MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome I

Total Repeats: 54922

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52001	NC_021848	AGC	2	6	3159173	3159178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959760
52002	NC_021848	GGC	2	6	3159197	3159202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525959760
52003	NC_021848	GA	3	6	3159236	3159241	50 %	0 %	50 %	0 %	525959760
52004	NC_021848	TGC	2	6	3159323	3159328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959760
52005	NC_021848	GGT	3	9	3159345	3159353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525959760
52006	NC_021848	GT	3	6	3159358	3159363	0 %	50 %	50 %	0 %	525959760
52007	NC_021848	ATG	2	6	3159423	3159428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959760
52008	NC_021848	TA	3	6	3159651	3159656	50 %	50 %	0 %	0 %	525959760
52009	NC_021848	TGA	2	6	3159668	3159673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959760
52010	NC_021848	GAG	2	6	3159679	3159684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525959760
52011	NC_021848	ATG	2	6	3159708	3159713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959760
52012	NC_021848	ATG	2	6	3159757	3159762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959760
52013	NC_021848	GCA	2	6	3159816	3159821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959760
52014	NC_021848	CAT	2	6	3160048	3160053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959761
52015	NC_021848	TGC	2	6	3160057	3160062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959761
52016	NC_021848	ATG	2	6	3160316	3160321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959762
52017	NC_021848	ACTC	2	8	3160397	3160404	25 %	25 %	0 %	50 %	525959762
52018	NC_021848	CG	3	6	3160444	3160449	0 %	0 %	50 %	50 %	525959762
52019	NC_021848	GAC	2	6	3160592	3160597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959762
52020	NC_021848	TACA	2	8	3160753	3160760	50 %	25 %	0 %	25 %	525959762
52021	NC_021848	TGT	2	6	3160838	3160843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959762
52022	NC_021848	CTT	2	6	3160959	3160964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959762
52023	NC_021848	T	7	7	3160971	3160977	0 %	100 %	0 %	0 %	525959762
52024	NC_021848	GAT	2	6	3161001	3161006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959762
52025	NC_021848	TTCGAC	2	12	3161119	3161130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525959762
52026	NC_021848	CAT	2	6	3161157	3161162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959762
52027	NC_021848	TCA	2	6	3161287	3161292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959762
52028	NC_021848	TCA	2	6	3161489	3161494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959763
52029	NC_021848	CAA	2	6	3161622	3161627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959763
52030	NC_021848	TGGT	2	8	3161650	3161657	0 %	50 %	50 %	0 %	525959763
52031	NC_021848	GTT	2	6	3161873	3161878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959763
52032	NC_021848	AGTACC	2	12	3161884	3161895	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525959763
52033	NC_021848	TCCA	2	8	3162005	3162012	25 %	25 %	0 %	50 %	525959763
52034	NC_021848	TTGC	2	8	3162077	3162084	0 %	50 %	25 %	25 %	525959763
52035	NC_021848	GAT	2	6	3162097	3162102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959763
52036	NC_021848	ACAG	2	8	3162218	3162225	50 %	0 %	25 %	25 %	525959763
52037	NC_021848	TTTGA	2	10	3162289	3162298	20 %	60 %	20 %	0 %	525959763
52038	NC_021848	TCT	2	6	3162457	3162462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959764
52039	NC_021848	CCG	2	6	3162483	3162488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959764
52040	NC_021848	TCA	2	6	3162501	3162506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959764
52041	NC_021848	GAT	2	6	3162551	3162556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959764
52042	NC_021848	GCC	2	6	3162698	3162703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959764
52043	NC_021848	TCT	2	6	3162756	3162761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959764
52044	NC_021848	CTG	2	6	3162832	3162837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959764
52045	NC_021848	GGAGCT	2	12	3163047	3163058	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525959764
52046	NC_021848	ACT	2	6	3163065	3163070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959764
52047	NC_021848	GAC	2	6	3163078	3163083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959764
52048	NC_021848	ACGTG	2	10	3163155	3163164	20 %	20 %	40 %	20 %	525959764
52049	NC_021848	GTT	2	6	3163199	3163204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525959764
52050	NC_021848	TGC	2	6	3163208	3163213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959764
52051	NC_021848	CCG	4	12	3163287	3163298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959764
52052	NC_021848	TGA	2	6	3163309	3163314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959764
52053	NC_021848	TCG	2	6	3163359	3163364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959764
52054	NC_021848	T	6	6	3163409	3163414	0 %	100 %	0 %	0 %	525959764
52055	NC_021848	CAT	2	6	3163445	3163450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959764
52056	NC_021848	AAG	2	6	3163530	3163535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959764
52057	NC_021848	CTG	2	6	3163573	3163578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959764
52058	NC_021848	ATG	2	6	3163584	3163589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959764
52059	NC_021848	AC	3	6	3163634	3163639	50 %	0 %	0 %	50 %	525959764
52060	NC_021848	AGT	2	6	3163653	3163658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959764
52061	NC_021848	GAA	2	6	3163729	3163734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959764
52062	NC_021848	ACT	2	6	3163767	3163772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959764
52063	NC_021848	AAC	2	6	3163864	3163869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959765
52064	NC_021848	TCA	2	6	3163896	3163901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959765
52065	NC_021848	ACCA	2	8	3164002	3164009	50 %	0 %	0 %	50 %	525959765
52066	NC_021848	GCT	3	9	3164042	3164050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959765
52067	NC_021848	GCT	2	6	3164060	3164065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959765
52068	NC_021848	TGC	2	6	3164083	3164088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959765
52069	NC_021848	TGC	2	6	3164101	3164106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959765
52070	NC_021848	GCT	2	6	3164114	3164119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959765
52071	NC_021848	GCT	2	6	3164141	3164146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959765
52072	NC_021848	GAC	2	6	3164154	3164159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959765
52073	NC_021848	AACT	2	8	3164218	3164225	50 %	25 %	0 %	25 %	525959765
52074	NC_021848	CTT	2	6	3164233	3164238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959765
52075	NC_021848	TCTTT	2	10	3164256	3164265	0 %	80 %	0 %	20 %	525959765
52076	NC_021848	CAGA	2	8	3164347	3164354	50 %	0 %	25 %	25 %	525959766
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52079	NC_021848	GTGA	2	8	3164519	3164526	25 %	25 %	50 %	0 %	525959766
52080	NC_021848	AGC	2	6	3164528	3164533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959766
52081	NC_021848	TGA	4	12	3164539	3164550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959766
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52086	NC_021848	ACG	2	6	3165183	3165188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959767
52087	NC_021848	AG	3	6	3165217	3165222	50 %	0 %	50 %	0 %	525959767
52088	NC_021848	CTT	2	6	3165287	3165292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959767
52089	NC_021848	CAA	2	6	3165377	3165382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525959767
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52098	NC_021848	ATG	2	6	3165877	3165882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959767
52099	NC_021848	TGGT	2	8	3166134	3166141	0 %	50 %	50 %	0 %	525959767
52100	NC_021848	GCA	2	6	3166168	3166173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959767
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52103	NC_021848	CCA	2	6	3166314	3166319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959767
52104	NC_021848	GCC	2	6	3166350	3166355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525959767
52105	NC_021848	AGTG	2	8	3166404	3166411	25 %	25 %	50 %	0 %	525959767
52106	NC_021848	GAT	2	6	3166497	3166502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959767
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52108	NC_021848	GCT	2	6	3166588	3166593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959767
52109	NC_021848	AC	3	6	3166617	3166622	50 %	0 %	0 %	50 %	525959767
52110	NC_021848	CTT	2	6	3166676	3166681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959767
52111	NC_021848	GTC	2	6	3166710	3166715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959767
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52114	NC_021848	CGT	2	6	3166748	3166753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959767
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52463	NC_021848	GCT	5	15	3184872	3184886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959779
52464	NC_021848	ACG	2	6	3184977	3184982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959779
52465	NC_021848	T	7	7	3185015	3185021	0 %	100 %	0 %	0 %	525959779
52466	NC_021848	GCA	2	6	3185223	3185228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525959779
52467	NC_021848	GTAGA	2	10	3185350	3185359	40 %	20 %	40 %	0 %	525959779
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52469	NC_021848	ATCCA	2	10	3185472	3185481	40 %	20 %	0 %	40 %	525959779
52470	NC_021848	ACC	2	6	3185483	3185488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959779
52471	NC_021848	TGC	2	6	3185501	3185506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959779
52472	NC_021848	ATG	2	6	3185526	3185531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959779
52473	NC_021848	GCTTG	2	10	3185559	3185568	0 %	40 %	40 %	20 %	525959779
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52480	NC_021848	CA	3	6	3186141	3186146	50 %	0 %	0 %	50 %	525959780
52481	NC_021848	GTA	2	6	3186155	3186160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959780
52482	NC_021848	GA	3	6	3186161	3186166	50 %	0 %	50 %	0 %	525959780
52483	NC_021848	TAGCTG	2	12	3186210	3186221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525959780
52484	NC_021848	CTG	2	6	3186230	3186235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525959780
52485	NC_021848	GAAA	2	8	3186237	3186244	75 %	0 %	25 %	0 %	525959780
52486	NC_021848	TAC	2	6	3186285	3186290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525959780
52487	NC_021848	GAA	2	6	3186328	3186333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959780
52488	NC_021848	AGGT	2	8	3186348	3186355	25 %	25 %	50 %	0 %	525959780
52489	NC_021848	CG	3	6	3186372	3186377	0 %	0 %	50 %	50 %	525959780
52490	NC_021848	AGA	2	6	3186384	3186389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525959780
52491	NC_021848	GC	3	6	3186443	3186448	0 %	0 %	50 %	50 %	525959780
52492	NC_021848	CAC	2	6	3186467	3186472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525959780
52493	NC_021848	TCT	2	6	3186496	3186501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525959780
52494	NC_021848	GT	3	6	3186569	3186574	0 %	50 %	50 %	0 %	525959780
52495	NC_021848	TAG	2	6	3186615	3186620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525959780
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