MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_021848	CA	3	6	1105033	1105038	50 %	0 %	0 %	50 %	525958295
18002	NC_021848	CAAAG	2	10	1105043	1105052	60 %	0 %	20 %	20 %	525958295
18003	NC_021848	AGA	2	6	1105124	1105129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958295
18004	NC_021848	GGC	2	6	1105181	1105186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958295
18005	NC_021848	TGG	3	9	1105198	1105206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958295
18006	NC_021848	GCG	2	6	1105254	1105259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958295
18007	NC_021848	ATC	2	6	1105320	1105325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958295
18008	NC_021848	GGC	2	6	1105349	1105354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958295
18009	NC_021848	GCG	2	6	1105377	1105382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958295
18010	NC_021848	GTT	2	6	1105384	1105389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958295
18011	NC_021848	CAG	2	6	1105405	1105410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958295
18012	NC_021848	A	6	6	1105444	1105449	100 %	0 %	0 %	0 %	525958295
18013	NC_021848	TCC	2	6	1105463	1105468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525958295
18014	NC_021848	TCA	2	6	1105474	1105479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958295
18015	NC_021848	AGTTG	2	10	1105619	1105628	20 %	40 %	40 %	0 %	525958295
18016	NC_021848	GGT	2	6	1105629	1105634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958295
18017	NC_021848	TTC	2	6	1105719	1105724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958295
18018	NC_021848	CAAG	2	8	1105823	1105830	50 %	0 %	25 %	25 %	525958295
18019	NC_021848	CGATAC	2	12	1105841	1105852	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525958295
18020	NC_021848	GAA	2	6	1105920	1105925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958295
18021	NC_021848	TGG	2	6	1105943	1105948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958295
18022	NC_021848	TAC	2	6	1105986	1105991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958295
18023	NC_021848	CAA	2	6	1105999	1106004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958295
18024	NC_021848	AAG	2	6	1106038	1106043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958295
18025	NC_021848	TGG	2	6	1106243	1106248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958295
18026	NC_021848	GAT	2	6	1106285	1106290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958295
18027	NC_021848	ATCT	2	8	1106492	1106499	25 %	50 %	0 %	25 %	525958296
18028	NC_021848	AGC	2	6	1106522	1106527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958296
18029	NC_021848	TGTT	2	8	1106643	1106650	0 %	75 %	25 %	0 %	525958296
18030	NC_021848	TGA	2	6	1106654	1106659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958296
18031	NC_021848	AG	3	6	1106660	1106665	50 %	0 %	50 %	0 %	525958296
18032	NC_021848	GTT	2	6	1106713	1106718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958296
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18034	NC_021848	AAT	2	6	1106983	1106988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525958297
18035	NC_021848	A	6	6	1107019	1107024	100 %	0 %	0 %	0 %	525958297
18036	NC_021848	CAA	2	6	1107059	1107064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958297
18037	NC_021848	ATGAA	2	10	1107106	1107115	60 %	20 %	20 %	0 %	525958297
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18039	NC_021848	AAGCT	2	10	1107134	1107143	40 %	20 %	20 %	20 %	525958297
18040	NC_021848	TGA	2	6	1107184	1107189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958297
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18042	NC_021848	TA	3	6	1107775	1107780	50 %	50 %	0 %	0 %	525960120
18043	NC_021848	TCT	2	6	1107826	1107831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525960120
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18045	NC_021848	AT	4	8	1107966	1107973	50 %	50 %	0 %	0 %	525960120
18046	NC_021848	GAAG	2	8	1107979	1107986	50 %	0 %	50 %	0 %	525960120
18047	NC_021848	TAGAAA	2	12	1108016	1108027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525960120
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18049	NC_021848	TTG	2	6	1108775	1108780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958298
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18051	NC_021848	ACT	2	6	1108868	1108873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958298
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18053	NC_021848	TCT	2	6	1108968	1108973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958298
18054	NC_021848	GTTT	2	8	1109009	1109016	0 %	75 %	25 %	0 %	525958298
18055	NC_021848	GGA	2	6	1109070	1109075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525958298
18056	NC_021848	CAT	2	6	1109094	1109099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958298
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18058	NC_021848	TGC	2	6	1109132	1109137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958298
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18062	NC_021848	GCAC	2	8	1109355	1109362	25 %	0 %	25 %	50 %	525958298
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18099	NC_021848	GC	3	6	1111522	1111527	0 %	0 %	50 %	50 %	525958300
18100	NC_021848	GCC	2	6	1111561	1111566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958300
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18116	NC_021848	TTGG	2	8	1112306	1112313	0 %	50 %	50 %	0 %	525958300
18117	NC_021848	CGG	2	6	1112322	1112327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958300
18118	NC_021848	GAA	2	6	1112333	1112338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958300
18119	NC_021848	TTG	2	6	1112354	1112359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958300
18120	NC_021848	TCG	2	6	1112376	1112381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958300
18121	NC_021848	CGCGA	2	10	1112392	1112401	20 %	0 %	40 %	40 %	525958300
18122	NC_021848	AGA	2	6	1112428	1112433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958300
18123	NC_021848	TGG	2	6	1112452	1112457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958300
18124	NC_021848	GAT	2	6	1112462	1112467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958300
18125	NC_021848	TGG	2	6	1112536	1112541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958300
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18128	NC_021848	AAC	2	6	1112765	1112770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958300
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18134	NC_021848	CGA	2	6	1113069	1113074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958301
18135	NC_021848	GT	3	6	1113133	1113138	0 %	50 %	50 %	0 %	525958301
18136	NC_021848	GTG	2	6	1113253	1113258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958301
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18144	NC_021848	GAA	2	6	1113661	1113666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958301
18145	NC_021848	TTC	2	6	1113689	1113694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958301
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18148	NC_021848	GCT	2	6	1113903	1113908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958301
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18188	NC_021848	TTG	2	6	1115588	1115593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958304
18189	NC_021848	A	7	7	1115668	1115674	100 %	0 %	0 %	0 %	525958304
18190	NC_021848	GAA	2	6	1115684	1115689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958304
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18196	NC_021848	AAG	2	6	1116009	1116014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958305
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18201	NC_021848	ACT	2	6	1116864	1116869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525960460
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18216	NC_021848	GTTA	2	8	1117540	1117547	25 %	50 %	25 %	0 %	525958306
18217	NC_021848	GCG	2	6	1117573	1117578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958306
18218	NC_021848	GCA	2	6	1117611	1117616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958306
18219	NC_021848	AGC	2	6	1117634	1117639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958306
18220	NC_021848	CGT	2	6	1117752	1117757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958306
18221	NC_021848	ATC	2	6	1117777	1117782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958306
18222	NC_021848	TGA	2	6	1117791	1117796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958306
18223	NC_021848	GA	4	8	1117896	1117903	50 %	0 %	50 %	0 %	525958306
18224	NC_021848	GC	3	6	1117963	1117968	0 %	0 %	50 %	50 %	525958306
18225	NC_021848	ATT	2	6	1118008	1118013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958306
18226	NC_021848	AAGC	2	8	1118047	1118054	50 %	0 %	25 %	25 %	525958306
18227	NC_021848	AAC	2	6	1118063	1118068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958306
18228	NC_021848	TCA	2	6	1118089	1118094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958306
18229	NC_021848	TTA	2	6	1118326	1118331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958307
18230	NC_021848	TGA	2	6	1118338	1118343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958307
18231	NC_021848	AAC	2	6	1118371	1118376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958307
18232	NC_021848	CGA	2	6	1118390	1118395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958307
18233	NC_021848	TTGA	2	8	1118409	1118416	25 %	50 %	25 %	0 %	525958307
18234	NC_021848	GAT	2	6	1118448	1118453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958307
18235	NC_021848	TGC	2	6	1118506	1118511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958307
18236	NC_021848	CTCA	2	8	1118529	1118536	25 %	25 %	0 %	50 %	525958307
18237	NC_021848	TTG	2	6	1118575	1118580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958307
18238	NC_021848	TC	3	6	1118631	1118636	0 %	50 %	0 %	50 %	525958307
18239	NC_021848	CAA	2	6	1118674	1118679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958307
18240	NC_021848	GATG	2	8	1118705	1118712	25 %	25 %	50 %	0 %	525958307
18241	NC_021848	GCG	2	6	1118778	1118783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958308
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18243	NC_021848	TGC	2	6	1118855	1118860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958308
18244	NC_021848	GTG	2	6	1118893	1118898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958308
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18246	NC_021848	CTT	2	6	1118909	1118914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958308
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18248	NC_021848	GCA	2	6	1118944	1118949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958308
18249	NC_021848	TCT	2	6	1119027	1119032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958308
18250	NC_021848	TGT	2	6	1119049	1119054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958308
18251	NC_021848	GCT	2	6	1119135	1119140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958308
18252	NC_021848	TGA	2	6	1119224	1119229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958308
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18254	NC_021848	GTG	2	6	1119255	1119260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958308
18255	NC_021848	CGG	2	6	1119269	1119274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525958308
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18261	NC_021848	TGG	2	6	1119656	1119661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958308
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18263	NC_021848	ATTT	2	8	1119760	1119767	25 %	75 %	0 %	0 %	525958308
18264	NC_021848	ACA	2	6	1120146	1120151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960123
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18268	NC_021848	TGC	2	6	1120362	1120367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960123
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18271	NC_021848	TGAGT	2	10	1120507	1120516	20 %	40 %	40 %	0 %	525960123
18272	NC_021848	ACA	2	6	1120542	1120547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525960123
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18275	NC_021848	CA	3	6	1120705	1120710	50 %	0 %	0 %	50 %	525958309
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18301	NC_021848	A	7	7	1122456	1122462	100 %	0 %	0 %	0 %	525958311
18302	NC_021848	TTC	2	6	1122472	1122477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958311
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18322	NC_021848	CAAA	2	8	1123407	1123414	75 %	0 %	0 %	25 %	525958311
18323	NC_021848	GATTGG	2	12	1123543	1123554	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525958311
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18327	NC_021848	AAAAG	2	10	1123760	1123769	80 %	0 %	20 %	0 %	525958311
18328	NC_021848	ATTG	2	8	1123834	1123841	25 %	50 %	25 %	0 %	525958312
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18330	NC_021848	TCGT	2	8	1123872	1123879	0 %	50 %	25 %	25 %	525958312
18331	NC_021848	TTC	2	6	1123897	1123902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958312
18332	NC_021848	TTG	2	6	1123930	1123935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958312
18333	NC_021848	GCA	2	6	1123956	1123961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958312
18334	NC_021848	GTT	2	6	1123978	1123983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958312
18335	NC_021848	TTG	2	6	1124022	1124027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958312
18336	NC_021848	AGAGG	2	10	1124114	1124123	40 %	0 %	60 %	0 %	525958312
18337	NC_021848	TGT	2	6	1124130	1124135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958312
18338	NC_021848	ATCC	2	8	1124181	1124188	25 %	25 %	0 %	50 %	525958312
18339	NC_021848	TTTGT	2	10	1124238	1124247	0 %	80 %	20 %	0 %	525958312
18340	NC_021848	GA	3	6	1124287	1124292	50 %	0 %	50 %	0 %	525958312
18341	NC_021848	ACG	2	6	1124295	1124300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958312
18342	NC_021848	TGC	2	6	1124331	1124336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958312
18343	NC_021848	GCT	2	6	1124344	1124349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958312
18344	NC_021848	TTTG	2	8	1124350	1124357	0 %	75 %	25 %	0 %	525958312
18345	NC_021848	ACG	2	6	1124391	1124396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958312
18346	NC_021848	ACC	2	6	1124403	1124408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958312
18347	NC_021848	AAG	2	6	1124565	1124570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958313
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18349	NC_021848	TCA	2	6	1124743	1124748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958313
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18466	NC_021848	CGA	2	6	1130893	1130898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525960124
18467	NC_021848	GGC	2	6	1130903	1130908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525960124
18468	NC_021848	CAAA	2	8	1130947	1130954	75 %	0 %	0 %	25 %	525960124
18469	NC_021848	GTTT	2	8	1130967	1130974	0 %	75 %	25 %	0 %	525960124
18470	NC_021848	GA	3	6	1131124	1131129	50 %	0 %	50 %	0 %	525960124
18471	NC_021848	TGC	2	6	1131167	1131172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525960124
18472	NC_021848	CCA	2	6	1131209	1131214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525960124
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18475	NC_021848	TTG	3	9	1131423	1131431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958320
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18478	NC_021848	TTG	2	6	1131537	1131542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958320
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18481	NC_021848	CCA	2	6	1131701	1131706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958320
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18491	NC_021848	GTA	2	6	1132300	1132305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958320
18492	NC_021848	TG	3	6	1132328	1132333	0 %	50 %	50 %	0 %	525958320
18493	NC_021848	GAC	2	6	1132381	1132386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958320
18494	NC_021848	GTT	2	6	1132398	1132403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958320
18495	NC_021848	CAG	2	6	1132451	1132456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958320
18496	NC_021848	GTTG	2	8	1132463	1132470	0 %	50 %	50 %	0 %	525958320
18497	NC_021848	AG	3	6	1132495	1132500	50 %	0 %	50 %	0 %	525958320
18498	NC_021848	T	6	6	1132527	1132532	0 %	100 %	0 %	0 %	525958320
18499	NC_021848	ATT	2	6	1132551	1132556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958320
18500	NC_021848	TGGTT	2	10	1132572	1132581	0 %	60 %	40 %	0 %	525958320

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