MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus O1:K33 str. CDC_K4557 chromosome II

Total Repeats: 29913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021822	CGG	2	6	158021	158026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852976
2502	NC_021822	TCG	2	6	158070	158075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852976
2503	NC_021822	CAG	2	6	158089	158094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852976
2504	NC_021822	ACA	2	6	158102	158107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852976
2505	NC_021822	TTG	2	6	158117	158122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852976
2506	NC_021822	GTGG	2	8	158127	158134	0 %	25 %	75 %	0 %	525852976
2507	NC_021822	TTG	2	6	158194	158199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852976
2508	NC_021822	GCA	2	6	158235	158240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852976
2509	NC_021822	ATTTTT	2	12	158291	158302	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	525852976
2510	NC_021822	GCG	2	6	158332	158337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852976
2511	NC_021822	TCA	2	6	158471	158476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852976
2512	NC_021822	GT	3	6	158502	158507	0 %	50 %	50 %	0 %	525852976
2513	NC_021822	GCA	2	6	158520	158525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852976
2514	NC_021822	ATAG	2	8	158541	158548	50 %	25 %	25 %	0 %	525852976
2515	NC_021822	TGGAAA	2	12	158600	158611	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525852977
2516	NC_021822	TTG	2	6	158621	158626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852977
2517	NC_021822	AAATC	2	10	158627	158636	60 %	20 %	0 %	20 %	525852977
2518	NC_021822	TC	3	6	158729	158734	0 %	50 %	0 %	50 %	525852977
2519	NC_021822	CAA	2	6	158784	158789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852977
2520	NC_021822	ATG	2	6	158794	158799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852977
2521	NC_021822	AGA	2	6	158811	158816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852977
2522	NC_021822	GAA	2	6	158857	158862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525852977
2523	NC_021822	TGT	2	6	158914	158919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852977
2524	NC_021822	GGT	2	6	159093	159098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525854217
2525	NC_021822	GT	3	6	159097	159102	0 %	50 %	50 %	0 %	525854217
2526	NC_021822	CTC	2	6	159123	159128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525854217
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2529	NC_021822	AATC	2	8	159264	159271	50 %	25 %	0 %	25 %	525854217
2530	NC_021822	GTTT	2	8	159281	159288	0 %	75 %	25 %	0 %	525854217
2531	NC_021822	ACA	2	6	159436	159441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525852978
2532	NC_021822	ATGAC	2	10	159495	159504	40 %	20 %	20 %	20 %	525852978
2533	NC_021822	GA	3	6	159523	159528	50 %	0 %	50 %	0 %	525852978
2534	NC_021822	CTA	2	6	159697	159702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525852978
2535	NC_021822	GAGCC	2	10	159721	159730	20 %	0 %	40 %	40 %	525852978
2536	NC_021822	TTG	2	6	159731	159736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852978
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2539	NC_021822	TTGA	2	8	160066	160073	25 %	50 %	25 %	0 %	525852979
2540	NC_021822	GCTAT	2	10	160078	160087	20 %	40 %	20 %	20 %	525852979
2541	NC_021822	TGG	2	6	160125	160130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852979
2542	NC_021822	AGT	2	6	160145	160150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852979
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2544	NC_021822	T	6	6	160313	160318	0 %	100 %	0 %	0 %	525852979
2545	NC_021822	ACG	2	6	160374	160379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852979
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2551	NC_021822	GAGT	2	8	160619	160626	25 %	25 %	50 %	0 %	525852979
2552	NC_021822	CTT	2	6	160631	160636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852979
2553	NC_021822	TCT	2	6	160750	160755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852979
2554	NC_021822	TGC	2	6	160756	160761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852979
2555	NC_021822	TCTG	2	8	160819	160826	0 %	50 %	25 %	25 %	525852979
2556	NC_021822	GTT	2	6	160910	160915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525852979
2557	NC_021822	TGG	2	6	160924	160929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525852979
2558	NC_021822	GC	3	6	160941	160946	0 %	0 %	50 %	50 %	525852979
2559	NC_021822	GAT	2	6	161060	161065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852979
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2561	NC_021822	CAG	2	6	161160	161165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852979
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2563	NC_021822	CAG	2	6	161182	161187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852979
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2575	NC_021822	CGCT	2	8	161660	161667	0 %	25 %	25 %	50 %	525852980
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2581	NC_021822	CTG	2	6	162069	162074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852980
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2589	NC_021822	TCG	2	6	162505	162510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852980
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2593	NC_021822	AG	3	6	162780	162785	50 %	0 %	50 %	0 %	525852980
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2595	NC_021822	T	7	7	162797	162803	0 %	100 %	0 %	0 %	525852980
2596	NC_021822	GC	3	6	162860	162865	0 %	0 %	50 %	50 %	525852980
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2608	NC_021822	TGCC	2	8	163761	163768	0 %	25 %	25 %	50 %	525852981
2609	NC_021822	GGGA	2	8	163798	163805	25 %	0 %	75 %	0 %	525852981
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2618	NC_021822	CGG	2	6	164151	164156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525852981
2619	NC_021822	CG	3	6	164201	164206	0 %	0 %	50 %	50 %	525852981
2620	NC_021822	TCG	2	6	164339	164344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852981
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2622	NC_021822	GCA	2	6	164363	164368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525852981
2623	NC_021822	GATT	2	8	164395	164402	25 %	50 %	25 %	0 %	525852981
2624	NC_021822	CTT	2	6	164518	164523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525852982
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2628	NC_021822	GCT	2	6	164787	164792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852982
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2740	NC_021822	ATG	2	6	171146	171151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525852988
2741	NC_021822	AAAGA	2	10	171181	171190	80 %	0 %	20 %	0 %	525852988
2742	NC_021822	TCG	2	6	171239	171244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525852988
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2864	NC_021822	ATC	2	6	178933	178938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525854219
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2989	NC_021822	CAA	3	9	186287	186295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525853003
2990	NC_021822	GAG	2	6	186407	186412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525853003
2991	NC_021822	ATG	2	6	186440	186445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525853004
2992	NC_021822	TATT	2	8	186489	186496	25 %	75 %	0 %	0 %	525853004
2993	NC_021822	GCTG	2	8	186550	186557	0 %	25 %	50 %	25 %	525853004
2994	NC_021822	GC	3	6	186633	186638	0 %	0 %	50 %	50 %	525853004
2995	NC_021822	GA	3	6	186720	186725	50 %	0 %	50 %	0 %	525853004
2996	NC_021822	GTC	2	6	186749	186754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525853004
2997	NC_021822	ATC	2	6	186764	186769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525853004
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