MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 55669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021847	ATT	2	6	322634	322639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950136
5002	NC_021847	TGT	2	6	322660	322665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950136
5003	NC_021847	CTGTC	2	10	322684	322693	0 %	40 %	20 %	40 %	525950136
5004	NC_021847	ACT	2	6	322700	322705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950136
5005	NC_021847	ACC	2	6	322726	322731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950136
5006	NC_021847	CAG	2	6	322874	322879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950137
5007	NC_021847	TTG	2	6	322898	322903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950137
5008	NC_021847	TTG	2	6	322958	322963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950137
5009	NC_021847	TTC	2	6	323087	323092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950137
5010	NC_021847	GCGT	2	8	323244	323251	0 %	25 %	50 %	25 %	525950138
5011	NC_021847	CAAT	2	8	323318	323325	50 %	25 %	0 %	25 %	525950138
5012	NC_021847	GCC	2	6	323457	323462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950138
5013	NC_021847	GAC	2	6	323485	323490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950138
5014	NC_021847	GCA	2	6	323501	323506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950138
5015	NC_021847	TCA	2	6	323534	323539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950138
5016	NC_021847	CAC	2	6	323547	323552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950138
5017	NC_021847	CCAG	2	8	323554	323561	25 %	0 %	25 %	50 %	525950138
5018	NC_021847	ACCA	2	8	323577	323584	50 %	0 %	0 %	50 %	525950138
5019	NC_021847	TG	4	8	323594	323601	0 %	50 %	50 %	0 %	525950138
5020	NC_021847	TGA	2	6	323648	323653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950138
5021	NC_021847	TCAT	2	8	323683	323690	25 %	50 %	0 %	25 %	525950138
5022	NC_021847	TCA	2	6	323708	323713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950138
5023	NC_021847	ATGA	2	8	323785	323792	50 %	25 %	25 %	0 %	525950138
5024	NC_021847	ACTT	2	8	323820	323827	25 %	50 %	0 %	25 %	525950138
5025	NC_021847	GGTT	2	8	323855	323862	0 %	50 %	50 %	0 %	525950138
5026	NC_021847	TCA	3	9	323867	323875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950138
5027	NC_021847	ATC	2	6	324016	324021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950138
5028	NC_021847	GCT	2	6	324067	324072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950138
5029	NC_021847	TAGA	2	8	324333	324340	50 %	25 %	25 %	0 %	525950138
5030	NC_021847	CAA	2	6	324378	324383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950138
5031	NC_021847	T	6	6	324393	324398	0 %	100 %	0 %	0 %	525950138
5032	NC_021847	AC	3	6	324419	324424	50 %	0 %	0 %	50 %	525950138
5033	NC_021847	GCTC	2	8	324543	324550	0 %	25 %	25 %	50 %	525950139
5034	NC_021847	AGC	2	6	324612	324617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950139
5035	NC_021847	TGA	2	6	324681	324686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950139
5036	NC_021847	AACACC	2	12	324717	324728	50 %	0 %	0 %	50 %	525950139
5037	NC_021847	AGA	2	6	324795	324800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950139
5038	NC_021847	GTG	2	6	324962	324967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950139
5039	NC_021847	GACATC	2	12	324994	325005	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525950139
5040	NC_021847	CTG	2	6	325024	325029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950139
5041	NC_021847	GAT	2	6	325036	325041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950139
5042	NC_021847	CAT	2	6	325080	325085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950139
5043	NC_021847	ACC	2	6	325094	325099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950139
5044	NC_021847	GTTG	2	8	325178	325185	0 %	50 %	50 %	0 %	525950139
5045	NC_021847	GCC	2	6	325255	325260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950139
5046	NC_021847	TGG	2	6	325337	325342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950139
5047	NC_021847	CAGAGA	2	12	325395	325406	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525950139
5048	NC_021847	GAT	2	6	325437	325442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950139
5049	NC_021847	A	6	6	325448	325453	100 %	0 %	0 %	0 %	525950139
5050	NC_021847	CAACA	2	10	325723	325732	60 %	0 %	0 %	40 %	525950140
5051	NC_021847	CA	3	6	325848	325853	50 %	0 %	0 %	50 %	525950140
5052	NC_021847	TTG	2	6	325871	325876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950140
5053	NC_021847	GTT	2	6	325920	325925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950140
5054	NC_021847	GAA	2	6	325945	325950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950140
5055	NC_021847	ATTGG	2	10	325956	325965	20 %	40 %	40 %	0 %	525950140
5056	NC_021847	TC	3	6	326079	326084	0 %	50 %	0 %	50 %	525950140
5057	NC_021847	TGA	2	6	326097	326102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950140
5058	NC_021847	TCAA	2	8	326169	326176	50 %	25 %	0 %	25 %	525950140
5059	NC_021847	TCA	2	6	326237	326242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950140
5060	NC_021847	TTG	2	6	326259	326264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950140
5061	NC_021847	ACGT	2	8	326273	326280	25 %	25 %	25 %	25 %	525950140
5062	NC_021847	TTC	2	6	326324	326329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950140
5063	NC_021847	CGCT	2	8	326364	326371	0 %	25 %	25 %	50 %	525950140
5064	NC_021847	CTG	2	6	326375	326380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950140
5065	NC_021847	TCA	2	6	326415	326420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950140
5066	NC_021847	AGTT	2	8	326504	326511	25 %	50 %	25 %	0 %	525950140
5067	NC_021847	TTA	2	6	326534	326539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950140
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5070	NC_021847	GGC	2	6	326776	326781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950140
5071	NC_021847	TGC	2	6	326784	326789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950140
5072	NC_021847	AACC	2	8	326812	326819	50 %	0 %	0 %	50 %	525950140
5073	NC_021847	AC	3	6	326843	326848	50 %	0 %	0 %	50 %	525950140
5074	NC_021847	TTG	2	6	326855	326860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950140
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5078	NC_021847	TTG	2	6	327401	327406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950140
5079	NC_021847	TCT	2	6	327708	327713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950141
5080	NC_021847	GTTCCA	2	12	327751	327762	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525950141
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5085	NC_021847	ATG	2	6	328193	328198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950141
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5088	NC_021847	AG	3	6	328529	328534	50 %	0 %	50 %	0 %	525950141
5089	NC_021847	CAG	3	9	328624	328632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950141
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5091	NC_021847	CAA	2	6	329017	329022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950142
5092	NC_021847	AAT	2	6	329042	329047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950142
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5094	NC_021847	CTT	2	6	329128	329133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950142
5095	NC_021847	TCGGG	2	10	329248	329257	0 %	20 %	60 %	20 %	525950142
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5102	NC_021847	CAC	2	6	329872	329877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950144
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5104	NC_021847	CAC	2	6	330029	330034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950144
5105	NC_021847	TGC	2	6	330072	330077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950144
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5107	NC_021847	AGC	2	6	330106	330111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950144
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5109	NC_021847	CCAA	2	8	330161	330168	50 %	0 %	0 %	50 %	525950144
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5111	NC_021847	TTGA	2	8	330212	330219	25 %	50 %	25 %	0 %	525950144
5112	NC_021847	ATTGA	2	10	330333	330342	40 %	40 %	20 %	0 %	525950144
5113	NC_021847	GCT	2	6	330352	330357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950144
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5118	NC_021847	TGC	2	6	330494	330499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950144
5119	NC_021847	ACCCA	2	10	330503	330512	40 %	0 %	0 %	60 %	525950144
5120	NC_021847	GAAT	2	8	330601	330608	50 %	25 %	25 %	0 %	525950144
5121	NC_021847	TCC	2	6	330631	330636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525950145
5122	NC_021847	TCA	2	6	330662	330667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950145
5123	NC_021847	ACC	2	6	330724	330729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950145
5124	NC_021847	CCA	2	6	330784	330789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950145
5125	NC_021847	TTTG	2	8	330890	330897	0 %	75 %	25 %	0 %	525950145
5126	NC_021847	GTG	2	6	330898	330903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950145
5127	NC_021847	GCA	2	6	330956	330961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950145
5128	NC_021847	ATA	2	6	330966	330971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950145
5129	NC_021847	AAT	2	6	331091	331096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950145
5130	NC_021847	TAA	2	6	331100	331105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950145
5131	NC_021847	GAC	2	6	331124	331129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950145
5132	NC_021847	CG	3	6	331140	331145	0 %	0 %	50 %	50 %	525950145
5133	NC_021847	CTG	2	6	331152	331157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950145
5134	NC_021847	CAA	2	6	331218	331223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950145
5135	NC_021847	CGT	2	6	331241	331246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950145
5136	NC_021847	TGA	2	6	331311	331316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950145
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5138	NC_021847	CTG	2	6	331392	331397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950145
5139	NC_021847	TAA	2	6	331415	331420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950145
5140	NC_021847	GC	4	8	331447	331454	0 %	0 %	50 %	50 %	525950145
5141	NC_021847	AGCA	2	8	331488	331495	50 %	0 %	25 %	25 %	525950145
5142	NC_021847	TAGAAG	2	12	331544	331555	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525950145
5143	NC_021847	TCA	2	6	331576	331581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950145
5144	NC_021847	ATC	2	6	331635	331640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950145
5145	NC_021847	GTT	2	6	331688	331693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950145
5146	NC_021847	GTA	2	6	331725	331730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950145
5147	NC_021847	ACGT	2	8	331761	331768	25 %	25 %	25 %	25 %	525950145
5148	NC_021847	ATCAG	2	10	331771	331780	40 %	20 %	20 %	20 %	525950145
5149	NC_021847	TCA	2	6	331852	331857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950145
5150	NC_021847	CAA	2	6	331881	331886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950145
5151	NC_021847	CTG	2	6	331893	331898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950145
5152	NC_021847	ACG	3	9	331922	331930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950145
5153	NC_021847	CTT	2	6	332018	332023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950146
5154	NC_021847	CTT	2	6	332113	332118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950146
5155	NC_021847	TCA	2	6	332199	332204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950146
5156	NC_021847	GCA	2	6	332331	332336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950146
5157	NC_021847	TCT	2	6	332376	332381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950146
5158	NC_021847	ACA	2	6	332422	332427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950146
5159	NC_021847	ACCA	2	8	332440	332447	50 %	0 %	0 %	50 %	525950146
5160	NC_021847	ATC	2	6	332448	332453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950146
5161	NC_021847	ATG	2	6	332607	332612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950146
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5167	NC_021847	CTGCT	2	10	332927	332936	0 %	40 %	20 %	40 %	525950146
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5190	NC_021847	TGC	2	6	334315	334320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950147
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5204	NC_021847	CTTC	2	8	342135	342142	0 %	50 %	0 %	50 %	525950148
5205	NC_021847	TCT	2	6	342162	342167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950148
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5364	NC_021847	TGC	2	6	350026	350031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952346
5365	NC_021847	CTT	2	6	350063	350068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952346
5366	NC_021847	CTG	2	6	350148	350153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952346
5367	NC_021847	ACA	2	6	350174	350179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525952346
5368	NC_021847	TTGGG	2	10	350235	350244	0 %	40 %	60 %	0 %	525952346
5369	NC_021847	AC	3	6	350306	350311	50 %	0 %	0 %	50 %	525952346
5370	NC_021847	GCC	2	6	350347	350352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525952346
5371	NC_021847	GCT	2	6	350361	350366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525952346
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5374	NC_021847	TCT	2	6	350422	350427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525952346
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5376	NC_021847	GTCT	2	8	350762	350769	0 %	50 %	25 %	25 %	525950154
5377	NC_021847	CAA	2	6	350938	350943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950155
5378	NC_021847	TGA	2	6	350983	350988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950155
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5382	NC_021847	GTTT	2	8	351203	351210	0 %	75 %	25 %	0 %	525950156
5383	NC_021847	GTT	2	6	351256	351261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950156
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5386	NC_021847	TCAG	2	8	351375	351382	25 %	25 %	25 %	25 %	525950156
5387	NC_021847	CCAAA	2	10	351406	351415	60 %	0 %	0 %	40 %	525950156
5388	NC_021847	AATA	2	8	351420	351427	75 %	25 %	0 %	0 %	525950156
5389	NC_021847	AAG	2	6	351680	351685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950157
5390	NC_021847	CAA	2	6	351700	351705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950157
5391	NC_021847	CTG	2	6	351756	351761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950157
5392	NC_021847	GC	3	6	351852	351857	0 %	0 %	50 %	50 %	525950157
5393	NC_021847	AAG	2	6	351905	351910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950157
5394	NC_021847	AATG	2	8	351925	351932	50 %	25 %	25 %	0 %	525950157
5395	NC_021847	TCG	2	6	351953	351958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950157
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5399	NC_021847	AAT	2	6	352117	352122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525950157
5400	NC_021847	AGT	2	6	352201	352206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950157
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5402	NC_021847	CGT	2	6	352899	352904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950158
5403	NC_021847	ACT	2	6	352948	352953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950158
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5423	NC_021847	CAACC	2	10	353895	353904	40 %	0 %	0 %	60 %	525950159
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5428	NC_021847	CTG	2	6	354242	354247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950159
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5456	NC_021847	GTAATG	2	12	355600	355611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950159
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5462	NC_021847	TCG	2	6	356055	356060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950160
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5466	NC_021847	TGT	2	6	356380	356385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950160
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5468	NC_021847	TGT	2	6	356466	356471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950160
5469	NC_021847	AGA	2	6	356476	356481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950160
5470	NC_021847	CAA	2	6	356489	356494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950160
5471	NC_021847	CAACG	2	10	356518	356527	40 %	0 %	20 %	40 %	525950160
5472	NC_021847	GACC	2	8	356542	356549	25 %	0 %	25 %	50 %	525950160
5473	NC_021847	ACA	2	6	356577	356582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950160
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5477	NC_021847	CAC	2	6	356706	356711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950160
5478	NC_021847	GGC	3	9	356735	356743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950160
5479	NC_021847	CTA	2	6	356779	356784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950160
5480	NC_021847	CCA	2	6	356785	356790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950160
5481	NC_021847	TCG	2	6	356844	356849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950160
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5483	NC_021847	TGA	2	6	356959	356964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950160
5484	NC_021847	AAG	2	6	356967	356972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950160
5485	NC_021847	TGG	2	6	357083	357088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950160
5486	NC_021847	CTAC	2	8	357163	357170	25 %	25 %	0 %	50 %	525950160
5487	NC_021847	CTT	2	6	357214	357219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950160
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5490	NC_021847	GTG	2	6	357476	357481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950160
5491	NC_021847	TTCGA	2	10	357506	357515	20 %	40 %	20 %	20 %	525950160
5492	NC_021847	TCA	2	6	357516	357521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950160
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