MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42002	NC_021848	ATC	2	6	2539774	2539779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960334
42003	NC_021848	CAACA	2	10	2539831	2539840	60 %	0 %	0 %	40 %	525960334
42004	NC_021848	TTG	2	6	2539846	2539851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960334
42005	NC_021848	TCA	2	6	2539916	2539921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960334
42006	NC_021848	CGC	2	6	2539927	2539932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525960334
42007	NC_021848	CGA	2	6	2539997	2540002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960334
42008	NC_021848	ACA	3	9	2540012	2540020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960334
42009	NC_021848	CCA	2	6	2540025	2540030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960334
42010	NC_021848	CTG	2	6	2540051	2540056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959310
42011	NC_021848	AGA	2	6	2540078	2540083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959310
42012	NC_021848	TGG	2	6	2540100	2540105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959310
42013	NC_021848	TAC	2	6	2540110	2540115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959310
42014	NC_021848	T	6	6	2540141	2540146	0 %	100 %	0 %	0 %	525959310
42015	NC_021848	TTCA	2	8	2540198	2540205	25 %	50 %	0 %	25 %	525959310
42016	NC_021848	ACG	2	6	2540236	2540241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959310
42017	NC_021848	CTAA	2	8	2540250	2540257	50 %	25 %	0 %	25 %	525959310
42018	NC_021848	CA	3	6	2540275	2540280	50 %	0 %	0 %	50 %	525959310
42019	NC_021848	CAC	2	6	2540315	2540320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959310
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42025	NC_021848	CGG	2	6	2540853	2540858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959311
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42043	NC_021848	CAAA	2	8	2542238	2542245	75 %	0 %	0 %	25 %	525959312
42044	NC_021848	CACT	2	8	2542267	2542274	25 %	25 %	0 %	50 %	525959312
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42052	NC_021848	TGA	2	6	2542516	2542521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959312
42053	NC_021848	TCA	2	6	2542543	2542548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959312
42054	NC_021848	CAA	2	6	2542657	2542662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959312
42055	NC_021848	TGG	2	6	2542667	2542672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959312
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42105	NC_021848	GTA	2	6	2546057	2546062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959315
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42234	NC_021848	AAT	2	6	2553931	2553936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959320
42235	NC_021848	TC	3	6	2553953	2553958	0 %	50 %	0 %	50 %	525959321
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42238	NC_021848	GCA	2	6	2554149	2554154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959321
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42244	NC_021848	GTA	2	6	2554448	2554453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959321
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42249	NC_021848	CGC	2	6	2554628	2554633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959321
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42252	NC_021848	CGA	2	6	2554739	2554744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959321
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42256	NC_021848	AGATC	2	10	2554837	2554846	40 %	20 %	20 %	20 %	525959321
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42264	NC_021848	TAC	2	6	2555288	2555293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959321
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42268	NC_021848	GTGCA	2	10	2555555	2555564	20 %	20 %	40 %	20 %	525959321
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42325	NC_021848	TG	3	6	2559053	2559058	0 %	50 %	50 %	0 %	525959323
42326	NC_021848	CAGT	2	8	2559101	2559108	25 %	25 %	25 %	25 %	525959323
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42328	NC_021848	TCTT	2	8	2559172	2559179	0 %	75 %	0 %	25 %	525959323
42329	NC_021848	TTC	2	6	2559843	2559848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959324
42330	NC_021848	TGC	2	6	2559925	2559930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959324
42331	NC_021848	CTG	2	6	2560017	2560022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959324
42332	NC_021848	T	6	6	2560056	2560061	0 %	100 %	0 %	0 %	525959324
42333	NC_021848	ACC	2	6	2560095	2560100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959324
42334	NC_021848	CTG	2	6	2560224	2560229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959324
42335	NC_021848	AAC	2	6	2560240	2560245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959324
42336	NC_021848	ATC	2	6	2560296	2560301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959324
42337	NC_021848	TTG	2	6	2560497	2560502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959324
42338	NC_021848	A	6	6	2560585	2560590	100 %	0 %	0 %	0 %	525959324
42339	NC_021848	TTG	2	6	2560600	2560605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959324
42340	NC_021848	CGA	2	6	2560663	2560668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959324
42341	NC_021848	A	6	6	2560724	2560729	100 %	0 %	0 %	0 %	525959324
42342	NC_021848	TGCACG	2	12	2560773	2560784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	525959324
42343	NC_021848	CCT	2	6	2560840	2560845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525959325
42344	NC_021848	CAC	2	6	2560865	2560870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959325
42345	NC_021848	GAT	2	6	2560893	2560898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959325
42346	NC_021848	GTA	2	6	2560986	2560991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959325
42347	NC_021848	GCA	3	9	2561020	2561028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959325
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42349	NC_021848	CGG	2	6	2561104	2561109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959325
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42451	NC_021848	GCA	2	6	2567951	2567956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959331
42452	NC_021848	TC	3	6	2567983	2567988	0 %	50 %	0 %	50 %	525959331
42453	NC_021848	ACA	2	6	2568037	2568042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959331
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42456	NC_021848	A	6	6	2568468	2568473	100 %	0 %	0 %	0 %	525959331
42457	NC_021848	TGG	2	6	2568539	2568544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959331
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42461	NC_021848	TGC	2	6	2568990	2568995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959332
42462	NC_021848	GAC	2	6	2569002	2569007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959332
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42464	NC_021848	ACC	2	6	2569037	2569042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959332
42465	NC_021848	CGC	2	6	2569061	2569066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959332
42466	NC_021848	GCA	2	6	2569132	2569137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959332
42467	NC_021848	TGGA	2	8	2569151	2569158	25 %	25 %	50 %	0 %	525959332
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42469	NC_021848	GCA	2	6	2569207	2569212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959332
42470	NC_021848	TCT	2	6	2569257	2569262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959332
42471	NC_021848	CT	3	6	2569275	2569280	0 %	50 %	0 %	50 %	525959332
42472	NC_021848	GTT	2	6	2569315	2569320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959332
42473	NC_021848	CAT	2	6	2569343	2569348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959332
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42475	NC_021848	TGACC	2	10	2569378	2569387	20 %	20 %	20 %	40 %	525959332
42476	NC_021848	CGC	2	6	2569421	2569426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959332
42477	NC_021848	TTC	2	6	2569436	2569441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959332
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42479	NC_021848	AATA	2	8	2569532	2569539	75 %	25 %	0 %	0 %	525959332
42480	NC_021848	ACC	2	6	2569562	2569567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959332
42481	NC_021848	A	6	6	2569580	2569585	100 %	0 %	0 %	0 %	525959332
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42483	NC_021848	TTGT	2	8	2569931	2569938	0 %	75 %	25 %	0 %	525959333
42484	NC_021848	CAC	2	6	2569942	2569947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959333
42485	NC_021848	GAG	2	6	2570024	2570029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525959333
42486	NC_021848	AGT	2	6	2570047	2570052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959333
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42488	NC_021848	CAA	2	6	2570165	2570170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959333
42489	NC_021848	GTG	3	9	2570177	2570185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959333
42490	NC_021848	CAA	2	6	2570303	2570308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959333
42491	NC_021848	CTG	2	6	2570319	2570324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959333
42492	NC_021848	GTCT	2	8	2570347	2570354	0 %	50 %	25 %	25 %	525959333
42493	NC_021848	AGA	2	6	2570362	2570367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959333
42494	NC_021848	CAT	2	6	2570379	2570384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959333
42495	NC_021848	CAC	2	6	2570462	2570467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959333
42496	NC_021848	TCTT	2	8	2570563	2570570	0 %	75 %	0 %	25 %	525959333
42497	NC_021848	TGGAAG	2	12	2570589	2570600	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525959333
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42499	NC_021848	A	6	6	2570753	2570758	100 %	0 %	0 %	0 %	525959333
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