MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021848	TGA	2	6	160940	160945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957612
2502	NC_021848	TTC	2	6	161031	161036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957612
2503	NC_021848	T	7	7	161064	161070	0 %	100 %	0 %	0 %	525957612
2504	NC_021848	TTTC	2	8	161072	161079	0 %	75 %	0 %	25 %	525957612
2505	NC_021848	ATG	2	6	161130	161135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957612
2506	NC_021848	T	6	6	161250	161255	0 %	100 %	0 %	0 %	525957612
2507	NC_021848	GAT	2	6	161285	161290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957612
2508	NC_021848	GAA	2	6	161786	161791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957613
2509	NC_021848	GTC	2	6	161814	161819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957613
2510	NC_021848	T	6	6	161855	161860	0 %	100 %	0 %	0 %	525957613
2511	NC_021848	GAAC	2	8	161881	161888	50 %	0 %	25 %	25 %	525957613
2512	NC_021848	TGA	2	6	161923	161928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957613
2513	NC_021848	GCA	2	6	161984	161989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957613
2514	NC_021848	TTG	2	6	162003	162008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957613
2515	NC_021848	ATTA	2	8	162446	162453	50 %	50 %	0 %	0 %	525957614
2516	NC_021848	CT	3	6	162541	162546	0 %	50 %	0 %	50 %	525957614
2517	NC_021848	CAA	2	6	162606	162611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957614
2518	NC_021848	TTA	2	6	162613	162618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957614
2519	NC_021848	GTA	2	6	162636	162641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957614
2520	NC_021848	TTG	2	6	162654	162659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957614
2521	NC_021848	GCG	2	6	162672	162677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957614
2522	NC_021848	AAT	2	6	162762	162767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957614
2523	NC_021848	CTT	2	6	162770	162775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957614
2524	NC_021848	GCA	2	6	162862	162867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957614
2525	NC_021848	CA	3	6	162882	162887	50 %	0 %	0 %	50 %	525957614
2526	NC_021848	CCA	2	6	162992	162997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957614
2527	NC_021848	CGC	2	6	163001	163006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957614
2528	NC_021848	TGG	2	6	163088	163093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957614
2529	NC_021848	ACA	2	6	163192	163197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957614
2530	NC_021848	G	6	6	163202	163207	0 %	0 %	100 %	0 %	525957614
2531	NC_021848	TCA	2	6	163222	163227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957614
2532	NC_021848	CGA	2	6	163258	163263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957614
2533	NC_021848	CAC	2	6	163277	163282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957614
2534	NC_021848	AAG	2	6	163300	163305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957614
2535	NC_021848	GGT	2	6	163319	163324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957614
2536	NC_021848	CAGC	2	8	163372	163379	25 %	0 %	25 %	50 %	525957614
2537	NC_021848	GC	3	6	163480	163485	0 %	0 %	50 %	50 %	525957614
2538	NC_021848	CAC	2	6	163547	163552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957614
2539	NC_021848	GCG	2	6	163669	163674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957614
2540	NC_021848	CGG	3	9	163684	163692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957614
2541	NC_021848	GGT	2	6	163715	163720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957614
2542	NC_021848	ATC	2	6	163740	163745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957614
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2544	NC_021848	CA	3	6	163788	163793	50 %	0 %	0 %	50 %	525957614
2545	NC_021848	GTA	2	6	163926	163931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957614
2546	NC_021848	TAT	2	6	164114	164119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957614
2547	NC_021848	AGC	2	6	164650	164655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957615
2548	NC_021848	ATTG	2	8	164669	164676	25 %	50 %	25 %	0 %	525957615
2549	NC_021848	AAGC	2	8	164697	164704	50 %	0 %	25 %	25 %	525957615
2550	NC_021848	CTG	2	6	164712	164717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957615
2551	NC_021848	GT	3	6	164739	164744	0 %	50 %	50 %	0 %	525957615
2552	NC_021848	AAG	2	6	164797	164802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957615
2553	NC_021848	GAA	2	6	164946	164951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957615
2554	NC_021848	GAA	2	6	165114	165119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957615
2555	NC_021848	GAAAA	2	10	165189	165198	80 %	0 %	20 %	0 %	525957615
2556	NC_021848	AAC	2	6	165261	165266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957616
2557	NC_021848	ATGG	2	8	165278	165285	25 %	25 %	50 %	0 %	525957616
2558	NC_021848	AG	3	6	165331	165336	50 %	0 %	50 %	0 %	525957616
2559	NC_021848	GTGAT	2	10	165369	165378	20 %	40 %	40 %	0 %	525957616
2560	NC_021848	GCGAG	2	10	165379	165388	20 %	0 %	60 %	20 %	525957616
2561	NC_021848	AGCGT	2	10	165422	165431	20 %	20 %	40 %	20 %	525957616
2562	NC_021848	AGA	2	6	165439	165444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957616
2563	NC_021848	CGAT	2	8	165462	165469	25 %	25 %	25 %	25 %	525957616
2564	NC_021848	TGC	2	6	165586	165591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957616
2565	NC_021848	TG	3	6	165593	165598	0 %	50 %	50 %	0 %	525957616
2566	NC_021848	GCA	2	6	165622	165627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957616
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2568	NC_021848	CCGTT	2	10	165684	165693	0 %	40 %	20 %	40 %	525957616
2569	NC_021848	GCAG	2	8	165695	165702	25 %	0 %	50 %	25 %	525957616
2570	NC_021848	ATGCT	2	10	165786	165795	20 %	40 %	20 %	20 %	525957616
2571	NC_021848	TGAA	2	8	165868	165875	50 %	25 %	25 %	0 %	525957616
2572	NC_021848	A	6	6	165874	165879	100 %	0 %	0 %	0 %	525957616
2573	NC_021848	ATG	2	6	165910	165915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959924
2574	NC_021848	CGG	2	6	165944	165949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959924
2575	NC_021848	GCGAG	2	10	165971	165980	20 %	0 %	60 %	20 %	525959924
2576	NC_021848	AC	3	6	166057	166062	50 %	0 %	0 %	50 %	525959924
2577	NC_021848	TTTA	2	8	166088	166095	25 %	75 %	0 %	0 %	525959924
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2579	NC_021848	CGA	2	6	166224	166229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959924
2580	NC_021848	TGA	2	6	166457	166462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959924
2581	NC_021848	CTG	2	6	166487	166492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959924
2582	NC_021848	CAAA	2	8	166661	166668	75 %	0 %	0 %	25 %	525959924
2583	NC_021848	CATT	2	8	166675	166682	25 %	50 %	0 %	25 %	525959924
2584	NC_021848	GCGCA	2	10	166780	166789	20 %	0 %	40 %	40 %	525959924
2585	NC_021848	AAT	2	6	166829	166834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959924
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2588	NC_021848	GCT	2	6	166927	166932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959925
2589	NC_021848	A	6	6	166939	166944	100 %	0 %	0 %	0 %	525959925
2590	NC_021848	TAA	2	6	166979	166984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959925
2591	NC_021848	A	7	7	167011	167017	100 %	0 %	0 %	0 %	525959925
2592	NC_021848	TGGT	2	8	167125	167132	0 %	50 %	50 %	0 %	525959925
2593	NC_021848	CTC	2	6	167146	167151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525959925
2594	NC_021848	TGG	2	6	167159	167164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959925
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2597	NC_021848	GC	3	6	167720	167725	0 %	0 %	50 %	50 %	525957617
2598	NC_021848	GTT	2	6	167731	167736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957617
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2602	NC_021848	ATC	2	6	168013	168018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957617
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2604	NC_021848	GAA	3	9	168081	168089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957617
2605	NC_021848	GGTTG	2	10	168196	168205	0 %	40 %	60 %	0 %	525957617
2606	NC_021848	ATC	2	6	168336	168341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957617
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2611	NC_021848	TG	3	6	168692	168697	0 %	50 %	50 %	0 %	525957617
2612	NC_021848	AGT	2	6	168777	168782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957617
2613	NC_021848	TTC	2	6	168790	168795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957617
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2620	NC_021848	AGAA	2	8	169133	169140	75 %	0 %	25 %	0 %	525957617
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2864	NC_021848	TGA	2	6	183073	183078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957627
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2979	NC_021848	AACC	2	8	189743	189750	50 %	0 %	0 %	50 %	525957635
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2984	NC_021848	CTG	2	6	190019	190024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957635
2985	NC_021848	TTC	2	6	191318	191323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957636
2986	NC_021848	GTC	2	6	191362	191367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957636
2987	NC_021848	AGCTG	2	10	191418	191427	20 %	20 %	40 %	20 %	525957636
2988	NC_021848	TGA	2	6	191514	191519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957636
2989	NC_021848	GCG	2	6	191573	191578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957636
2990	NC_021848	CTT	2	6	191580	191585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957636
2991	NC_021848	C	6	6	192017	192022	0 %	0 %	0 %	100 %	525957636
2992	NC_021848	TGA	3	9	192036	192044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957636
2993	NC_021848	CTA	2	6	192108	192113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957636
2994	NC_021848	AAT	2	6	192171	192176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957636
2995	NC_021848	T	6	6	192295	192300	0 %	100 %	0 %	0 %	525957636
2996	NC_021848	TTTTGA	2	12	192316	192327	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525957636
2997	NC_021848	AAT	2	6	192364	192369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957636
2998	NC_021848	TGAA	2	8	192446	192453	50 %	25 %	25 %	0 %	525957636
2999	NC_021848	TTC	2	6	192577	192582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957636
3000	NC_021848	CAC	2	6	192603	192608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957636

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