC_022234	GCC	2	6	259581	259586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344445
6238	NC_022234	GCC	2	6	259588	259593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344445
6239	NC_022234	CCG	2	6	259606	259611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344445
6240	NC_022234	CAGG	2	8	259637	259644	25 %	0 %	50 %	25 %	538344445
6241	NC_022234	CGG	2	6	259694	259699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344445
6242	NC_022234	GAT	2	6	259721	259726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344445
6243	NC_022234	GCC	2	6	259746	259751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344445
6244	NC_022234	GTCCG	2	10	259799	259808	0 %	20 %	40 %	40 %	538344445
6245	NC_022234	CGG	2	6	259809	259814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344445
6246	NC_022234	CCT	2	6	259834	259839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344445
6247	NC_022234	TCC	2	6	259950	259955	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538344445
6248	NC_022234	GCCAG	2	10	259960	259969	20 %	0 %	40 %	40 %	538344445
6249	NC_022234	CCGC	2	8	260011	260018	0 %	0 %	25 %	75 %	538344445
6250	NC_022234	TGCGC	2	10	260062	260071	0 %	20 %	40 %	40 %	538344445
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6257	NC_022234	CGA	2	6	260410	260415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344445
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6269	NC_022234	CGA	2	6	260808	260813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344446
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6286	NC_022234	CGA	2	6	261216	261221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344446
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6322	NC_022234	GCA	2	6	262373	262378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344447
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6324	NC_022234	GCGCG	2	10	262409	262418	0 %	0 %	60 %	40 %	538344447
6325	NC_022234	GC	3	6	262457	262462	0 %	0 %	50 %	50 %	538344447
6326	NC_022234	ATC	2	6	262471	262476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344447
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6329	NC_022234	CCA	3	9	262649	262657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344447
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6332	NC_022234	TGC	2	6	262708	262713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344447
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6334	NC_022234	CAC	2	6	262768	262773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344447
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6336	NC_022234	CGGT	2	8	262867	262874	0 %	25 %	50 %	25 %	538344447
6337	NC_022234	CGC	2	6	262937	262942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344447
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6339	NC_022234	GGGCA	2	10	263020	263029	20 %	0 %	60 %	20 %	538344447
6340	NC_022234	CGG	2	6	263080	263085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344447
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6344	NC_022234	GTC	2	6	263190	263195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344447
6345	NC_022234	CAT	2	6	263199	263204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538344447
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6349	NC_022234	TGGT	2	8	263386	263393	0 %	50 %	50 %	0 %	538344448
6350	NC_022234	GCT	3	9	263409	263417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344448
6351	NC_022234	GTC	2	6	263429	263434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344448
6352	NC_022234	AGCC	2	8	263436	263443	25 %	0 %	25 %	50 %	538344448
6353	NC_022234	CAG	2	6	263471	263476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344448
6354	NC_022234	GTA	2	6	263480	263485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344448
6355	NC_022234	GC	4	8	263514	263521	0 %	0 %	50 %	50 %	538344448
6356	NC_022234	TGC	2	6	263544	263549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344448
6357	NC_022234	CAC	2	6	263552	263557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344448
6358	NC_022234	TCG	2	6	263562	263567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344448
6359	NC_022234	TGA	2	6	263599	263604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344448
6360	NC_022234	AC	3	6	263614	263619	50 %	0 %	0 %	50 %	538344448
6361	NC_022234	CGC	2	6	263628	263633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344448
6362	NC_022234	CCG	2	6	263656	263661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344448
6363	NC_022234	CCA	2	6	263665	263670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538344448
6364	NC_022234	TCG	2	6	263694	263699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344448
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6366	NC_022234	GC	4	8	263730	263737	0 %	0 %	50 %	50 %	538344448
6367	NC_022234	GCT	2	6	263749	263754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344448
6368	NC_022234	GCCC	2	8	263758	263765	0 %	0 %	25 %	75 %	538344448
6369	NC_022234	GCCC	2	8	263770	263777	0 %	0 %	25 %	75 %	538344448
6370	NC_022234	GCT	2	6	263836	263841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344448
6371	NC_022234	GCG	2	6	263954	263959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344448
6372	NC_022234	GCT	2	6	263962	263967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344448
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6380	NC_022234	GCC	2	6	264267	264272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344448
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6391	NC_022234	GCC	2	6	264563	264568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344448
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6400	NC_022234	CG	4	8	265041	265048	0 %	0 %	50 %	50 %	538344449
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6467	NC_022234	CTG	2	6	267351	267356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344451
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6475	NC_022234	GCC	2	6	267747	267752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344451
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6479	NC_022234	TCG	2	6	267808	267813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344451
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6482	NC_022234	CCTT	2	8	267934	267941	0 %	50 %	0 %	50 %	538344451
6483	NC_022234	TGGAAG	2	12	267949	267960	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	538344451
6484	NC_022234	GC	3	6	267992	267997	0 %	0 %	50 %	50 %	538344451
6485	NC_022234	CCTTGG	2	12	268061	268072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344451
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6487	NC_022234	CGGC	2	8	268118	268125	0 %	0 %	50 %	50 %	538344451
6488	NC_022234	CGT	2	6	268139	268144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538344451
6489	NC_022234	TGG	2	6	268193	268198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538344451
6490	NC_022234	CAGC	2	8	268208	268215	25 %	0 %	25 %	50 %	538344451
6491	NC_022234	GCG	2	6	268223	268228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538344451
6492	NC_022234	AGT	2	6	268280	268285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538344451
6493	NC_022234	GTCG	2	8	268320	268327	0 %	25 %	50 %	25 %	538344451
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6495	NC_022234	CGCC	2	8	268340	268347	0 %	0 %	25 %	75 %	538344451
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6499	NC_022234	CGC	2	6	268465	268470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538344451
6500	NC_022234	CGA	2	6	268520	268525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538344451

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