MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_021848	CAATC	2	10	1189161	1189170	40 %	20 %	0 %	40 %	525960131
19503	NC_021848	TCG	2	6	1189199	1189204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960131
19504	NC_021848	ACC	2	6	1189207	1189212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960131
19505	NC_021848	AGA	2	6	1189239	1189244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960131
19506	NC_021848	ACC	2	6	1189294	1189299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960131
19507	NC_021848	GAC	2	6	1189384	1189389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960131
19508	NC_021848	ATT	2	6	1189411	1189416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525960131
19509	NC_021848	CAATC	2	10	1189527	1189536	40 %	20 %	0 %	40 %	525960131
19510	NC_021848	ACC	2	6	1189573	1189578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960131
19511	NC_021848	AGA	2	6	1189605	1189610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960131
19512	NC_021848	ACC	2	6	1189660	1189665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960131
19513	NC_021848	CGCT	2	8	1189718	1189725	0 %	25 %	25 %	50 %	525960131
19514	NC_021848	TGA	2	6	1189749	1189754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19515	NC_021848	GAT	2	6	1189825	1189830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19516	NC_021848	GAC	2	6	1189888	1189893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960131
19517	NC_021848	CAT	2	6	1189944	1189949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960131
19518	NC_021848	ATG	2	6	1189955	1189960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19519	NC_021848	CCA	2	6	1189972	1189977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960131
19520	NC_021848	TCA	2	6	1189991	1189996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960131
19521	NC_021848	AAG	2	6	1190012	1190017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960131
19522	NC_021848	AAC	2	6	1190069	1190074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960131
19523	NC_021848	GAT	2	6	1190092	1190097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19524	NC_021848	ATG	2	6	1190111	1190116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19525	NC_021848	GTT	2	6	1190134	1190139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960131
19526	NC_021848	TAT	2	6	1190164	1190169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525960131
19527	NC_021848	TGA	2	6	1190250	1190255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19528	NC_021848	CTT	2	6	1190256	1190261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960131
19529	NC_021848	CTT	2	6	1190290	1190295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960131
19530	NC_021848	CTC	2	6	1190333	1190338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525960131
19531	NC_021848	ATC	2	6	1190392	1190397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960131
19532	NC_021848	CAA	2	6	1190437	1190442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960131
19533	NC_021848	GTT	3	9	1190452	1190460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960131
19534	NC_021848	TGA	2	6	1190484	1190489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19535	NC_021848	AT	3	6	1190505	1190510	50 %	50 %	0 %	0 %	525960131
19536	NC_021848	GTTAGA	2	12	1190514	1190525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19537	NC_021848	CAA	2	6	1190583	1190588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960131
19538	NC_021848	TGG	2	6	1190589	1190594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960131
19539	NC_021848	TTG	2	6	1190633	1190638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960131
19540	NC_021848	CAG	2	6	1190644	1190649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960131
19541	NC_021848	ATTA	2	8	1190665	1190672	50 %	50 %	0 %	0 %	525960131
19542	NC_021848	TGA	2	6	1190724	1190729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19543	NC_021848	TAA	2	6	1190763	1190768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525960131
19544	NC_021848	TCA	2	6	1190963	1190968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960131
19545	NC_021848	TGGT	2	8	1190993	1191000	0 %	50 %	50 %	0 %	525960131
19546	NC_021848	ATC	2	6	1191019	1191024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960131
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19548	NC_021848	TGA	2	6	1191063	1191068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19549	NC_021848	TGA	2	6	1191156	1191161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19550	NC_021848	TGA	2	6	1191192	1191197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19551	NC_021848	GAT	2	6	1191229	1191234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960131
19552	NC_021848	TAA	2	6	1191282	1191287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525960131
19553	NC_021848	GA	3	6	1191372	1191377	50 %	0 %	50 %	0 %	525960131
19554	NC_021848	CAA	2	6	1191528	1191533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960132
19555	NC_021848	T	6	6	1191576	1191581	0 %	100 %	0 %	0 %	525960132
19556	NC_021848	CCA	2	6	1191632	1191637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960132
19557	NC_021848	GCTTT	2	10	1191704	1191713	0 %	60 %	20 %	20 %	525960132
19558	NC_021848	GC	3	6	1191812	1191817	0 %	0 %	50 %	50 %	525960132
19559	NC_021848	GCTG	2	8	1191872	1191879	0 %	25 %	50 %	25 %	525960132
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19565	NC_021848	CTT	2	6	1192140	1192145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960132
19566	NC_021848	GCTT	2	8	1192220	1192227	0 %	50 %	25 %	25 %	525960132
19567	NC_021848	CTGCGC	2	12	1192236	1192247	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525960132
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19569	NC_021848	GCG	2	6	1192316	1192321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525960132
19570	NC_021848	GAA	2	6	1192368	1192373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960132
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19573	NC_021848	TGC	2	6	1192471	1192476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960132
19574	NC_021848	CGT	2	6	1192494	1192499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960132
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19576	NC_021848	ATAG	2	8	1192615	1192622	50 %	25 %	25 %	0 %	525960132
19577	NC_021848	TCATT	2	10	1192629	1192638	20 %	60 %	0 %	20 %	525960132
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19581	NC_021848	GCG	2	6	1192946	1192951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958354
19582	NC_021848	CTG	2	6	1193003	1193008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958354
19583	NC_021848	TGGTT	2	10	1193016	1193025	0 %	60 %	40 %	0 %	525958354
19584	NC_021848	ATC	2	6	1193150	1193155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958354
19585	NC_021848	TTGC	2	8	1193172	1193179	0 %	50 %	25 %	25 %	525958354
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19587	NC_021848	CAA	2	6	1193214	1193219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958354
19588	NC_021848	TCA	2	6	1193324	1193329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958354
19589	NC_021848	CAT	2	6	1193457	1193462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958354
19590	NC_021848	TG	3	6	1193468	1193473	0 %	50 %	50 %	0 %	525958354
19591	NC_021848	AG	3	6	1193540	1193545	50 %	0 %	50 %	0 %	525958354
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19595	NC_021848	T	6	6	1193658	1193663	0 %	100 %	0 %	0 %	525958354
19596	NC_021848	TCA	2	6	1193711	1193716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958354
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19598	NC_021848	CG	3	6	1193738	1193743	0 %	0 %	50 %	50 %	525958354
19599	NC_021848	ATG	2	6	1193813	1193818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958354
19600	NC_021848	AACA	2	8	1193839	1193846	75 %	0 %	0 %	25 %	525958354
19601	NC_021848	GAT	2	6	1193857	1193862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958354
19602	NC_021848	CTTGAG	2	12	1194003	1194014	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525958354
19603	NC_021848	ATAC	2	8	1194064	1194071	50 %	25 %	0 %	25 %	525958354
19604	NC_021848	AAG	2	6	1194127	1194132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958354
19605	NC_021848	GAA	2	6	1194135	1194140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958354
19606	NC_021848	TTTC	2	8	1194210	1194217	0 %	75 %	0 %	25 %	525958354
19607	NC_021848	GA	3	6	1194326	1194331	50 %	0 %	50 %	0 %	525960133
19608	NC_021848	GAA	2	6	1194418	1194423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960133
19609	NC_021848	AAG	2	6	1194498	1194503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960133
19610	NC_021848	GA	3	6	1194537	1194542	50 %	0 %	50 %	0 %	525960133
19611	NC_021848	TTG	2	6	1194624	1194629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960134
19612	NC_021848	T	6	6	1194646	1194651	0 %	100 %	0 %	0 %	525960134
19613	NC_021848	CTG	2	6	1194729	1194734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960134
19614	NC_021848	TCT	3	9	1194809	1194817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960134
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19616	NC_021848	GTAG	2	8	1194864	1194871	25 %	25 %	50 %	0 %	525960134
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19849	NC_021848	TAACGC	2	12	1210080	1210091	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525958366
19850	NC_021848	A	6	6	1210131	1210136	100 %	0 %	0 %	0 %	525958366
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19962	NC_021848	GC	3	6	1216226	1216231	0 %	0 %	50 %	50 %	525960138
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19965	NC_021848	CAGC	2	8	1216380	1216387	25 %	0 %	25 %	50 %	525958369
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19967	NC_021848	TGA	2	6	1216552	1216557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958369
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19991	NC_021848	TTTA	2	8	1218198	1218205	25 %	75 %	0 %	0 %	525958369
19992	NC_021848	TGC	2	6	1218484	1218489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958370
19993	NC_021848	CTTT	2	8	1218622	1218629	0 %	75 %	0 %	25 %	525958370
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19995	NC_021848	ATT	2	6	1218671	1218676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958370
19996	NC_021848	GGAA	2	8	1218690	1218697	50 %	0 %	50 %	0 %	525958370
19997	NC_021848	TAG	2	6	1219074	1219079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958370
19998	NC_021848	CA	3	6	1219110	1219115	50 %	0 %	0 %	50 %	525958370
19999	NC_021848	CA	3	6	1219402	1219407	50 %	0 %	0 %	50 %	525958371
20000	NC_021848	ACGACA	2	12	1219439	1219450	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525958371

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