MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 55669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021847	ACC	2	6	197315	197320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950042
3002	NC_021847	TCG	2	6	197359	197364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950042
3003	NC_021847	CTG	2	6	197371	197376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950042
3004	NC_021847	GAA	2	6	197399	197404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950042
3005	NC_021847	AATAGC	2	12	197429	197440	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525950042
3006	NC_021847	TAA	2	6	197466	197471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950042
3007	NC_021847	ACC	2	6	197528	197533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950042
3008	NC_021847	AAAC	2	8	197566	197573	75 %	0 %	0 %	25 %	525950042
3009	NC_021847	CAGC	2	8	197603	197610	25 %	0 %	25 %	50 %	525950042
3010	NC_021847	GCTAG	2	10	197637	197646	20 %	20 %	40 %	20 %	525950042
3011	NC_021847	CAT	2	6	197672	197677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950042
3012	NC_021847	T	7	7	197716	197722	0 %	100 %	0 %	0 %	525950042
3013	NC_021847	AATC	2	8	198465	198472	50 %	25 %	0 %	25 %	525950043
3014	NC_021847	CAG	2	6	198508	198513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950043
3015	NC_021847	CAT	2	6	198739	198744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950043
3016	NC_021847	GTT	2	6	198774	198779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950043
3017	NC_021847	CTTT	2	8	198789	198796	0 %	75 %	0 %	25 %	525950043
3018	NC_021847	GA	3	6	198802	198807	50 %	0 %	50 %	0 %	525950043
3019	NC_021847	TTG	2	6	199066	199071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950043
3020	NC_021847	GAC	2	6	199110	199115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950043
3021	NC_021847	ACA	2	6	199119	199124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950043
3022	NC_021847	ACG	2	6	199230	199235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950043
3023	NC_021847	CTT	2	6	199237	199242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950043
3024	NC_021847	CAC	2	6	199426	199431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950043
3025	NC_021847	TCA	2	6	199458	199463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950043
3026	NC_021847	ATTTT	2	10	199484	199493	20 %	80 %	0 %	0 %	525950043
3027	NC_021847	T	8	8	199490	199497	0 %	100 %	0 %	0 %	525950043
3028	NC_021847	TCT	3	9	199589	199597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950043
3029	NC_021847	TTC	2	6	199600	199605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950043
3030	NC_021847	TTC	2	6	199732	199737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950043
3031	NC_021847	GCA	2	6	199749	199754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950043
3032	NC_021847	CAC	2	6	199783	199788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950043
3033	NC_021847	AAG	2	6	199868	199873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950043
3034	NC_021847	ATTA	2	8	199882	199889	50 %	50 %	0 %	0 %	525950043
3035	NC_021847	TCA	2	6	199937	199942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950043
3036	NC_021847	ATG	2	6	200030	200035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952326
3037	NC_021847	GCC	2	6	200108	200113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525952326
3038	NC_021847	TTAAG	2	10	200126	200135	40 %	40 %	20 %	0 %	525952326
3039	NC_021847	ACT	2	6	200151	200156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950044
3040	NC_021847	TGC	2	6	200161	200166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950044
3041	NC_021847	CAT	2	6	200187	200192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950044
3042	NC_021847	CAT	2	6	200214	200219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950044
3043	NC_021847	TCT	2	6	200223	200228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950044
3044	NC_021847	TCT	2	6	200262	200267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950044
3045	NC_021847	TTCGC	2	10	200449	200458	0 %	40 %	20 %	40 %	525950044
3046	NC_021847	CAC	2	6	200514	200519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950044
3047	NC_021847	ATT	2	6	200607	200612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525952327
3048	NC_021847	T	6	6	200640	200645	0 %	100 %	0 %	0 %	525952327
3049	NC_021847	TAA	2	6	200647	200652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525952327
3050	NC_021847	TTG	2	6	200874	200879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950045
3051	NC_021847	TGG	2	6	200926	200931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950045
3052	NC_021847	ATG	2	6	201002	201007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950045
3053	NC_021847	GGT	2	6	201044	201049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950045
3054	NC_021847	GTC	2	6	201057	201062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3055	NC_021847	GAC	2	6	201074	201079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3056	NC_021847	CAATC	2	10	201100	201109	40 %	20 %	0 %	40 %	525950045
3057	NC_021847	GTT	2	6	201119	201124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950045
3058	NC_021847	AGA	2	6	201157	201162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950045
3059	NC_021847	CAG	2	6	201222	201227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3060	NC_021847	GAA	2	6	201229	201234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950045
3061	NC_021847	GCA	2	6	201347	201352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3062	NC_021847	AC	3	6	201358	201363	50 %	0 %	0 %	50 %	525950045
3063	NC_021847	CGC	2	6	201364	201369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950045
3064	NC_021847	ACT	2	6	201390	201395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950045
3065	NC_021847	TGA	2	6	201436	201441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950045
3066	NC_021847	AG	3	6	201442	201447	50 %	0 %	50 %	0 %	525950045
3067	NC_021847	CAA	2	6	201470	201475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950045
3068	NC_021847	GAA	2	6	201481	201486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950045
3069	NC_021847	CCA	2	6	201514	201519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950045
3070	NC_021847	GCT	2	6	201524	201529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3071	NC_021847	AAG	2	6	201552	201557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950045
3072	NC_021847	ACA	3	9	201603	201611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950045
3073	NC_021847	CGC	2	6	201625	201630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950045
3074	NC_021847	CGG	2	6	201766	201771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950045
3075	NC_021847	CAT	2	6	201772	201777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950045
3076	NC_021847	TTG	2	6	201819	201824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950045
3077	NC_021847	GCG	2	6	201887	201892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950045
3078	NC_021847	AAG	2	6	201893	201898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950045
3079	NC_021847	ACGT	2	8	201900	201907	25 %	25 %	25 %	25 %	525950045
3080	NC_021847	CTA	2	6	201908	201913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950045
3081	NC_021847	GGT	2	6	201968	201973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950045
3082	NC_021847	GAC	2	6	202013	202018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3083	NC_021847	AGA	3	9	202048	202056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950045
3084	NC_021847	CTG	2	6	202075	202080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3085	NC_021847	GCAG	2	8	202223	202230	25 %	0 %	50 %	25 %	525950045
3086	NC_021847	TTC	2	6	202250	202255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950045
3087	NC_021847	GCA	2	6	202280	202285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3088	NC_021847	GAC	2	6	202331	202336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3089	NC_021847	GCA	3	9	202346	202354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950045
3090	NC_021847	GAT	2	6	202372	202377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950045
3091	NC_021847	AGA	2	6	202712	202717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950046
3092	NC_021847	TTG	2	6	202729	202734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950046
3093	NC_021847	CGCAG	2	10	202853	202862	20 %	0 %	40 %	40 %	525950046
3094	NC_021847	GCTT	2	8	202955	202962	0 %	50 %	25 %	25 %	525950046
3095	NC_021847	CGTG	2	8	202964	202971	0 %	25 %	50 %	25 %	525950046
3096	NC_021847	GTG	2	6	202989	202994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950046
3097	NC_021847	TGC	2	6	203009	203014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950046
3098	NC_021847	AGA	2	6	203045	203050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950046
3099	NC_021847	GCAG	2	8	203100	203107	25 %	0 %	50 %	25 %	525950046
3100	NC_021847	GAA	2	6	203139	203144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950046
3101	NC_021847	CCA	2	6	203191	203196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950046
3102	NC_021847	CAT	2	6	203300	203305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950046
3103	NC_021847	GAA	2	6	203307	203312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950046
3104	NC_021847	TGGCA	2	10	203333	203342	20 %	20 %	40 %	20 %	525950046
3105	NC_021847	TGA	2	6	203383	203388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950046
3106	NC_021847	ATG	2	6	203460	203465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950046
3107	NC_021847	AGC	2	6	203498	203503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950046
3108	NC_021847	CGA	2	6	203507	203512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950046
3109	NC_021847	AGC	2	6	203570	203575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950046
3110	NC_021847	CAG	2	6	203587	203592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950046
3111	NC_021847	ACA	2	6	203596	203601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950046
3112	NC_021847	GCCT	2	8	203620	203627	0 %	25 %	25 %	50 %	525950046
3113	NC_021847	TGG	2	6	203699	203704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950046
3114	NC_021847	TG	3	6	203713	203718	0 %	50 %	50 %	0 %	525950046
3115	NC_021847	CAA	2	6	203751	203756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950046
3116	NC_021847	TCGC	2	8	203830	203837	0 %	25 %	25 %	50 %	525950046
3117	NC_021847	ATA	2	6	203849	203854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950046
3118	NC_021847	AGT	2	6	203979	203984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952328
3119	NC_021847	CAT	2	6	203985	203990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952328
3120	NC_021847	ACC	2	6	204011	204016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525952328
3121	NC_021847	CAA	2	6	204039	204044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952328
3122	NC_021847	GAT	2	6	204065	204070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525952328
3123	NC_021847	CGA	2	6	204078	204083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525952328
3124	NC_021847	CAA	2	6	204210	204215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952328
3125	NC_021847	CAT	2	6	204219	204224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952328
3126	NC_021847	TTA	2	6	204317	204322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525952328
3127	NC_021847	ACT	2	6	204508	204513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525952328
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3129	NC_021847	AGG	2	6	204608	204613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525952328
3130	NC_021847	AGTGA	2	10	204614	204623	40 %	20 %	40 %	0 %	525952328
3131	NC_021847	T	6	6	204631	204636	0 %	100 %	0 %	0 %	525952328
3132	NC_021847	GCT	2	6	204731	204736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950047
3133	NC_021847	GGT	2	6	204789	204794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950047
3134	NC_021847	AGC	2	6	204880	204885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950047
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3136	NC_021847	TAC	2	6	205275	205280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950048
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3138	NC_021847	CTG	3	9	205329	205337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950048
3139	NC_021847	AGC	2	6	205338	205343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950048
3140	NC_021847	GCA	2	6	205421	205426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950048
3141	NC_021847	CAG	2	6	205428	205433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950048
3142	NC_021847	GGC	2	6	205441	205446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950048
3143	NC_021847	CGT	2	6	205447	205452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950048
3144	NC_021847	TCT	2	6	205476	205481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950048
3145	NC_021847	CTG	2	6	205482	205487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950048
3146	NC_021847	TC	3	6	205510	205515	0 %	50 %	0 %	50 %	525950048
3147	NC_021847	CAG	2	6	205566	205571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950048
3148	NC_021847	CGG	2	6	205572	205577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950048
3149	NC_021847	TGA	2	6	205678	205683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950048
3150	NC_021847	GTG	2	6	205716	205721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950048
3151	NC_021847	CA	3	6	205783	205788	50 %	0 %	0 %	50 %	525950048
3152	NC_021847	TGT	2	6	205807	205812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950048
3153	NC_021847	CAA	2	6	205827	205832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950048
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3157	NC_021847	AAC	2	6	205974	205979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950048
3158	NC_021847	TCCAA	2	10	205996	206005	40 %	20 %	0 %	40 %	525950048
3159	NC_021847	ATG	2	6	206048	206053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950048
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3165	NC_021847	GAC	3	9	206252	206260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950048
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3169	NC_021847	GTCA	2	8	206569	206576	25 %	25 %	25 %	25 %	525952329
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3192	NC_021847	TTG	2	6	208219	208224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950049
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3203	NC_021847	TTG	2	6	209029	209034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950050
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3223	NC_021847	GCC	2	6	210369	210374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950052
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3226	NC_021847	ACTG	2	8	210517	210524	25 %	25 %	25 %	25 %	525950052
3227	NC_021847	CAG	2	6	210582	210587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950052
3228	NC_021847	CAT	2	6	210615	210620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950052
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3230	NC_021847	ACC	2	6	210651	210656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950052
3231	NC_021847	CATT	2	8	210749	210756	25 %	50 %	0 %	25 %	525950052
3232	NC_021847	CAG	2	6	210848	210853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950052
3233	NC_021847	CAGACC	2	12	210861	210872	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525950052
3234	NC_021847	GTAA	2	8	211028	211035	50 %	25 %	25 %	0 %	525950052
3235	NC_021847	CCTG	2	8	211039	211046	0 %	25 %	25 %	50 %	525950052
3236	NC_021847	CAT	2	6	211050	211055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950052
3237	NC_021847	AAG	2	6	211086	211091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950052
3238	NC_021847	CGCA	2	8	211092	211099	25 %	0 %	25 %	50 %	525950052
3239	NC_021847	T	6	6	211111	211116	0 %	100 %	0 %	0 %	525950052
3240	NC_021847	T	6	6	211447	211452	0 %	100 %	0 %	0 %	525950053
3241	NC_021847	AAT	2	6	211522	211527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950053
3242	NC_021847	TAT	2	6	211602	211607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950053
3243	NC_021847	AGT	2	6	211659	211664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950053
3244	NC_021847	TGC	2	6	211673	211678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950053
3245	NC_021847	CTG	3	9	211680	211688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950053
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3250	NC_021847	TGC	2	6	211837	211842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950053
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3253	NC_021847	CTG	2	6	211915	211920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950053
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3261	NC_021847	T	6	6	212326	212331	0 %	100 %	0 %	0 %	525950054
3262	NC_021847	CTT	2	6	212347	212352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950054
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3482	NC_021847	TTAG	2	8	224827	224834	25 %	50 %	25 %	0 %	525950061
3483	NC_021847	TTA	2	6	224845	224850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950062
3484	NC_021847	CAG	2	6	225024	225029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950062
3485	NC_021847	AAG	2	6	225037	225042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950062
3486	NC_021847	CAG	3	9	225045	225053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950062
3487	NC_021847	ACT	2	6	225104	225109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950062
3488	NC_021847	ATG	2	6	225170	225175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950062
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3490	NC_021847	CAG	2	6	225231	225236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950062
3491	NC_021847	GGC	2	6	225518	225523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525952331
3492	NC_021847	TCT	2	6	225524	225529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952331
3493	NC_021847	CTT	2	6	225539	225544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952331
3494	NC_021847	GAG	2	6	225623	225628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525952331
3495	NC_021847	CTT	2	6	225668	225673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952331
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