MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_021848	GCATG	2	10	1132625	1132634	20 %	20 %	40 %	20 %	525958320
18502	NC_021848	ATG	2	6	1132708	1132713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958320
18503	NC_021848	ATA	2	6	1132723	1132728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525958321
18504	NC_021848	CTT	2	6	1132745	1132750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958321
18505	NC_021848	TTC	2	6	1132758	1132763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958321
18506	NC_021848	TGT	2	6	1132771	1132776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958321
18507	NC_021848	TTG	3	9	1132800	1132808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958321
18508	NC_021848	TTG	2	6	1132854	1132859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958321
18509	NC_021848	GCT	2	6	1132916	1132921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958321
18510	NC_021848	AAG	2	6	1132983	1132988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958321
18511	NC_021848	GCG	2	6	1133016	1133021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958321
18512	NC_021848	TTC	4	12	1133022	1133033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958321
18513	NC_021848	GCC	2	6	1133086	1133091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958321
18514	NC_021848	TAA	2	6	1133163	1133168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525958321
18515	NC_021848	AGC	2	6	1133334	1133339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958322
18516	NC_021848	CTT	2	6	1133344	1133349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958322
18517	NC_021848	TGA	2	6	1133391	1133396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958322
18518	NC_021848	TCA	2	6	1133416	1133421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958322
18519	NC_021848	GTC	2	6	1133543	1133548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958322
18520	NC_021848	TGG	2	6	1133663	1133668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958322
18521	NC_021848	CAG	2	6	1133729	1133734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958322
18522	NC_021848	AACG	2	8	1133783	1133790	50 %	0 %	25 %	25 %	525958322
18523	NC_021848	GC	3	6	1133799	1133804	0 %	0 %	50 %	50 %	525958322
18524	NC_021848	CTT	2	6	1133857	1133862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958322
18525	NC_021848	TACGTC	2	12	1133930	1133941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525958322
18526	NC_021848	CCG	2	6	1133979	1133984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958322
18527	NC_021848	CAC	2	6	1134019	1134024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958322
18528	NC_021848	GGC	2	6	1134160	1134165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958322
18529	NC_021848	TGT	2	6	1134294	1134299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958322
18530	NC_021848	CGA	2	6	1134307	1134312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958322
18531	NC_021848	CAA	2	6	1134320	1134325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958322
18532	NC_021848	CA	3	6	1134355	1134360	50 %	0 %	0 %	50 %	525958322
18533	NC_021848	TGA	2	6	1134394	1134399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958322
18534	NC_021848	GTTT	2	8	1134447	1134454	0 %	75 %	25 %	0 %	525958322
18535	NC_021848	TAT	2	6	1134691	1134696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958323
18536	NC_021848	CAAC	2	8	1134711	1134718	50 %	0 %	0 %	50 %	525958323
18537	NC_021848	A	6	6	1134987	1134992	100 %	0 %	0 %	0 %	525958323
18538	NC_021848	GAA	2	6	1135073	1135078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958323
18539	NC_021848	A	6	6	1135077	1135082	100 %	0 %	0 %	0 %	525958323
18540	NC_021848	CCA	2	6	1135084	1135089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958323
18541	NC_021848	GAA	2	6	1135111	1135116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958323
18542	NC_021848	TGA	2	6	1135243	1135248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958323
18543	NC_021848	CT	3	6	1135273	1135278	0 %	50 %	0 %	50 %	525958323
18544	NC_021848	TGT	2	6	1135348	1135353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958323
18545	NC_021848	AAG	2	6	1135371	1135376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958323
18546	NC_021848	TGC	2	6	1135398	1135403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958323
18547	NC_021848	GCA	2	6	1135434	1135439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958323
18548	NC_021848	GCT	2	6	1135462	1135467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958323
18549	NC_021848	GGC	2	6	1135521	1135526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958323
18550	NC_021848	CAG	2	6	1135622	1135627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958324
18551	NC_021848	TGG	2	6	1135663	1135668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958324
18552	NC_021848	T	7	7	1135688	1135694	0 %	100 %	0 %	0 %	525958324
18553	NC_021848	GAC	2	6	1135743	1135748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958324
18554	NC_021848	AGA	3	9	1135808	1135816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958324
18555	NC_021848	CAT	2	6	1135957	1135962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958325
18556	NC_021848	GCGT	2	8	1135986	1135993	0 %	25 %	50 %	25 %	525958325
18557	NC_021848	TGAAA	2	10	1136067	1136076	60 %	20 %	20 %	0 %	525958325
18558	NC_021848	CGA	3	9	1136088	1136096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958325
18559	NC_021848	TGA	2	6	1136200	1136205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958325
18560	NC_021848	TTG	2	6	1136367	1136372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960125
18561	NC_021848	ACA	2	6	1136440	1136445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960125
18562	NC_021848	GCC	2	6	1136502	1136507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525960125
18563	NC_021848	CA	3	6	1136522	1136527	50 %	0 %	0 %	50 %	525960125
18564	NC_021848	TCT	2	6	1136561	1136566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960125
18565	NC_021848	GCT	3	9	1136608	1136616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958326
18566	NC_021848	CAA	2	6	1136645	1136650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958326
18567	NC_021848	AC	3	6	1136716	1136721	50 %	0 %	0 %	50 %	525958326
18568	NC_021848	GCG	2	6	1136813	1136818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958326
18569	NC_021848	CAT	2	6	1136969	1136974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960126
18570	NC_021848	ATG	2	6	1137006	1137011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960126
18571	NC_021848	TTTGCC	2	12	1137014	1137025	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525960126
18572	NC_021848	TAG	2	6	1137034	1137039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525960126
18573	NC_021848	CAC	2	6	1137101	1137106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960126
18574	NC_021848	ACG	2	6	1137147	1137152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960126
18575	NC_021848	CAC	2	6	1137176	1137181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960126
18576	NC_021848	TCG	2	6	1137241	1137246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960126
18577	NC_021848	GGC	2	6	1137249	1137254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525960126
18578	NC_021848	ATC	2	6	1137285	1137290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960126
18579	NC_021848	TC	3	6	1137355	1137360	0 %	50 %	0 %	50 %	525960126
18580	NC_021848	ATGCC	2	10	1137364	1137373	20 %	20 %	20 %	40 %	525960126
18581	NC_021848	GC	3	6	1137404	1137409	0 %	0 %	50 %	50 %	525960126
18582	NC_021848	AG	3	6	1137461	1137466	50 %	0 %	50 %	0 %	525960126
18583	NC_021848	ATC	3	9	1137534	1137542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960126
18584	NC_021848	TAT	2	6	1137686	1137691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525960126
18585	NC_021848	TGG	2	6	1137740	1137745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960126
18586	NC_021848	TGG	2	6	1137779	1137784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960126
18587	NC_021848	TGC	2	6	1137787	1137792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960126
18588	NC_021848	TGG	2	6	1137850	1137855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525960126
18589	NC_021848	GGC	2	6	1137861	1137866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525960126
18590	NC_021848	AGC	2	6	1137912	1137917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960126
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18594	NC_021848	CG	3	6	1138119	1138124	0 %	0 %	50 %	50 %	525960126
18595	NC_021848	ACG	2	6	1138174	1138179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960126
18596	NC_021848	AAG	2	6	1138213	1138218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960126
18597	NC_021848	GAAG	2	8	1138266	1138273	50 %	0 %	50 %	0 %	525960126
18598	NC_021848	GAC	2	6	1138314	1138319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960126
18599	NC_021848	TCC	2	6	1138321	1138326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525960126
18600	NC_021848	CTAC	2	8	1138481	1138488	25 %	25 %	0 %	50 %	525960126
18601	NC_021848	GCGCA	2	10	1138530	1138539	20 %	0 %	40 %	40 %	525960126
18602	NC_021848	A	6	6	1138552	1138557	100 %	0 %	0 %	0 %	525960126
18603	NC_021848	GTC	2	6	1138659	1138664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960126
18604	NC_021848	TGC	2	6	1138735	1138740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960126
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18606	NC_021848	GCA	2	6	1138838	1138843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960126
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18608	NC_021848	CGT	2	6	1138926	1138931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960126
18609	NC_021848	ACTC	2	8	1138991	1138998	25 %	25 %	0 %	50 %	525960126
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18614	NC_021848	T	6	6	1139404	1139409	0 %	100 %	0 %	0 %	525958327
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18840	NC_021848	TGT	2	6	1151385	1151390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958336
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18843	NC_021848	CG	3	6	1151438	1151443	0 %	0 %	50 %	50 %	525958336
18844	NC_021848	CTGA	2	8	1151465	1151472	25 %	25 %	25 %	25 %	525958336
18845	NC_021848	ATTC	2	8	1151479	1151486	25 %	50 %	0 %	25 %	525958336
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18847	NC_021848	TGA	2	6	1151529	1151534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958336
18848	NC_021848	GAC	2	6	1151535	1151540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958336
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18852	NC_021848	GAA	2	6	1151719	1151724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958337
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18959	NC_021848	ACTTAC	2	12	1158124	1158135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958341
18960	NC_021848	GTT	3	9	1158208	1158216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958341
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18962	NC_021848	GGCAAT	2	12	1158240	1158251	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525958341
18963	NC_021848	GCTT	2	8	1158252	1158259	0 %	50 %	25 %	25 %	525958341
18964	NC_021848	TGG	2	6	1158294	1158299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958341
18965	NC_021848	TAG	2	6	1158407	1158412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958341
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