MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_021848	GTT	2	6	648925	648930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958014
11002	NC_021848	CCA	2	6	648938	648943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958014
11003	NC_021848	TGA	2	6	648954	648959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958014
11004	NC_021848	TCT	2	6	648962	648967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958014
11005	NC_021848	AAC	2	6	649015	649020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958014
11006	NC_021848	GTG	2	6	649042	649047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958014
11007	NC_021848	CTG	2	6	649062	649067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958014
11008	NC_021848	TG	3	6	649071	649076	0 %	50 %	50 %	0 %	525958014
11009	NC_021848	CAG	2	6	649466	649471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959958
11010	NC_021848	TGT	2	6	649491	649496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959958
11011	NC_021848	TCT	2	6	649535	649540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959958
11012	NC_021848	TGG	2	6	649681	649686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959958
11013	NC_021848	CAT	2	6	649693	649698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959958
11014	NC_021848	GCA	2	6	649748	649753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959958
11015	NC_021848	TAC	2	6	649868	649873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959959
11016	NC_021848	ACCA	2	8	649912	649919	50 %	0 %	0 %	50 %	525959959
11017	NC_021848	ACA	2	6	649933	649938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959959
11018	NC_021848	TGG	2	6	649968	649973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959959
11019	NC_021848	GCC	2	6	650005	650010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959959
11020	NC_021848	CAA	2	6	650018	650023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959959
11021	NC_021848	ATCA	2	8	650118	650125	50 %	25 %	0 %	25 %	525959959
11022	NC_021848	CGC	2	6	650140	650145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959959
11023	NC_021848	TAT	2	6	650195	650200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959959
11024	NC_021848	GAA	2	6	650222	650227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959959
11025	NC_021848	GCA	2	6	650269	650274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959959
11026	NC_021848	ATGG	2	8	650288	650295	25 %	25 %	50 %	0 %	525959959
11027	NC_021848	TGC	2	6	650373	650378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959959
11028	NC_021848	GAT	2	6	650607	650612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959960
11029	NC_021848	AAC	2	6	650643	650648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959960
11030	NC_021848	CTA	2	6	650756	650761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959960
11031	NC_021848	AAAG	2	8	650797	650804	75 %	0 %	25 %	0 %	525959960
11032	NC_021848	TCG	2	6	650834	650839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959960
11033	NC_021848	GAA	2	6	650845	650850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959960
11034	NC_021848	CAA	2	6	650876	650881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959960
11035	NC_021848	GCA	2	6	650896	650901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959960
11036	NC_021848	TGT	2	6	650909	650914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959960
11037	NC_021848	GTTT	2	8	650962	650969	0 %	75 %	25 %	0 %	525959960
11038	NC_021848	ATC	2	6	651013	651018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959960
11039	NC_021848	CAT	2	6	651021	651026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959960
11040	NC_021848	CGT	2	6	651047	651052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959960
11041	NC_021848	TTCC	2	8	651057	651064	0 %	50 %	0 %	50 %	525959960
11042	NC_021848	CCA	2	6	651076	651081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959960
11043	NC_021848	GAT	2	6	651114	651119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959960
11044	NC_021848	AAT	2	6	651156	651161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959960
11045	NC_021848	TGTT	2	8	651187	651194	0 %	75 %	25 %	0 %	525959960
11046	NC_021848	CAGT	2	8	651221	651228	25 %	25 %	25 %	25 %	525959960
11047	NC_021848	TTC	2	6	651370	651375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959960
11048	NC_021848	TGT	2	6	651383	651388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959960
11049	NC_021848	AAG	2	6	651391	651396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959960
11050	NC_021848	CA	3	6	651453	651458	50 %	0 %	0 %	50 %	525959960
11051	NC_021848	CGA	2	6	651469	651474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959960
11052	NC_021848	AGT	2	6	651609	651614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959960
11053	NC_021848	CTTT	2	8	651625	651632	0 %	75 %	0 %	25 %	525959960
11054	NC_021848	CAA	2	6	651797	651802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959960
11055	NC_021848	CCA	2	6	651805	651810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959960
11056	NC_021848	ACC	2	6	651835	651840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959960
11057	NC_021848	TTA	2	6	651928	651933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959961
11058	NC_021848	TTC	2	6	651934	651939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959961
11059	NC_021848	CCG	2	6	651956	651961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959961
11060	NC_021848	T	6	6	652005	652010	0 %	100 %	0 %	0 %	525959961
11061	NC_021848	GCG	2	6	652205	652210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959961
11062	NC_021848	ATT	2	6	652223	652228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525959961
11063	NC_021848	CTT	2	6	652290	652295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959961
11064	NC_021848	CTT	2	6	652356	652361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959961
11065	NC_021848	CTT	2	6	652428	652433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959961
11066	NC_021848	CAA	2	6	652509	652514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959961
11067	NC_021848	GTG	2	6	652946	652951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958015
11068	NC_021848	GCA	2	6	653016	653021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958015
11069	NC_021848	TGG	2	6	653036	653041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958015
11070	NC_021848	TCG	2	6	653104	653109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958015
11071	NC_021848	A	7	7	653119	653125	100 %	0 %	0 %	0 %	525958015
11072	NC_021848	TAT	2	6	653390	653395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958015
11073	NC_021848	AGTA	2	8	653401	653408	50 %	25 %	25 %	0 %	525958015
11074	NC_021848	TTG	2	6	653437	653442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958015
11075	NC_021848	TGG	2	6	653579	653584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958015
11076	NC_021848	CGA	2	6	653638	653643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958015
11077	NC_021848	TACT	2	8	653658	653665	25 %	50 %	0 %	25 %	525958015
11078	NC_021848	CGT	2	6	653767	653772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958015
11079	NC_021848	TCT	2	6	654067	654072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958016
11080	NC_021848	CCAGC	2	10	654249	654258	20 %	0 %	20 %	60 %	525958016
11081	NC_021848	TTG	2	6	654362	654367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958016
11082	NC_021848	GAA	2	6	654373	654378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958016
11083	NC_021848	TGC	2	6	654379	654384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958016
11084	NC_021848	ATC	2	6	654392	654397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958016
11085	NC_021848	GT	4	8	654424	654431	0 %	50 %	50 %	0 %	525958016
11086	NC_021848	TTGT	2	8	654619	654626	0 %	75 %	25 %	0 %	525958017
11087	NC_021848	TG	3	6	654675	654680	0 %	50 %	50 %	0 %	525958017
11088	NC_021848	ACC	2	6	654685	654690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525958017
11089	NC_021848	GTC	2	6	654760	654765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958017
11090	NC_021848	TCA	2	6	654857	654862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958017
11091	NC_021848	CAA	2	6	654870	654875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525958017
11092	NC_021848	GT	3	6	654882	654887	0 %	50 %	50 %	0 %	525958017
11093	NC_021848	TGAT	2	8	654951	654958	25 %	50 %	25 %	0 %	525958017
11094	NC_021848	GT	3	6	654986	654991	0 %	50 %	50 %	0 %	525958017
11095	NC_021848	AAT	2	6	655089	655094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525958018
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11098	NC_021848	CCAA	2	8	655290	655297	50 %	0 %	0 %	50 %	525958018
11099	NC_021848	TAA	2	6	655395	655400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525958018
11100	NC_021848	CAGTT	2	10	655609	655618	20 %	40 %	20 %	20 %	525958018
11101	NC_021848	GTT	2	6	655635	655640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958018
11102	NC_021848	T	6	6	655670	655675	0 %	100 %	0 %	0 %	525958018
11103	NC_021848	TAT	2	6	655763	655768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525958019
11104	NC_021848	GTTA	2	8	655771	655778	25 %	50 %	25 %	0 %	525958019
11105	NC_021848	TCT	2	6	655805	655810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958019
11106	NC_021848	TGG	2	6	655888	655893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525958019
11107	NC_021848	TAA	2	6	655903	655908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525958019
11108	NC_021848	GCT	2	6	655912	655917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958019
11109	NC_021848	CCAT	2	8	656055	656062	25 %	25 %	0 %	50 %	525958019
11110	NC_021848	CAT	2	6	656088	656093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958019
11111	NC_021848	T	6	6	656093	656098	0 %	100 %	0 %	0 %	525958019
11112	NC_021848	GAT	3	9	656122	656130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958019
11113	NC_021848	CGTAAG	2	12	656181	656192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525958019
11114	NC_021848	CATT	2	8	656193	656200	25 %	50 %	0 %	25 %	525958019
11115	NC_021848	CGTTA	2	10	656293	656302	20 %	40 %	20 %	20 %	525958019
11116	NC_021848	TCG	2	6	656355	656360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525958019
11117	NC_021848	AGC	2	6	656390	656395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958019
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11119	NC_021848	TTC	2	6	656429	656434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525958019
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11121	NC_021848	ATTG	2	8	656456	656463	25 %	50 %	25 %	0 %	525958019
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11128	NC_021848	TGA	2	6	656765	656770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958020
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11227	NC_021848	TCAA	2	8	660736	660743	50 %	25 %	0 %	25 %	525958022
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11230	NC_021848	GCA	2	6	660798	660803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958023
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11233	NC_021848	TGA	2	6	660937	660942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958023
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11236	NC_021848	CGGT	2	8	661042	661049	0 %	25 %	50 %	25 %	525958023
11237	NC_021848	CCG	2	6	661128	661133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525958023
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11240	NC_021848	GAA	2	6	661225	661230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525958023
11241	NC_021848	GCA	2	6	661311	661316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525958023
11242	NC_021848	GAT	2	6	661331	661336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525958023
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11246	NC_021848	CA	4	8	661774	661781	50 %	0 %	0 %	50 %	525958024
11247	NC_021848	T	6	6	661838	661843	0 %	100 %	0 %	0 %	525958024
11248	NC_021848	GTT	2	6	661892	661897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525958024
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11252	NC_021848	TAC	2	6	663202	663207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525958025
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11353	NC_021848	AACA	2	8	668645	668652	75 %	0 %	0 %	25 %	525959962
11354	NC_021848	GCGT	2	8	668741	668748	0 %	25 %	50 %	25 %	525959962
11355	NC_021848	TGA	2	6	668788	668793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959962
11356	NC_021848	TCCAA	2	10	668846	668855	40 %	20 %	0 %	40 %	525959962
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