MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021848	TGGT	2	8	335445	335452	0 %	50 %	50 %	0 %	525957738
5502	NC_021848	GCT	2	6	335545	335550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957738
5503	NC_021848	TCT	2	6	335560	335565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957738
5504	NC_021848	TGA	2	6	335602	335607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957738
5505	NC_021848	AAAGCG	2	12	335859	335870	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525957739
5506	NC_021848	CTT	2	6	335924	335929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957739
5507	NC_021848	GGCG	2	8	335993	336000	0 %	0 %	75 %	25 %	525957739
5508	NC_021848	TGAA	2	8	336058	336065	50 %	25 %	25 %	0 %	525957739
5509	NC_021848	TC	3	6	336074	336079	0 %	50 %	0 %	50 %	525957739
5510	NC_021848	GTG	2	6	336093	336098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957739
5511	NC_021848	TGA	2	6	336137	336142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957739
5512	NC_021848	CTGG	2	8	336153	336160	0 %	25 %	50 %	25 %	525957739
5513	NC_021848	GAA	2	6	336168	336173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957739
5514	NC_021848	TGG	2	6	336368	336373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957739
5515	NC_021848	ATA	2	6	336550	336555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525957739
5516	NC_021848	CCGTTG	2	12	336556	336567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957739
5517	NC_021848	TGA	2	6	336589	336594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957739
5518	NC_021848	CCG	2	6	336598	336603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957739
5519	NC_021848	GC	3	6	336706	336711	0 %	0 %	50 %	50 %	525957739
5520	NC_021848	AGC	2	6	336718	336723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957739
5521	NC_021848	A	6	6	336724	336729	100 %	0 %	0 %	0 %	525957739
5522	NC_021848	T	6	6	336791	336796	0 %	100 %	0 %	0 %	525957740
5523	NC_021848	ACG	2	6	336817	336822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957740
5524	NC_021848	CTT	2	6	336824	336829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957740
5525	NC_021848	CCAA	2	8	336856	336863	50 %	0 %	0 %	50 %	525957740
5526	NC_021848	TGA	2	6	336895	336900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957740
5527	NC_021848	AGC	2	6	336937	336942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957740
5528	NC_021848	CAT	2	6	336999	337004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957740
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5530	NC_021848	T	6	6	337011	337016	0 %	100 %	0 %	0 %	525957740
5531	NC_021848	CGC	2	6	337098	337103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525957740
5532	NC_021848	CTTG	2	8	337126	337133	0 %	50 %	25 %	25 %	525957740
5533	NC_021848	GC	3	6	337227	337232	0 %	0 %	50 %	50 %	525957740
5534	NC_021848	AAC	2	6	337234	337239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957740
5535	NC_021848	ACC	2	6	337273	337278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957740
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5537	NC_021848	GAA	2	6	337437	337442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957740
5538	NC_021848	TCA	2	6	337471	337476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957740
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5540	NC_021848	CTG	2	6	337667	337672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957740
5541	NC_021848	GCG	2	6	337700	337705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957740
5542	NC_021848	TGGC	2	8	337811	337818	0 %	25 %	50 %	25 %	525957740
5543	NC_021848	GA	3	6	337925	337930	50 %	0 %	50 %	0 %	525957740
5544	NC_021848	TCT	2	6	337942	337947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957740
5545	NC_021848	ACGC	2	8	337985	337992	25 %	0 %	25 %	50 %	525957740
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5549	NC_021848	TTG	2	6	338187	338192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957740
5550	NC_021848	TC	3	6	338196	338201	0 %	50 %	0 %	50 %	525957740
5551	NC_021848	GTT	2	6	338229	338234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957740
5552	NC_021848	A	6	6	338271	338276	100 %	0 %	0 %	0 %	525957740
5553	NC_021848	GT	3	6	338293	338298	0 %	50 %	50 %	0 %	525957740
5554	NC_021848	GTGC	2	8	338326	338333	0 %	25 %	50 %	25 %	525957740
5555	NC_021848	GGC	2	6	338373	338378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957740
5556	NC_021848	TCG	2	6	338392	338397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957740
5557	NC_021848	CG	3	6	338402	338407	0 %	0 %	50 %	50 %	525957740
5558	NC_021848	CAT	2	6	338456	338461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957740
5559	NC_021848	AAACG	2	10	338547	338556	60 %	0 %	20 %	20 %	525957740
5560	NC_021848	GCG	2	6	338661	338666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957740
5561	NC_021848	AATG	2	8	338767	338774	50 %	25 %	25 %	0 %	525957740
5562	NC_021848	TG	3	6	338785	338790	0 %	50 %	50 %	0 %	525957740
5563	NC_021848	TCA	2	6	338801	338806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957740
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5565	NC_021848	CTT	2	6	338982	338987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957740
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5570	NC_021848	CAT	2	6	339276	339281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957741
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5572	NC_021848	TGC	2	6	339393	339398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957741
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5578	NC_021848	TTACG	2	10	339654	339663	20 %	40 %	20 %	20 %	525957741
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5590	NC_021848	TCG	2	6	340254	340259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957741
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5592	NC_021848	TC	3	6	340287	340292	0 %	50 %	0 %	50 %	525957741
5593	NC_021848	TTA	3	9	340294	340302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957741
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5598	NC_021848	GCT	2	6	340567	340572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957741
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5605	NC_021848	TGG	2	6	341193	341198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525957742
5606	NC_021848	TCAG	2	8	341208	341215	25 %	25 %	25 %	25 %	525957742
5607	NC_021848	AACT	2	8	341217	341224	50 %	25 %	0 %	25 %	525957742
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5611	NC_021848	GCCA	2	8	341435	341442	25 %	0 %	25 %	50 %	525957742
5612	NC_021848	CAG	2	6	341468	341473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957742
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5620	NC_021848	GAC	2	6	341827	341832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957742
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5622	NC_021848	CAT	2	6	341991	341996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957742
5623	NC_021848	GAA	2	6	342012	342017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957742
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5741	NC_021848	ATG	2	6	349246	349251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957748
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5744	NC_021848	TCA	2	6	349418	349423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957749
5745	NC_021848	TGC	2	6	349430	349435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957749
5746	NC_021848	TGC	2	6	349455	349460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957749
5747	NC_021848	ATGG	2	8	349479	349486	25 %	25 %	50 %	0 %	525957749
5748	NC_021848	TGT	2	6	349536	349541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957749
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5764	NC_021848	A	6	6	350375	350380	100 %	0 %	0 %	0 %	525957750
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5766	NC_021848	GTT	2	6	350479	350484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525957750
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5785	NC_021848	ACG	2	6	351474	351479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957750
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5829	NC_021848	T	6	6	354020	354025	0 %	100 %	0 %	0 %	525957753
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5833	NC_021848	TTA	2	6	354126	354131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957753
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5835	NC_021848	AAAC	2	8	354201	354208	75 %	0 %	0 %	25 %	525957754
5836	NC_021848	GTCAAT	2	12	354278	354289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525957754
5837	NC_021848	ATTT	2	8	354309	354316	25 %	75 %	0 %	0 %	525957754
5838	NC_021848	AGT	2	6	354416	354421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957754
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5845	NC_021848	GATC	2	8	354703	354710	25 %	25 %	25 %	25 %	525957754
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5849	NC_021848	TTC	2	6	354924	354929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525957754
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5851	NC_021848	AT	3	6	355011	355016	50 %	50 %	0 %	0 %	525957754
5852	NC_021848	GCA	2	6	355027	355032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957754
5853	NC_021848	TA	3	6	355064	355069	50 %	50 %	0 %	0 %	525957754
5854	NC_021848	ATTAGA	2	12	355075	355086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525957754
5855	NC_021848	ATC	2	6	355101	355106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525957754
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5858	NC_021848	AG	3	6	355225	355230	50 %	0 %	50 %	0 %	525957754
5859	NC_021848	TTA	2	6	355307	355312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525957754
5860	NC_021848	TTCTT	2	10	355352	355361	0 %	80 %	0 %	20 %	525957754
5861	NC_021848	TTCA	2	8	355405	355412	25 %	50 %	0 %	25 %	525957755
5862	NC_021848	GAA	2	6	355424	355429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957755
5863	NC_021848	GTC	2	6	355442	355447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957755
5864	NC_021848	TGC	2	6	355459	355464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957755
5865	NC_021848	AGA	2	6	355471	355476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525957755
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5989	NC_021848	GGA	2	6	361432	361437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525957760
5990	NC_021848	GC	3	6	361459	361464	0 %	0 %	50 %	50 %	525957760
5991	NC_021848	GCG	2	6	361542	361547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525957760
5992	NC_021848	CAA	2	6	361585	361590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525957760
5993	NC_021848	GCA	2	6	361606	361611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525957760
5994	NC_021848	CCA	2	6	361623	361628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957760
5995	NC_021848	A	6	6	361650	361655	100 %	0 %	0 %	0 %	525957760
5996	NC_021848	CGGCT	2	10	361754	361763	0 %	20 %	40 %	40 %	525957760
5997	NC_021848	TCTT	2	8	361776	361783	0 %	75 %	0 %	25 %	525957760
5998	NC_021848	CTG	2	6	361807	361812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525957760
5999	NC_021848	ATG	2	6	361836	361841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525957760
6000	NC_021848	CCA	2	6	361849	361854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525957760

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