MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22117	NC_021848	CGC	2	6	1344217	1344222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958462
22118	NC_021848	TTC	2	6	1344224	1344229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958462
22119	NC_021848	GCC	2	6	1344239	1344244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958462
22120	NC_021848	ACG	2	6	1344260	1344265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958462
22121	NC_021848	CGAT	2	8	1344273	1344280	25 %	25 %	25 %	25 %	525958462
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22123	NC_021848	ATT	2	6	1344378	1344383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958462
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22126	NC_021848	ATG	2	6	1344557	1344562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958463
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22225	NC_021848	ACT	2	6	1350826	1350831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958466
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22228	NC_021848	CG	3	6	1351023	1351028	0 %	0 %	50 %	50 %	525958466
22229	NC_021848	GGAGA	2	10	1351134	1351143	40 %	0 %	60 %	0 %	525958466
22230	NC_021848	AGA	2	6	1351166	1351171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958466
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22233	NC_021848	CTG	2	6	1351369	1351374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960161
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22347	NC_021848	A	6	6	1357832	1357837	100 %	0 %	0 %	0 %	525958470
22348	NC_021848	CTG	2	6	1357842	1357847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958470
22349	NC_021848	GCT	2	6	1357954	1357959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958470
22350	NC_021848	AAG	2	6	1357992	1357997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958470
22351	NC_021848	TTC	2	6	1358021	1358026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958470
22352	NC_021848	CGC	2	6	1358060	1358065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958470
22353	NC_021848	TCAGCA	2	12	1358140	1358151	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525958470
22354	NC_021848	CGC	2	6	1358161	1358166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958470
22355	NC_021848	GAC	2	6	1358180	1358185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958470
22356	NC_021848	CACTA	2	10	1358260	1358269	40 %	20 %	0 %	40 %	525958470
22357	NC_021848	GGCGC	2	10	1358280	1358289	0 %	0 %	60 %	40 %	525958470
22358	NC_021848	GGTC	2	8	1358325	1358332	0 %	25 %	50 %	25 %	525958470
22359	NC_021848	CGT	2	6	1358363	1358368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958470
22360	NC_021848	CTT	2	6	1358410	1358415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958470
22361	NC_021848	A	7	7	1358427	1358433	100 %	0 %	0 %	0 %	525958470
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22363	NC_021848	GTC	2	6	1358502	1358507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958470
22364	NC_021848	CTG	2	6	1358546	1358551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958470
22365	NC_021848	CAA	2	6	1358575	1358580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958470
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22367	NC_021848	CAC	2	6	1358650	1358655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958470
22368	NC_021848	TGAAGG	2	12	1358659	1358670	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525958470
22369	NC_021848	GT	3	6	1358755	1358760	0 %	50 %	50 %	0 %	525958470
22370	NC_021848	GAC	2	6	1358771	1358776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958470
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22375	NC_021848	CGT	3	9	1359029	1359037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958470
22376	NC_021848	AAC	2	6	1359045	1359050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958470
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22381	NC_021848	CT	3	6	1359355	1359360	0 %	50 %	0 %	50 %	525958470
22382	NC_021848	CTG	2	6	1359389	1359394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958470
22383	NC_021848	TGG	2	6	1359449	1359454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958470
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22404	NC_021848	A	6	6	1360746	1360751	100 %	0 %	0 %	0 %	525960164
22405	NC_021848	GCA	2	6	1360761	1360766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960164
22406	NC_021848	A	6	6	1361357	1361362	100 %	0 %	0 %	0 %	525958471
22407	NC_021848	CTGA	2	8	1361380	1361387	25 %	25 %	25 %	25 %	525958471
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22409	NC_021848	GACA	2	8	1361535	1361542	50 %	0 %	25 %	25 %	525958471
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22411	NC_021848	TGC	2	6	1361691	1361696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958471
22412	NC_021848	AATC	2	8	1361736	1361743	50 %	25 %	0 %	25 %	525958471
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22414	NC_021848	TTGG	2	8	1361825	1361832	0 %	50 %	50 %	0 %	525958471
22415	NC_021848	ATGAAC	2	12	1361966	1361977	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525958471
22416	NC_021848	TGA	2	6	1362014	1362019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958471
22417	NC_021848	CT	3	6	1362037	1362042	0 %	50 %	0 %	50 %	525958471
22418	NC_021848	GTC	3	9	1362073	1362081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958471
22419	NC_021848	GCA	2	6	1362103	1362108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958471
22420	NC_021848	ACT	2	6	1362110	1362115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958471
22421	NC_021848	TCG	2	6	1362118	1362123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958471
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22423	NC_021848	TGG	2	6	1362345	1362350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958471
22424	NC_021848	TCT	2	6	1362374	1362379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958471
22425	NC_021848	GAT	2	6	1362403	1362408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958471
22426	NC_021848	GGCT	2	8	1362436	1362443	0 %	25 %	50 %	25 %	525958471
22427	NC_021848	TTG	2	6	1362482	1362487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958471
22428	NC_021848	ATC	2	6	1362562	1362567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958471
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22430	NC_021848	GCTTA	2	10	1362623	1362632	20 %	40 %	20 %	20 %	525958471
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22433	NC_021848	CAT	3	9	1362992	1363000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958472
22434	NC_021848	GTT	2	6	1363008	1363013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958472
22435	NC_021848	GTT	2	6	1363017	1363022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958472
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22440	NC_021848	CAA	2	6	1363337	1363342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958472
22441	NC_021848	CATC	2	8	1363352	1363359	25 %	25 %	0 %	50 %	525958472
22442	NC_021848	TAC	2	6	1363380	1363385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958472
22443	NC_021848	GTT	2	6	1363848	1363853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958473
22444	NC_021848	AAAC	2	8	1363867	1363874	75 %	0 %	0 %	25 %	525958473
22445	NC_021848	GTT	2	6	1363889	1363894	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958473
22446	NC_021848	T	6	6	1364031	1364036	0 %	100 %	0 %	0 %	525958473
22447	NC_021848	GC	3	6	1364064	1364069	0 %	0 %	50 %	50 %	525958473
22448	NC_021848	ACGA	2	8	1364073	1364080	50 %	0 %	25 %	25 %	525958473
22449	NC_021848	ATC	2	6	1364160	1364165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958473
22450	NC_021848	ATT	2	6	1364232	1364237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958473
22451	NC_021848	TTC	2	6	1364254	1364259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958473
22452	NC_021848	TGC	2	6	1364338	1364343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958473
22453	NC_021848	CAA	2	6	1364370	1364375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958473
22454	NC_021848	GC	3	6	1364436	1364441	0 %	0 %	50 %	50 %	525958473
22455	NC_021848	TCT	2	6	1364480	1364485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958473
22456	NC_021848	GGC	2	6	1364492	1364497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958473
22457	NC_021848	TGA	2	6	1364569	1364574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958473
22458	NC_021848	AAC	2	6	1364662	1364667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958473
22459	NC_021848	TGG	2	6	1364678	1364683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958473
22460	NC_021848	CCA	2	6	1364757	1364762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958473
22461	NC_021848	ACA	2	6	1364995	1365000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958473
22462	NC_021848	CAA	2	6	1365022	1365027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958473
22463	NC_021848	AGC	2	6	1365044	1365049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958473
22464	NC_021848	ACG	2	6	1365067	1365072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958473
22465	NC_021848	AGC	2	6	1365145	1365150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958473
22466	NC_021848	GAT	2	6	1365201	1365206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958473
22467	NC_021848	CCG	2	6	1365214	1365219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958473
22468	NC_021848	CGAAC	2	10	1365228	1365237	40 %	0 %	20 %	40 %	525958473
22469	NC_021848	AC	3	6	1365261	1365266	50 %	0 %	0 %	50 %	525958473
22470	NC_021848	TGA	2	6	1365323	1365328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958473
22471	NC_021848	ATC	2	6	1365330	1365335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958473
22472	NC_021848	CGAG	2	8	1365359	1365366	25 %	0 %	50 %	25 %	525958473
22473	NC_021848	CAT	2	6	1365372	1365377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958473
22474	NC_021848	GGA	2	6	1365443	1365448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525958473
22475	NC_021848	AAAC	2	8	1365459	1365466	75 %	0 %	0 %	25 %	525958474
22476	NC_021848	GTT	2	6	1365482	1365487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958474
22477	NC_021848	GCGAGT	2	12	1365555	1365566	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525958474
22478	NC_021848	TGA	2	6	1365593	1365598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958474
22479	NC_021848	ACT	2	6	1365616	1365621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958474
22480	NC_021848	ATTG	2	8	1365632	1365639	25 %	50 %	25 %	0 %	525958474
22481	NC_021848	TGG	2	6	1365715	1365720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958474
22482	NC_021848	GCAA	2	8	1365745	1365752	50 %	0 %	25 %	25 %	525958474
22483	NC_021848	CTG	2	6	1365802	1365807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958474
22484	NC_021848	CAG	2	6	1365849	1365854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958474
22485	NC_021848	GTT	2	6	1365863	1365868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958474
22486	NC_021848	TGA	2	6	1365895	1365900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958474
22487	NC_021848	TTC	2	6	1365924	1365929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958474
22488	NC_021848	GTT	2	6	1365951	1365956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958474
22489	NC_021848	AAC	2	6	1366000	1366005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958474
22490	NC_021848	AATC	2	8	1366069	1366076	50 %	25 %	0 %	25 %	525958474
22491	NC_021848	CAA	2	6	1366104	1366109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958474
22492	NC_021848	AACA	2	8	1366122	1366129	75 %	0 %	0 %	25 %	525958474
22493	NC_021848	CTG	2	6	1366144	1366149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958474
22494	NC_021848	A	6	6	1366167	1366172	100 %	0 %	0 %	0 %	525958474
22495	NC_021848	CTG	2	6	1366194	1366199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958474
22496	NC_021848	TGGC	2	8	1366219	1366226	0 %	25 %	50 %	25 %	525958474
22497	NC_021848	TCA	2	6	1366303	1366308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958474
22498	NC_021848	CAA	2	6	1366350	1366355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958474
22499	NC_021848	ACA	2	6	1366367	1366372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958474
22500	NC_021848	TTGA	2	8	1366404	1366411	25 %	50 %	25 %	0 %	525958474

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