MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_021822	GCT	2	6	1781881	1781886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854183
29502	NC_021822	AAC	2	6	1781903	1781908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854183
29503	NC_021822	TGAA	2	8	1781928	1781935	50 %	25 %	25 %	0 %	525854183
29504	NC_021822	ATT	2	6	1782227	1782232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854183
29505	NC_021822	GAAAGA	2	12	1782250	1782261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854183
29506	NC_021822	GCAATG	2	12	1782306	1782317	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525854183
29507	NC_021822	A	6	6	1782375	1782380	100 %	0 %	0 %	0 %	525854183
29508	NC_021822	ACC	2	6	1782404	1782409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854183
29509	NC_021822	ACC	2	6	1782676	1782681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854184
29510	NC_021822	ATC	2	6	1782712	1782717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854184
29511	NC_021822	GCG	2	6	1782718	1782723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854184
29512	NC_021822	CAT	2	6	1782834	1782839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854184
29513	NC_021822	GTG	2	6	1782860	1782865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854184
29514	NC_021822	TTA	2	6	1782890	1782895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854184
29515	NC_021822	CAT	2	6	1782933	1782938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854184
29516	NC_021822	GCC	2	6	1783089	1783094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854184
29517	NC_021822	GGTGTG	2	12	1783159	1783170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854184
29518	NC_021822	TTG	2	6	1783172	1783177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854184
29519	NC_021822	GCG	2	6	1783186	1783191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854184
29520	NC_021822	TGT	2	6	1783202	1783207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854184
29521	NC_021822	ACA	2	6	1783493	1783498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854184
29522	NC_021822	GAA	2	6	1783504	1783509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854184
29523	NC_021822	GCGA	2	8	1783514	1783521	25 %	0 %	50 %	25 %	525854184
29524	NC_021822	GCT	2	6	1783540	1783545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854184
29525	NC_021822	GTG	2	6	1783574	1783579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854184
29526	NC_021822	CGC	2	6	1783604	1783609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854184
29527	NC_021822	ACG	2	6	1783627	1783632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854184
29528	NC_021822	CTT	2	6	1783845	1783850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854184
29529	NC_021822	CG	3	6	1783897	1783902	0 %	0 %	50 %	50 %	525854184
29530	NC_021822	AAAG	2	8	1784024	1784031	75 %	0 %	25 %	0 %	525854185
29531	NC_021822	ATG	2	6	1784088	1784093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854185
29532	NC_021822	ATG	2	6	1784205	1784210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854185
29533	NC_021822	CGGCGA	2	12	1784233	1784244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	525854185
29534	NC_021822	CAG	2	6	1784320	1784325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854185
29535	NC_021822	GGC	2	6	1784393	1784398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854185
29536	NC_021822	ATG	2	6	1784409	1784414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854185
29537	NC_021822	TGA	2	6	1784455	1784460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854185
29538	NC_021822	GCG	2	6	1784498	1784503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854185
29539	NC_021822	CATC	2	8	1784508	1784515	25 %	25 %	0 %	50 %	525854185
29540	NC_021822	GCT	2	6	1784543	1784548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854185
29541	NC_021822	TGC	2	6	1784737	1784742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854185
29542	NC_021822	TGG	2	6	1784743	1784748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854185
29543	NC_021822	TGCGGA	2	12	1784839	1784850	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525854185
29544	NC_021822	ATC	2	6	1784880	1784885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854185
29545	NC_021822	GGT	2	6	1784923	1784928	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854185
29546	NC_021822	TG	3	6	1784966	1784971	0 %	50 %	50 %	0 %	525854185
29547	NC_021822	CGA	2	6	1784974	1784979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854185
29548	NC_021822	T	6	6	1785476	1785481	0 %	100 %	0 %	0 %	525854451
29549	NC_021822	TGA	2	6	1785506	1785511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854451
29550	NC_021822	TGT	2	6	1785534	1785539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854451
29551	NC_021822	CA	3	6	1785642	1785647	50 %	0 %	0 %	50 %	525854451
29552	NC_021822	CCAA	2	8	1785691	1785698	50 %	0 %	0 %	50 %	525854451
29553	NC_021822	CAAGCT	2	12	1785766	1785777	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525854451
29554	NC_021822	ATA	2	6	1785824	1785829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854451
29555	NC_021822	CAT	2	6	1785877	1785882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854451
29556	NC_021822	GAT	2	6	1785916	1785921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854451
29557	NC_021822	CGA	2	6	1786065	1786070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854451
29558	NC_021822	GC	3	6	1786091	1786096	0 %	0 %	50 %	50 %	525854451
29559	NC_021822	TTG	2	6	1786114	1786119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854451
29560	NC_021822	TGGC	2	8	1786152	1786159	0 %	25 %	50 %	25 %	525854451
29561	NC_021822	GTT	2	6	1786188	1786193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854451
29562	NC_021822	GGC	2	6	1786251	1786256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854451
29563	NC_021822	TGGG	2	8	1786309	1786316	0 %	25 %	75 %	0 %	525854451
29564	NC_021822	ATC	2	6	1786561	1786566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854451
29565	NC_021822	CCA	2	6	1786580	1786585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854451
29566	NC_021822	CCA	2	6	1786611	1786616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854451
29567	NC_021822	TTG	2	6	1786807	1786812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854186
29568	NC_021822	ACT	2	6	1786850	1786855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854186
29569	NC_021822	TGG	2	6	1787041	1787046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854186
29570	NC_021822	TGG	2	6	1787077	1787082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854186
29571	NC_021822	AGC	2	6	1787185	1787190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854186
29572	NC_021822	TGGT	2	8	1787227	1787234	0 %	50 %	50 %	0 %	525854186
29573	NC_021822	A	6	6	1787259	1787264	100 %	0 %	0 %	0 %	525854186
29574	NC_021822	CAA	2	6	1787271	1787276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525854186
29575	NC_021822	TGGT	2	8	1787284	1787291	0 %	50 %	50 %	0 %	525854186
29576	NC_021822	TCA	2	6	1787320	1787325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854186
29577	NC_021822	TGGT	2	8	1787400	1787407	0 %	50 %	50 %	0 %	525854186
29578	NC_021822	CGT	2	6	1787408	1787413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854186
29579	NC_021822	CT	3	6	1787415	1787420	0 %	50 %	0 %	50 %	525854186
29580	NC_021822	TG	3	6	1787421	1787426	0 %	50 %	50 %	0 %	525854186
29581	NC_021822	TTG	2	6	1787436	1787441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854186
29582	NC_021822	GCC	2	6	1787498	1787503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525854186
29583	NC_021822	ACG	2	6	1787505	1787510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854186
29584	NC_021822	CGG	2	6	1787584	1787589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525854186
29585	NC_021822	TGG	2	6	1787596	1787601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854186
29586	NC_021822	A	6	6	1787604	1787609	100 %	0 %	0 %	0 %	525854186
29587	NC_021822	A	6	6	1787624	1787629	100 %	0 %	0 %	0 %	525854186
29588	NC_021822	TGA	2	6	1787720	1787725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525854452
29589	NC_021822	ATC	2	6	1787761	1787766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854452
29590	NC_021822	TG	4	8	1787811	1787818	0 %	50 %	50 %	0 %	525854452
29591	NC_021822	GAA	2	6	1787847	1787852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854452
29592	NC_021822	TGG	2	6	1787864	1787869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854452
29593	NC_021822	TCG	2	6	1787934	1787939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854452
29594	NC_021822	TCG	2	6	1787964	1787969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854452
29595	NC_021822	AAT	2	6	1787983	1787988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854452
29596	NC_021822	AG	3	6	1788008	1788013	50 %	0 %	50 %	0 %	525854452
29597	NC_021822	CAC	2	6	1788246	1788251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525854453
29598	NC_021822	GCT	2	6	1788271	1788276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854453
29599	NC_021822	TAC	2	6	1788284	1788289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854453
29600	NC_021822	TGC	2	6	1788320	1788325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525854453
29601	NC_021822	TCT	2	6	1788337	1788342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854453
29602	NC_021822	TTC	2	6	1788361	1788366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525854453
29603	NC_021822	TGAT	2	8	1788380	1788387	25 %	50 %	25 %	0 %	525854453
29604	NC_021822	TTA	2	6	1788481	1788486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525854453
29605	NC_021822	CCTG	2	8	1788495	1788502	0 %	25 %	25 %	50 %	525854453
29606	NC_021822	CGTGC	2	10	1788525	1788534	0 %	20 %	40 %	40 %	525854453
29607	NC_021822	ATC	2	6	1788553	1788558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854453
29608	NC_021822	CAG	2	6	1788562	1788567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525854453
29609	NC_021822	GTG	2	6	1788637	1788642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854453
29610	NC_021822	AGA	2	6	1788672	1788677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525854453
29611	NC_021822	CTA	2	6	1788690	1788695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854453
29612	NC_021822	GTT	2	6	1788803	1788808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525854187
29613	NC_021822	T	6	6	1788838	1788843	0 %	100 %	0 %	0 %	525854187
29614	NC_021822	GT	3	6	1788934	1788939	0 %	50 %	50 %	0 %	525854187
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29616	NC_021822	ATA	2	6	1789006	1789011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525854187
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.