MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:Kuk str. FDA_R31 chromosome I

Total Repeats: 55669

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021847	GTC	2	6	289292	289297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
4502	NC_021847	CGT	2	6	289357	289362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
4503	NC_021847	GC	3	6	289450	289455	0 %	0 %	50 %	50 %	525950113
4504	NC_021847	GCT	2	6	289465	289470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950113
4505	NC_021847	ATG	2	6	289494	289499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950113
4506	NC_021847	TGG	2	6	290037	290042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950114
4507	NC_021847	TGA	2	6	290217	290222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950114
4508	NC_021847	GTC	2	6	290239	290244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950114
4509	NC_021847	CAT	2	6	290295	290300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950114
4510	NC_021847	ACG	2	6	290360	290365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950114
4511	NC_021847	GAC	2	6	290491	290496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950114
4512	NC_021847	CCG	2	6	290540	290545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950114
4513	NC_021847	TGT	2	6	290552	290557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950114
4514	NC_021847	TGA	2	6	290631	290636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950114
4515	NC_021847	CG	3	6	290647	290652	0 %	0 %	50 %	50 %	525950114
4516	NC_021847	TCG	2	6	290654	290659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950114
4517	NC_021847	GC	3	6	290845	290850	0 %	0 %	50 %	50 %	525950115
4518	NC_021847	CT	3	6	290855	290860	0 %	50 %	0 %	50 %	525950115
4519	NC_021847	CAC	2	6	290886	290891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950115
4520	NC_021847	TTG	2	6	290908	290913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950115
4521	NC_021847	CAT	2	6	291025	291030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950115
4522	NC_021847	A	6	6	291064	291069	100 %	0 %	0 %	0 %	525950115
4523	NC_021847	CAG	3	9	291171	291179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950115
4524	NC_021847	GGA	2	6	291201	291206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525950115
4525	NC_021847	AG	3	6	291271	291276	50 %	0 %	50 %	0 %	525950115
4526	NC_021847	TCG	2	6	291340	291345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950115
4527	NC_021847	GTG	2	6	291352	291357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950115
4528	NC_021847	AAC	2	6	291358	291363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950115
4529	NC_021847	ATT	2	6	291367	291372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950115
4530	NC_021847	CAA	2	6	291414	291419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950115
4531	NC_021847	CAGC	2	8	291434	291441	25 %	0 %	25 %	50 %	525950115
4532	NC_021847	CCAA	2	8	291502	291509	50 %	0 %	0 %	50 %	525950115
4533	NC_021847	GCT	2	6	291519	291524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950115
4534	NC_021847	A	7	7	291576	291582	100 %	0 %	0 %	0 %	525950116
4535	NC_021847	GAA	2	6	291602	291607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950116
4536	NC_021847	CAG	2	6	291699	291704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950116
4537	NC_021847	CAA	2	6	291708	291713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950116
4538	NC_021847	ATC	2	6	291782	291787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950116
4539	NC_021847	CAA	2	6	291821	291826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950116
4540	NC_021847	AGA	2	6	291913	291918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950116
4541	NC_021847	GTG	2	6	291959	291964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950116
4542	NC_021847	CAA	3	9	291971	291979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950116
4543	NC_021847	CAACT	2	10	292116	292125	40 %	20 %	0 %	40 %	525950116
4544	NC_021847	ATTG	2	8	292228	292235	25 %	50 %	25 %	0 %	525950116
4545	NC_021847	CAG	2	6	292271	292276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950116
4546	NC_021847	ACT	2	6	292306	292311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950116
4547	NC_021847	AGA	2	6	292348	292353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950116
4548	NC_021847	TGA	2	6	292377	292382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950116
4549	NC_021847	CT	3	6	292384	292389	0 %	50 %	0 %	50 %	525950116
4550	NC_021847	TTA	2	6	292410	292415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950116
4551	NC_021847	ATT	2	6	292447	292452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525950116
4552	NC_021847	AGC	2	6	292461	292466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950116
4553	NC_021847	TCAA	2	8	292590	292597	50 %	25 %	0 %	25 %	525950116
4554	NC_021847	GAC	2	6	292598	292603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950116
4555	NC_021847	CAA	2	6	292621	292626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950116
4556	NC_021847	CAA	2	6	292646	292651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950116
4557	NC_021847	CGT	2	6	292724	292729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950116
4558	NC_021847	CAA	2	6	292737	292742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950116
4559	NC_021847	ATAA	2	8	292758	292765	75 %	25 %	0 %	0 %	525950116
4560	NC_021847	CAA	2	6	292834	292839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950117
4561	NC_021847	TCC	2	6	292931	292936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525950117
4562	NC_021847	ACT	2	6	292985	292990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950117
4563	NC_021847	CGTA	2	8	292995	293002	25 %	25 %	25 %	25 %	525950117
4564	NC_021847	CGT	2	6	293008	293013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950117
4565	NC_021847	TCG	2	6	293016	293021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950117
4566	NC_021847	AAAG	2	8	293076	293083	75 %	0 %	25 %	0 %	525950117
4567	NC_021847	CAC	2	6	293101	293106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950117
4568	NC_021847	ACT	2	6	293115	293120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950117
4569	NC_021847	AGC	2	6	293142	293147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950117
4570	NC_021847	CAAGGT	2	12	293149	293160	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525950117
4571	NC_021847	TAGC	2	8	293192	293199	25 %	25 %	25 %	25 %	525950117
4572	NC_021847	AAC	2	6	293343	293348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950117
4573	NC_021847	ATTG	2	8	293376	293383	25 %	50 %	25 %	0 %	525950117
4574	NC_021847	AAAGC	2	10	293404	293413	60 %	0 %	20 %	20 %	525950117
4575	NC_021847	GAA	2	6	293422	293427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950117
4576	NC_021847	AGCA	2	8	293429	293436	50 %	0 %	25 %	25 %	525950117
4577	NC_021847	CAA	3	9	293482	293490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950117
4578	NC_021847	AAG	2	6	293621	293626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950117
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4580	NC_021847	ACT	2	6	293661	293666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950117
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4582	NC_021847	GTA	2	6	293698	293703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950117
4583	NC_021847	GTA	2	6	293719	293724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950117
4584	NC_021847	AAGA	2	8	293725	293732	75 %	0 %	25 %	0 %	525950117
4585	NC_021847	CA	3	6	293750	293755	50 %	0 %	0 %	50 %	525950117
4586	NC_021847	CAA	2	6	293794	293799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950117
4587	NC_021847	AC	3	6	293867	293872	50 %	0 %	0 %	50 %	525950117
4588	NC_021847	AGC	2	6	293895	293900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950117
4589	NC_021847	TC	3	6	293909	293914	0 %	50 %	0 %	50 %	525950117
4590	NC_021847	AAT	2	6	294215	294220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525952341
4591	NC_021847	A	6	6	294230	294235	100 %	0 %	0 %	0 %	525952341
4592	NC_021847	CA	3	6	294313	294318	50 %	0 %	0 %	50 %	525952341
4593	NC_021847	AATG	2	8	300485	300492	50 %	25 %	25 %	0 %	525950118
4594	NC_021847	T	6	6	300527	300532	0 %	100 %	0 %	0 %	525950118
4595	NC_021847	TGC	2	6	300554	300559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950118
4596	NC_021847	ATC	2	6	300617	300622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950118
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4598	NC_021847	CAA	2	6	300679	300684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950118
4599	NC_021847	ATAG	2	8	300779	300786	50 %	25 %	25 %	0 %	525950118
4600	NC_021847	GGTT	2	8	300787	300794	0 %	50 %	50 %	0 %	525950118
4601	NC_021847	ACGT	2	8	300827	300834	25 %	25 %	25 %	25 %	525950118
4602	NC_021847	ACC	2	6	300848	300853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950118
4603	NC_021847	TCT	2	6	300882	300887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525950118
4604	NC_021847	GCG	2	6	300907	300912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525950118
4605	NC_021847	CAG	2	6	300991	300996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950118
4606	NC_021847	GCT	2	6	301037	301042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950118
4607	NC_021847	ACTTT	2	10	301171	301180	20 %	60 %	0 %	20 %	525950118
4608	NC_021847	TCA	2	6	301214	301219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950119
4609	NC_021847	TGC	3	9	301274	301282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950119
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4612	NC_021847	TGA	2	6	301469	301474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525950119
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4616	NC_021847	CA	3	6	301715	301720	50 %	0 %	0 %	50 %	525952342
4617	NC_021847	TTG	2	6	301732	301737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525952342
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4619	NC_021847	TCTT	2	8	301801	301808	0 %	75 %	0 %	25 %	525952342
4620	NC_021847	ATT	2	6	301830	301835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525952342
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4622	NC_021847	TAGA	2	8	301848	301855	50 %	25 %	25 %	0 %	525952342
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4743	NC_021847	GGT	2	6	308138	308143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525950124
4744	NC_021847	GTC	2	6	308148	308153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950124
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4775	NC_021847	AGAT	2	8	310060	310067	50 %	25 %	25 %	0 %	525950125
4776	NC_021847	GCT	2	6	310079	310084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950125
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4847	NC_021847	ACG	2	6	313919	313924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950129
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4849	NC_021847	ACTT	2	8	313979	313986	25 %	50 %	0 %	25 %	525950129
4850	NC_021847	ATC	2	6	314041	314046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950129
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4855	NC_021847	TC	3	6	314501	314506	0 %	50 %	0 %	50 %	525950129
4856	NC_021847	AGC	2	6	314510	314515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950129
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4858	NC_021847	CTG	2	6	314621	314626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950130
4859	NC_021847	GCCCAG	2	12	314661	314672	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525950130
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4861	NC_021847	TGC	2	6	314757	314762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950130
4862	NC_021847	GTT	2	6	314767	314772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950130
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4865	NC_021847	CAA	2	6	314918	314923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950130
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4984	NC_021847	ACC	2	6	321567	321572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525950134
4985	NC_021847	CGA	2	6	321658	321663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950135
4986	NC_021847	AT	3	6	321710	321715	50 %	50 %	0 %	0 %	525950135
4987	NC_021847	CAA	2	6	321718	321723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950135
4988	NC_021847	ATC	2	6	321728	321733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525950135
4989	NC_021847	AAG	2	6	321840	321845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525950135
4990	NC_021847	TGT	2	6	321888	321893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950135
4991	NC_021847	GGTCA	2	10	321896	321905	20 %	20 %	40 %	20 %	525950135
4992	NC_021847	ACA	2	6	322165	322170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525950135
4993	NC_021847	TTGC	2	8	322238	322245	0 %	50 %	25 %	25 %	525950135
4994	NC_021847	AGG	2	6	322357	322362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525950135
4995	NC_021847	ACG	2	6	322402	322407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525950136
4996	NC_021847	GTT	2	6	322442	322447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525950136
4997	NC_021847	GCT	2	6	322448	322453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525950136
4998	NC_021847	T	6	6	322482	322487	0 %	100 %	0 %	0 %	525950136
4999	NC_021847	GCC	2	6	322578	322583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525950136
5000	NC_021847	AGTT	2	8	322603	322610	25 %	50 %	25 %	0 %	525950136

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