MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_021848	AGGT	2	8	3216395	3216402	25 %	25 %	50 %	0 %	525959808
53002	NC_021848	ACA	2	6	3216510	3216515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959808
53003	NC_021848	T	6	6	3216608	3216613	0 %	100 %	0 %	0 %	525959808
53004	NC_021848	CAA	2	6	3216640	3216645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959808
53005	NC_021848	TGC	2	6	3216701	3216706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959808
53006	NC_021848	AAG	2	6	3216743	3216748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959808
53007	NC_021848	CCAAA	2	10	3216755	3216764	60 %	0 %	0 %	40 %	525959808
53008	NC_021848	AGA	2	6	3217067	3217072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525960454
53009	NC_021848	TTG	2	6	3217172	3217177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525960454
53010	NC_021848	AAG	2	6	3217366	3217371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959809
53011	NC_021848	ACGGTT	2	12	3217394	3217405	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525959809
53012	NC_021848	TGCGAA	2	12	3217434	3217445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525959809
53013	NC_021848	AAC	2	6	3217474	3217479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959809
53014	NC_021848	CAT	2	6	3217695	3217700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959809
53015	NC_021848	GGC	2	6	3217764	3217769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959809
53016	NC_021848	CTAC	2	8	3217791	3217798	25 %	25 %	0 %	50 %	525959809
53017	NC_021848	AC	3	6	3217820	3217825	50 %	0 %	0 %	50 %	525959809
53018	NC_021848	CAC	3	9	3217823	3217831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959809
53019	NC_021848	TAC	2	6	3217915	3217920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959809
53020	NC_021848	ACA	2	6	3217934	3217939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959809
53021	NC_021848	CTA	2	6	3217969	3217974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959809
53022	NC_021848	CAG	2	6	3217997	3218002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959809
53023	NC_021848	ACG	2	6	3218048	3218053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959809
53024	NC_021848	AAG	2	6	3218090	3218095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959809
53025	NC_021848	CCA	2	6	3218275	3218280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959809
53026	NC_021848	TCT	2	6	3218375	3218380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959809
53027	NC_021848	GGT	2	6	3218386	3218391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959809
53028	NC_021848	ATC	2	6	3218533	3218538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959809
53029	NC_021848	TGGT	2	8	3218561	3218568	0 %	50 %	50 %	0 %	525959809
53030	NC_021848	AAG	2	6	3218648	3218653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959809
53031	NC_021848	ATG	2	6	3218698	3218703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959809
53032	NC_021848	GGC	2	6	3218719	3218724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959809
53033	NC_021848	CA	3	6	3218735	3218740	50 %	0 %	0 %	50 %	525959809
53034	NC_021848	AAG	2	6	3218792	3218797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959809
53035	NC_021848	CAA	2	6	3218822	3218827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959809
53036	NC_021848	CTG	2	6	3218855	3218860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959809
53037	NC_021848	CCAA	2	8	3219016	3219023	50 %	0 %	0 %	50 %	525959810
53038	NC_021848	AGC	2	6	3219060	3219065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959810
53039	NC_021848	GAGC	2	8	3219222	3219229	25 %	0 %	50 %	25 %	525959810
53040	NC_021848	AACG	2	8	3219266	3219273	50 %	0 %	25 %	25 %	525959810
53041	NC_021848	AAT	2	6	3219338	3219343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525959810
53042	NC_021848	CAC	2	6	3219464	3219469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959810
53043	NC_021848	TGG	2	6	3219544	3219549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959810
53044	NC_021848	ACA	2	6	3219571	3219576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959810
53045	NC_021848	CAT	2	6	3219659	3219664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959810
53046	NC_021848	CCG	2	6	3219699	3219704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959810
53047	NC_021848	TGC	2	6	3219780	3219785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959810
53048	NC_021848	TGAT	2	8	3219859	3219866	25 %	50 %	25 %	0 %	525959810
53049	NC_021848	TGCG	2	8	3220072	3220079	0 %	25 %	50 %	25 %	525959811
53050	NC_021848	CGCT	2	8	3220166	3220173	0 %	25 %	25 %	50 %	525959811
53051	NC_021848	CTG	2	6	3220180	3220185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959811
53052	NC_021848	TCT	2	6	3220365	3220370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959811
53053	NC_021848	CG	3	6	3220445	3220450	0 %	0 %	50 %	50 %	525959811
53054	NC_021848	TGC	2	6	3220451	3220456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959811
53055	NC_021848	GAGC	2	8	3220474	3220481	25 %	0 %	50 %	25 %	525959811
53056	NC_021848	GGTT	2	8	3220483	3220490	0 %	50 %	50 %	0 %	525959811
53057	NC_021848	TCAC	2	8	3220575	3220582	25 %	25 %	0 %	50 %	525959811
53058	NC_021848	CA	3	6	3220640	3220645	50 %	0 %	0 %	50 %	525959811
53059	NC_021848	TTG	2	6	3220757	3220762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959811
53060	NC_021848	GCC	2	6	3220779	3220784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959811
53061	NC_021848	TGT	2	6	3220806	3220811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959811
53062	NC_021848	CTG	2	6	3220826	3220831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959811
53063	NC_021848	CGA	2	6	3220840	3220845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959811
53064	NC_021848	T	6	6	3220848	3220853	0 %	100 %	0 %	0 %	525959811
53065	NC_021848	ATTG	2	8	3220857	3220864	25 %	50 %	25 %	0 %	525959811
53066	NC_021848	CGTG	2	8	3220888	3220895	0 %	25 %	50 %	25 %	525959811
53067	NC_021848	TCACCT	2	12	3220947	3220958	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525959811
53068	NC_021848	AG	3	6	3220970	3220975	50 %	0 %	50 %	0 %	525959811
53069	NC_021848	GTA	2	6	3221002	3221007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959811
53070	NC_021848	GAT	2	6	3221039	3221044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959811
53071	NC_021848	TTTG	2	8	3221110	3221117	0 %	75 %	25 %	0 %	525959811
53072	NC_021848	ACG	2	6	3221124	3221129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959811
53073	NC_021848	ATAA	2	8	3221165	3221172	75 %	25 %	0 %	0 %	525959811
53074	NC_021848	TGT	2	6	3221217	3221222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959811
53075	NC_021848	CG	3	6	3221242	3221247	0 %	0 %	50 %	50 %	525959811
53076	NC_021848	GTG	2	6	3221265	3221270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959811
53077	NC_021848	CGA	2	6	3221305	3221310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959811
53078	NC_021848	TTG	2	6	3221316	3221321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959811
53079	NC_021848	CCA	2	6	3221326	3221331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959811
53080	NC_021848	GTT	2	6	3221345	3221350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959811
53081	NC_021848	TGA	2	6	3221377	3221382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959811
53082	NC_021848	TTGT	2	8	3221417	3221424	0 %	75 %	25 %	0 %	525959811
53083	NC_021848	AG	3	6	3221615	3221620	50 %	0 %	50 %	0 %	525959811
53084	NC_021848	CG	3	6	3221630	3221635	0 %	0 %	50 %	50 %	525959811
53085	NC_021848	CAT	2	6	3221662	3221667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959811
53086	NC_021848	GAT	2	6	3221678	3221683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959811
53087	NC_021848	CAT	2	6	3221699	3221704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959811
53088	NC_021848	TTC	2	6	3221792	3221797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959811
53089	NC_021848	AGA	2	6	3222165	3222170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959812
53090	NC_021848	ATG	2	6	3222215	3222220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959812
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53092	NC_021848	TGC	2	6	3222391	3222396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959812
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53095	NC_021848	CAAC	2	8	3222451	3222458	50 %	0 %	0 %	50 %	525959812
53096	NC_021848	AC	3	6	3222457	3222462	50 %	0 %	0 %	50 %	525959812
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53099	NC_021848	CAAC	2	8	3222579	3222586	50 %	0 %	0 %	50 %	525959812
53100	NC_021848	CTT	2	6	3222618	3222623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959812
53101	NC_021848	ATG	2	6	3222629	3222634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959812
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53103	NC_021848	CGA	2	6	3222669	3222674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959812
53104	NC_021848	CGTA	2	8	3222675	3222682	25 %	25 %	25 %	25 %	525959812
53105	NC_021848	TGG	2	6	3222699	3222704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959812
53106	NC_021848	ACC	2	6	3222743	3222748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959812
53107	NC_021848	GC	3	6	3222752	3222757	0 %	0 %	50 %	50 %	525959812
53108	NC_021848	GCTC	2	8	3222801	3222808	0 %	25 %	25 %	50 %	525959812
53109	NC_021848	CAT	3	9	3222874	3222882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959812
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53111	NC_021848	CAT	2	6	3223066	3223071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959812
53112	NC_021848	GTT	2	6	3223076	3223081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959812
53113	NC_021848	ATG	2	6	3223136	3223141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959812
53114	NC_021848	CGAG	2	8	3223178	3223185	25 %	0 %	50 %	25 %	525959812
53115	NC_021848	GTT	2	6	3223186	3223191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959812
53116	NC_021848	GCC	2	6	3223231	3223236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959812
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53121	NC_021848	GCA	2	6	3223430	3223435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959812
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53124	NC_021848	CAT	2	6	3223504	3223509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959812
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53217	NC_021848	TGG	2	6	3231160	3231165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959818
53218	NC_021848	TCG	2	6	3231193	3231198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959818
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53224	NC_021848	AAG	2	6	3231579	3231584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959818
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53229	NC_021848	GGT	2	6	3231796	3231801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959818
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53231	NC_021848	CTGT	2	8	3231890	3231897	0 %	50 %	25 %	25 %	525959818
53232	NC_021848	AATA	2	8	3231905	3231912	75 %	25 %	0 %	0 %	525959818
53233	NC_021848	CAAG	2	8	3232017	3232024	50 %	0 %	25 %	25 %	525959818
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53340	NC_021848	GTA	2	6	3237587	3237592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959823
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53344	NC_021848	TTG	2	6	3237819	3237824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959823
53345	NC_021848	TGA	2	6	3237874	3237879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959823
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53465	NC_021848	TGG	2	6	3244810	3244815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959830
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53483	NC_021848	TGA	2	6	3245812	3245817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959830
53484	NC_021848	CTT	2	6	3245917	3245922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959830
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53491	NC_021848	GC	4	8	3246242	3246249	0 %	0 %	50 %	50 %	525959830
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53493	NC_021848	AAG	2	6	3246341	3246346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959830
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