MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_021848	TGC	2	6	2236784	2236789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959098
37002	NC_021848	GTT	2	6	2236820	2236825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959098
37003	NC_021848	CCA	2	6	2236888	2236893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959098
37004	NC_021848	TTGCA	2	10	2236898	2236907	20 %	40 %	20 %	20 %	525959098
37005	NC_021848	GTC	2	6	2236913	2236918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959098
37006	NC_021848	ATC	2	6	2236925	2236930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959098
37007	NC_021848	ACCA	2	8	2237036	2237043	50 %	0 %	0 %	50 %	525959098
37008	NC_021848	AAC	2	6	2237048	2237053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959098
37009	NC_021848	TTG	2	6	2237510	2237515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959099
37010	NC_021848	GCC	2	6	2237545	2237550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959099
37011	NC_021848	TCAT	2	8	2237624	2237631	25 %	50 %	0 %	25 %	525959099
37012	NC_021848	AGGA	2	8	2237660	2237667	50 %	0 %	50 %	0 %	525959099
37013	NC_021848	GTTG	2	8	2237757	2237764	0 %	50 %	50 %	0 %	525959099
37014	NC_021848	GAT	2	6	2237812	2237817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959099
37015	NC_021848	CCA	2	6	2237820	2237825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959099
37016	NC_021848	TTG	2	6	2237965	2237970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959099
37017	NC_021848	TGC	2	6	2238176	2238181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959099
37018	NC_021848	GTG	2	6	2238212	2238217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959099
37019	NC_021848	GGCTAT	2	12	2238253	2238264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525959099
37020	NC_021848	CAT	2	6	2238343	2238348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959099
37021	NC_021848	CT	3	6	2238511	2238516	0 %	50 %	0 %	50 %	525959100
37022	NC_021848	CCGA	2	8	2238532	2238539	25 %	0 %	25 %	50 %	525959100
37023	NC_021848	GGC	2	6	2238586	2238591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959100
37024	NC_021848	CAT	2	6	2238609	2238614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959100
37025	NC_021848	TCAT	2	8	2238620	2238627	25 %	50 %	0 %	25 %	525959100
37026	NC_021848	CAT	2	6	2238738	2238743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959100
37027	NC_021848	TGTT	2	8	2238803	2238810	0 %	75 %	25 %	0 %	525959100
37028	NC_021848	ACG	2	6	2238851	2238856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959100
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37030	NC_021848	GCA	2	6	2238875	2238880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959100
37031	NC_021848	ACC	2	6	2238923	2238928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959100
37032	NC_021848	CGC	2	6	2238976	2238981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959100
37033	NC_021848	CAT	2	6	2239038	2239043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959100
37034	NC_021848	AGA	2	6	2239059	2239064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959100
37035	NC_021848	T	6	6	2239107	2239112	0 %	100 %	0 %	0 %	525959100
37036	NC_021848	GTG	2	6	2239171	2239176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959100
37037	NC_021848	GC	3	6	2239188	2239193	0 %	0 %	50 %	50 %	525959100
37038	NC_021848	T	6	6	2239231	2239236	0 %	100 %	0 %	0 %	525959100
37039	NC_021848	CT	3	6	2239242	2239247	0 %	50 %	0 %	50 %	525959100
37040	NC_021848	TTC	2	6	2239285	2239290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959100
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37043	NC_021848	CAT	2	6	2239413	2239418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959100
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37047	NC_021848	GGC	2	6	2239768	2239773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959100
37048	NC_021848	CG	3	6	2239790	2239795	0 %	0 %	50 %	50 %	525959100
37049	NC_021848	ATTT	2	8	2239849	2239856	25 %	75 %	0 %	0 %	525959100
37050	NC_021848	ACG	2	6	2239862	2239867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959100
37051	NC_021848	ATC	2	6	2239903	2239908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959100
37052	NC_021848	CTG	2	6	2240260	2240265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959101
37053	NC_021848	T	6	6	2240302	2240307	0 %	100 %	0 %	0 %	525959101
37054	NC_021848	TGA	2	6	2240342	2240347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959101
37055	NC_021848	TATGGT	2	12	2240391	2240402	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525959101
37056	NC_021848	GCT	2	6	2240417	2240422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959101
37057	NC_021848	TACT	2	8	2240443	2240450	25 %	50 %	0 %	25 %	525959101
37058	NC_021848	CTA	2	6	2240454	2240459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959101
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37060	NC_021848	TGG	2	6	2240552	2240557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959101
37061	NC_021848	AG	3	6	2240626	2240631	50 %	0 %	50 %	0 %	525959101
37062	NC_021848	CCA	2	6	2240657	2240662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959101
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37064	NC_021848	TA	3	6	2240729	2240734	50 %	50 %	0 %	0 %	525959101
37065	NC_021848	A	7	7	2240808	2240814	100 %	0 %	0 %	0 %	525959101
37066	NC_021848	TCG	2	6	2240821	2240826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959101
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37070	NC_021848	TATT	2	8	2241078	2241085	25 %	75 %	0 %	0 %	525959102
37071	NC_021848	CAT	3	9	2241166	2241174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959102
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37085	NC_021848	TGG	2	6	2241910	2241915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959102
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37087	NC_021848	GGT	2	6	2241941	2241946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959102
37088	NC_021848	AGC	2	6	2241971	2241976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959102
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37091	NC_021848	TC	3	6	2242143	2242148	0 %	50 %	0 %	50 %	525959102
37092	NC_021848	TCG	2	6	2242150	2242155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959102
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37095	NC_021848	GC	3	6	2242212	2242217	0 %	0 %	50 %	50 %	525959102
37096	NC_021848	TTG	2	6	2242223	2242228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959102
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37101	NC_021848	CCAA	2	8	2242864	2242871	50 %	0 %	0 %	50 %	525959103
37102	NC_021848	CTT	2	6	2242888	2242893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959103
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37105	NC_021848	CAT	2	6	2243021	2243026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959103
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37109	NC_021848	CGTT	2	8	2243094	2243101	0 %	50 %	25 %	25 %	525959103
37110	NC_021848	TCA	2	6	2243327	2243332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959104
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37113	NC_021848	CTTT	2	8	2243492	2243499	0 %	75 %	0 %	25 %	525959104
37114	NC_021848	CCA	2	6	2243505	2243510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959104
37115	NC_021848	A	6	6	2243521	2243526	100 %	0 %	0 %	0 %	525959104
37116	NC_021848	GCA	2	6	2243592	2243597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959104
37117	NC_021848	CCG	2	6	2243616	2243621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959104
37118	NC_021848	TAA	2	6	2243623	2243628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959104
37119	NC_021848	ATC	2	6	2243629	2243634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959104
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37121	NC_021848	GCA	2	6	2243663	2243668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959104
37122	NC_021848	A	6	6	2243711	2243716	100 %	0 %	0 %	0 %	525959104
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37127	NC_021848	CATTA	2	10	2244001	2244010	40 %	40 %	0 %	20 %	525959104
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37132	NC_021848	ACC	2	6	2244172	2244177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959104
37133	NC_021848	CG	3	6	2244221	2244226	0 %	0 %	50 %	50 %	525959104
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37152	NC_021848	TGC	2	6	2245398	2245403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959105
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37228	NC_021848	T	8	8	2249980	2249987	0 %	100 %	0 %	0 %	525959109
37229	NC_021848	ATC	2	6	2250145	2250150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959110
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37231	NC_021848	CTT	2	6	2250204	2250209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959110
37232	NC_021848	TCG	2	6	2250274	2250279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959110
37233	NC_021848	TCAA	2	8	2250291	2250298	50 %	25 %	0 %	25 %	525959110
37234	NC_021848	GC	3	6	2250305	2250310	0 %	0 %	50 %	50 %	525959110
37235	NC_021848	CCG	2	6	2250334	2250339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959110
37236	NC_021848	AATCC	2	10	2250391	2250400	40 %	20 %	0 %	40 %	525959110
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37238	NC_021848	CAA	2	6	2250467	2250472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959110
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37256	NC_021848	ATCAA	2	10	2251475	2251484	60 %	20 %	0 %	20 %	525959111
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37301	NC_021848	CGT	2	6	2254567	2254572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959113
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37344	NC_021848	AGT	2	6	2256923	2256928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959115
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37349	NC_021848	GCC	2	6	2257054	2257059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959115
37350	NC_021848	CAC	2	6	2257115	2257120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959115
37351	NC_021848	ACC	2	6	2257128	2257133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959115
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37379	NC_021848	AT	3	6	2258711	2258716	50 %	50 %	0 %	0 %	525959116
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37453	NC_021848	CAG	2	6	2262389	2262394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960296
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37459	NC_021848	TGA	2	6	2262656	2262661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960296
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37461	NC_021848	TCAG	2	8	2262718	2262725	25 %	25 %	25 %	25 %	525960296
37462	NC_021848	TCACAG	2	12	2262758	2262769	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525960296
37463	NC_021848	CTT	2	6	2262795	2262800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960296
37464	NC_021848	TGC	2	6	2262823	2262828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960296
37465	NC_021848	AGT	2	6	2263012	2263017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960296
37466	NC_021848	CTT	2	6	2263037	2263042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960296
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37493	NC_021848	ACT	2	6	2264424	2264429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959118
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37495	NC_021848	AAGGT	2	10	2264528	2264537	40 %	20 %	40 %	0 %	525959118
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37498	NC_021848	T	6	6	2264652	2264657	0 %	100 %	0 %	0 %	525959119
37499	NC_021848	AAT	2	6	2264712	2264717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959119
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