MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021848	GAA	2	6	91920	91925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957559
1502	NC_021848	CTG	2	6	92030	92035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957559
1503	NC_021848	CGC	2	6	92070	92075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957559
1504	NC_021848	CAT	2	6	92076	92081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957559
1505	NC_021848	TGG	2	6	92145	92150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957559
1506	NC_021848	AGT	2	6	92163	92168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957559
1507	NC_021848	GAACTT	2	12	92532	92543	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525957560
1508	NC_021848	GCC	2	6	92552	92557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957560
1509	NC_021848	CAT	2	6	92559	92564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957560
1510	NC_021848	CAT	2	6	92583	92588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957560
1511	NC_021848	TTGG	2	8	92642	92649	0 %	50 %	50 %	0 %	525957560
1512	NC_021848	TAA	2	6	92658	92663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957560
1513	NC_021848	GA	3	6	92739	92744	50 %	0 %	50 %	0 %	525957560
1514	NC_021848	TCT	2	6	92846	92851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957560
1515	NC_021848	ATAG	2	8	92920	92927	50 %	25 %	25 %	0 %	525957560
1516	NC_021848	TGT	2	6	92975	92980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957560
1517	NC_021848	GGT	2	6	93118	93123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957560
1518	NC_021848	GAT	2	6	93178	93183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957560
1519	NC_021848	CAC	2	6	93193	93198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957560
1520	NC_021848	GAT	2	6	93259	93264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957560
1521	NC_021848	TAG	2	6	93342	93347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957560
1522	NC_021848	CGT	2	6	93409	93414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957560
1523	NC_021848	CAG	2	6	93457	93462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957560
1524	NC_021848	TGG	2	6	93480	93485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957560
1525	NC_021848	ATTT	2	8	93501	93508	25 %	75 %	0 %	0 %	525957560
1526	NC_021848	ATA	2	6	93512	93517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957560
1527	NC_021848	ACA	2	6	93533	93538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957560
1528	NC_021848	AGC	2	6	93593	93598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957560
1529	NC_021848	ATG	2	6	93980	93985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957561
1530	NC_021848	CT	3	6	94030	94035	0 %	50 %	0 %	50 %	525957561
1531	NC_021848	AAG	2	6	94097	94102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957561
1532	NC_021848	GGT	2	6	94143	94148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957561
1533	NC_021848	GCAG	2	8	94156	94163	25 %	0 %	50 %	25 %	525957561
1534	NC_021848	GTT	2	6	94176	94181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957561
1535	NC_021848	AAT	2	6	94222	94227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957561
1536	NC_021848	CTCAG	2	10	94228	94237	20 %	20 %	20 %	40 %	525957561
1537	NC_021848	TGC	2	6	94247	94252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957561
1538	NC_021848	TGA	2	6	94295	94300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957561
1539	NC_021848	CAG	2	6	94318	94323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957561
1540	NC_021848	GATT	2	8	94373	94380	25 %	50 %	25 %	0 %	525957561
1541	NC_021848	ATT	2	6	94420	94425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957561
1542	NC_021848	GGA	2	6	94438	94443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957561
1543	NC_021848	AGA	2	6	94506	94511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957561
1544	NC_021848	GCA	2	6	94513	94518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957561
1545	NC_021848	GCTA	2	8	94536	94543	25 %	25 %	25 %	25 %	525957561
1546	NC_021848	A	9	9	95360	95368	100 %	0 %	0 %	0 %	525959915
1547	NC_021848	AAT	2	6	95376	95381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959915
1548	NC_021848	TCG	2	6	95441	95446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959915
1549	NC_021848	TGG	2	6	95454	95459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959915
1550	NC_021848	GTT	2	6	95502	95507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959915
1551	NC_021848	ACA	2	6	95525	95530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959915
1552	NC_021848	CAAG	2	8	95568	95575	50 %	0 %	25 %	25 %	525959915
1553	NC_021848	AAG	2	6	95611	95616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959915
1554	NC_021848	TC	3	6	95650	95655	0 %	50 %	0 %	50 %	525959915
1555	NC_021848	CTG	2	6	95669	95674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959915
1556	NC_021848	CAA	2	6	95679	95684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959915
1557	NC_021848	TCA	2	6	95733	95738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959915
1558	NC_021848	T	7	7	95751	95757	0 %	100 %	0 %	0 %	525959915
1559	NC_021848	CTTG	2	8	95803	95810	0 %	50 %	25 %	25 %	525959915
1560	NC_021848	AAC	2	6	95813	95818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959915
1561	NC_021848	GAA	2	6	95884	95889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959915
1562	NC_021848	CA	3	6	95897	95902	50 %	0 %	0 %	50 %	525959915
1563	NC_021848	TAAG	2	8	96049	96056	50 %	25 %	25 %	0 %	525959916
1564	NC_021848	ATT	2	6	96101	96106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959916
1565	NC_021848	TCA	2	6	96118	96123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959916
1566	NC_021848	CTT	2	6	96201	96206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959916
1567	NC_021848	ACC	2	6	96326	96331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959916
1568	NC_021848	ATC	2	6	96522	96527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959916
1569	NC_021848	CGG	2	6	96564	96569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959916
1570	NC_021848	TGT	2	6	96652	96657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959916
1571	NC_021848	ACA	2	6	96688	96693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959916
1572	NC_021848	CGTT	2	8	96745	96752	0 %	50 %	25 %	25 %	525959916
1573	NC_021848	GCG	2	6	96834	96839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959916
1574	NC_021848	TCA	2	6	96898	96903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959916
1575	NC_021848	ACA	2	6	96912	96917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959916
1576	NC_021848	ATC	2	6	96924	96929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959916
1577	NC_021848	CGACA	2	10	97040	97049	40 %	0 %	20 %	40 %	525959916
1578	NC_021848	CA	3	6	97048	97053	50 %	0 %	0 %	50 %	525959916
1579	NC_021848	TGC	2	6	97085	97090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959916
1580	NC_021848	GAT	2	6	97145	97150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959916
1581	NC_021848	A	6	6	97172	97177	100 %	0 %	0 %	0 %	525959916
1582	NC_021848	ACC	2	6	97200	97205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959916
1583	NC_021848	A	6	6	97220	97225	100 %	0 %	0 %	0 %	525959916
1584	NC_021848	TGC	2	6	97442	97447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959916
1585	NC_021848	CAA	2	6	97495	97500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959916
1586	NC_021848	CAG	2	6	97520	97525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959916
1587	NC_021848	T	6	6	97534	97539	0 %	100 %	0 %	0 %	525959916
1588	NC_021848	TAC	2	6	97657	97662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959917
1589	NC_021848	CAA	2	6	97696	97701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959917
1590	NC_021848	ATGG	2	8	97752	97759	25 %	25 %	50 %	0 %	525959917
1591	NC_021848	ACTTGT	2	12	97901	97912	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525959917
1592	NC_021848	GCTGT	2	10	98004	98013	0 %	40 %	40 %	20 %	525959917
1593	NC_021848	TCA	2	6	98031	98036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959917
1594	NC_021848	TAC	2	6	98091	98096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959917
1595	NC_021848	T	6	6	98115	98120	0 %	100 %	0 %	0 %	525959917
1596	NC_021848	TGATT	2	10	98268	98277	20 %	60 %	20 %	0 %	525959917
1597	NC_021848	AAGT	2	8	98280	98287	50 %	25 %	25 %	0 %	525959917
1598	NC_021848	TGC	2	6	98308	98313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959917
1599	NC_021848	TCA	3	9	98345	98353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959917
1600	NC_021848	ACAA	2	8	98357	98364	75 %	0 %	0 %	25 %	525959917
1601	NC_021848	CCA	2	6	98420	98425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959917
1602	NC_021848	CGT	2	6	98473	98478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959917
1603	NC_021848	CAG	2	6	98508	98513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959917
1604	NC_021848	CAA	2	6	98529	98534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959917
1605	NC_021848	TCT	2	6	98553	98558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959917
1606	NC_021848	CGAG	2	8	98841	98848	25 %	0 %	50 %	25 %	525959918
1607	NC_021848	T	6	6	98937	98942	0 %	100 %	0 %	0 %	525959918
1608	NC_021848	G	6	6	98946	98951	0 %	0 %	100 %	0 %	525959918
1609	NC_021848	AGT	2	6	98957	98962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959918
1610	NC_021848	GT	3	6	98961	98966	0 %	50 %	50 %	0 %	525959918
1611	NC_021848	CAC	2	6	99260	99265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957562
1612	NC_021848	TTGT	2	8	99272	99279	0 %	75 %	25 %	0 %	525957562
1613	NC_021848	TAG	2	6	99301	99306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957562
1614	NC_021848	TTG	2	6	99356	99361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957562
1615	NC_021848	TACCG	2	10	99389	99398	20 %	20 %	20 %	40 %	525957562
1616	NC_021848	GTT	2	6	99428	99433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957562
1617	NC_021848	GT	3	6	99451	99456	0 %	50 %	50 %	0 %	525957562
1618	NC_021848	ATT	2	6	99794	99799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957562
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1620	NC_021848	ATC	2	6	99890	99895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957562
1621	NC_021848	TTC	2	6	100133	100138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957562
1622	NC_021848	CGA	2	6	100177	100182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957562
1623	NC_021848	TCA	2	6	100236	100241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957562
1624	NC_021848	CTT	3	9	100288	100296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957562
1625	NC_021848	CAT	2	6	100339	100344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957562
1626	NC_021848	TTTA	2	8	100433	100440	25 %	75 %	0 %	0 %	525957562
1627	NC_021848	GCT	2	6	100764	100769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957563
1628	NC_021848	GTTT	2	8	100845	100852	0 %	75 %	25 %	0 %	525957563
1629	NC_021848	A	6	6	100913	100918	100 %	0 %	0 %	0 %	525957563
1630	NC_021848	ATG	2	6	100950	100955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957563
1631	NC_021848	AATT	2	8	100987	100994	50 %	50 %	0 %	0 %	525957563
1632	NC_021848	GA	3	6	101179	101184	50 %	0 %	50 %	0 %	525957564
1633	NC_021848	ATC	2	6	101210	101215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957564
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1636	NC_021848	GTC	2	6	101280	101285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957564
1637	NC_021848	CACT	2	8	101305	101312	25 %	25 %	0 %	50 %	525957564
1638	NC_021848	ATG	2	6	101324	101329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957564
1639	NC_021848	ATGG	2	8	101408	101415	25 %	25 %	50 %	0 %	525957564
1640	NC_021848	TGG	2	6	101454	101459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957564
1641	NC_021848	TG	3	6	101529	101534	0 %	50 %	50 %	0 %	525957564
1642	NC_021848	CTT	2	6	101536	101541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957564
1643	NC_021848	CG	3	6	101617	101622	0 %	0 %	50 %	50 %	525957564
1644	NC_021848	TGCC	2	8	101766	101773	0 %	25 %	25 %	50 %	525957564
1645	NC_021848	ACT	2	6	101785	101790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957564
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1647	NC_021848	TGG	2	6	101959	101964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957564
1648	NC_021848	CTT	2	6	102055	102060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957564
1649	NC_021848	CTA	2	6	102201	102206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957564
1650	NC_021848	GAC	2	6	102214	102219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957564
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1652	NC_021848	CTT	2	6	102302	102307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957564
1653	NC_021848	TTC	2	6	102320	102325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957564
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1655	NC_021848	GAAAC	2	10	102374	102383	60 %	0 %	20 %	20 %	525957564
1656	NC_021848	AAC	2	6	102390	102395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957564
1657	NC_021848	CTG	2	6	102396	102401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957564
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1664	NC_021848	GAA	2	6	102645	102650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957565
1665	NC_021848	AG	3	6	102799	102804	50 %	0 %	50 %	0 %	525957566
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1866	NC_021848	CTT	2	6	122255	122260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957574
1867	NC_021848	GCTAC	2	10	122394	122403	20 %	20 %	20 %	40 %	525957574
1868	NC_021848	ATT	2	6	122405	122410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957574
1869	NC_021848	CAC	2	6	122439	122444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957574
1870	NC_021848	CGT	2	6	122448	122453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957574
1871	NC_021848	CGAA	2	8	122500	122507	50 %	0 %	25 %	25 %	525957574
1872	NC_021848	GT	3	6	122677	122682	0 %	50 %	50 %	0 %	525957574
1873	NC_021848	GCA	2	6	122850	122855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957575
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1885	NC_021848	GCA	2	6	123481	123486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957575
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1983	NC_021848	AAG	2	6	130015	130020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957584
1984	NC_021848	GAA	2	6	130071	130076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957584
1985	NC_021848	A	7	7	130227	130233	100 %	0 %	0 %	0 %	525957584
1986	NC_021848	GGTTT	2	10	130251	130260	0 %	60 %	40 %	0 %	525957584
1987	NC_021848	AGC	2	6	130301	130306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957584
1988	NC_021848	TTG	2	6	130309	130314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957584
1989	NC_021848	CAA	2	6	130334	130339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957584
1990	NC_021848	CAA	3	9	130379	130387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957584
1991	NC_021848	CAAC	2	8	130400	130407	50 %	0 %	0 %	50 %	525957584
1992	NC_021848	CGG	2	6	130528	130533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957584
1993	NC_021848	CAG	2	6	130576	130581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957584
1994	NC_021848	ATC	2	6	130599	130604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957584
1995	NC_021848	TGT	2	6	130645	130650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957584
1996	NC_021848	TTCG	2	8	130660	130667	0 %	50 %	25 %	25 %	525957584
1997	NC_021848	GGT	2	6	130701	130706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957584
1998	NC_021848	ATG	2	6	130728	130733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957584
1999	NC_021848	CG	3	6	130870	130875	0 %	0 %	50 %	50 %	525957584
2000	NC_021848	AAG	2	6	130876	130881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957584

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