MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 55669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021847	ACCA	2	8	74092	74099	50 %	0 %	0 %	50 %	525949949
1002	NC_021847	ACA	2	6	74100	74105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949949
1003	NC_021847	TGC	2	6	74112	74117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949949
1004	NC_021847	CCAT	2	8	74198	74205	25 %	25 %	0 %	50 %	525949949
1005	NC_021847	ACC	2	6	74303	74308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949949
1006	NC_021847	GCT	2	6	74360	74365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949949
1007	NC_021847	TCA	2	6	74396	74401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949949
1008	NC_021847	CCG	2	6	74432	74437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949949
1009	NC_021847	AACCGC	2	12	74606	74617	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525949950
1010	NC_021847	CGC	3	9	74615	74623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949950
1011	NC_021847	GTC	2	6	74637	74642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949950
1012	NC_021847	CGC	2	6	74654	74659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949950
1013	NC_021847	CAG	2	6	74662	74667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949950
1014	NC_021847	TGATCG	2	12	74677	74688	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525949950
1015	NC_021847	ACC	2	6	74697	74702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949950
1016	NC_021847	ACA	2	6	74703	74708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949950
1017	NC_021847	ACC	2	6	74709	74714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949950
1018	NC_021847	TCT	2	6	74743	74748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949950
1019	NC_021847	CAA	2	6	74822	74827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949950
1020	NC_021847	TCG	2	6	74833	74838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949950
1021	NC_021847	CAG	2	6	74936	74941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949950
1022	NC_021847	CGT	2	6	74960	74965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949950
1023	NC_021847	GCCA	2	8	75015	75022	25 %	0 %	25 %	50 %	525949950
1024	NC_021847	GTT	2	6	75060	75065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525949950
1025	NC_021847	ACT	2	6	75112	75117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949950
1026	NC_021847	CAT	2	6	75129	75134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949950
1027	NC_021847	CAA	2	6	75155	75160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949950
1028	NC_021847	GCT	2	6	75339	75344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949951
1029	NC_021847	CCA	2	6	75394	75399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949951
1030	NC_021847	GCTG	2	8	75414	75421	0 %	25 %	50 %	25 %	525949951
1031	NC_021847	TAC	2	6	75500	75505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949952
1032	NC_021847	TCT	2	6	75557	75562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949952
1033	NC_021847	CTT	2	6	75576	75581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949952
1034	NC_021847	CTT	2	6	75598	75603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949952
1035	NC_021847	GCA	2	6	75621	75626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949952
1036	NC_021847	AGCAT	2	10	75635	75644	40 %	20 %	20 %	20 %	525949952
1037	NC_021847	GAC	2	6	75717	75722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949952
1038	NC_021847	A	6	6	75740	75745	100 %	0 %	0 %	0 %	525949952
1039	NC_021847	TCA	2	6	75777	75782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949952
1040	NC_021847	CGAG	2	8	75812	75819	25 %	0 %	50 %	25 %	525949952
1041	NC_021847	GCG	2	6	75923	75928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949952
1042	NC_021847	CAA	2	6	75931	75936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949952
1043	NC_021847	A	6	6	75960	75965	100 %	0 %	0 %	0 %	525949952
1044	NC_021847	TGGC	2	8	75998	76005	0 %	25 %	50 %	25 %	525949952
1045	NC_021847	ATG	2	6	76088	76093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949952
1046	NC_021847	GAC	2	6	76101	76106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949952
1047	NC_021847	CT	3	6	76130	76135	0 %	50 %	0 %	50 %	525949952
1048	NC_021847	CTT	2	6	76165	76170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949952
1049	NC_021847	CAA	2	6	76180	76185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949952
1050	NC_021847	CAC	2	6	76213	76218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949952
1051	NC_021847	CAA	2	6	76222	76227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949952
1052	NC_021847	CTT	2	6	76257	76262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949952
1053	NC_021847	CAC	2	6	76296	76301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949952
1054	NC_021847	GGC	2	6	76315	76320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949952
1055	NC_021847	ACA	2	6	76371	76376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949952
1056	NC_021847	CAC	2	6	76387	76392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949952
1057	NC_021847	CCA	2	6	76401	76406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949952
1058	NC_021847	A	6	6	76474	76479	100 %	0 %	0 %	0 %	525949952
1059	NC_021847	AAG	2	6	76486	76491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949952
1060	NC_021847	CAG	2	6	76549	76554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949952
1061	NC_021847	CAC	2	6	76606	76611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949952
1062	NC_021847	CAC	2	6	76624	76629	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949952
1063	NC_021847	TCA	2	6	76668	76673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949952
1064	NC_021847	ACC	2	6	76708	76713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949952
1065	NC_021847	CAA	2	6	76717	76722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949952
1066	NC_021847	AGC	2	6	76835	76840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949952
1067	NC_021847	CAAA	2	8	76968	76975	75 %	0 %	0 %	25 %	525949952
1068	NC_021847	CCG	2	6	76995	77000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949952
1069	NC_021847	GC	3	6	77016	77021	0 %	0 %	50 %	50 %	525949952
1070	NC_021847	T	6	6	77059	77064	0 %	100 %	0 %	0 %	525949952
1071	NC_021847	CAG	2	6	77092	77097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949952
1072	NC_021847	CAAT	2	8	77169	77176	50 %	25 %	0 %	25 %	525949952
1073	NC_021847	CAA	2	6	77185	77190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949952
1074	NC_021847	CCG	3	9	77244	77252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949952
1075	NC_021847	CCT	2	6	77304	77309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525949953
1076	NC_021847	TCA	2	6	77328	77333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949953
1077	NC_021847	CGA	2	6	77352	77357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949953
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1079	NC_021847	TCCA	2	8	77424	77431	25 %	25 %	0 %	50 %	525949953
1080	NC_021847	GCC	2	6	77448	77453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525949953
1081	NC_021847	CTT	3	9	77518	77526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525949953
1082	NC_021847	ACC	2	6	77528	77533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949953
1083	NC_021847	CAA	2	6	77627	77632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949953
1084	NC_021847	GAT	2	6	77659	77664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949953
1085	NC_021847	CAT	2	6	77677	77682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949953
1086	NC_021847	TCA	2	6	77686	77691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949953
1087	NC_021847	ATC	2	6	77787	77792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949953
1088	NC_021847	GCT	2	6	77862	77867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949953
1089	NC_021847	CTA	2	6	77980	77985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949954
1090	NC_021847	CG	3	6	78013	78018	0 %	0 %	50 %	50 %	525949954
1091	NC_021847	GAA	2	6	78346	78351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949954
1092	NC_021847	TGG	2	6	78368	78373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949954
1093	NC_021847	CCGTGC	2	12	78417	78428	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525949954
1094	NC_021847	TGG	2	6	78495	78500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949954
1095	NC_021847	CTA	2	6	78550	78555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949954
1096	NC_021847	CGA	2	6	78561	78566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949954
1097	NC_021847	ACCA	3	12	78567	78578	50 %	0 %	0 %	50 %	525949954
1098	NC_021847	GCTG	2	8	78611	78618	0 %	25 %	50 %	25 %	525949954
1099	NC_021847	TGATCT	2	12	78638	78649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525949954
1100	NC_021847	CAT	2	6	78687	78692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949954
1101	NC_021847	ACT	2	6	78731	78736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949954
1102	NC_021847	A	6	6	78761	78766	100 %	0 %	0 %	0 %	525949954
1103	NC_021847	TGC	2	6	78770	78775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525949954
1104	NC_021847	CAA	2	6	78796	78801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525949954
1105	NC_021847	GC	3	6	78859	78864	0 %	0 %	50 %	50 %	525949954
1106	NC_021847	GCTGC	2	10	78958	78967	0 %	20 %	40 %	40 %	525949954
1107	NC_021847	ATG	3	9	78979	78987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949954
1108	NC_021847	GAC	2	6	78988	78993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949954
1109	NC_021847	GGC	2	6	79138	79143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525949954
1110	NC_021847	AGA	2	6	79212	79217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949954
1111	NC_021847	GCA	2	6	79227	79232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949954
1112	NC_021847	ATG	2	6	79234	79239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949954
1113	NC_021847	AGC	2	6	79262	79267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949954
1114	NC_021847	TGG	2	6	79338	79343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525949954
1115	NC_021847	CGA	2	6	79404	79409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525949954
1116	NC_021847	ACCA	3	12	79410	79421	50 %	0 %	0 %	50 %	525949954
1117	NC_021847	TTAC	2	8	79503	79510	25 %	50 %	0 %	25 %	525949954
1118	NC_021847	GC	3	6	79512	79517	0 %	0 %	50 %	50 %	525949954
1119	NC_021847	ACC	2	6	79519	79524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525949954
1120	NC_021847	GAT	2	6	79525	79530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949954
1121	NC_021847	ACT	2	6	79583	79588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525949954
1122	NC_021847	CTGA	2	8	79597	79604	25 %	25 %	25 %	25 %	525949954
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1124	NC_021847	AAG	2	6	79625	79630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949954
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1129	NC_021847	GAA	2	6	79891	79896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525949954
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1499	NC_021847	TTA	2	6	101808	101813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525949973
1500	NC_021847	GAT	2	6	101868	101873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525949973

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