MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021848	AGCT	2	8	4505	4512	25 %	25 %	25 %	25 %	525957491
2	NC_021848	T	9	9	4525	4533	0 %	100 %	0 %	0 %	525957491
3	NC_021848	GAT	2	6	4622	4627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957491
4	NC_021848	ACC	2	6	4656	4661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957491
5	NC_021848	GCC	2	6	4703	4708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957491
6	NC_021848	TATG	2	8	4775	4782	25 %	50 %	25 %	0 %	525957491
7	NC_021848	CAT	2	6	4835	4840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
8	NC_021848	TCT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957491
9	NC_021848	AGC	2	6	4869	4874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957491
10	NC_021848	CTA	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
11	NC_021848	GGT	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957491
12	NC_021848	CT	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	525957491
13	NC_021848	CTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957491
14	NC_021848	AGTA	2	8	5081	5088	50 %	25 %	25 %	0 %	525957491
15	NC_021848	CTT	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957491
16	NC_021848	AGAGT	2	10	5188	5197	40 %	20 %	40 %	0 %	525957491
17	NC_021848	CAT	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957491
18	NC_021848	AGCA	2	8	5388	5395	50 %	0 %	25 %	25 %	525957491
19	NC_021848	GAA	2	6	5456	5461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957491
20	NC_021848	GCC	2	6	5543	5548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957491
21	NC_021848	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957491
22	NC_021848	GTT	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957491
23	NC_021848	AGAA	2	8	5675	5682	75 %	0 %	25 %	0 %	525957491
24	NC_021848	TGG	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957491
25	NC_021848	GCG	2	6	5760	5765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957491
26	NC_021848	ACA	2	6	6006	6011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
27	NC_021848	ATTG	2	8	6042	6049	25 %	50 %	25 %	0 %	525957492
28	NC_021848	TGG	2	6	6051	6056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
29	NC_021848	GAG	2	6	6104	6109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957492
30	NC_021848	CAA	2	6	6144	6149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
31	NC_021848	TTG	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
32	NC_021848	AGCC	2	8	6166	6173	25 %	0 %	25 %	50 %	525957492
33	NC_021848	ACC	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957492
34	NC_021848	CGC	2	6	6306	6311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957492
35	NC_021848	CCAA	2	8	6394	6401	50 %	0 %	0 %	50 %	525957492
36	NC_021848	TTTC	2	8	6452	6459	0 %	75 %	0 %	25 %	525957492
37	NC_021848	CT	3	6	6690	6695	0 %	50 %	0 %	50 %	525957492
38	NC_021848	AGA	2	6	6855	6860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
39	NC_021848	AGC	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957492
40	NC_021848	TGG	2	6	6912	6917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
41	NC_021848	TGT	2	6	6919	6924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
42	NC_021848	GTC	2	6	7010	7015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
43	NC_021848	TC	3	6	7014	7019	0 %	50 %	0 %	50 %	525957492
44	NC_021848	TCA	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
45	NC_021848	AGA	2	6	7119	7124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
46	NC_021848	CG	3	6	7149	7154	0 %	0 %	50 %	50 %	525957492
47	NC_021848	ATC	2	6	7180	7185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
48	NC_021848	AAGGTA	2	12	7337	7348	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525957492
49	NC_021848	GAAG	2	8	7368	7375	50 %	0 %	50 %	0 %	525957492
50	NC_021848	TTG	2	6	7388	7393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
51	NC_021848	CGT	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
52	NC_021848	CG	5	10	7469	7478	0 %	0 %	50 %	50 %	525957492
53	NC_021848	AGA	2	6	7539	7544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
54	NC_021848	ATT	2	6	7546	7551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957492
55	NC_021848	TGA	2	6	7587	7592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
56	NC_021848	CAA	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957492
57	NC_021848	GAT	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
58	NC_021848	TCTTTC	2	12	7687	7698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957492
59	NC_021848	TAA	2	6	7704	7709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957492
60	NC_021848	AGA	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
61	NC_021848	TTG	2	6	7882	7887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
62	NC_021848	AGA	3	9	7926	7934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
63	NC_021848	GTTA	2	8	7989	7996	25 %	50 %	25 %	0 %	525957492
64	NC_021848	GAA	2	6	8029	8034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
65	NC_021848	GATG	2	8	8082	8089	25 %	25 %	50 %	0 %	525957492
66	NC_021848	GTG	2	6	8098	8103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
67	NC_021848	TGA	2	6	8162	8167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
68	NC_021848	TTA	2	6	8195	8200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957492
69	NC_021848	TTG	2	6	8239	8244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957492
70	NC_021848	TAA	2	6	8307	8312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957492
71	NC_021848	ATC	2	6	8320	8325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
72	NC_021848	AGA	2	6	8373	8378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
73	NC_021848	TGG	2	6	8487	8492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
74	NC_021848	CCG	2	6	8516	8521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957492
75	NC_021848	GGT	2	6	8550	8555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957492
76	NC_021848	CG	3	6	8573	8578	0 %	0 %	50 %	50 %	525957492
77	NC_021848	AAG	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
78	NC_021848	CCA	2	6	8758	8763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957492
79	NC_021848	GAT	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
80	NC_021848	GAA	2	6	8893	8898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957492
81	NC_021848	GAG	2	6	8905	8910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957492
82	NC_021848	ATG	2	6	8927	8932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
83	NC_021848	GCT	2	6	8940	8945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957492
84	NC_021848	TGA	2	6	9018	9023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
85	NC_021848	ACT	2	6	9113	9118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957492
86	NC_021848	GAAA	2	8	9318	9325	75 %	0 %	25 %	0 %	525957492
87	NC_021848	GCA	2	6	9337	9342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957492
88	NC_021848	ATG	2	6	9359	9364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
89	NC_021848	GAT	2	6	9583	9588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957492
90	NC_021848	AG	3	6	9594	9599	50 %	0 %	50 %	0 %	525957492
91	NC_021848	GCTT	2	8	9830	9837	0 %	50 %	25 %	25 %	525957493
92	NC_021848	TCT	2	6	9911	9916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957493
93	NC_021848	CAAA	2	8	9982	9989	75 %	0 %	0 %	25 %	525957493
94	NC_021848	TGC	2	6	10036	10041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957493
95	NC_021848	GCC	2	6	10060	10065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957493
96	NC_021848	GTGA	2	8	10088	10095	25 %	25 %	50 %	0 %	525957493
97	NC_021848	AAG	2	6	10169	10174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957493
98	NC_021848	GTG	2	6	10251	10256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957493
99	NC_021848	TGA	2	6	10268	10273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957493
100	NC_021848	GCC	2	6	10285	10290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957493
101	NC_021848	CAA	2	6	10314	10319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957493
102	NC_021848	TGCGA	2	10	10441	10450	20 %	20 %	40 %	20 %	525957493
103	NC_021848	ACC	2	6	10543	10548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957493
104	NC_021848	GTT	2	6	10559	10564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957493
105	NC_021848	CTT	2	6	10572	10577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957493
106	NC_021848	TG	3	6	10598	10603	0 %	50 %	50 %	0 %	525957493
107	NC_021848	GAC	2	6	10606	10611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957493
108	NC_021848	GTC	2	6	10693	10698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957493
109	NC_021848	CAC	2	6	10788	10793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957493
110	NC_021848	GGT	2	6	10803	10808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957493
111	NC_021848	GGC	2	6	10837	10842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957493
112	NC_021848	GAA	2	6	10886	10891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957493
113	NC_021848	T	6	6	10945	10950	0 %	100 %	0 %	0 %	525957493
114	NC_021848	GCT	2	6	11029	11034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957493
115	NC_021848	AAC	2	6	11035	11040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957493
116	NC_021848	GAT	2	6	11065	11070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957493
117	NC_021848	ATC	2	6	11392	11397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959907
118	NC_021848	CTC	2	6	11411	11416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525959907
119	NC_021848	TCAA	2	8	11461	11468	50 %	25 %	0 %	25 %	525959907
120	NC_021848	ATG	2	6	11482	11487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959907
121	NC_021848	TTA	2	6	11492	11497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959907
122	NC_021848	GAT	2	6	11881	11886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957494
123	NC_021848	TGG	2	6	12073	12078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957494
124	NC_021848	GTG	2	6	12083	12088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957494
125	NC_021848	GAT	2	6	12095	12100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957494
126	NC_021848	GGC	2	6	12284	12289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957494
127	NC_021848	TGA	2	6	12304	12309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957494
128	NC_021848	GT	3	6	12355	12360	0 %	50 %	50 %	0 %	525957494
129	NC_021848	GCT	2	6	12392	12397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957494
130	NC_021848	A	6	6	12402	12407	100 %	0 %	0 %	0 %	525957494
131	NC_021848	CA	3	6	12500	12505	50 %	0 %	0 %	50 %	525957494
132	NC_021848	TGCAT	2	10	12526	12535	20 %	40 %	20 %	20 %	525957494
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495	NC_021848	GGT	2	6	32408	32413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959909
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498	NC_021848	GGC	2	6	32546	32551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959909
499	NC_021848	GCT	2	6	32573	32578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959909
500	NC_021848	ATA	2	6	32619	32624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959909

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